Doublet Group distance statistics: 54717

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 4, 7, 1, 8, 3, 7, 7, 6, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.001, 0.009, 0.018, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.015, 0.024, 0.034, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.024 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.017, 0.027, 0.037, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.016, 0.027, 0.038, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.027 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.031, 0.059, 0.087, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.059 std_dev=0.028
N4	A	0, 0.055, 0.088, 0.122, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.088 std_dev=0.034
C2'	A	0, 0.089, 0.181, 0.272, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.181 std_dev=0.092
O2'	A	0, 0.100, 0.201, 0.303, 0.449 max_d=0.449 avg_d=0.201 std_dev=0.101
O4'	A	0, 0.076, 0.178, 0.280, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.178 std_dev=0.102
C3'	A	0, 0.154, 0.306, 0.457, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.306 std_dev=0.151
C4'	A	0, 0.123, 0.285, 0.446, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.285 std_dev=0.162
O5'	A	0, 0.081, 0.296, 0.512, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.296 std_dev=0.216
O3'	A	0, 0.249, 0.480, 0.711, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.480 std_dev=0.231
C5'	A	0, 0.162, 0.403, 0.644, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.403 std_dev=0.241
OP2	B	0, 0.276, 0.525, 0.775, 1.272 max_d=1.272 avg_d=0.525 std_dev=0.250
OP2	A	0, 0.087, 0.357, 0.627, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.357 std_dev=0.270
P	B	0, 0.284, 0.561, 0.837, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.561 std_dev=0.276
C3'	B	0, 0.113, 0.392, 0.671, 1.855 max_d=1.855 avg_d=0.392 std_dev=0.279
O5'	B	0, 0.236, 0.520, 0.804, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.520 std_dev=0.284
C8	B	0, 0.144, 0.435, 0.726, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.435 std_dev=0.291
P	A	0, 0.039, 0.351, 0.663, 1.981 max_d=1.981 avg_d=0.351 std_dev=0.312
O3'	B	0, 0.076, 0.404, 0.733, 2.193 max_d=2.193 avg_d=0.404 std_dev=0.328
N9	B	0, 0.193, 0.548, 0.903, 2.186 max_d=2.186 avg_d=0.548 std_dev=0.355
OP1	B	0, 0.384, 0.743, 1.102, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.743 std_dev=0.359
N7	B	0, 0.211, 0.577, 0.942, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.577 std_dev=0.365
C2'	B	0, 0.176, 0.545, 0.913, 2.257 max_d=2.257 avg_d=0.545 std_dev=0.368
C5'	B	0, 0.241, 0.616, 0.991, 2.363 max_d=2.363 avg_d=0.616 std_dev=0.375
C4'	B	0, 0.185, 0.562, 0.939, 2.467 max_d=2.467 avg_d=0.562 std_dev=0.377
C1'	B	0, 0.171, 0.596, 1.020, 2.525 max_d=2.525 avg_d=0.596 std_dev=0.425
O4'	B	0, 0.212, 0.642, 1.072, 2.547 max_d=2.547 avg_d=0.642 std_dev=0.430
OP1	A	0, 0.026, 0.457, 0.889, 2.813 max_d=2.813 avg_d=0.457 std_dev=0.432
O2'	B	0, 0.237, 0.744, 1.251, 3.075 max_d=3.075 avg_d=0.744 std_dev=0.507
C5	B	0, 0.376, 0.918, 1.461, 2.401 max_d=2.401 avg_d=0.918 std_dev=0.543
C4	B	0, 0.330, 0.996, 1.662, 2.578 max_d=2.578 avg_d=0.996 std_dev=0.666
C6	B	0, 0.510, 1.385, 2.261, 2.935 max_d=2.935 avg_d=1.385 std_dev=0.876
N6	B	0, 0.585, 1.468, 2.352, 3.209 max_d=3.209 avg_d=1.468 std_dev=0.883
N3	B	0, 0.412, 1.522, 2.633, 3.187 max_d=3.187 avg_d=1.522 std_dev=1.111
N1	B	0, 0.567, 1.861, 3.155, 3.554 max_d=3.554 avg_d=1.861 std_dev=1.294
C2	B	0, 0.518, 1.906, 3.294, 3.629 max_d=3.629 avg_d=1.906 std_dev=1.388

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.10	0.04
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.07	0.08	0.15	0.08
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.07	0.05	0.13	0.00	0.02	0.01	0.06	0.07	0.13	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.02	0.08	0.04	0.09	0.07	0.13	0.02	0.01	0.01	0.08	0.09	0.12	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.02	0.09	0.12	0.18	0.12
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.06	0.04	0.01	0.00	0.02	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.03	0.09	0.11	0.17	0.11
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.08	0.01	0.08	0.00	0.07	0.04	0.07	0.08	0.06	0.04	0.04	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.03	0.07	0.07	0.14	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.05	0.05	0.13	0.06
N3	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.09	0.11	0.18	0.11
N4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.09	0.03	0.10	0.14	0.20	0.13
O2	0.04	0.01	0.13	0.13	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.17	0.04	0.08	0.09	0.15	0.08
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.06	0.05	0.11	0.00	0.05	0.03	0.05	0.07	0.10	0.05
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.08	0.01	0.09	0.04	0.09	0.04	0.11	0.09	0.17	0.05	0.00	0.01	0.11	0.15	0.16	0.13
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.05	0.09	0.08	0.07
O5'	0.03	0.07	0.06	0.08	0.09	0.02	0.09	0.01	0.07	0.05	0.09	0.10	0.08	0.05	0.11	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.04	0.08	0.07	0.09	0.12	0.06	0.11	0.08	0.07	0.05	0.11	0.14	0.09	0.07	0.15	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.15	0.13	0.12	0.18	0.04	0.17	0.02	0.14	0.13	0.18	0.20	0.15	0.10	0.16	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.08	0.06	0.08	0.12	0.02	0.11	0.01	0.08	0.06	0.11	0.13	0.08	0.05	0.13	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.38	1.42	0.32	0.16	0.83	0.19	0.67	0.15	0.94	0.19	1.30	1.22	0.80	0.28	0.42	0.36	0.11	0.28	0.13	0.16	0.16	0.13
C2	0.29	1.28	0.25	0.12	0.73	0.13	0.66	0.11	1.00	0.21	1.30	1.03	0.90	0.24	0.34	0.29	0.10	0.21	0.11	0.15	0.13	0.11
C2'	0.33	1.49	0.28	0.11	0.82	0.13	0.69	0.10	1.01	0.17	1.40	1.23	0.89	0.26	0.39	0.33	0.08	0.23	0.09	0.20	0.14	0.09
C3'	0.25	1.29	0.22	0.07	0.71	0.07	0.59	0.09	0.87	0.15	1.20	1.07	0.78	0.21	0.31	0.26	0.08	0.14	0.10	0.24	0.16	0.12
C4	0.19	0.87	0.19	0.12	0.54	0.11	0.58	0.12	0.83	0.17	0.94	0.69	0.84	0.24	0.25	0.20	0.11	0.15	0.12	0.16	0.11	0.11
C4'	0.27	1.16	0.24	0.11	0.66	0.12	0.52	0.09	0.74	0.17	1.04	1.01	0.64	0.23	0.31	0.29	0.08	0.19	0.08	0.17	0.14	0.09
C5	0.17	0.82	0.17	0.11	0.55	0.11	0.56	0.13	0.74	0.11	0.85	0.68	0.72	0.25	0.26	0.18	0.10	0.14	0.12	0.15	0.13	0.10
C5'	0.18	0.88	0.17	0.08	0.50	0.07	0.41	0.08	0.58	0.18	0.80	0.77	0.51	0.20	0.23	0.19	0.07	0.12	0.09	0.16	0.14	0.08
C6	0.26	1.01	0.23	0.12	0.68	0.13	0.61	0.13	0.81	0.13	0.99	0.88	0.72	0.24	0.35	0.23	0.10	0.19	0.11	0.16	0.15	0.11
N1	0.31	1.26	0.26	0.13	0.77	0.15	0.66	0.13	0.93	0.17	1.21	1.06	0.80	0.24	0.37	0.29	0.10	0.22	0.12	0.16	0.14	0.12
N3	0.24	1.07	0.22	0.12	0.63	0.12	0.62	0.11	0.96	0.21	1.15	0.85	0.94	0.22	0.30	0.25	0.10	0.18	0.11	0.16	0.12	0.11
N4	0.18	0.71	0.19	0.14	0.44	0.14	0.52	0.14	0.75	0.21	0.80	0.54	0.84	0.29	0.23	0.19	0.11	0.18	0.15	0.18	0.12	0.13
O2	0.32	1.41	0.26	0.13	0.74	0.15	0.64	0.12	1.03	0.24	1.43	1.10	0.93	0.27	0.35	0.32	0.10	0.23	0.11	0.15	0.13	0.11
O2'	0.40	1.61	0.33	0.15	0.87	0.18	0.71	0.12	1.05	0.20	1.49	1.33	0.92	0.30	0.44	0.39	0.10	0.29	0.10	0.18	0.14	0.10
O3'	0.22	1.33	0.20	0.06	0.70	0.06	0.60	0.14	0.90	0.15	1.25	1.09	0.83	0.21	0.30	0.24	0.11	0.11	0.15	0.31	0.19	0.16
O4'	0.35	1.18	0.31	0.18	0.71	0.21	0.55	0.17	0.75	0.19	1.04	1.07	0.62	0.26	0.37	0.36	0.13	0.28	0.15	0.19	0.18	0.16
O5'	0.16	0.82	0.17	0.07	0.49	0.05	0.42	0.09	0.58	0.14	0.77	0.71	0.53	0.19	0.23	0.17	0.01	0.09	0.11	0.20	0.17	0.10
OP1	0.04	0.57	0.08	0.02	0.31	0.08	0.29	0.16	0.42	0.11	0.55	0.47	0.41	0.14	0.11	0.10	0.02	0.05	0.16	0.28	0.20	0.17
OP2	0.06	0.48	0.05	0.06	0.28	0.14	0.30	0.21	0.42	0.17	0.49	0.38	0.44	0.20	0.12	0.05	0.01	0.13	0.21	0.26	0.22	0.16
P	0.04	0.55	0.07	0.01	0.32	0.07	0.29	0.12	0.41	0.12	0.53	0.46	0.40	0.14	0.12	0.08	0.00	0.04	0.13	0.23	0.18	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.14	0.14	0.09
C2	0.03	0.00	0.24	0.26	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.33	0.12	0.22	0.29	0.36	0.24
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.13	0.01	0.07	0.03	0.12	0.10	0.19	0.23	0.09	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.14	0.15	0.08
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.16	0.00	0.14	0.02	0.19	0.09	0.24	0.23	0.18	0.09	0.07	0.02	0.01	0.01	0.06	0.16	0.13	0.09
C4	0.02	0.01	0.13	0.16	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.18	0.06	0.22	0.28	0.32	0.24
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.11	0.07	0.05	0.11	0.12	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.09	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.14	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.03	0.30	0.37	0.42	0.34
C5'	0.03	0.09	0.03	0.02	0.11	0.01	0.19	0.00	0.19	0.22	0.14	0.06	0.24	0.25	0.12	0.05	0.02	0.02	0.01	0.07	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.12	0.19	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.23	0.05	0.32	0.41	0.48	0.37
C8	0.02	0.01	0.10	0.09	0.01	0.11	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.10	0.10	0.28	0.32	0.33	0.31
N1	0.02	0.00	0.19	0.24	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.31	0.09	0.28	0.36	0.43	0.32
N3	0.03	0.00	0.23	0.23	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.28	0.12	0.18	0.24	0.29	0.19
N6	0.02	0.01	0.09	0.18	0.01	0.11	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.22	0.04	0.36	0.48	0.55	0.45
N7	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.12	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.09	0.07	0.33	0.41	0.45	0.40
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.19	0.23	0.25	0.20
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.08	0.04	0.05	0.05	0.08	0.08	0.14	0.16	0.07	0.06	0.03	0.00	0.04	0.06	0.06	0.13	0.12	0.07
O3'	0.01	0.33	0.01	0.01	0.18	0.02	0.16	0.02	0.23	0.10	0.31	0.28	0.22	0.09	0.06	0.04	0.00	0.02	0.07	0.21	0.16	0.11
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.10	0.09	0.12	0.04	0.07	0.01	0.06	0.02	0.00	0.07	0.14	0.11	0.08
O5'	0.09	0.22	0.07	0.06	0.22	0.01	0.30	0.01	0.32	0.28	0.28	0.18	0.36	0.33	0.19	0.06	0.07	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.14	0.29	0.14	0.16	0.28	0.09	0.37	0.07	0.41	0.32	0.36	0.24	0.48	0.41	0.23	0.13	0.21	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.36	0.15	0.13	0.32	0.04	0.42	0.04	0.48	0.33	0.43	0.29	0.55	0.45	0.25	0.12	0.16	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.24	0.08	0.09	0.24	0.02	0.34	0.02	0.37	0.31	0.32	0.19	0.45	0.40	0.20	0.07	0.11	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00