Doublet Group distance statistics: 54734

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 1, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.012, 0.030, 0.049, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.008, 0.035, 0.062, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.035 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.020, 0.072, 0.124, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.072 std_dev=0.052
C2'	A	0, 0.018, 0.076, 0.134, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.076 std_dev=0.058
C4'	A	0, 0.052, 0.113, 0.173, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.113 std_dev=0.060
C3'	A	0, 0.060, 0.140, 0.220, 0.232 max_d=0.232 avg_d=0.140 std_dev=0.080
O2'	A	0, 0.057, 0.152, 0.248, 0.300 max_d=0.300 avg_d=0.152 std_dev=0.095
C5'	A	0, 0.077, 0.188, 0.299, 0.348 max_d=0.348 avg_d=0.188 std_dev=0.111
O3'	A	0, 0.090, 0.227, 0.365, 0.436 max_d=0.436 avg_d=0.227 std_dev=0.138
P	A	0, 0.177, 0.318, 0.459, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.318 std_dev=0.141
O5'	A	0, 0.071, 0.236, 0.401, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.236 std_dev=0.165
OP2	B	0, 0.125, 0.296, 0.468, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.296 std_dev=0.172
P	B	0, 0.166, 0.367, 0.568, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.367 std_dev=0.201
OP1	A	0, 0.214, 0.416, 0.618, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.416 std_dev=0.202
O3'	B	0, 0.229, 0.434, 0.639, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.434 std_dev=0.205
OP2	A	0, 0.253, 0.479, 0.705, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.479 std_dev=0.226
O4'	B	0, 0.263, 0.490, 0.717, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.490 std_dev=0.227
C1'	B	0, 0.326, 0.566, 0.807, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.566 std_dev=0.241
C4	B	0, 0.290, 0.536, 0.782, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.536 std_dev=0.246
C3'	B	0, 0.210, 0.458, 0.707, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.458 std_dev=0.249
OP1	B	0, 0.190, 0.459, 0.729, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.459 std_dev=0.269
C6	B	0, 0.334, 0.658, 0.983, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.658 std_dev=0.324
C5	B	0, 0.389, 0.726, 1.063, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.726 std_dev=0.337
C4'	B	0, 0.115, 0.453, 0.792, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.453 std_dev=0.338
N9	B	0, 0.344, 0.696, 1.049, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.696 std_dev=0.352
C2'	B	0, 0.254, 0.607, 0.960, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.607 std_dev=0.353
N6	B	0, 0.424, 0.823, 1.223, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.823 std_dev=0.399
O5'	B	0, 0.040, 0.444, 0.847, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.444 std_dev=0.403
O2'	B	0, 0.268, 0.760, 1.253, 2.064 max_d=2.064 avg_d=0.760 std_dev=0.493
C5'	B	0, -0.170, 0.526, 1.223, 2.591 max_d=2.591 avg_d=0.526 std_dev=0.697
N1	B	0, 0.063, 0.829, 1.595, 2.976 max_d=2.976 avg_d=0.829 std_dev=0.766
N3	B	0, -0.054, 0.728, 1.510, 2.986 max_d=2.986 avg_d=0.728 std_dev=0.782
N7	B	0, 0.227, 1.154, 2.081, 3.636 max_d=3.636 avg_d=1.154 std_dev=0.927
C8	B	0, 0.169, 1.123, 2.077, 3.735 max_d=3.735 avg_d=1.123 std_dev=0.954
C2	B	0, -0.179, 0.902, 1.984, 4.071 max_d=4.071 avg_d=0.902 std_dev=1.082

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.06	0.08	0.11	0.07
C2	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.02	0.09	0.12	0.17	0.11
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.08	0.07	0.05
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.10	0.05	0.06	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.05	0.05
C4	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.12	0.17	0.23	0.16
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.05	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.05	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.13	0.02	0.14	0.18	0.24	0.17
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.10	0.06	0.07	0.10	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.02	0.13	0.15	0.20	0.14
N1	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.10	0.11	0.16	0.11
N3	0.02	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.11	0.14	0.20	0.13
N4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.02	0.12	0.18	0.24	0.17
O2	0.03	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.03	0.04	0.08	0.11	0.15	0.10
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.02	0.05	0.04	0.07	0.00	0.04	0.04	0.04	0.06	0.06	0.05
O3'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.10	0.01	0.13	0.02	0.11	0.05	0.06	0.11	0.03	0.04	0.00	0.02	0.09	0.10	0.10	0.09
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.00	0.07	0.07	0.10	0.07
O5'	0.06	0.09	0.04	0.04	0.12	0.02	0.14	0.01	0.13	0.10	0.11	0.12	0.08	0.04	0.09	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.12	0.08	0.08	0.17	0.05	0.18	0.05	0.15	0.11	0.14	0.18	0.11	0.06	0.10	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.17	0.07	0.05	0.23	0.03	0.24	0.02	0.20	0.16	0.20	0.24	0.15	0.06	0.10	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.11	0.05	0.05	0.16	0.03	0.17	0.01	0.14	0.11	0.13	0.17	0.10	0.05	0.09	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.37	0.17	0.13	0.07	0.27	0.16	0.44	0.06	0.43	0.22	0.32	0.14	0.40	0.19	0.39	0.08	0.16	0.26	0.17	0.15	0.17
C2	0.18	0.65	0.27	0.11	0.13	0.26	0.21	0.42	0.11	0.65	0.43	0.54	0.17	0.60	0.27	0.48	0.10	0.16	0.28	0.18	0.17	0.20
C2'	0.11	0.31	0.14	0.10	0.06	0.21	0.13	0.34	0.06	0.35	0.18	0.26	0.13	0.33	0.15	0.31	0.06	0.12	0.21	0.14	0.13	0.15
C3'	0.07	0.21	0.09	0.08	0.05	0.17	0.09	0.26	0.05	0.23	0.13	0.19	0.09	0.21	0.09	0.23	0.05	0.10	0.17	0.11	0.09	0.11
C4	0.26	0.78	0.40	0.19	0.18	0.23	0.29	0.33	0.17	0.83	0.52	0.64	0.23	0.76	0.36	0.55	0.15	0.18	0.25	0.19	0.20	0.21
C4'	0.07	0.13	0.06	0.13	0.04	0.20	0.09	0.31	0.06	0.18	0.07	0.12	0.10	0.18	0.08	0.20	0.06	0.12	0.18	0.11	0.09	0.10
C5	0.25	0.67	0.40	0.19	0.15	0.23	0.26	0.33	0.13	0.77	0.43	0.56	0.20	0.69	0.34	0.54	0.15	0.16	0.22	0.16	0.18	0.18
C5'	0.04	0.11	0.03	0.13	0.04	0.16	0.04	0.23	0.05	0.08	0.08	0.10	0.06	0.08	0.03	0.09	0.05	0.10	0.13	0.09	0.09	0.07
C6	0.20	0.53	0.32	0.12	0.10	0.25	0.21	0.39	0.08	0.62	0.33	0.45	0.16	0.55	0.27	0.50	0.12	0.14	0.24	0.16	0.16	0.17
N1	0.16	0.53	0.25	0.10	0.10	0.26	0.18	0.43	0.08	0.57	0.34	0.45	0.15	0.52	0.24	0.46	0.09	0.15	0.26	0.17	0.16	0.18
N3	0.23	0.76	0.34	0.14	0.17	0.25	0.26	0.38	0.16	0.77	0.51	0.62	0.21	0.71	0.33	0.53	0.13	0.17	0.27	0.19	0.19	0.21
N4	0.30	0.87	0.44	0.23	0.23	0.23	0.34	0.28	0.23	0.94	0.60	0.71	0.29	0.86	0.42	0.57	0.17	0.21	0.24	0.21	0.22	0.22
O2	0.15	0.64	0.23	0.10	0.13	0.27	0.19	0.44	0.11	0.60	0.43	0.52	0.16	0.56	0.23	0.44	0.09	0.16	0.29	0.19	0.17	0.20
O2'	0.12	0.26	0.13	0.14	0.09	0.24	0.15	0.38	0.10	0.31	0.15	0.23	0.15	0.30	0.15	0.28	0.09	0.15	0.24	0.16	0.14	0.16
O3'	0.05	0.14	0.05	0.09	0.05	0.15	0.07	0.21	0.06	0.14	0.09	0.13	0.09	0.14	0.06	0.15	0.07	0.10	0.15	0.11	0.10	0.11
O4'	0.13	0.25	0.13	0.16	0.06	0.27	0.13	0.42	0.06	0.32	0.14	0.22	0.12	0.30	0.15	0.35	0.09	0.16	0.24	0.16	0.15	0.16
O5'	0.04	0.15	0.06	0.06	0.06	0.13	0.04	0.15	0.05	0.11	0.11	0.14	0.05	0.10	0.04	0.15	0.01	0.09	0.13	0.15	0.16	0.12
OP1	0.05	0.24	0.04	0.02	0.09	0.05	0.06	0.07	0.10	0.16	0.19	0.21	0.08	0.13	0.07	0.09	0.01	0.05	0.05	0.15	0.24	0.09
OP2	0.08	0.29	0.06	0.07	0.16	0.07	0.12	0.11	0.17	0.09	0.25	0.27	0.14	0.07	0.08	0.06	0.02	0.11	0.14	0.28	0.34	0.23
P	0.05	0.06	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.03	0.04	0.07	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.06	0.01	0.07	0.08	0.16	0.21	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.17	0.21	0.23	0.30
C2	0.01	0.00	0.19	0.30	0.01	0.48	0.01	0.92	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.05	0.35	0.89	0.95	0.76	0.82
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.09	0.01	0.04	0.04	0.07	0.11	0.14	0.19	0.05	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.22	0.34	0.41	0.43
C3'	0.01	0.30	0.00	0.00	0.13	0.01	0.06	0.02	0.12	0.14	0.23	0.28	0.08	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.16	0.22	0.22
C4	0.01	0.01	0.09	0.13	0.00	0.22	0.01	0.40	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.03	0.18	0.26	0.17	0.14	0.12
C4'	0.00	0.48	0.01	0.01	0.22	0.00	0.10	0.01	0.21	0.21	0.37	0.46	0.15	0.12	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.11	0.05
C5	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.04	0.08	0.14	0.28	0.28	0.32
C5'	0.03	0.92	0.04	0.02	0.40	0.01	0.20	0.00	0.40	0.37	0.72	0.85	0.29	0.22	0.05	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.09	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.21	0.01	0.40	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.03	0.15	0.26	0.20	0.14	0.14
C8	0.01	0.01	0.11	0.14	0.01	0.21	0.01	0.37	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.13	0.08	0.17	0.71	0.99	0.89	1.03
N1	0.01	0.01	0.14	0.23	0.01	0.37	0.01	0.72	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.03	0.27	0.65	0.66	0.50	0.53
N3	0.02	0.01	0.19	0.28	0.00	0.46	0.01	0.85	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.20	0.04	0.36	0.79	0.76	0.64	0.67
N6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.15	0.01	0.29	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.04	0.11	0.16	0.24	0.22	0.24
N7	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.12	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.09	0.07	0.09	0.55	0.89	0.79	0.90
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.24	0.37	0.36	0.45
O2'	0.02	0.21	0.00	0.01	0.10	0.02	0.05	0.03	0.09	0.13	0.16	0.20	0.07	0.09	0.03	0.00	0.04	0.02	0.22	0.37	0.44	0.46
O3'	0.04	0.05	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03	0.08	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.04	0.00	0.04	0.04	0.06	0.11	0.09
O4'	0.00	0.35	0.01	0.00	0.18	0.00	0.08	0.02	0.15	0.17	0.27	0.36	0.11	0.09	0.01	0.02	0.04	0.00	0.08	0.08	0.12	0.13
O5'	0.17	0.89	0.22	0.12	0.26	0.01	0.14	0.01	0.26	0.71	0.65	0.79	0.16	0.55	0.24	0.22	0.04	0.08	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.21	0.95	0.34	0.16	0.17	0.05	0.28	0.03	0.20	0.99	0.66	0.76	0.24	0.89	0.37	0.37	0.06	0.08	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.76	0.41	0.22	0.14	0.11	0.28	0.09	0.14	0.89	0.50	0.64	0.22	0.79	0.36	0.44	0.11	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.30	0.82	0.43	0.22	0.12	0.05	0.32	0.02	0.14	1.03	0.53	0.67	0.24	0.90	0.45	0.46	0.09	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00