Doublet Group distance statistics: 54672

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C4	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C6	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
O2	A	0, 0.000, 0.077, 0.154, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.077 std_dev=0.077
N4	A	0, 0.000, 0.122, 0.243, 0.243 max_d=0.243 avg_d=0.122 std_dev=0.122
O2'	A	0, 0.000, 0.148, 0.296, 0.296 max_d=0.296 avg_d=0.148 std_dev=0.148
C2'	A	0, 0.000, 0.150, 0.300, 0.300 max_d=0.300 avg_d=0.150 std_dev=0.150
O4'	A	0, 0.000, 0.182, 0.364, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.182 std_dev=0.182
C3'	A	0, 0.000, 0.288, 0.576, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.288 std_dev=0.288
C4'	A	0, 0.000, 0.317, 0.633, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.317 std_dev=0.317
O5'	B	0, 0.000, 0.369, 0.738, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.369 std_dev=0.369
O3'	A	0, 0.000, 0.381, 0.761, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.381 std_dev=0.381
OP1	B	0, 0.000, 0.384, 0.768, 0.768 max_d=0.768 avg_d=0.384 std_dev=0.384
P	B	0, 0.000, 0.412, 0.825, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.412 std_dev=0.412
C5'	A	0, 0.000, 0.637, 1.273, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.637 std_dev=0.637
OP2	B	0, 0.000, 0.769, 1.538, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.769 std_dev=0.769
O5'	A	0, 0.000, 0.957, 1.914, 1.914 max_d=1.914 avg_d=0.957 std_dev=0.957
P	A	0, 0.000, 1.169, 2.339, 2.339 max_d=2.339 avg_d=1.169 std_dev=1.169
OP2	A	0, 0.000, 1.222, 2.443, 2.443 max_d=2.443 avg_d=1.222 std_dev=1.222
C3'	B	0, 0.000, 1.277, 2.554, 2.554 max_d=2.554 avg_d=1.277 std_dev=1.277
C5'	B	0, 0.000, 1.431, 2.862, 2.862 max_d=2.862 avg_d=1.431 std_dev=1.431
O3'	B	0, 0.000, 1.452, 2.904, 2.904 max_d=2.904 avg_d=1.452 std_dev=1.452
C4'	B	0, 0.000, 1.489, 2.977, 2.977 max_d=2.977 avg_d=1.489 std_dev=1.489
C6	B	0, 0.000, 1.545, 3.089, 3.089 max_d=3.089 avg_d=1.545 std_dev=1.545
C2'	B	0, 0.000, 1.552, 3.104, 3.104 max_d=3.104 avg_d=1.552 std_dev=1.552
OP1	A	0, 0.000, 1.623, 3.247, 3.247 max_d=3.247 avg_d=1.623 std_dev=1.623
C5	B	0, 0.000, 1.649, 3.298, 3.298 max_d=3.298 avg_d=1.649 std_dev=1.649
O4'	B	0, 0.000, 1.820, 3.639, 3.639 max_d=3.639 avg_d=1.820 std_dev=1.820
O2'	B	0, 0.000, 1.863, 3.725, 3.725 max_d=3.725 avg_d=1.863 std_dev=1.863
C1'	B	0, 0.000, 1.922, 3.844, 3.844 max_d=3.844 avg_d=1.922 std_dev=1.922
N1	B	0, 0.000, 2.104, 4.209, 4.209 max_d=4.209 avg_d=2.104 std_dev=2.104
C4	B	0, 0.000, 2.398, 4.797, 4.797 max_d=4.797 avg_d=2.398 std_dev=2.398
O4	B	0, 0.000, 2.541, 5.082, 5.082 max_d=5.082 avg_d=2.541 std_dev=2.541
C2	B	0, 0.000, 2.888, 5.776, 5.776 max_d=5.776 avg_d=2.888 std_dev=2.888
N3	B	0, 0.000, 3.008, 6.016, 6.016 max_d=6.016 avg_d=3.008 std_dev=3.008
O2	B	0, 0.000, 3.468, 6.936, 6.936 max_d=6.936 avg_d=3.468 std_dev=3.468

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.09	0.47	0.10
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.10	0.20	0.66	0.29
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.42	0.12
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.07	0.05	0.07	0.02	0.01	0.01	0.05	0.14	0.32	0.09
C4	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.06	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.15	0.34	0.68	0.34
C4'	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.04	0.03	0.06	0.07	0.02	0.09	0.04	0.01	0.01	0.25	0.32	0.02
C5	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.23	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.23	0.20	0.56	0.23
C5'	0.05	0.16	0.01	0.00	0.23	0.00	0.23	0.00	0.18	0.14	0.21	0.25	0.12	0.10	0.08	0.02	0.00	0.31	0.29	0.00
C6	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.03	0.26	0.05	0.50	0.14
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.07	0.56	0.19
N3	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.21	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.09	0.33	0.72	0.36
N4	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.25	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.13	0.45	0.70	0.39
O2	0.00	0.00	0.06	0.07	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.18	0.65	0.28
O2'	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.09	0.02	0.10	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.04	0.02	0.22	0.35	0.03
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.08	0.05	0.00	0.06	0.05	0.07	0.03	0.00	0.02	0.18	0.21	0.20	0.05
O4'	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.20	0.22	0.36	0.00
O5'	0.13	0.10	0.01	0.05	0.15	0.01	0.23	0.00	0.26	0.17	0.09	0.13	0.05	0.02	0.18	0.20	0.00	0.00	0.02	0.01
OP1	0.09	0.20	0.09	0.14	0.34	0.25	0.20	0.31	0.05	0.07	0.33	0.45	0.18	0.22	0.21	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.47	0.66	0.42	0.32	0.68	0.32	0.56	0.29	0.50	0.56	0.72	0.70	0.65	0.35	0.20	0.36	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.29	0.12	0.09	0.34	0.02	0.23	0.00	0.14	0.19	0.36	0.39	0.28	0.03	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.01	0.11	0.19	0.20	0.32	0.35	0.55	0.34	0.16	0.04	0.20	0.08	0.07	0.22	0.27	0.08	0.00	0.07	0.01
C2	0.35	0.28	0.25	0.34	0.40	0.55	0.47	0.76	0.46	0.37	0.31	0.17	0.05	0.27	0.40	0.52	0.12	0.03	0.06	0.00
C2'	0.10	0.05	0.12	0.18	0.16	0.28	0.30	0.49	0.29	0.12	0.00	0.23	0.04	0.09	0.16	0.21	0.04	0.09	0.07	0.12
C3'	0.07	0.07	0.12	0.16	0.12	0.20	0.26	0.37	0.25	0.09	0.02	0.25	0.02	0.07	0.13	0.13	0.13	0.18	0.18	0.21
C4	0.54	0.55	0.36	0.43	0.59	0.69	0.59	0.88	0.58	0.56	0.57	0.50	0.17	0.38	0.59	0.71	0.16	0.05	0.03	0.00
C4'	0.04	0.12	0.10	0.15	0.13	0.19	0.30	0.39	0.29	0.07	0.06	0.34	0.05	0.01	0.14	0.12	0.04	0.05	0.01	0.05
C5	0.49	0.49	0.35	0.39	0.56	0.62	0.58	0.83	0.56	0.53	0.52	0.42	0.17	0.31	0.57	0.64	0.14	0.03	0.01	0.02
C5'	0.05	0.12	0.13	0.18	0.13	0.20	0.30	0.39	0.29	0.08	0.05	0.34	0.02	0.00	0.14	0.12	0.12	0.03	0.10	0.03
C6	0.34	0.29	0.26	0.30	0.42	0.48	0.49	0.70	0.48	0.38	0.34	0.18	0.08	0.20	0.43	0.47	0.11	0.00	0.03	0.02
N1	0.28	0.19	0.20	0.28	0.34	0.45	0.44	0.67	0.43	0.30	0.23	0.05	0.01	0.19	0.35	0.42	0.10	0.01	0.05	0.02
N3	0.48	0.45	0.33	0.41	0.52	0.66	0.55	0.86	0.54	0.50	0.48	0.38	0.13	0.37	0.52	0.66	0.15	0.06	0.05	0.01
N4	0.64	0.70	0.42	0.48	0.69	0.78	0.65	0.94	0.63	0.67	0.72	0.70	0.23	0.45	0.70	0.83	0.19	0.08	0.02	0.01
O2	0.30	0.20	0.22	0.31	0.34	0.51	0.44	0.73	0.43	0.32	0.23	0.07	0.01	0.25	0.34	0.47	0.10	0.03	0.06	0.00
O2'	0.03	0.23	0.01	0.09	0.02	0.18	0.21	0.41	0.20	0.02	0.18	0.46	0.16	0.03	0.03	0.09	0.04	0.09	0.03	0.10
O3'	0.01	0.17	0.09	0.11	0.04	0.11	0.19	0.27	0.18	0.00	0.12	0.37	0.02	0.03	0.04	0.02	0.19	0.23	0.23	0.25
O4'	0.05	0.10	0.05	0.11	0.14	0.22	0.31	0.45	0.30	0.08	0.04	0.31	0.14	0.02	0.16	0.17	0.09	0.01	0.08	0.00
O5'	0.04	0.09	0.00	0.06	0.02	0.10	0.08	0.07	0.07	0.02	0.06	0.20	0.05	0.01	0.02	0.09	0.46	0.55	0.56	0.59
OP1	0.04	0.12	0.00	0.01	0.07	0.04	0.02	0.10	0.02	0.06	0.10	0.19	0.03	0.00	0.07	0.03	0.29	0.26	0.27	0.33
OP2	0.03	0.06	0.05	0.06	0.04	0.01	0.03	0.10	0.02	0.03	0.06	0.10	0.05	0.01	0.05	0.07	0.46	0.39	0.27	0.39
P	0.04	0.09	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.07	0.16	0.03	0.01	0.04	0.06	0.35	0.35	0.31	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.00	0.41	0.28	0.33	0.28
C2	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.10	0.00	0.07	0.60	0.62	0.53	0.53
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.09	0.02	0.11	0.01	0.04	0.16	0.00	0.00	0.03	0.00	0.33	0.08	0.20	0.12
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.02	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.12	0.03	0.10
C4	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.04	0.00	0.04	0.69	0.69	0.64	0.65
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.09	0.01	0.02	0.08	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.05	0.16	0.01
C5	0.01	0.00	0.09	0.03	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00	0.18	0.00	0.01	0.12	0.65	0.56	0.61	0.60
C5'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.09	0.01	0.17	0.00	0.17	0.04	0.00	0.09	0.02	0.03	0.10	0.00	0.02	0.17	0.32	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.03	0.01	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.00	0.01	0.13	0.61	0.44	0.53	0.51
N1	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.58	0.48	0.49	0.47
N3	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.08	0.00	0.04	0.67	0.71	0.61	0.62
O2	0.03	0.00	0.16	0.09	0.01	0.08	0.00	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.31	0.18	0.02	0.13	0.53	0.60	0.46	0.46
O2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.06	0.00	0.18	0.02	0.19	0.02	0.07	0.31	0.00	0.01	0.07	0.01	0.27	0.06	0.11	0.07
O3'	0.05	0.10	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.08	0.18	0.01	0.00	0.04	0.06	0.11	0.17	0.09	0.19
O4	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.04	0.00	0.05	0.70	0.74	0.68	0.69
O4'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.00	0.12	0.00	0.13	0.01	0.04	0.13	0.01	0.06	0.05	0.00	0.36	0.27	0.38	0.28
O5'	0.41	0.60	0.33	0.04	0.69	0.03	0.65	0.02	0.61	0.58	0.67	0.53	0.27	0.11	0.70	0.36	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.28	0.62	0.08	0.12	0.69	0.05	0.56	0.17	0.44	0.48	0.71	0.60	0.06	0.17	0.74	0.27	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.33	0.53	0.20	0.03	0.64	0.16	0.61	0.32	0.53	0.49	0.61	0.46	0.11	0.09	0.68	0.38	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.28	0.53	0.12	0.10	0.65	0.01	0.60	0.01	0.51	0.47	0.62	0.46	0.07	0.19	0.69	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00