Doublet Group distance statistics: 54682

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 4, 7, 6, 3, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.005, 0.008, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.004, 0.018, 0.031, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.019 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.002, 0.037, 0.072, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.037 std_dev=0.035
N4	A	0, 0.013, 0.059, 0.105, 0.257 max_d=0.257 avg_d=0.059 std_dev=0.046
C2'	A	0, 0.097, 0.193, 0.289, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.193 std_dev=0.096
O4'	A	0, 0.012, 0.114, 0.216, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.114 std_dev=0.102
O2'	A	0, 0.168, 0.283, 0.399, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.283 std_dev=0.116
C4'	A	0, 0.031, 0.201, 0.371, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.201 std_dev=0.170
C3'	A	0, 0.099, 0.279, 0.458, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.279 std_dev=0.179
O5'	A	0, 0.219, 0.438, 0.657, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.438 std_dev=0.219
C6	B	0, 0.340, 0.562, 0.783, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.562 std_dev=0.221
N1	B	0, 0.289, 0.524, 0.759, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.524 std_dev=0.235
C5'	A	0, 0.102, 0.338, 0.574, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.338 std_dev=0.236
C3'	B	0, 0.324, 0.567, 0.810, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.567 std_dev=0.243
P	B	0, 0.343, 0.595, 0.848, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.595 std_dev=0.252
C4'	B	0, 0.423, 0.676, 0.929, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.676 std_dev=0.253
C5	B	0, 0.265, 0.519, 0.772, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.519 std_dev=0.254
P	A	0, 0.336, 0.592, 0.849, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.592 std_dev=0.256
OP2	A	0, 0.391, 0.656, 0.922, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.656 std_dev=0.265
OP2	B	0, 0.556, 0.821, 1.087, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.821 std_dev=0.266
O3'	A	0, 0.118, 0.395, 0.672, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.395 std_dev=0.277
C1'	B	0, 0.342, 0.619, 0.896, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.619 std_dev=0.277
C2'	B	0, 0.291, 0.581, 0.870, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.581 std_dev=0.289
O3'	B	0, 0.328, 0.619, 0.909, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.619 std_dev=0.290
O4'	B	0, 0.403, 0.694, 0.986, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.694 std_dev=0.291
C4	B	0, 0.184, 0.476, 0.768, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.476 std_dev=0.292
OP1	B	0, 0.314, 0.612, 0.911, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.612 std_dev=0.298
OP1	A	0, 0.364, 0.678, 0.993, 1.588 max_d=1.588 avg_d=0.678 std_dev=0.315
C5'	B	0, 0.394, 0.721, 1.049, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.721 std_dev=0.328
C2	B	0, 0.173, 0.524, 0.874, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.524 std_dev=0.350
N4	B	0, 0.162, 0.528, 0.895, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.528 std_dev=0.366
N3	B	0, 0.142, 0.518, 0.893, 1.870 max_d=1.870 avg_d=0.518 std_dev=0.376
O5'	B	0, 0.861, 1.274, 1.687, 1.885 max_d=1.885 avg_d=1.274 std_dev=0.413
O2'	B	0, 0.248, 0.684, 1.119, 1.938 max_d=1.938 avg_d=0.684 std_dev=0.435
O2	B	0, 0.081, 0.600, 1.119, 2.752 max_d=2.752 avg_d=0.600 std_dev=0.519

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.09	0.06
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.03	0.07	0.08	0.12	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.08	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.08	0.05
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.06	0.05	0.09	0.10	0.09	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.02	0.10	0.12	0.14	0.12
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.02	0.10	0.11	0.13	0.11
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.05	0.07	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.03	0.08	0.08	0.11	0.09
N1	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.06	0.10	0.08
N3	0.01	0.00	0.05	0.09	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.03	0.08	0.10	0.14	0.11
N4	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02	0.10	0.13	0.16	0.13
O2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.10	0.04	0.06	0.07	0.11	0.09
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.02	0.04	0.06	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.10	0.01	0.09	0.01	0.07	0.04	0.10	0.12	0.10	0.02	0.00	0.01	0.04	0.11	0.09	0.06
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.01	0.00	0.03	0.06	0.09	0.09
O5'	0.03	0.07	0.04	0.04	0.10	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.08	0.10	0.06	0.02	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.08	0.05	0.07	0.12	0.03	0.11	0.04	0.08	0.06	0.10	0.13	0.07	0.04	0.11	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.12	0.08	0.06	0.14	0.03	0.13	0.01	0.11	0.10	0.14	0.16	0.11	0.06	0.09	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.09	0.05	0.04	0.12	0.03	0.11	0.01	0.09	0.08	0.11	0.13	0.09	0.03	0.06	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.32	0.25	0.14	0.16	0.15	0.24	0.24	0.19	0.15	0.28	0.21	0.53	0.34	0.15	0.14	0.27	0.15	0.21	0.14
C2	0.19	0.36	0.24	0.14	0.13	0.15	0.21	0.26	0.17	0.17	0.35	0.17	0.52	0.29	0.14	0.17	0.27	0.15	0.19	0.13
C2'	0.17	0.32	0.21	0.11	0.15	0.13	0.22	0.26	0.18	0.14	0.29	0.19	0.52	0.31	0.11	0.11	0.26	0.11	0.22	0.11
C3'	0.12	0.25	0.15	0.07	0.15	0.10	0.21	0.22	0.18	0.10	0.24	0.18	0.42	0.23	0.08	0.07	0.25	0.08	0.24	0.11
C4	0.17	0.31	0.20	0.13	0.20	0.18	0.12	0.30	0.16	0.17	0.34	0.22	0.39	0.20	0.13	0.21	0.26	0.13	0.18	0.13
C4'	0.12	0.20	0.14	0.09	0.20	0.10	0.26	0.19	0.22	0.12	0.19	0.24	0.35	0.24	0.11	0.09	0.23	0.11	0.25	0.13
C5	0.15	0.30	0.20	0.14	0.19	0.17	0.11	0.30	0.13	0.16	0.32	0.21	0.39	0.20	0.13	0.18	0.28	0.13	0.19	0.13
C5'	0.12	0.18	0.12	0.08	0.21	0.08	0.26	0.17	0.24	0.15	0.19	0.24	0.26	0.18	0.07	0.10	0.20	0.08	0.27	0.12
C6	0.18	0.33	0.24	0.15	0.17	0.16	0.16	0.27	0.15	0.17	0.32	0.19	0.46	0.26	0.14	0.15	0.29	0.14	0.21	0.14
N1	0.19	0.35	0.25	0.14	0.15	0.15	0.20	0.26	0.17	0.15	0.32	0.18	0.52	0.30	0.14	0.14	0.28	0.14	0.20	0.13
N3	0.19	0.34	0.22	0.14	0.17	0.17	0.18	0.28	0.18	0.18	0.37	0.19	0.45	0.25	0.13	0.20	0.26	0.14	0.18	0.13
N4	0.17	0.27	0.17	0.13	0.24	0.20	0.14	0.31	0.18	0.18	0.32	0.28	0.32	0.17	0.13	0.25	0.25	0.14	0.17	0.14
O2	0.20	0.36	0.25	0.14	0.13	0.15	0.23	0.25	0.17	0.17	0.34	0.19	0.55	0.33	0.15	0.16	0.27	0.15	0.19	0.13
O2'	0.22	0.32	0.25	0.13	0.17	0.13	0.26	0.23	0.20	0.16	0.27	0.23	0.55	0.38	0.14	0.15	0.26	0.12	0.22	0.11
O3'	0.11	0.22	0.13	0.07	0.15	0.09	0.21	0.21	0.18	0.10	0.21	0.18	0.39	0.22	0.06	0.07	0.24	0.08	0.25	0.12
O4'	0.15	0.23	0.21	0.14	0.21	0.14	0.28	0.20	0.22	0.11	0.21	0.25	0.41	0.32	0.17	0.12	0.27	0.17	0.22	0.15
O5'	0.10	0.19	0.13	0.04	0.17	0.07	0.20	0.17	0.19	0.12	0.20	0.19	0.28	0.17	0.01	0.06	0.21	0.07	0.28	0.13
OP1	0.05	0.12	0.09	0.01	0.11	0.05	0.12	0.17	0.11	0.07	0.13	0.13	0.19	0.15	0.01	0.03	0.21	0.13	0.29	0.14
OP2	0.07	0.15	0.05	0.05	0.11	0.14	0.08	0.27	0.07	0.07	0.16	0.14	0.22	0.05	0.01	0.13	0.24	0.13	0.27	0.12
P	0.02	0.13	0.07	0.01	0.10	0.07	0.11	0.17	0.10	0.05	0.13	0.12	0.20	0.10	0.00	0.03	0.21	0.09	0.29	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.16	0.24	0.14	0.12
C2	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.07	0.03	0.24	0.28	0.23	0.24
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.11	0.00	0.01	0.02	0.14	0.15	0.24	0.13
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.02	0.09	0.03	0.06	0.07	0.11	0.02	0.00	0.01	0.18	0.13	0.27	0.15
C4	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.04	0.25	0.38	0.25	0.31
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.08	0.03	0.04	0.07	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.14	0.18	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.09	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.04	0.23	0.39	0.19	0.29
C5'	0.05	0.12	0.03	0.02	0.20	0.00	0.22	0.00	0.20	0.13	0.16	0.21	0.08	0.03	0.06	0.02	0.02	0.17	0.17	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.04	0.21	0.34	0.14	0.23
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.21	0.29	0.17	0.20
N3	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.07	0.03	0.26	0.33	0.27	0.29
N4	0.02	0.01	0.02	0.07	0.00	0.07	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.04	0.26	0.41	0.29	0.34
O2	0.02	0.00	0.11	0.11	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.14	0.03	0.24	0.25	0.25	0.21
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.03	0.11	0.00	0.04	0.06	0.06	0.12	0.26	0.08
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.01	0.10	0.06	0.10	0.03	0.07	0.08	0.14	0.04	0.00	0.02	0.18	0.08	0.32	0.17
O4'	0.00	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.06	0.02	0.00	0.17	0.30	0.13	0.14
O5'	0.16	0.24	0.14	0.18	0.25	0.01	0.23	0.02	0.21	0.21	0.26	0.26	0.24	0.06	0.18	0.17	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.24	0.28	0.15	0.13	0.38	0.14	0.39	0.17	0.34	0.29	0.33	0.41	0.25	0.12	0.08	0.30	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.23	0.24	0.27	0.25	0.18	0.19	0.17	0.14	0.17	0.27	0.29	0.25	0.26	0.32	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.24	0.13	0.15	0.31	0.03	0.29	0.01	0.23	0.20	0.29	0.34	0.21	0.08	0.17	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00