Doublet Group distance statistics: 54692

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.018, 0.025, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.018 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.011, 0.021, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.021 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.013, 0.023, 0.034, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.018, 0.035, 0.051, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.035 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.031, 0.057, 0.083, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.057 std_dev=0.026
O2	A	0, 0.034, 0.061, 0.087, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.061 std_dev=0.027
C2'	A	0, 0.040, 0.130, 0.221, 0.274 max_d=0.274 avg_d=0.130 std_dev=0.091
O4'	A	0, 0.026, 0.129, 0.232, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.129 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.047, 0.314, 0.582, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.314 std_dev=0.268
C5	B	0, 0.060, 0.378, 0.696, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.378 std_dev=0.318
C6	B	0, 0.031, 0.368, 0.705, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.368 std_dev=0.337
C4	B	0, 0.034, 0.372, 0.711, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.372 std_dev=0.339
N4	B	0, 0.056, 0.395, 0.735, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.395 std_dev=0.339
O2'	A	0, -0.008, 0.340, 0.688, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.340 std_dev=0.348
N3	B	0, 0.003, 0.372, 0.740, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.372 std_dev=0.368
C3'	A	0, -0.004, 0.365, 0.734, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.365 std_dev=0.369
N1	B	0, -0.005, 0.381, 0.766, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.381 std_dev=0.385
C2	B	0, -0.014, 0.384, 0.782, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.384 std_dev=0.398
C3'	B	0, 0.079, 0.481, 0.884, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.481 std_dev=0.403
OP1	A	0, 0.114, 0.521, 0.929, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.521 std_dev=0.408
P	A	0, 0.088, 0.505, 0.921, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.505 std_dev=0.417
O3'	B	0, 0.089, 0.509, 0.928, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.509 std_dev=0.420
C4'	B	0, 0.116, 0.539, 0.962, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.539 std_dev=0.423
C1'	B	0, 0.027, 0.450, 0.873, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.450 std_dev=0.423
C5'	B	0, 0.180, 0.607, 1.034, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.607 std_dev=0.427
O4'	B	0, 0.097, 0.524, 0.951, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.524 std_dev=0.427
C2'	B	0, -0.017, 0.412, 0.841, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.412 std_dev=0.429
O2	B	0, -0.016, 0.423, 0.863, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.423 std_dev=0.439
OP2	A	0, 0.170, 0.616, 1.062, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.616 std_dev=0.446
OP1	B	0, 0.159, 0.606, 1.053, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.606 std_dev=0.447
P	B	0, 0.155, 0.621, 1.086, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.621 std_dev=0.465
C5'	A	0, 0.035, 0.507, 0.979, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.507 std_dev=0.472
O5'	B	0, 0.124, 0.607, 1.090, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.607 std_dev=0.483
O2'	B	0, -0.031, 0.459, 0.950, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.459 std_dev=0.491
OP2	B	0, 0.119, 0.615, 1.110, 1.606 max_d=1.606 avg_d=0.615 std_dev=0.495
O5'	A	0, 0.026, 0.531, 1.037, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.531 std_dev=0.506
O3'	A	0, 0.010, 0.691, 1.372, 2.173 max_d=2.173 avg_d=0.691 std_dev=0.681

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.20	0.52	0.25
C2	0.03	0.00	0.06	0.12	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.24	0.10	0.05	0.21	0.14	0.39	0.14
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.07	0.07	0.08	0.00	0.03	0.02	0.08	0.25	0.48	0.25
C3'	0.03	0.12	0.00	0.00	0.24	0.01	0.28	0.03	0.27	0.16	0.18	0.25	0.07	0.02	0.00	0.02	0.14	0.17	0.23	0.11
C4	0.03	0.01	0.06	0.24	0.00	0.13	0.00	0.28	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.23	0.06	0.36	0.10	0.22	0.09
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.13	0.00	0.17	0.01	0.17	0.08	0.08	0.14	0.05	0.16	0.03	0.00	0.03	0.07	0.29	0.11
C5	0.02	0.01	0.05	0.28	0.00	0.17	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.30	0.04	0.40	0.11	0.21	0.11
C5'	0.03	0.14	0.02	0.03	0.28	0.01	0.33	0.00	0.29	0.16	0.20	0.30	0.07	0.13	0.06	0.03	0.01	0.04	0.11	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.27	0.01	0.17	0.00	0.29	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.26	0.04	0.33	0.10	0.35	0.09
N1	0.02	0.01	0.03	0.16	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.11	0.03	0.20	0.14	0.43	0.15
N3	0.03	0.00	0.07	0.18	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.14	0.06	0.29	0.11	0.30	0.09
N4	0.03	0.02	0.07	0.25	0.00	0.14	0.01	0.30	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.23	0.26	0.06	0.40	0.11	0.16	0.12
O2	0.04	0.00	0.08	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.30	0.17	0.06	0.14	0.18	0.43	0.18
O2'	0.01	0.24	0.00	0.02	0.21	0.16	0.13	0.13	0.08	0.12	0.26	0.23	0.30	0.00	0.08	0.12	0.12	0.12	0.41	0.14
O3'	0.05	0.10	0.03	0.00	0.23	0.03	0.30	0.06	0.26	0.11	0.14	0.26	0.17	0.08	0.00	0.03	0.21	0.30	0.24	0.24
O4'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.06	0.00	0.04	0.03	0.04	0.03	0.06	0.06	0.06	0.12	0.03	0.00	0.09	0.19	0.56	0.30
O5'	0.06	0.21	0.08	0.14	0.36	0.03	0.40	0.01	0.33	0.20	0.29	0.40	0.14	0.12	0.21	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.20	0.14	0.25	0.17	0.10	0.07	0.11	0.04	0.10	0.14	0.11	0.11	0.18	0.12	0.30	0.19	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.52	0.39	0.48	0.23	0.22	0.29	0.21	0.11	0.35	0.43	0.30	0.16	0.43	0.41	0.24	0.56	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.14	0.25	0.11	0.09	0.11	0.11	0.01	0.09	0.15	0.09	0.12	0.18	0.14	0.24	0.30	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.20	0.21	0.23	0.23	0.25	0.26	0.29	0.26	0.23	0.20	0.23	0.18	0.21	0.21	0.23	0.39	0.27	0.37	0.34
C2	0.11	0.12	0.09	0.12	0.18	0.15	0.19	0.21	0.16	0.12	0.15	0.21	0.11	0.10	0.12	0.13	0.28	0.18	0.31	0.26
C2'	0.19	0.16	0.18	0.20	0.21	0.23	0.25	0.29	0.23	0.19	0.17	0.22	0.14	0.18	0.21	0.20	0.40	0.33	0.43	0.38
C3'	0.08	0.05	0.06	0.07	0.09	0.11	0.12	0.15	0.11	0.08	0.06	0.09	0.08	0.05	0.08	0.09	0.16	0.27	0.28	0.23
C4	0.06	0.13	0.06	0.07	0.18	0.09	0.15	0.13	0.09	0.09	0.17	0.22	0.13	0.06	0.08	0.08	0.16	0.09	0.18	0.15
C4'	0.11	0.10	0.12	0.06	0.10	0.05	0.12	0.08	0.11	0.10	0.09	0.10	0.11	0.14	0.06	0.06	0.17	0.15	0.19	0.15
C5	0.06	0.12	0.05	0.07	0.18	0.10	0.18	0.15	0.12	0.09	0.16	0.21	0.12	0.06	0.09	0.08	0.20	0.11	0.22	0.19
C5'	0.17	0.18	0.17	0.13	0.18	0.12	0.18	0.11	0.19	0.18	0.18	0.17	0.19	0.13	0.10	0.15	0.10	0.18	0.14	0.11
C6	0.12	0.13	0.08	0.10	0.19	0.16	0.23	0.22	0.20	0.15	0.16	0.21	0.11	0.07	0.09	0.15	0.31	0.18	0.31	0.28
N1	0.16	0.16	0.13	0.15	0.21	0.19	0.23	0.24	0.21	0.17	0.18	0.22	0.14	0.13	0.14	0.17	0.33	0.21	0.34	0.30
N3	0.06	0.10	0.04	0.07	0.16	0.10	0.15	0.16	0.10	0.08	0.15	0.21	0.10	0.05	0.08	0.08	0.20	0.12	0.23	0.20
N4	0.11	0.17	0.12	0.12	0.22	0.11	0.17	0.12	0.11	0.13	0.21	0.27	0.18	0.12	0.12	0.11	0.12	0.09	0.07	0.08
O2	0.13	0.14	0.12	0.14	0.18	0.17	0.19	0.22	0.17	0.14	0.16	0.20	0.12	0.13	0.15	0.14	0.29	0.20	0.32	0.28
O2'	0.14	0.14	0.11	0.12	0.23	0.17	0.28	0.26	0.24	0.17	0.17	0.26	0.12	0.09	0.09	0.16	0.40	0.37	0.51	0.43
O3'	0.17	0.08	0.16	0.21	0.07	0.26	0.13	0.31	0.16	0.13	0.05	0.07	0.11	0.14	0.24	0.22	0.21	0.46	0.34	0.34
O4'	0.24	0.19	0.24	0.26	0.20	0.27	0.25	0.30	0.26	0.23	0.17	0.18	0.16	0.24	0.25	0.25	0.39	0.26	0.33	0.33
O5'	0.08	0.05	0.09	0.04	0.09	0.06	0.13	0.12	0.12	0.07	0.05	0.09	0.10	0.16	0.02	0.07	0.13	0.28	0.23	0.20
OP1	0.05	0.06	0.06	0.02	0.07	0.05	0.09	0.10	0.07	0.04	0.05	0.08	0.11	0.09	0.02	0.04	0.21	0.19	0.19	0.17
OP2	0.07	0.17	0.09	0.04	0.24	0.07	0.23	0.13	0.17	0.14	0.22	0.28	0.14	0.05	0.01	0.03	0.16	0.22	0.16	0.10
P	0.03	0.05	0.05	0.01	0.09	0.04	0.10	0.06	0.07	0.04	0.07	0.10	0.06	0.05	0.00	0.03	0.13	0.14	0.10	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.00	0.09	0.09	0.10	0.07
C2	0.03	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.05	0.03	0.10	0.09	0.09	0.05
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.04	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.08	0.07	0.05
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.06	0.08	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.03
C4	0.03	0.01	0.05	0.07	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.08	0.05	0.13	0.09	0.10	0.07
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.05	0.07	0.04	0.03	0.02	0.00	0.03	0.08	0.05	0.02
C5	0.03	0.01	0.05	0.08	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.05	0.13	0.09	0.10	0.07
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.10	0.01	0.11	0.00	0.09	0.05	0.07	0.11	0.05	0.03	0.04	0.03	0.02	0.07	0.04	0.03
C6	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.05	0.12	0.08	0.11	0.06
N1	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03	0.10	0.08	0.10	0.06
N3	0.03	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.07	0.04	0.11	0.09	0.09	0.06
N4	0.03	0.02	0.04	0.08	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.08	0.05	0.14	0.10	0.10	0.09
O2	0.04	0.01	0.05	0.05	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.08	0.04	0.10	0.10	0.10	0.07
O2'	0.04	0.07	0.01	0.01	0.05	0.03	0.05	0.03	0.04	0.04	0.07	0.06	0.09	0.00	0.05	0.04	0.04	0.09	0.06	0.04
O3'	0.03	0.05	0.03	0.01	0.08	0.02	0.09	0.04	0.07	0.04	0.07	0.08	0.08	0.05	0.00	0.02	0.11	0.08	0.05	0.06
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.03	0.05	0.03	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.00	0.12	0.08	0.13	0.08
O5'	0.09	0.10	0.04	0.04	0.13	0.03	0.13	0.02	0.12	0.10	0.11	0.14	0.10	0.04	0.11	0.12	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.09	0.09	0.08	0.08	0.09	0.08	0.09	0.07	0.08	0.08	0.09	0.10	0.10	0.09	0.08	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.09	0.07	0.03	0.10	0.05	0.10	0.04	0.11	0.10	0.09	0.10	0.10	0.06	0.05	0.13	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.05	0.05	0.03	0.07	0.02	0.07	0.03	0.06	0.06	0.06	0.09	0.07	0.04	0.06	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00