Doublet Group distance statistics: 54720

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 3, 6, 1, 5, 6, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C5	A	0, -0.001, 0.010, 0.021, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.010 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.014, 0.038, 0.062, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.038 std_dev=0.024
O2	A	0, 0.007, 0.039, 0.071, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.039 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.037, 0.185, 0.332, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.185 std_dev=0.147
C2'	A	0, 0.058, 0.206, 0.354, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.206 std_dev=0.148
O2'	A	0, 0.095, 0.245, 0.395, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.245 std_dev=0.150
P	B	0, 0.153, 0.313, 0.473, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.313 std_dev=0.160
O5'	B	0, 0.174, 0.386, 0.599, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.386 std_dev=0.212
OP1	B	0, 0.214, 0.439, 0.663, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.439 std_dev=0.225
C4'	A	0, 0.056, 0.295, 0.535, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.295 std_dev=0.239
C3'	A	0, 0.080, 0.328, 0.576, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.328 std_dev=0.248
OP2	B	0, 0.189, 0.440, 0.690, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.440 std_dev=0.250
O5'	A	0, 0.087, 0.422, 0.757, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.422 std_dev=0.335
O3'	A	0, 0.122, 0.468, 0.815, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.468 std_dev=0.346
OP2	A	0, 0.181, 0.558, 0.936, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.558 std_dev=0.378
C3'	B	0, 0.119, 0.501, 0.883, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.501 std_dev=0.382
P	A	0, 0.122, 0.508, 0.894, 1.615 max_d=1.615 avg_d=0.508 std_dev=0.386
C8	B	0, 0.260, 0.655, 1.049, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.655 std_dev=0.395
C5'	B	0, 0.129, 0.532, 0.935, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.532 std_dev=0.403
C2'	B	0, 0.163, 0.568, 0.973, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.568 std_dev=0.405
N9	B	0, 0.198, 0.621, 1.044, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.621 std_dev=0.423
O4'	B	0, 0.150, 0.573, 0.996, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.573 std_dev=0.423
C4'	B	0, 0.126, 0.555, 0.983, 1.790 max_d=1.790 avg_d=0.555 std_dev=0.429
O3'	B	0, 0.129, 0.569, 1.009, 1.774 max_d=1.774 avg_d=0.569 std_dev=0.440
C5'	A	0, 0.076, 0.517, 0.958, 1.612 max_d=1.612 avg_d=0.517 std_dev=0.441
C1'	B	0, 0.142, 0.587, 1.031, 1.888 max_d=1.888 avg_d=0.587 std_dev=0.444
O2'	B	0, 0.212, 0.704, 1.197, 2.128 max_d=2.128 avg_d=0.704 std_dev=0.493
OP1	A	0, 0.149, 0.648, 1.147, 2.124 max_d=2.124 avg_d=0.648 std_dev=0.499
N7	B	0, 0.352, 0.865, 1.378, 1.714 max_d=1.714 avg_d=0.865 std_dev=0.513
C4	B	0, 0.277, 0.827, 1.378, 2.094 max_d=2.094 avg_d=0.827 std_dev=0.550
C5	B	0, 0.367, 0.949, 1.530, 2.098 max_d=2.098 avg_d=0.949 std_dev=0.582
N3	B	0, 0.321, 1.009, 1.698, 2.574 max_d=2.574 avg_d=1.009 std_dev=0.688
C6	B	0, 0.480, 1.224, 1.968, 2.631 max_d=2.631 avg_d=1.224 std_dev=0.744
C2	B	0, 0.443, 1.241, 2.038, 2.882 max_d=2.882 avg_d=1.241 std_dev=0.798
N1	B	0, 0.513, 1.341, 2.170, 2.939 max_d=2.939 avg_d=1.341 std_dev=0.829
N6	B	0, 0.586, 1.446, 2.306, 2.986 max_d=2.986 avg_d=1.446 std_dev=0.860

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.07	0.07	0.27	0.09
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.09	0.03	0.14	0.07	0.26	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.05	0.04	0.14	0.00	0.02	0.01	0.16	0.16	0.19	0.09
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.01	0.11	0.03	0.12	0.05	0.08	0.08	0.15	0.02	0.01	0.01	0.25	0.23	0.15	0.15
C4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.09	0.03	0.21	0.12	0.23	0.11
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.07	0.09	0.07	0.05	0.02	0.00	0.02	0.09	0.24	0.04
C5	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.04	0.22	0.14	0.24	0.12
C5'	0.04	0.13	0.02	0.03	0.19	0.01	0.19	0.00	0.16	0.11	0.17	0.21	0.11	0.05	0.03	0.02	0.01	0.11	0.26	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.14	0.04	0.19	0.10	0.26	0.09
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.05	0.02	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.13	0.07	0.27	0.08
N3	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.09	0.02	0.18	0.10	0.24	0.09
N4	0.02	0.02	0.04	0.08	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.10	0.03	0.23	0.15	0.21	0.12
O2	0.04	0.01	0.14	0.15	0.02	0.07	0.01	0.11	0.02	0.02	0.02	0.03	0.00	0.13	0.18	0.05	0.12	0.08	0.27	0.09
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.03	0.06	0.05	0.13	0.00	0.04	0.05	0.07	0.14	0.20	0.06
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.09	0.02	0.14	0.03	0.14	0.05	0.09	0.10	0.18	0.04	0.00	0.02	0.25	0.30	0.15	0.19
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.00	0.11	0.09	0.30	0.14
O5'	0.07	0.14	0.16	0.25	0.21	0.02	0.22	0.01	0.19	0.13	0.18	0.23	0.12	0.07	0.25	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.07	0.16	0.23	0.12	0.09	0.14	0.11	0.10	0.07	0.10	0.15	0.08	0.14	0.30	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.26	0.19	0.15	0.23	0.24	0.24	0.26	0.26	0.27	0.24	0.21	0.27	0.20	0.15	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.08	0.09	0.15	0.11	0.04	0.12	0.02	0.09	0.08	0.09	0.12	0.09	0.06	0.19	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.33	0.15	0.18	0.21	0.19	0.28	0.20	0.28	0.33	0.30	0.28	0.34	0.38	0.21	0.17	0.17	0.19	0.18	0.22	0.15	0.16
C2	0.17	0.43	0.17	0.14	0.23	0.16	0.17	0.17	0.23	0.26	0.38	0.36	0.22	0.29	0.18	0.19	0.12	0.18	0.16	0.22	0.14	0.15
C2'	0.16	0.34	0.16	0.18	0.21	0.18	0.27	0.19	0.30	0.29	0.32	0.29	0.37	0.35	0.19	0.21	0.19	0.18	0.16	0.28	0.18	0.16
C3'	0.19	0.37	0.22	0.22	0.20	0.21	0.20	0.22	0.24	0.23	0.31	0.33	0.30	0.27	0.16	0.29	0.25	0.19	0.16	0.35	0.26	0.21
C4	0.17	0.47	0.17	0.11	0.31	0.14	0.32	0.16	0.43	0.19	0.49	0.39	0.44	0.22	0.20	0.18	0.09	0.17	0.15	0.22	0.14	0.14
C4'	0.21	0.42	0.22	0.19	0.26	0.19	0.25	0.18	0.28	0.26	0.35	0.39	0.30	0.29	0.20	0.29	0.19	0.20	0.14	0.26	0.22	0.16
C5	0.13	0.35	0.15	0.10	0.22	0.15	0.21	0.18	0.30	0.16	0.36	0.30	0.31	0.17	0.13	0.15	0.09	0.17	0.16	0.22	0.15	0.14
C5'	0.28	0.41	0.31	0.23	0.26	0.24	0.21	0.18	0.23	0.24	0.31	0.41	0.25	0.27	0.21	0.41	0.25	0.25	0.14	0.30	0.30	0.20
C6	0.14	0.31	0.13	0.13	0.16	0.17	0.13	0.21	0.19	0.24	0.27	0.27	0.20	0.24	0.13	0.15	0.09	0.19	0.19	0.23	0.16	0.16
N1	0.13	0.32	0.13	0.14	0.14	0.17	0.14	0.19	0.16	0.28	0.27	0.27	0.21	0.31	0.14	0.16	0.12	0.18	0.17	0.22	0.15	0.16
N3	0.20	0.51	0.18	0.12	0.32	0.15	0.29	0.16	0.42	0.23	0.52	0.42	0.39	0.25	0.22	0.20	0.09	0.19	0.15	0.22	0.14	0.15
N4	0.21	0.52	0.19	0.12	0.37	0.15	0.43	0.17	0.55	0.23	0.57	0.43	0.61	0.32	0.25	0.19	0.11	0.19	0.16	0.24	0.15	0.16
O2	0.20	0.45	0.19	0.16	0.24	0.18	0.22	0.18	0.23	0.28	0.38	0.38	0.26	0.33	0.21	0.22	0.15	0.20	0.16	0.21	0.14	0.15
O2'	0.20	0.41	0.17	0.18	0.30	0.18	0.37	0.19	0.42	0.35	0.43	0.34	0.48	0.42	0.26	0.19	0.18	0.20	0.16	0.26	0.16	0.15
O3'	0.20	0.41	0.23	0.23	0.22	0.22	0.22	0.23	0.27	0.23	0.35	0.36	0.32	0.27	0.17	0.30	0.27	0.20	0.17	0.41	0.31	0.25
O4'	0.19	0.38	0.18	0.20	0.25	0.20	0.26	0.21	0.28	0.29	0.32	0.35	0.30	0.32	0.22	0.21	0.19	0.20	0.18	0.22	0.16	0.16
O5'	0.18	0.25	0.21	0.09	0.17	0.08	0.19	0.11	0.20	0.26	0.22	0.22	0.22	0.25	0.19	0.25	0.02	0.13	0.14	0.35	0.31	0.23
OP1	0.08	0.23	0.12	0.03	0.10	0.07	0.11	0.14	0.14	0.18	0.19	0.21	0.17	0.18	0.08	0.18	0.02	0.04	0.18	0.40	0.36	0.28
OP2	0.10	0.28	0.11	0.07	0.20	0.16	0.25	0.26	0.29	0.24	0.29	0.24	0.33	0.29	0.16	0.10	0.02	0.13	0.22	0.47	0.42	0.35
P	0.05	0.20	0.10	0.02	0.09	0.06	0.12	0.13	0.15	0.19	0.18	0.18	0.18	0.19	0.08	0.13	0.01	0.03	0.13	0.36	0.32	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.08	0.08	0.13	0.09
C2	0.03	0.00	0.16	0.15	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.20	0.04	0.16	0.21	0.29	0.19
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.02	0.07	0.08	0.12	0.16	0.07	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.13	0.12	0.07
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.02	0.09	0.13	0.12	0.14	0.10	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.16	0.15	0.10
C4	0.02	0.01	0.08	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.08	0.02	0.15	0.18	0.25	0.18
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.06	0.06	0.07	0.08	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.02	0.19	0.24	0.31	0.23
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.10	0.06	0.15	0.15	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.09	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.20	0.27	0.35	0.26
C8	0.01	0.02	0.08	0.13	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.06	0.14	0.04	0.18	0.19	0.24	0.19
N1	0.03	0.00	0.12	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.16	0.03	0.18	0.25	0.33	0.23
N3	0.03	0.01	0.16	0.14	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.18	0.04	0.14	0.16	0.24	0.16
N6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.02	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.12	0.02	0.22	0.32	0.39	0.30
N7	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.13	0.03	0.21	0.26	0.31	0.25
N9	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.13	0.14	0.20	0.14
O2'	0.02	0.17	0.01	0.02	0.09	0.04	0.06	0.04	0.09	0.06	0.14	0.17	0.08	0.05	0.03	0.00	0.07	0.03	0.05	0.12	0.10	0.04
O3'	0.02	0.20	0.03	0.01	0.08	0.02	0.07	0.02	0.11	0.14	0.16	0.18	0.12	0.13	0.03	0.07	0.00	0.02	0.10	0.24	0.22	0.15
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.08	0.15	0.12
O5'	0.08	0.16	0.06	0.07	0.15	0.01	0.19	0.01	0.20	0.18	0.18	0.14	0.22	0.21	0.13	0.05	0.10	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.08	0.21	0.13	0.16	0.18	0.07	0.24	0.05	0.27	0.19	0.25	0.16	0.32	0.26	0.14	0.12	0.24	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.29	0.12	0.15	0.25	0.03	0.31	0.02	0.35	0.24	0.33	0.24	0.39	0.31	0.20	0.10	0.22	0.15	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.19	0.07	0.10	0.18	0.02	0.23	0.02	0.26	0.19	0.23	0.16	0.30	0.25	0.14	0.04	0.15	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00