Doublet Group distance statistics: 54689

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 1, 1, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.007, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.022, 0.061, 0.101, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.061 std_dev=0.040
N4	A	0, 0.019, 0.064, 0.109, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.064 std_dev=0.045
C3'	A	0, 0.037, 0.141, 0.244, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.141 std_dev=0.104
C2'	A	0, 0.069, 0.175, 0.281, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.175 std_dev=0.106
O4'	A	0, 0.052, 0.171, 0.290, 0.364 max_d=0.364 avg_d=0.171 std_dev=0.119
O3'	A	0, 0.156, 0.278, 0.401, 0.424 max_d=0.424 avg_d=0.278 std_dev=0.123
C4'	A	0, 0.022, 0.178, 0.334, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.178 std_dev=0.156
O5'	A	0, 0.212, 0.407, 0.602, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.407 std_dev=0.195
C5'	A	0, 0.153, 0.375, 0.598, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.375 std_dev=0.223
O2'	A	0, 0.078, 0.306, 0.534, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.306 std_dev=0.228
P	B	0, 0.283, 0.514, 0.746, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.514 std_dev=0.231
OP2	B	0, 0.116, 0.395, 0.674, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.395 std_dev=0.279
OP1	B	0, 0.291, 0.574, 0.856, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.574 std_dev=0.282
P	A	0, 0.301, 0.586, 0.871, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.586 std_dev=0.285
OP2	A	0, 0.286, 0.616, 0.946, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.616 std_dev=0.330
O5'	B	0, 0.336, 0.670, 1.005, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.670 std_dev=0.335
C5'	B	0, 0.371, 0.741, 1.111, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.741 std_dev=0.370
OP1	A	0, 0.404, 0.797, 1.191, 1.697 max_d=1.697 avg_d=0.797 std_dev=0.394
C6	B	0, 0.402, 0.809, 1.215, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.809 std_dev=0.407
C5	B	0, 0.398, 0.818, 1.239, 1.896 max_d=1.896 avg_d=0.818 std_dev=0.421
O4'	B	0, 0.469, 0.921, 1.373, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.921 std_dev=0.452
C4'	B	0, 0.423, 0.890, 1.357, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.890 std_dev=0.467
N1	B	0, 0.413, 0.881, 1.350, 2.033 max_d=2.033 avg_d=0.881 std_dev=0.469
C1'	B	0, 0.428, 0.916, 1.404, 1.933 max_d=1.933 avg_d=0.916 std_dev=0.488
C4	B	0, 0.376, 0.882, 1.387, 2.251 max_d=2.251 avg_d=0.882 std_dev=0.505
C2'	B	0, 0.334, 0.854, 1.374, 1.957 max_d=1.957 avg_d=0.854 std_dev=0.520
N4	B	0, 0.370, 0.910, 1.449, 2.382 max_d=2.382 avg_d=0.910 std_dev=0.539
C3'	B	0, 0.359, 0.901, 1.443, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.901 std_dev=0.542
C2	B	0, 0.418, 0.982, 1.545, 2.391 max_d=2.391 avg_d=0.982 std_dev=0.563
N3	B	0, 0.402, 0.975, 1.547, 2.489 max_d=2.489 avg_d=0.975 std_dev=0.573
O3'	B	0, 0.344, 0.922, 1.501, 1.854 max_d=1.854 avg_d=0.922 std_dev=0.578
O2'	B	0, 0.333, 0.952, 1.572, 2.115 max_d=2.115 avg_d=0.952 std_dev=0.620
O2	B	0, 0.435, 1.106, 1.777, 2.636 max_d=2.636 avg_d=1.106 std_dev=0.671

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.05	0.06	0.13	0.06
C2	0.02	0.00	0.05	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.05	0.06	0.07	0.09	0.20	0.10
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.02	0.04	0.03	0.06	0.00	0.02	0.01	0.12	0.16	0.18	0.15
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.08	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.06	0.14	0.25	0.12
C4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.03	0.06	0.07	0.17	0.26	0.14
C5'	0.02	0.06	0.05	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.06	0.09	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.08	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.02	0.07	0.07	0.15	0.24	0.13
N1	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.10	0.20	0.10
N3	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.03	0.06	0.11	0.23	0.10
N4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02	0.06	0.16	0.27	0.13
O2	0.04	0.00	0.06	0.03	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.15	0.08	0.12	0.10	0.10	0.19	0.11
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.09	0.05	0.09	0.02	0.06	0.05	0.15	0.00	0.07	0.01	0.14	0.21	0.22	0.18
O3'	0.04	0.05	0.02	0.01	0.04	0.04	0.03	0.05	0.02	0.04	0.05	0.04	0.08	0.07	0.00	0.04	0.07	0.11	0.06	0.09
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.02	0.07	0.01	0.03	0.02	0.12	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.12	0.02
O5'	0.05	0.07	0.12	0.08	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.06	0.06	0.06	0.10	0.14	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.09	0.16	0.10	0.14	0.04	0.17	0.02	0.15	0.10	0.11	0.16	0.10	0.21	0.11	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.20	0.18	0.08	0.25	0.07	0.26	0.08	0.24	0.20	0.23	0.27	0.19	0.22	0.06	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.10	0.15	0.09	0.12	0.02	0.14	0.01	0.13	0.10	0.10	0.13	0.11	0.18	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.09	0.18	0.18	0.22	0.10	0.26	0.10	0.20	0.12	0.14	0.29	0.06	0.23	0.15	0.13	0.10	0.15	0.12	0.10
C2	0.09	0.08	0.14	0.17	0.21	0.08	0.25	0.09	0.19	0.10	0.14	0.28	0.08	0.19	0.12	0.11	0.09	0.16	0.10	0.09
C2'	0.18	0.11	0.29	0.29	0.10	0.18	0.17	0.17	0.16	0.13	0.08	0.17	0.16	0.36	0.26	0.15	0.15	0.12	0.10	0.12
C3'	0.14	0.10	0.23	0.21	0.18	0.13	0.22	0.13	0.19	0.13	0.12	0.24	0.09	0.29	0.20	0.14	0.11	0.14	0.15	0.10
C4	0.12	0.15	0.12	0.16	0.26	0.10	0.29	0.10	0.23	0.15	0.20	0.32	0.16	0.15	0.12	0.13	0.11	0.18	0.15	0.10
C4'	0.16	0.18	0.16	0.15	0.28	0.12	0.29	0.12	0.23	0.19	0.23	0.35	0.15	0.20	0.14	0.17	0.13	0.16	0.25	0.14
C5	0.10	0.14	0.13	0.16	0.25	0.09	0.29	0.08	0.22	0.14	0.19	0.32	0.14	0.17	0.12	0.12	0.09	0.17	0.10	0.08
C5'	0.17	0.19	0.17	0.14	0.29	0.11	0.28	0.10	0.22	0.19	0.25	0.36	0.17	0.20	0.14	0.17	0.11	0.12	0.29	0.11
C6	0.09	0.09	0.16	0.18	0.22	0.08	0.26	0.08	0.19	0.10	0.15	0.29	0.09	0.21	0.14	0.11	0.08	0.15	0.08	0.08
N1	0.10	0.07	0.16	0.18	0.20	0.08	0.25	0.09	0.19	0.10	0.13	0.28	0.07	0.22	0.14	0.11	0.09	0.15	0.09	0.09
N3	0.10	0.12	0.12	0.16	0.24	0.09	0.27	0.10	0.21	0.13	0.17	0.30	0.12	0.16	0.12	0.13	0.10	0.17	0.13	0.09
N4	0.15	0.20	0.13	0.17	0.28	0.13	0.31	0.13	0.25	0.18	0.24	0.33	0.21	0.15	0.15	0.16	0.14	0.20	0.21	0.12
O2	0.09	0.06	0.15	0.17	0.19	0.09	0.23	0.09	0.18	0.09	0.12	0.26	0.06	0.21	0.12	0.11	0.09	0.16	0.10	0.09
O2'	0.26	0.22	0.40	0.40	0.08	0.26	0.12	0.23	0.15	0.19	0.16	0.11	0.30	0.49	0.36	0.21	0.23	0.12	0.17	0.18
O3'	0.15	0.12	0.22	0.21	0.21	0.13	0.24	0.14	0.20	0.14	0.15	0.28	0.11	0.28	0.19	0.15	0.13	0.16	0.15	0.12
O4'	0.18	0.20	0.15	0.14	0.32	0.14	0.33	0.13	0.27	0.21	0.26	0.38	0.17	0.18	0.14	0.20	0.15	0.19	0.24	0.16
O5'	0.13	0.13	0.19	0.18	0.20	0.11	0.19	0.13	0.16	0.14	0.17	0.27	0.12	0.24	0.18	0.13	0.08	0.11	0.23	0.07
OP1	0.20	0.16	0.27	0.28	0.14	0.22	0.16	0.25	0.18	0.18	0.15	0.14	0.16	0.29	0.30	0.19	0.19	0.22	0.27	0.18
OP2	0.12	0.10	0.19	0.21	0.17	0.19	0.12	0.26	0.12	0.10	0.16	0.31	0.10	0.21	0.22	0.15	0.18	0.28	0.29	0.21
P	0.13	0.11	0.19	0.18	0.15	0.13	0.13	0.17	0.13	0.11	0.14	0.23	0.11	0.22	0.20	0.13	0.09	0.16	0.25	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.13	0.00	0.07	0.06	0.18	0.09
C2	0.02	0.00	0.10	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.19	0.03	0.11	0.11	0.32	0.14
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.05	0.05	0.02	0.08	0.05	0.17	0.00	0.08	0.01	0.09	0.09	0.09	0.10
C3'	0.03	0.06	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.05	0.10	0.02	0.01	0.02	0.09	0.09	0.12	0.10
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.01	0.19	0.22	0.53	0.26
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.02	0.05	0.05	0.02	0.04	0.00	0.01	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.07	0.02	0.22	0.22	0.58	0.30
C5'	0.01	0.05	0.05	0.03	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.05	0.06	0.10	0.06	0.04	0.09	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01
C6	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.04	0.20	0.16	0.47	0.25
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.12	0.01	0.12	0.10	0.33	0.15
N3	0.02	0.00	0.08	0.06	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.17	0.03	0.15	0.17	0.43	0.20
N4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.12	0.02	0.21	0.26	0.58	0.30
O2	0.04	0.00	0.17	0.10	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.19	0.26	0.05	0.08	0.08	0.25	0.10
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.06	0.02	0.07	0.04	0.08	0.03	0.09	0.07	0.19	0.00	0.12	0.02	0.10	0.11	0.12	0.12
O3'	0.13	0.19	0.08	0.01	0.12	0.04	0.07	0.09	0.06	0.12	0.17	0.12	0.26	0.12	0.00	0.11	0.12	0.17	0.16	0.13
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.11	0.00	0.07	0.06	0.18	0.10
O5'	0.07	0.11	0.09	0.09	0.19	0.01	0.22	0.01	0.20	0.12	0.15	0.21	0.08	0.10	0.12	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.11	0.09	0.09	0.22	0.07	0.22	0.07	0.16	0.10	0.17	0.26	0.08	0.11	0.17	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.32	0.09	0.12	0.53	0.03	0.58	0.01	0.47	0.33	0.43	0.58	0.25	0.12	0.16	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.14	0.10	0.10	0.26	0.02	0.30	0.01	0.25	0.15	0.20	0.30	0.10	0.12	0.13	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00