Doublet Group distance statistics: 54707

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C6	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
O2	A	0, 0.000, 0.053, 0.107, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.053 std_dev=0.053
N4	A	0, 0.000, 0.069, 0.139, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.069 std_dev=0.069
OP2	B	0, 0.000, 0.411, 0.822, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.411 std_dev=0.411
O4'	A	0, 0.000, 0.434, 0.868, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.434 std_dev=0.434
C4'	A	0, 0.000, 0.512, 1.024, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.512 std_dev=0.512
N1	B	0, 0.000, 0.516, 1.031, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.516 std_dev=0.516
O2	B	0, 0.000, 0.518, 1.035, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.518 std_dev=0.518
O4'	B	0, 0.000, 0.520, 1.041, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.520 std_dev=0.520
C2	B	0, 0.000, 0.528, 1.057, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.528 std_dev=0.528
C1'	B	0, 0.000, 0.530, 1.060, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.530 std_dev=0.530
P	B	0, 0.000, 0.531, 1.062, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.531 std_dev=0.531
C2'	A	0, 0.000, 0.543, 1.087, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.543 std_dev=0.543
C6	B	0, 0.000, 0.569, 1.139, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.569 std_dev=0.569
C5'	B	0, 0.000, 0.582, 1.163, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.582 std_dev=0.582
C5	B	0, 0.000, 0.582, 1.165, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.582 std_dev=0.582
C4	B	0, 0.000, 0.609, 1.217, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.609 std_dev=0.609
N3	B	0, 0.000, 0.609, 1.217, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.609 std_dev=0.609
OP1	B	0, 0.000, 0.614, 1.228, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.614 std_dev=0.614
C4'	B	0, 0.000, 0.619, 1.237, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.619 std_dev=0.619
O5'	A	0, 0.000, 0.649, 1.298, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.649 std_dev=0.649
C2'	B	0, 0.000, 0.652, 1.305, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.652 std_dev=0.652
OP1	A	0, 0.000, 0.655, 1.310, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.655 std_dev=0.655
C3'	B	0, 0.000, 0.685, 1.369, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.685 std_dev=0.685
N4	B	0, 0.000, 0.688, 1.376, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.688 std_dev=0.688
O2'	B	0, 0.000, 0.695, 1.390, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.695 std_dev=0.695
P	A	0, 0.000, 0.707, 1.414, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.707 std_dev=0.707
C3'	A	0, 0.000, 0.711, 1.423, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.711 std_dev=0.711
O5'	B	0, 0.000, 0.712, 1.424, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.712 std_dev=0.712
O2'	A	0, 0.000, 0.762, 1.524, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.762 std_dev=0.762
O3'	B	0, 0.000, 0.826, 1.653, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.826 std_dev=0.826
O3'	A	0, 0.000, 0.934, 1.868, 1.868 max_d=1.868 avg_d=0.934 std_dev=0.934
C5'	A	0, 0.000, 1.121, 2.243, 2.243 max_d=2.243 avg_d=1.121 std_dev=1.121
OP2	A	0, 0.000, 1.248, 2.496, 2.496 max_d=2.496 avg_d=1.248 std_dev=1.248

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.33	0.79	0.46
C2	0.01	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.12	0.38	0.76	0.41
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.14	0.03	0.15	0.04	0.02	0.08	0.19	0.00	0.01	0.00	0.16	0.02	0.55	0.23
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.18	0.02	0.19	0.03	0.03	0.08	0.20	0.02	0.01	0.01	0.27	0.24	0.32	0.01
C4	0.00	0.01	0.07	0.07	0.00	0.01	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.21	0.45	0.65	0.36
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.03	0.01	0.02	0.04	0.54	0.25
C5	0.01	0.01	0.14	0.18	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.22	0.07	0.24	0.45	0.63	0.34
C5'	0.05	0.11	0.03	0.02	0.11	0.01	0.09	0.00	0.07	0.08	0.12	0.11	0.11	0.03	0.02	0.03	0.00	0.18	0.35	0.00
C6	0.01	0.00	0.15	0.19	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.21	0.07	0.21	0.42	0.74	0.39
N1	0.00	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.13	0.38	0.78	0.42
N3	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.17	0.42	0.71	0.39
N4	0.01	0.01	0.08	0.08	0.00	0.01	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.04	0.23	0.47	0.57	0.33
O2	0.02	0.01	0.19	0.20	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.21	0.06	0.08	0.34	0.77	0.42
O2'	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.03	0.08	0.03	0.07	0.02	0.02	0.06	0.07	0.00	0.03	0.04	0.03	0.15	0.67	0.39
O3'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.12	0.03	0.22	0.02	0.21	0.05	0.00	0.13	0.21	0.03	0.00	0.02	0.20	0.39	0.20	0.08
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.03	0.07	0.02	0.00	0.04	0.06	0.04	0.02	0.00	0.08	0.38	0.83	0.52
O5'	0.03	0.12	0.16	0.27	0.21	0.02	0.24	0.00	0.21	0.13	0.17	0.23	0.08	0.03	0.20	0.08	0.00	0.04	0.01	0.00
OP1	0.33	0.38	0.02	0.24	0.45	0.04	0.45	0.18	0.42	0.38	0.42	0.47	0.34	0.15	0.39	0.38	0.04	0.00	0.01	0.01
OP2	0.79	0.76	0.55	0.32	0.65	0.54	0.63	0.35	0.74	0.78	0.71	0.57	0.77	0.67	0.20	0.83	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.46	0.41	0.23	0.01	0.36	0.25	0.34	0.00	0.39	0.42	0.39	0.33	0.42	0.39	0.08	0.52	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.16	0.40	0.49	0.22	0.44	0.04	0.42	0.19	0.11	0.31	0.32	0.21	0.41	0.58	0.33	0.49	0.38	0.15	0.35
C2	0.24	0.10	0.35	0.42	0.19	0.38	0.12	0.38	0.25	0.14	0.27	0.36	0.15	0.33	0.47	0.29	0.46	0.36	0.20	0.34
C2'	0.29	0.02	0.37	0.35	0.05	0.32	0.10	0.25	0.20	0.18	0.09	0.14	0.01	0.43	0.42	0.28	0.33	0.16	0.03	0.17
C3'	0.04	0.26	0.03	0.03	0.26	0.01	0.14	0.03	0.08	0.13	0.32	0.29	0.29	0.11	0.13	0.04	0.09	0.04	0.22	0.05
C4	0.16	0.14	0.24	0.34	0.28	0.33	0.02	0.36	0.14	0.05	0.29	0.44	0.15	0.24	0.37	0.23	0.46	0.39	0.28	0.37
C4'	0.15	0.47	0.08	0.06	0.41	0.06	0.23	0.09	0.16	0.27	0.52	0.43	0.55	0.02	0.25	0.06	0.20	0.17	0.07	0.12
C5	0.10	0.23	0.18	0.30	0.37	0.31	0.17	0.35	0.02	0.04	0.37	0.48	0.23	0.19	0.34	0.19	0.48	0.40	0.23	0.37
C5'	0.53	0.72	0.54	0.36	0.55	0.31	0.40	0.19	0.40	0.57	0.69	0.52	0.83	0.53	0.20	0.42	0.01	0.07	0.13	0.01
C6	0.12	0.26	0.21	0.35	0.37	0.34	0.15	0.37	0.04	0.05	0.40	0.46	0.27	0.22	0.41	0.21	0.49	0.39	0.16	0.35
N1	0.21	0.19	0.32	0.43	0.29	0.39	0.01	0.39	0.16	0.06	0.36	0.40	0.23	0.32	0.49	0.28	0.48	0.37	0.17	0.35
N3	0.22	0.08	0.31	0.39	0.19	0.36	0.12	0.37	0.24	0.13	0.24	0.39	0.12	0.29	0.43	0.27	0.45	0.37	0.25	0.35
N4	0.15	0.10	0.22	0.30	0.22	0.30	0.01	0.33	0.13	0.06	0.23	0.39	0.11	0.22	0.33	0.21	0.42	0.38	0.32	0.36
O2	0.27	0.04	0.38	0.43	0.08	0.38	0.19	0.37	0.29	0.19	0.20	0.25	0.11	0.37	0.49	0.30	0.43	0.35	0.19	0.32
O2'	0.59	0.30	0.67	0.60	0.15	0.59	0.30	0.50	0.44	0.46	0.15	0.02	0.29	0.76	0.65	0.57	0.53	0.34	0.11	0.35
O3'	0.06	0.13	0.11	0.05	0.16	0.05	0.08	0.03	0.01	0.03	0.19	0.20	0.14	0.22	0.13	0.03	0.08	0.10	0.27	0.08
O4'	0.06	0.52	0.07	0.31	0.47	0.27	0.23	0.31	0.10	0.25	0.60	0.51	0.59	0.11	0.51	0.08	0.38	0.37	0.09	0.29
O5'	0.34	0.58	0.30	0.26	0.61	0.18	0.52	0.17	0.45	0.48	0.64	0.64	0.57	0.12	0.01	0.28	0.10	0.11	0.41	0.19
OP1	0.08	0.09	0.02	0.09	0.02	0.26	0.09	0.39	0.13	0.04	0.10	0.04	0.16	0.05	0.00	0.21	0.52	0.52	0.31	0.50
OP2	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.11	0.10	0.20	0.08	0.03	0.03	0.09	0.03	0.04	0.04	0.07	0.10	0.16	0.06	0.04
P	0.03	0.15	0.04	0.02	0.11	0.02	0.04	0.04	0.02	0.08	0.16	0.12	0.19	0.01	0.01	0.00	0.20	0.10	0.02	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.16	0.07
C2	0.00	0.00	0.05	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.09	0.14	0.22	0.11
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.12	0.02
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03	0.09	0.01	0.01	0.01	0.08	0.04	0.10	0.01
C4	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.09	0.16	0.24	0.15
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02
C5	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.09	0.16	0.23	0.15
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.06	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01
C6	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.10	0.14	0.21	0.13
N1	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.13	0.20	0.11
N3	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.09	0.15	0.24	0.13
N4	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.09	0.17	0.25	0.16
O2	0.01	0.00	0.09	0.09	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.09	0.02	0.09	0.12	0.21	0.10
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.03	0.00	0.01	0.04	0.11	0.01
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.06	0.03	0.09	0.03	0.00	0.02	0.09	0.03	0.09	0.02
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.11	0.10	0.14	0.07
O5'	0.07	0.09	0.02	0.08	0.09	0.01	0.09	0.01	0.10	0.09	0.09	0.09	0.09	0.01	0.09	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.14	0.05	0.04	0.16	0.07	0.16	0.07	0.14	0.13	0.15	0.17	0.12	0.04	0.03	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.22	0.12	0.10	0.24	0.10	0.23	0.08	0.21	0.20	0.24	0.25	0.21	0.11	0.09	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.11	0.02	0.01	0.15	0.02	0.15	0.01	0.13	0.11	0.13	0.16	0.10	0.01	0.02	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00