Doublet Group distance statistics: 54681

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 6, 2, 1, 4, 6, 5, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.006, 0.009, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.002
N1	A	0, 0.007, 0.010, 0.014, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.008, 0.013, 0.017, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.017, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.009, 0.015, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.012, 0.019, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.013, 0.030, 0.047, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.030 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.015, 0.035, 0.054, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.035 std_dev=0.020
C2'	A	0, 0.038, 0.102, 0.166, 0.292 max_d=0.292 avg_d=0.102 std_dev=0.064
O2'	A	0, 0.030, 0.101, 0.173, 0.380 max_d=0.380 avg_d=0.101 std_dev=0.072
O4'	A	0, 0.047, 0.121, 0.196, 0.287 max_d=0.287 avg_d=0.121 std_dev=0.075
C3'	A	0, 0.073, 0.193, 0.312, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.193 std_dev=0.119
C4'	A	0, 0.067, 0.190, 0.314, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.190 std_dev=0.124
P	B	0, 0.185, 0.368, 0.551, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.368 std_dev=0.183
O3'	A	0, 0.137, 0.321, 0.504, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.321 std_dev=0.183
C5'	A	0, 0.097, 0.287, 0.477, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.287 std_dev=0.190
O5'	A	0, 0.128, 0.335, 0.542, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.335 std_dev=0.207
OP2	A	0, 0.183, 0.415, 0.647, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.415 std_dev=0.232
P	A	0, 0.181, 0.424, 0.667, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.424 std_dev=0.243
OP1	B	0, 0.205, 0.456, 0.707, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.456 std_dev=0.251
C5'	B	0, 0.194, 0.479, 0.765, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.479 std_dev=0.285
OP1	A	0, 0.222, 0.513, 0.805, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.513 std_dev=0.292
O4'	B	0, 0.219, 0.539, 0.858, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.539 std_dev=0.320
C4'	B	0, 0.220, 0.543, 0.866, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.543 std_dev=0.323
O5'	B	0, 0.235, 0.570, 0.906, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.570 std_dev=0.336
C3'	B	0, 0.242, 0.601, 0.960, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.601 std_dev=0.359
C6	B	0, 0.269, 0.636, 1.003, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.636 std_dev=0.367
C1'	B	0, 0.269, 0.641, 1.014, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.641 std_dev=0.373
O3'	B	0, 0.242, 0.616, 0.990, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.616 std_dev=0.374
N1	B	0, 0.299, 0.687, 1.076, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.687 std_dev=0.389
C2'	B	0, 0.277, 0.679, 1.082, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.679 std_dev=0.403
C5	B	0, 0.315, 0.734, 1.153, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.734 std_dev=0.419
O2'	B	0, 0.319, 0.752, 1.186, 1.772 max_d=1.772 avg_d=0.752 std_dev=0.433
OP2	B	0, 0.276, 0.747, 1.218, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.747 std_dev=0.471
C2	B	0, 0.373, 0.844, 1.316, 1.919 max_d=1.919 avg_d=0.844 std_dev=0.471
C4	B	0, 0.396, 0.874, 1.353, 1.988 max_d=1.988 avg_d=0.874 std_dev=0.479
N3	B	0, 0.419, 0.927, 1.435, 2.053 max_d=2.053 avg_d=0.927 std_dev=0.508
O2	B	0, 0.401, 0.931, 1.461, 2.029 max_d=2.029 avg_d=0.931 std_dev=0.530
N4	B	0, 0.452, 0.994, 1.535, 2.163 max_d=2.163 avg_d=0.994 std_dev=0.542

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.10	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.04	0.07	0.13	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.04
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.08	0.07	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.06	0.03
C4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.02	0.07	0.11	0.16	0.11
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.02	0.08	0.12	0.17	0.12
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.06	0.07	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.07	0.10	0.15	0.10
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.07	0.13	0.08
N3	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.02	0.06	0.09	0.15	0.09
N4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.08	0.13	0.17	0.12
O2	0.02	0.00	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.11	0.02	0.04	0.05	0.12	0.07
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.04	0.07	0.04
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.06	0.03	0.10	0.09	0.11	0.02	0.00	0.02	0.04	0.09	0.04	0.05
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.09	0.05
O5'	0.02	0.04	0.01	0.02	0.07	0.01	0.08	0.01	0.07	0.04	0.06	0.08	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.07	0.04	0.05	0.11	0.03	0.12	0.03	0.10	0.07	0.09	0.13	0.05	0.04	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.13	0.09	0.06	0.16	0.05	0.17	0.03	0.15	0.13	0.15	0.17	0.12	0.07	0.04	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.08	0.04	0.03	0.11	0.02	0.12	0.01	0.10	0.08	0.09	0.12	0.07	0.04	0.05	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.12	0.09	0.09	0.16	0.09	0.16	0.11	0.13	0.11	0.15	0.19	0.12	0.10	0.11	0.10	0.18	0.15	0.36	0.13
C2	0.13	0.18	0.14	0.14	0.23	0.13	0.22	0.14	0.18	0.16	0.21	0.26	0.17	0.14	0.15	0.13	0.13	0.13	0.44	0.16
C2'	0.09	0.12	0.09	0.09	0.16	0.10	0.16	0.12	0.14	0.11	0.14	0.19	0.12	0.11	0.11	0.10	0.17	0.16	0.37	0.14
C3'	0.09	0.12	0.09	0.09	0.15	0.10	0.16	0.12	0.14	0.11	0.14	0.18	0.12	0.11	0.11	0.10	0.20	0.18	0.32	0.12
C4	0.16	0.20	0.17	0.17	0.24	0.16	0.23	0.16	0.20	0.19	0.22	0.26	0.19	0.17	0.18	0.16	0.14	0.15	0.45	0.18
C4'	0.09	0.11	0.09	0.09	0.14	0.10	0.15	0.11	0.13	0.10	0.13	0.17	0.12	0.10	0.10	0.10	0.22	0.21	0.29	0.12
C5	0.12	0.14	0.13	0.13	0.17	0.12	0.17	0.13	0.15	0.13	0.16	0.19	0.14	0.13	0.15	0.13	0.15	0.13	0.37	0.14
C5'	0.09	0.11	0.09	0.09	0.14	0.10	0.15	0.12	0.14	0.10	0.12	0.16	0.11	0.11	0.10	0.11	0.25	0.24	0.24	0.11
C6	0.10	0.12	0.10	0.10	0.15	0.10	0.16	0.11	0.13	0.11	0.14	0.17	0.12	0.11	0.12	0.11	0.17	0.14	0.34	0.13
N1	0.10	0.13	0.11	0.11	0.17	0.10	0.17	0.11	0.14	0.12	0.16	0.20	0.13	0.11	0.12	0.11	0.15	0.13	0.38	0.14
N3	0.17	0.21	0.17	0.17	0.26	0.16	0.25	0.16	0.22	0.19	0.24	0.30	0.20	0.17	0.17	0.16	0.14	0.15	0.48	0.18
N4	0.21	0.25	0.21	0.21	0.29	0.20	0.28	0.20	0.25	0.23	0.27	0.31	0.23	0.20	0.21	0.20	0.18	0.21	0.50	0.21
O2	0.14	0.19	0.14	0.14	0.25	0.13	0.24	0.14	0.19	0.17	0.23	0.29	0.18	0.14	0.15	0.13	0.13	0.13	0.46	0.17
O2'	0.09	0.13	0.09	0.09	0.17	0.09	0.16	0.11	0.14	0.11	0.15	0.19	0.13	0.10	0.10	0.10	0.18	0.15	0.38	0.14
O3'	0.10	0.12	0.10	0.10	0.15	0.11	0.16	0.12	0.14	0.11	0.14	0.18	0.12	0.12	0.11	0.11	0.21	0.19	0.31	0.12
O4'	0.09	0.12	0.09	0.09	0.15	0.09	0.15	0.10	0.13	0.10	0.14	0.17	0.12	0.10	0.10	0.10	0.21	0.19	0.31	0.12
O5'	0.08	0.10	0.08	0.08	0.12	0.09	0.14	0.10	0.12	0.09	0.11	0.14	0.11	0.11	0.10	0.09	0.24	0.28	0.22	0.12
OP1	0.14	0.14	0.15	0.14	0.15	0.16	0.17	0.15	0.17	0.14	0.14	0.16	0.15	0.18	0.16	0.14	0.24	0.37	0.18	0.15
OP2	0.11	0.12	0.11	0.11	0.15	0.12	0.17	0.12	0.16	0.12	0.13	0.17	0.12	0.13	0.11	0.11	0.23	0.36	0.20	0.14
P	0.10	0.11	0.10	0.10	0.13	0.11	0.15	0.11	0.14	0.11	0.12	0.15	0.12	0.13	0.11	0.10	0.24	0.34	0.18	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.11	0.32	0.08
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.13	0.12	0.28	0.09
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.07	0.00	0.01	0.00	0.03	0.21	0.24	0.04
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.05	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.06	0.25	0.17	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.02	0.20	0.14	0.20	0.13
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.18	0.26	0.04
C5	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.22	0.15	0.17	0.14
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.10	0.00	0.12	0.00	0.11	0.05	0.07	0.11	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.17	0.19	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.19	0.13	0.20	0.11
N1	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.13	0.12	0.27	0.08
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.17	0.13	0.24	0.11
N4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.02	0.22	0.15	0.19	0.15
O2	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.07	0.03	0.09	0.12	0.32	0.08
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.05	0.04	0.09	0.00	0.02	0.02	0.04	0.23	0.27	0.05
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.05	0.08	0.07	0.02	0.00	0.01	0.12	0.34	0.13	0.08
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.07	0.36	0.10
O5'	0.06	0.13	0.03	0.06	0.20	0.01	0.22	0.01	0.19	0.13	0.17	0.22	0.09	0.04	0.12	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.12	0.21	0.25	0.14	0.18	0.15	0.17	0.13	0.12	0.13	0.15	0.12	0.23	0.34	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.32	0.28	0.24	0.17	0.20	0.26	0.17	0.19	0.20	0.27	0.24	0.19	0.32	0.27	0.13	0.36	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.09	0.04	0.05	0.13	0.04	0.14	0.01	0.11	0.08	0.11	0.15	0.08	0.05	0.08	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00