Doublet Group distance statistics: 54705

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.003, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C5	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N4	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
O5'	A	0, 0.000, 0.203, 0.405, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.203 std_dev=0.203
O4'	A	0, 0.000, 0.217, 0.434, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.217 std_dev=0.217
C2'	A	0, 0.000, 0.280, 0.561, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.280 std_dev=0.280
C4'	A	0, 0.000, 0.344, 0.688, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.344 std_dev=0.344
C3'	A	0, 0.000, 0.391, 0.783, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.391 std_dev=0.391
O2'	A	0, 0.000, 0.396, 0.791, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.396 std_dev=0.396
O3'	A	0, 0.000, 0.453, 0.906, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.453 std_dev=0.453
OP1	B	0, 0.000, 0.501, 1.003, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.501 std_dev=0.501
OP2	B	0, 0.000, 0.518, 1.036, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.518 std_dev=0.518
P	B	0, 0.000, 0.720, 1.440, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.720 std_dev=0.720
OP2	A	0, 0.000, 0.747, 1.494, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.747 std_dev=0.747
C5'	A	0, 0.000, 0.800, 1.599, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.800 std_dev=0.800
P	A	0, 0.000, 0.872, 1.743, 1.743 max_d=1.743 avg_d=0.872 std_dev=0.872
OP1	A	0, 0.000, 1.631, 3.263, 3.263 max_d=3.263 avg_d=1.631 std_dev=1.631
O5'	B	0, 0.000, 1.880, 3.760, 3.760 max_d=3.760 avg_d=1.880 std_dev=1.880
C5'	B	0, 0.000, 2.326, 4.653, 4.653 max_d=4.653 avg_d=2.326 std_dev=2.326
C4'	B	0, 0.000, 3.306, 6.611, 6.611 max_d=6.611 avg_d=3.306 std_dev=3.306
O4'	B	0, 0.000, 4.057, 8.114, 8.114 max_d=8.114 avg_d=4.057 std_dev=4.057
C3'	B	0, 0.000, 4.285, 8.569, 8.569 max_d=8.569 avg_d=4.285 std_dev=4.285
O3'	B	0, 0.000, 4.711, 9.422, 9.422 max_d=9.422 avg_d=4.711 std_dev=4.711
C2'	B	0, 0.000, 5.022, 10.044, 10.044 max_d=10.044 avg_d=5.022 std_dev=5.022
C1'	B	0, 0.000, 5.133, 10.265, 10.265 max_d=10.265 avg_d=5.133 std_dev=5.133
C6	B	0, 0.000, 5.167, 10.334, 10.334 max_d=10.334 avg_d=5.167 std_dev=5.167
O2'	B	0, 0.000, 5.472, 10.944, 10.944 max_d=10.944 avg_d=5.472 std_dev=5.472
C5	B	0, 0.000, 5.752, 11.504, 11.504 max_d=11.504 avg_d=5.752 std_dev=5.752
N1	B	0, 0.000, 5.777, 11.553, 11.553 max_d=11.553 avg_d=5.777 std_dev=5.777
C4	B	0, 0.000, 7.032, 14.063, 14.063 max_d=14.063 avg_d=7.032 std_dev=7.032
C2	B	0, 0.000, 7.036, 14.072, 14.072 max_d=14.072 avg_d=7.036 std_dev=7.036
O2	B	0, 0.000, 7.566, 15.131, 15.131 max_d=15.131 avg_d=7.566 std_dev=7.566
N3	B	0, 0.000, 7.640, 15.280, 15.280 max_d=15.280 avg_d=7.640 std_dev=7.640
N4	B	0, 0.000, 7.658, 15.315, 15.315 max_d=15.315 avg_d=7.658 std_dev=7.658

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.24	0.08	0.21
C2	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.24	0.08	0.24
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.03	0.08	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.03	0.00	0.15	0.15	0.03	0.21
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.08	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.25	0.09	0.01	0.20
C4	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.10	0.25	0.04	0.27
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.09	0.17	0.07
C5	0.00	0.01	0.08	0.06	0.00	0.04	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.11	0.26	0.02	0.27
C5'	0.05	0.16	0.03	0.04	0.21	0.01	0.19	0.00	0.16	0.14	0.19	0.22	0.13	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.28	0.01
C6	0.00	0.00	0.08	0.08	0.00	0.03	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.10	0.26	0.04	0.27
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.25	0.07	0.24
N3	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.08	0.25	0.06	0.26
N4	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.11	0.25	0.02	0.26
O2	0.01	0.00	0.11	0.13	0.00	0.03	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.05	0.24	0.09	0.23
O2'	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03	0.04	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.06	0.03	0.05	0.11	0.07	0.14
O3'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.09	0.02	0.10	0.02	0.03	0.04	0.11	0.06	0.00	0.00	0.22	0.06	0.03	0.11
O4'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.06	0.27	0.11	0.18
O5'	0.02	0.06	0.15	0.25	0.10	0.02	0.11	0.01	0.10	0.06	0.08	0.11	0.05	0.05	0.22	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.24	0.24	0.15	0.09	0.25	0.09	0.26	0.07	0.26	0.25	0.25	0.25	0.24	0.11	0.06	0.27	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.08	0.03	0.01	0.04	0.17	0.02	0.28	0.04	0.07	0.06	0.02	0.09	0.07	0.03	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.21	0.24	0.21	0.20	0.27	0.07	0.27	0.01	0.27	0.24	0.26	0.26	0.23	0.14	0.11	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.65	1.20	0.88	0.21	1.59	0.05	1.36	0.37	1.02	0.97	1.48	1.88	1.13	0.95	0.05	0.21	0.33	0.31	0.27	0.36
C2	1.28	2.04	1.55	0.83	2.54	0.41	2.22	0.01	1.77	1.72	2.42	2.89	1.94	1.60	0.68	0.69	0.02	0.35	0.30	0.32
C2'	0.82	1.49	0.93	0.18	1.93	0.01	1.62	0.42	1.22	1.19	1.83	2.30	1.43	1.01	0.01	0.36	0.36	0.42	0.42	0.43
C3'	0.56	1.12	0.60	0.11	1.49	0.19	1.25	0.55	0.91	0.87	1.39	1.79	1.06	0.66	0.30	0.21	0.48	0.40	0.41	0.41
C4	1.29	1.95	1.63	0.96	2.36	0.49	2.17	0.14	1.82	1.72	2.24	2.53	1.82	1.58	0.77	0.71	0.16	0.35	0.28	0.29
C4'	0.27	0.63	0.40	0.22	0.89	0.29	0.75	0.56	0.52	0.48	0.81	1.10	0.58	0.46	0.39	0.01	0.49	0.22	0.18	0.29
C5	0.75	1.23	1.06	0.47	1.59	0.10	1.50	0.17	1.21	1.08	1.46	1.75	1.12	0.99	0.27	0.28	0.13	0.33	0.27	0.35
C5'	0.08	0.26	0.18	0.38	0.40	0.33	0.35	0.53	0.23	0.19	0.35	0.51	0.23	0.23	0.54	0.09	0.44	0.02	0.04	0.09
C6	0.56	1.03	0.84	0.23	1.40	0.07	1.28	0.34	0.97	0.87	1.27	1.60	0.94	0.82	0.05	0.14	0.30	0.31	0.26	0.36
N1	0.84	1.44	1.10	0.43	1.87	0.10	1.65	0.23	1.28	1.20	1.73	2.15	1.34	1.13	0.26	0.35	0.20	0.33	0.28	0.35
N3	1.51	2.31	1.81	1.09	2.80	0.60	2.48	0.19	2.03	1.98	2.68	3.08	2.20	1.84	0.93	0.87	0.18	0.35	0.29	0.29
N4	1.55	2.20	1.95	1.30	2.50	0.73	2.31	0.38	2.04	1.98	2.44	2.59	2.08	1.86	1.09	0.91	0.40	0.35	0.25	0.23
O2	1.43	2.28	1.68	0.93	2.79	0.50	2.37	0.06	1.90	1.89	2.69	3.22	2.20	1.78	0.80	0.81	0.05	0.35	0.30	0.31
O2'	0.84	1.53	0.97	0.21	1.95	0.00	1.60	0.41	1.21	1.20	1.88	2.34	1.49	1.09	0.04	0.37	0.35	0.40	0.39	0.41
O3'	0.58	1.16	0.54	0.19	1.52	0.21	1.24	0.60	0.90	0.89	1.45	1.84	1.12	0.62	0.40	0.25	0.51	0.43	0.45	0.42
O4'	0.24	0.60	0.48	0.13	0.89	0.30	0.76	0.54	0.52	0.46	0.80	1.10	0.54	0.53	0.27	0.10	0.49	0.26	0.19	0.35
O5'	0.57	0.42	0.44	0.98	0.29	0.93	0.35	1.08	0.45	0.48	0.33	0.17	0.45	0.41	1.16	0.72	0.94	0.35	0.30	0.47
OP1	1.16	1.35	1.02	1.37	1.41	1.17	1.32	1.15	1.22	1.25	1.42	1.45	1.36	1.00	1.46	1.10	1.08	0.32	0.22	0.46
OP2	0.97	1.01	0.85	1.26	0.97	1.12	0.97	1.15	0.98	1.00	1.00	0.91	1.02	0.85	1.40	1.00	1.02	0.24	0.10	0.35
P	1.02	1.08	0.85	1.26	1.04	1.16	1.02	1.19	1.01	1.04	1.07	1.00	1.09	0.84	1.38	1.06	1.10	0.36	0.27	0.51

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.06	0.44	0.18	0.13
C2	0.00	0.00	0.02	0.12	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.35	0.18	0.01	0.01	0.36	0.35	0.09
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.40	0.02	0.52	0.25
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.33	0.00	0.43	0.01	0.40	0.20	0.20	0.36	0.04	0.01	0.01	0.01	0.23	0.02	0.19	0.13
C4	0.00	0.00	0.01	0.33	0.00	0.16	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.32	0.14	0.02	0.08	0.19	0.50	0.02
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.16	0.00	0.22	0.00	0.20	0.10	0.10	0.18	0.02	0.24	0.02	0.00	0.00	0.39	0.13	0.17
C5	0.01	0.00	0.03	0.43	0.00	0.22	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.30	0.02	0.10	0.13	0.51	0.07
C5'	0.01	0.10	0.10	0.01	0.24	0.00	0.29	0.00	0.24	0.11	0.16	0.27	0.02	0.12	0.14	0.01	0.00	0.03	0.14	0.02
C6	0.01	0.00	0.04	0.40	0.00	0.20	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.25	0.01	0.06	0.19	0.43	0.03
N1	0.00	0.00	0.01	0.20	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.03	0.01	0.00	0.33	0.33	0.06
N3	0.01	0.00	0.01	0.20	0.00	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.38	0.06	0.01	0.04	0.28	0.43	0.05
N4	0.00	0.01	0.00	0.36	0.00	0.18	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.35	0.18	0.02	0.10	0.14	0.55	0.04
O2	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.40	0.41	0.02	0.03	0.44	0.28	0.15
O2'	0.00	0.35	0.00	0.01	0.32	0.24	0.20	0.12	0.12	0.18	0.38	0.35	0.40	0.00	0.04	0.18	0.17	0.42	0.25	0.07
O3'	0.24	0.18	0.02	0.01	0.14	0.02	0.30	0.14	0.25	0.03	0.06	0.18	0.41	0.04	0.00	0.16	0.08	0.21	0.09	0.07
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.18	0.16	0.00	0.13	0.64	0.10	0.34
O5'	0.06	0.01	0.40	0.23	0.08	0.00	0.10	0.00	0.06	0.00	0.04	0.10	0.03	0.17	0.08	0.13	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.44	0.36	0.02	0.02	0.19	0.39	0.13	0.03	0.19	0.33	0.28	0.14	0.44	0.42	0.21	0.64	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.35	0.52	0.19	0.50	0.13	0.51	0.14	0.43	0.33	0.43	0.55	0.28	0.25	0.09	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.09	0.25	0.13	0.02	0.17	0.07	0.02	0.03	0.06	0.05	0.04	0.15	0.07	0.07	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00