Doublet Group distance statistics: 54723

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 3, 1, 5, 8, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.010 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.010, 0.028, 0.047, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.028 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.017, 0.041, 0.064, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.041 std_dev=0.023
P	B	0, 0.220, 0.380, 0.541, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.380 std_dev=0.161
OP2	B	0, 0.213, 0.426, 0.640, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.426 std_dev=0.213
C2'	A	0, -0.071, 0.192, 0.456, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.192 std_dev=0.263
O4'	A	0, -0.079, 0.199, 0.477, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.199 std_dev=0.278
O2'	A	0, -0.077, 0.263, 0.602, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.263 std_dev=0.340
OP2	A	0, 0.201, 0.547, 0.893, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.547 std_dev=0.346
OP1	B	0, 0.502, 0.868, 1.234, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.868 std_dev=0.366
O5'	B	0, 0.422, 0.794, 1.166, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.794 std_dev=0.372
C4'	A	0, -0.108, 0.313, 0.733, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.313 std_dev=0.421
C3'	A	0, -0.068, 0.366, 0.800, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.366 std_dev=0.434
C3'	B	0, 0.225, 0.659, 1.094, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.659 std_dev=0.435
P	A	0, 0.166, 0.616, 1.065, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.616 std_dev=0.450
O5'	A	0, -0.003, 0.459, 0.922, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.459 std_dev=0.463
C8	B	0, 0.335, 0.799, 1.263, 1.818 max_d=1.818 avg_d=0.799 std_dev=0.464
O3'	B	0, 0.238, 0.728, 1.218, 1.800 max_d=1.800 avg_d=0.728 std_dev=0.490
N7	B	0, 0.311, 0.803, 1.295, 2.058 max_d=2.058 avg_d=0.803 std_dev=0.492
C2'	B	0, 0.306, 0.805, 1.305, 2.015 max_d=2.015 avg_d=0.805 std_dev=0.500
N9	B	0, 0.330, 0.839, 1.348, 2.038 max_d=2.038 avg_d=0.839 std_dev=0.509
C4'	B	0, 0.333, 0.863, 1.392, 2.112 max_d=2.112 avg_d=0.863 std_dev=0.529
C1'	B	0, 0.353, 0.889, 1.424, 2.079 max_d=2.079 avg_d=0.889 std_dev=0.535
C5'	A	0, -0.154, 0.395, 0.945, 2.254 max_d=2.254 avg_d=0.395 std_dev=0.550
C5	B	0, 0.285, 0.835, 1.386, 2.370 max_d=2.370 avg_d=0.835 std_dev=0.550
O4'	B	0, 0.381, 0.932, 1.484, 2.119 max_d=2.119 avg_d=0.932 std_dev=0.552
C4	B	0, 0.299, 0.858, 1.417, 2.365 max_d=2.365 avg_d=0.858 std_dev=0.559
C5'	B	0, 0.298, 0.879, 1.460, 2.537 max_d=2.537 avg_d=0.879 std_dev=0.581
O3'	A	0, -0.004, 0.579, 1.163, 2.573 max_d=2.573 avg_d=0.579 std_dev=0.583
O2'	B	0, 0.422, 1.018, 1.614, 2.464 max_d=2.464 avg_d=1.018 std_dev=0.596
OP1	A	0, 0.290, 0.888, 1.487, 2.361 max_d=2.361 avg_d=0.888 std_dev=0.598
C6	B	0, 0.249, 0.872, 1.494, 2.729 max_d=2.729 avg_d=0.872 std_dev=0.623
N3	B	0, 0.283, 0.910, 1.538, 2.689 max_d=2.689 avg_d=0.910 std_dev=0.627
N6	B	0, 0.246, 0.897, 1.547, 2.873 max_d=2.873 avg_d=0.897 std_dev=0.650
C2	B	0, 0.237, 0.924, 1.610, 2.960 max_d=2.960 avg_d=0.924 std_dev=0.686
N1	B	0, 0.227, 0.914, 1.601, 2.996 max_d=2.996 avg_d=0.914 std_dev=0.687

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.15	0.14	0.21	0.13
C2	0.02	0.00	0.13	0.19	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.21	0.08	0.13	0.14	0.24	0.15
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.05	0.03	0.06	0.11	0.09	0.03	0.12	0.06	0.21	0.01	0.07	0.01	0.28	0.35	0.39	0.31
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.23	0.00	0.20	0.02	0.16	0.14	0.23	0.25	0.17	0.02	0.01	0.01	0.08	0.19	0.12	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.23	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.27	0.03	0.12	0.15	0.24	0.16
C4'	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.04	0.06	0.04	0.20	0.04	0.00	0.01	0.08	0.05	0.02
C5	0.02	0.01	0.06	0.20	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.22	0.07	0.13	0.16	0.25	0.16
C5'	0.08	0.11	0.11	0.02	0.12	0.00	0.13	0.00	0.12	0.11	0.12	0.13	0.11	0.10	0.07	0.01	0.01	0.09	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.16	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.17	0.09	0.15	0.16	0.24	0.16
N1	0.01	0.01	0.03	0.14	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.14	0.02	0.14	0.14	0.23	0.14
N3	0.02	0.01	0.12	0.23	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.26	0.06	0.12	0.14	0.25	0.15
N4	0.02	0.01	0.06	0.25	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.14	0.30	0.04	0.12	0.16	0.23	0.16
O2	0.03	0.01	0.21	0.17	0.02	0.04	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.20	0.12	0.13	0.13	0.24	0.14
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.13	0.20	0.16	0.10	0.14	0.09	0.10	0.14	0.10	0.00	0.08	0.12	0.17	0.24	0.36	0.21
O3'	0.02	0.21	0.07	0.01	0.27	0.04	0.22	0.07	0.17	0.14	0.26	0.30	0.20	0.08	0.00	0.02	0.07	0.19	0.12	0.09
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.06	0.04	0.12	0.12	0.02	0.00	0.07	0.10	0.13	0.12
O5'	0.15	0.13	0.28	0.08	0.12	0.01	0.13	0.01	0.15	0.14	0.12	0.12	0.13	0.17	0.07	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.14	0.14	0.35	0.19	0.15	0.08	0.16	0.09	0.16	0.14	0.14	0.16	0.13	0.24	0.19	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.24	0.39	0.12	0.24	0.05	0.25	0.03	0.24	0.23	0.25	0.23	0.24	0.36	0.12	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.15	0.31	0.11	0.16	0.02	0.16	0.01	0.16	0.14	0.15	0.16	0.14	0.21	0.09	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.39	0.23	0.17	0.37	0.20	0.45	0.21	0.49	0.41	0.45	0.33	0.52	0.47	0.35	0.25	0.14	0.26	0.22	0.30	0.21	0.17
C2	0.21	0.28	0.21	0.13	0.23	0.17	0.32	0.23	0.35	0.33	0.28	0.26	0.44	0.40	0.24	0.26	0.12	0.20	0.16	0.25	0.17	0.13
C2'	0.16	0.40	0.14	0.12	0.29	0.11	0.39	0.16	0.47	0.30	0.48	0.29	0.54	0.39	0.23	0.21	0.20	0.12	0.20	0.36	0.25	0.20
C3'	0.14	0.31	0.11	0.09	0.27	0.09	0.40	0.15	0.45	0.36	0.41	0.23	0.53	0.44	0.24	0.19	0.10	0.12	0.25	0.39	0.29	0.25
C4	0.20	0.41	0.24	0.15	0.23	0.17	0.15	0.24	0.20	0.19	0.33	0.37	0.19	0.22	0.18	0.27	0.14	0.15	0.16	0.21	0.15	0.12
C4'	0.12	0.24	0.11	0.12	0.19	0.11	0.28	0.15	0.32	0.27	0.29	0.17	0.37	0.32	0.18	0.20	0.13	0.11	0.24	0.37	0.24	0.21
C5	0.15	0.31	0.20	0.13	0.17	0.13	0.16	0.19	0.20	0.21	0.26	0.29	0.22	0.25	0.13	0.22	0.13	0.13	0.16	0.23	0.17	0.13
C5'	0.18	0.24	0.19	0.12	0.17	0.13	0.18	0.13	0.21	0.18	0.23	0.23	0.23	0.19	0.16	0.27	0.13	0.15	0.24	0.35	0.22	0.16
C6	0.17	0.25	0.18	0.11	0.21	0.14	0.29	0.18	0.30	0.32	0.26	0.22	0.34	0.37	0.21	0.20	0.11	0.18	0.19	0.27	0.19	0.15
N1	0.21	0.27	0.19	0.13	0.26	0.16	0.37	0.20	0.39	0.36	0.32	0.24	0.44	0.42	0.26	0.23	0.11	0.20	0.18	0.27	0.19	0.15
N3	0.20	0.38	0.23	0.14	0.22	0.17	0.21	0.25	0.22	0.26	0.29	0.34	0.30	0.31	0.20	0.27	0.13	0.18	0.16	0.22	0.15	0.12
N4	0.25	0.51	0.28	0.19	0.34	0.21	0.27	0.29	0.36	0.18	0.48	0.45	0.27	0.15	0.25	0.29	0.17	0.19	0.18	0.21	0.15	0.14
O2	0.23	0.31	0.22	0.14	0.27	0.19	0.37	0.24	0.42	0.35	0.35	0.28	0.53	0.42	0.27	0.28	0.13	0.22	0.16	0.25	0.17	0.13
O2'	0.29	0.51	0.25	0.15	0.39	0.15	0.43	0.15	0.49	0.35	0.54	0.43	0.52	0.40	0.34	0.30	0.13	0.24	0.20	0.39	0.29	0.22
O3'	0.13	0.32	0.11	0.10	0.27	0.08	0.40	0.14	0.46	0.35	0.42	0.22	0.55	0.44	0.23	0.20	0.10	0.10	0.27	0.43	0.32	0.28
O4'	0.26	0.27	0.25	0.27	0.29	0.27	0.36	0.29	0.36	0.39	0.31	0.22	0.39	0.42	0.31	0.24	0.24	0.27	0.31	0.38	0.27	0.27
O5'	0.13	0.21	0.17	0.07	0.14	0.05	0.16	0.10	0.18	0.19	0.20	0.20	0.20	0.20	0.13	0.23	0.02	0.08	0.26	0.39	0.24	0.21
OP1	0.04	0.17	0.08	0.02	0.09	0.09	0.09	0.22	0.13	0.08	0.16	0.14	0.13	0.09	0.04	0.15	0.01	0.06	0.37	0.34	0.26	0.21
OP2	0.13	0.29	0.10	0.09	0.22	0.16	0.20	0.25	0.24	0.16	0.28	0.27	0.22	0.17	0.16	0.08	0.02	0.17	0.42	0.38	0.26	0.24
P	0.04	0.19	0.07	0.02	0.10	0.07	0.10	0.16	0.14	0.09	0.17	0.17	0.13	0.10	0.05	0.12	0.01	0.05	0.33	0.36	0.23	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.23	0.29	0.16	0.14
C2	0.03	0.00	0.09	0.13	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.15	0.04	0.35	0.32	0.30	0.27
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.05	0.07	0.09	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.31	0.21	0.11
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.09	0.08	0.12	0.12	0.09	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.08	0.33	0.21	0.11
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.36	0.29	0.23	0.24
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.12	0.07	0.05	0.09	0.12	0.06	0.06	0.01	0.00	0.02	0.29	0.20	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.08	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.39	0.26	0.24	0.26
C5'	0.05	0.14	0.02	0.02	0.15	0.00	0.21	0.00	0.21	0.23	0.18	0.12	0.24	0.25	0.14	0.05	0.06	0.02	0.01	0.30	0.25	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.39	0.27	0.29	0.29
C8	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.12	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.09	0.04	0.39	0.22	0.14	0.19
N1	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.14	0.04	0.38	0.30	0.31	0.29
N3	0.03	0.01	0.09	0.12	0.00	0.05	0.01	0.12	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.08	0.13	0.03	0.33	0.32	0.27	0.25
N6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.10	0.04	0.40	0.26	0.30	0.30
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.12	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.08	0.04	0.41	0.22	0.19	0.24
N9	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.34	0.27	0.16	0.19
O2'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.05	0.06	0.04	0.05	0.06	0.03	0.08	0.08	0.05	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.05	0.31	0.20	0.09
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.08	0.01	0.08	0.06	0.11	0.09	0.14	0.13	0.10	0.08	0.04	0.04	0.00	0.01	0.22	0.37	0.22	0.14
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.25	0.32	0.14	0.16
O5'	0.23	0.35	0.09	0.08	0.36	0.02	0.39	0.01	0.39	0.39	0.38	0.33	0.40	0.41	0.34	0.05	0.22	0.25	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.29	0.32	0.31	0.33	0.29	0.29	0.26	0.30	0.27	0.22	0.30	0.32	0.26	0.22	0.27	0.31	0.37	0.32	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.30	0.21	0.21	0.23	0.20	0.24	0.25	0.29	0.14	0.31	0.27	0.30	0.19	0.16	0.20	0.22	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.27	0.11	0.11	0.24	0.04	0.26	0.01	0.29	0.19	0.29	0.25	0.30	0.24	0.19	0.09	0.14	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00