Doublet Group distance statistics: 54718

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 3, 7, 8, 5, 2, 3, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.010, 0.017, 0.023, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.007, 0.019, 0.030, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.022, 0.033, 0.044, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.033 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.009, 0.023, 0.038, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.023 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.036, 0.064, 0.092, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.064 std_dev=0.028
N4	A	0, 0.007, 0.043, 0.079, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.043 std_dev=0.036
O3'	A	0, 0.225, 0.351, 0.477, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.351 std_dev=0.126
C3'	A	0, 0.163, 0.317, 0.471, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.317 std_dev=0.154
OP1	B	0, 0.253, 0.422, 0.592, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.422 std_dev=0.169
O4'	A	0, 0.258, 0.431, 0.604, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.431 std_dev=0.173
C2'	A	0, 0.281, 0.457, 0.633, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.457 std_dev=0.176
C4'	A	0, 0.391, 0.594, 0.796, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.594 std_dev=0.203
P	B	0, 0.416, 0.660, 0.904, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.660 std_dev=0.244
O2'	A	0, 0.509, 0.833, 1.157, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.833 std_dev=0.324
C5'	A	0, 0.677, 1.024, 1.372, 1.743 max_d=1.743 avg_d=1.024 std_dev=0.348
O5'	B	0, 0.700, 1.059, 1.417, 1.683 max_d=1.683 avg_d=1.059 std_dev=0.359
OP2	B	0, 0.774, 1.149, 1.525, 1.873 max_d=1.873 avg_d=1.149 std_dev=0.375
C2'	B	0, 0.767, 1.175, 1.584, 2.013 max_d=2.013 avg_d=1.175 std_dev=0.409
C8	B	0, 0.837, 1.261, 1.686, 2.039 max_d=2.039 avg_d=1.261 std_dev=0.424
C3'	B	0, 0.773, 1.202, 1.631, 2.068 max_d=2.068 avg_d=1.202 std_dev=0.429
O5'	A	0, 0.910, 1.373, 1.836, 2.172 max_d=2.172 avg_d=1.373 std_dev=0.463
O3'	B	0, 0.921, 1.386, 1.851, 2.346 max_d=2.346 avg_d=1.386 std_dev=0.465
O2'	B	0, 0.729, 1.198, 1.668, 2.769 max_d=2.769 avg_d=1.198 std_dev=0.469
C5'	B	0, 0.916, 1.391, 1.865, 2.215 max_d=2.215 avg_d=1.391 std_dev=0.474
P	A	0, 0.972, 1.476, 1.980, 2.468 max_d=2.468 avg_d=1.476 std_dev=0.504
C4'	B	0, 0.942, 1.458, 1.973, 2.429 max_d=2.429 avg_d=1.458 std_dev=0.515
OP2	A	0, 1.009, 1.531, 2.053, 2.974 max_d=2.974 avg_d=1.531 std_dev=0.522
C1'	B	0, 0.994, 1.520, 2.045, 2.547 max_d=2.547 avg_d=1.520 std_dev=0.526
N9	B	0, 1.014, 1.561, 2.109, 2.535 max_d=2.535 avg_d=1.561 std_dev=0.547
O4'	B	0, 1.033, 1.588, 2.143, 2.639 max_d=2.639 avg_d=1.588 std_dev=0.555
N7	B	0, 0.837, 1.408, 1.979, 3.408 max_d=3.408 avg_d=1.408 std_dev=0.571
OP1	A	0, 0.982, 1.601, 2.220, 3.711 max_d=3.711 avg_d=1.601 std_dev=0.619
C4	B	0, 1.139, 1.948, 2.756, 4.631 max_d=4.631 avg_d=1.948 std_dev=0.808
C5	B	0, 0.981, 1.830, 2.680, 5.243 max_d=5.243 avg_d=1.830 std_dev=0.850
N3	B	0, 1.354, 2.377, 3.400, 5.962 max_d=5.962 avg_d=2.377 std_dev=1.023
C6	B	0, 0.995, 2.171, 3.348, 7.506 max_d=7.506 avg_d=2.171 std_dev=1.176
N6	B	0, 0.849, 2.134, 3.419, 8.326 max_d=8.326 avg_d=2.134 std_dev=1.285
C2	B	0, 1.362, 2.664, 3.965, 8.069 max_d=8.069 avg_d=2.664 std_dev=1.302
N1	B	0, 1.190, 2.591, 3.992, 8.914 max_d=8.914 avg_d=2.591 std_dev=1.401

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.06	0.00	0.12	0.13	0.15	0.09
C2	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.05	0.02	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.07	0.08	0.16	0.13	0.20	0.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.05	0.08	0.02	0.04	0.06	0.07	0.00	0.02	0.01	0.35	0.34	0.27	0.33
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.02	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.36	0.35	0.17	0.31
C4	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.03	0.03	0.18	0.11	0.28	0.12
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.05	0.05	0.08	0.02	0.03	0.00	0.02	0.10	0.19	0.02
C5	0.01	0.02	0.07	0.06	0.01	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.03	0.05	0.18	0.13	0.29	0.14
C5'	0.04	0.10	0.05	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.13	0.08	0.11	0.14	0.11	0.04	0.03	0.01	0.01	0.18	0.34	0.02
C6	0.01	0.02	0.08	0.05	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.11	0.04	0.06	0.18	0.14	0.25	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.15	0.11	0.19	0.09
N3	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.06	0.07	0.18	0.12	0.24	0.12
N4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.03	0.04	0.19	0.12	0.30	0.14
O2	0.03	0.01	0.07	0.05	0.02	0.08	0.02	0.11	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.17	0.11	0.12	0.17	0.16	0.18	0.12
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.08	0.02	0.11	0.04	0.11	0.03	0.09	0.09	0.17	0.00	0.03	0.01	0.40	0.41	0.40	0.40
O3'	0.06	0.07	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.05	0.06	0.03	0.11	0.03	0.00	0.07	0.23	0.25	0.13	0.21
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.04	0.12	0.01	0.07	0.00	0.24	0.17	0.27	0.18
O5'	0.12	0.16	0.35	0.36	0.18	0.02	0.18	0.01	0.18	0.15	0.18	0.19	0.17	0.40	0.23	0.24	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.13	0.13	0.34	0.35	0.11	0.10	0.13	0.18	0.14	0.11	0.12	0.12	0.16	0.41	0.25	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.20	0.27	0.17	0.28	0.19	0.29	0.34	0.25	0.19	0.24	0.30	0.18	0.40	0.13	0.27	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.10	0.33	0.31	0.12	0.02	0.14	0.02	0.14	0.09	0.12	0.14	0.12	0.40	0.21	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	1.20	0.15	0.12	0.78	0.14	0.83	0.21	1.07	0.37	1.24	0.96	1.09	0.58	0.45	0.13	0.12	0.16	0.14	0.15	0.10	0.09
C2	0.15	1.18	0.08	0.11	0.75	0.13	0.87	0.20	1.18	0.34	1.33	0.89	1.25	0.60	0.40	0.31	0.11	0.11	0.14	0.14	0.10	0.10
C2'	0.36	1.13	0.31	0.33	0.78	0.35	0.82	0.36	1.04	0.42	1.18	0.94	1.06	0.60	0.51	0.26	0.37	0.34	0.27	0.16	0.22	0.17
C3'	0.36	1.08	0.33	0.31	0.74	0.31	0.76	0.29	0.96	0.40	1.11	0.90	0.97	0.56	0.49	0.28	0.37	0.31	0.21	0.16	0.19	0.14
C4	0.10	0.90	0.17	0.11	0.61	0.13	0.77	0.19	1.02	0.30	1.06	0.68	1.12	0.56	0.32	0.39	0.10	0.11	0.16	0.15	0.12	0.12
C4'	0.25	1.01	0.25	0.11	0.67	0.10	0.68	0.15	0.87	0.32	1.01	0.85	0.87	0.48	0.41	0.22	0.15	0.13	0.10	0.17	0.09	0.12
C5	0.13	0.85	0.13	0.10	0.62	0.13	0.74	0.20	0.92	0.31	0.96	0.68	0.96	0.55	0.35	0.31	0.10	0.13	0.16	0.15	0.10	0.10
C5'	0.30	0.87	0.34	0.17	0.61	0.13	0.60	0.21	0.74	0.33	0.85	0.76	0.73	0.44	0.41	0.41	0.26	0.16	0.15	0.20	0.15	0.20
C6	0.20	0.99	0.11	0.12	0.71	0.15	0.79	0.22	0.98	0.35	1.06	0.81	1.00	0.57	0.42	0.23	0.13	0.16	0.15	0.15	0.10	0.09
N1	0.19	1.15	0.07	0.10	0.76	0.14	0.85	0.21	1.10	0.36	1.24	0.91	1.13	0.60	0.43	0.21	0.10	0.13	0.14	0.15	0.10	0.09
N3	0.13	1.06	0.16	0.13	0.68	0.13	0.84	0.20	1.15	0.32	1.24	0.79	1.26	0.59	0.35	0.40	0.13	0.11	0.16	0.15	0.11	0.11
N4	0.11	0.75	0.24	0.13	0.51	0.14	0.67	0.18	0.90	0.26	0.91	0.56	1.05	0.51	0.26	0.44	0.12	0.12	0.18	0.16	0.15	0.14
O2	0.17	1.26	0.09	0.12	0.76	0.13	0.88	0.20	1.22	0.34	1.41	0.94	1.30	0.60	0.41	0.31	0.13	0.11	0.14	0.15	0.10	0.10
O2'	0.39	1.18	0.32	0.39	0.80	0.45	0.86	0.49	1.10	0.44	1.25	0.95	1.15	0.63	0.52	0.24	0.41	0.42	0.37	0.19	0.34	0.27
O3'	0.26	1.07	0.23	0.22	0.68	0.25	0.72	0.28	0.95	0.33	1.11	0.86	0.97	0.51	0.41	0.16	0.25	0.23	0.20	0.15	0.18	0.14
O4'	0.25	1.11	0.19	0.08	0.73	0.10	0.75	0.15	0.95	0.35	1.11	0.92	0.94	0.53	0.44	0.10	0.08	0.15	0.13	0.20	0.12	0.14
O5'	0.08	0.56	0.16	0.08	0.39	0.09	0.43	0.11	0.54	0.23	0.59	0.46	0.55	0.34	0.24	0.17	0.01	0.04	0.15	0.27	0.18	0.22
OP1	0.14	0.20	0.05	0.02	0.13	0.09	0.14	0.11	0.19	0.07	0.21	0.17	0.20	0.11	0.09	0.08	0.02	0.16	0.18	0.29	0.26	0.29
OP2	0.11	0.32	0.05	0.03	0.25	0.16	0.32	0.10	0.38	0.21	0.37	0.27	0.42	0.29	0.17	0.05	0.02	0.17	0.24	0.41	0.31	0.37
P	0.07	0.25	0.05	0.02	0.17	0.08	0.22	0.07	0.27	0.11	0.28	0.20	0.30	0.18	0.09	0.08	0.01	0.11	0.17	0.28	0.22	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.11	0.00	0.07	0.24	0.18	0.13
C2	0.03	0.00	0.21	0.20	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.13	0.19	0.31	0.18	0.16
C2'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.08	0.11	0.09	0.17	0.21	0.09	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.32	0.22	0.20
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.16	0.01	0.16	0.02	0.19	0.08	0.21	0.18	0.19	0.12	0.10	0.02	0.01	0.01	0.07	0.18	0.10	0.11
C4	0.02	0.01	0.11	0.16	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.07	0.18	0.27	0.17	0.13
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.07	0.07	0.08	0.04	0.11	0.02	0.01	0.02	0.12	0.10	0.05
C5	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.11	0.06	0.04	0.23	0.28	0.16	0.13
C5'	0.03	0.10	0.08	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.11	0.09	0.10	0.10	0.12	0.11	0.06	0.05	0.07	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.19	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.06	0.25	0.31	0.16	0.15
C8	0.02	0.01	0.09	0.08	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.17	0.03	0.07	0.19	0.24	0.16	0.11
N1	0.02	0.00	0.17	0.21	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.10	0.23	0.31	0.17	0.16
N3	0.03	0.01	0.21	0.18	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.08	0.12	0.17	0.29	0.18	0.15
N6	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.07	0.02	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.13	0.10	0.05	0.27	0.32	0.17	0.17
N7	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.16	0.05	0.04	0.23	0.24	0.16	0.11
N9	0.01	0.01	0.02	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.03	0.01	0.14	0.25	0.17	0.11
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.07	0.11	0.11	0.05	0.10	0.17	0.10	0.12	0.13	0.16	0.08	0.00	0.04	0.08	0.11	0.37	0.17	0.21
O3'	0.11	0.10	0.02	0.01	0.05	0.02	0.06	0.07	0.09	0.03	0.10	0.08	0.10	0.05	0.03	0.04	0.00	0.09	0.11	0.20	0.14	0.17
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.07	0.10	0.12	0.05	0.04	0.01	0.08	0.09	0.00	0.07	0.19	0.17	0.11
O5'	0.07	0.19	0.13	0.07	0.18	0.02	0.23	0.01	0.25	0.19	0.23	0.17	0.27	0.23	0.14	0.11	0.11	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.24	0.31	0.32	0.18	0.27	0.12	0.28	0.04	0.31	0.24	0.31	0.29	0.32	0.24	0.25	0.37	0.20	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.18	0.22	0.10	0.17	0.10	0.16	0.08	0.16	0.16	0.17	0.18	0.17	0.16	0.17	0.17	0.14	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.16	0.20	0.11	0.13	0.05	0.13	0.02	0.15	0.11	0.16	0.15	0.17	0.11	0.11	0.21	0.17	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00