Doublet Group distance statistics: 54739

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 3, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.006, 0.010, 0.015, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.010 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N4	A	0, 0.017, 0.033, 0.048, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.033 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.031, 0.060, 0.090, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.060 std_dev=0.029
O2'	A	0, 0.077, 0.148, 0.219, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.148 std_dev=0.071
C2'	A	0, 0.068, 0.172, 0.275, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.172 std_dev=0.104
O4'	A	0, 0.064, 0.183, 0.303, 0.374 max_d=0.374 avg_d=0.183 std_dev=0.120
C4'	A	0, 0.096, 0.298, 0.500, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.298 std_dev=0.202
C3'	A	0, 0.089, 0.294, 0.499, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.294 std_dev=0.205
OP2	A	0, 0.163, 0.372, 0.582, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.372 std_dev=0.210
OP2	B	0, 0.154, 0.367, 0.580, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.367 std_dev=0.213
P	B	0, 0.166, 0.412, 0.658, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.412 std_dev=0.246
OP1	B	0, 0.158, 0.421, 0.684, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.421 std_dev=0.263
C5'	A	0, 0.175, 0.466, 0.756, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.466 std_dev=0.290
P	A	0, 0.044, 0.342, 0.640, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.342 std_dev=0.298
O5'	B	0, 0.185, 0.511, 0.837, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.511 std_dev=0.326
O3'	A	0, 0.115, 0.443, 0.771, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.443 std_dev=0.328
O5'	A	0, 0.197, 0.544, 0.890, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.544 std_dev=0.347
O3'	B	0, 0.187, 0.542, 0.896, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.542 std_dev=0.354
C3'	B	0, 0.169, 0.533, 0.898, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.533 std_dev=0.365
C4'	B	0, 0.191, 0.587, 0.982, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.587 std_dev=0.395
O4'	B	0, 0.197, 0.594, 0.990, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.594 std_dev=0.396
N3	B	0, 0.172, 0.579, 0.986, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.579 std_dev=0.407
C2	B	0, 0.191, 0.612, 1.033, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.612 std_dev=0.421
OP1	A	0, 0.216, 0.640, 1.064, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.640 std_dev=0.424
C5'	B	0, 0.223, 0.665, 1.107, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.665 std_dev=0.442
N1	B	0, 0.222, 0.666, 1.110, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.666 std_dev=0.444
C1'	B	0, 0.161, 0.615, 1.070, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.615 std_dev=0.454
C4	B	0, 0.154, 0.619, 1.083, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.619 std_dev=0.465
C2'	B	0, 0.092, 0.572, 1.052, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.572 std_dev=0.480
N9	B	0, 0.179, 0.682, 1.184, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.682 std_dev=0.502
O2'	B	0, 0.132, 0.650, 1.169, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.650 std_dev=0.518
C6	B	0, 0.177, 0.748, 1.320, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.748 std_dev=0.571
C5	B	0, 0.145, 0.749, 1.353, 1.919 max_d=1.919 avg_d=0.749 std_dev=0.604
C8	B	0, 0.206, 0.898, 1.590, 2.298 max_d=2.298 avg_d=0.898 std_dev=0.692
N6	B	0, 0.145, 0.890, 1.634, 2.524 max_d=2.524 avg_d=0.890 std_dev=0.745
N7	B	0, 0.169, 0.942, 1.715, 2.606 max_d=2.606 avg_d=0.942 std_dev=0.773

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.05	0.14	0.15	0.08
C2	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.12	0.02	0.04	0.05	0.13	0.03
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.07	0.05	0.12	0.01	0.02	0.01	0.05	0.20	0.22	0.12
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.09	0.00	0.06	0.02	0.05	0.06	0.11	0.10	0.14	0.02	0.01	0.01	0.06	0.21	0.21	0.12
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.02	0.05	0.07	0.09	0.03
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.04	0.04	0.06	0.06	0.09	0.05	0.02	0.00	0.01	0.15	0.08	0.04
C5	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.03	0.06	0.08	0.10	0.06
C5'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.00	0.05	0.04	0.07	0.08	0.09	0.05	0.03	0.01	0.00	0.11	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.07	0.10	0.13	0.08
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.08	0.14	0.06
N3	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.14	0.01	0.05	0.06	0.12	0.03
N4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.13	0.02	0.06	0.10	0.07	0.03
O2	0.06	0.00	0.12	0.14	0.01	0.09	0.02	0.09	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.16	0.05	0.07	0.06	0.14	0.03
O2'	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.04	0.19	0.19	0.08
O3'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.12	0.02	0.08	0.03	0.05	0.06	0.14	0.13	0.16	0.02	0.00	0.02	0.08	0.22	0.20	0.11
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.05	0.02	0.00	0.06	0.12	0.12	0.07
O5'	0.05	0.04	0.05	0.06	0.05	0.01	0.06	0.00	0.07	0.04	0.05	0.06	0.07	0.04	0.08	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.14	0.05	0.20	0.21	0.07	0.15	0.08	0.11	0.10	0.08	0.06	0.10	0.06	0.19	0.22	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.13	0.22	0.21	0.09	0.08	0.10	0.03	0.13	0.14	0.12	0.07	0.14	0.19	0.20	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.03	0.12	0.12	0.03	0.04	0.06	0.01	0.08	0.06	0.03	0.03	0.03	0.08	0.11	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.24	0.19	0.07	0.07	0.07	0.13	0.12	0.23	0.04	0.29	0.11	0.27	0.10	0.04	0.32	0.08	0.08	0.09	0.09	0.09	0.09
C2	0.17	0.22	0.23	0.11	0.10	0.08	0.12	0.12	0.16	0.16	0.23	0.12	0.17	0.14	0.14	0.32	0.05	0.11	0.05	0.03	0.03	0.03
C2'	0.14	0.23	0.18	0.06	0.07	0.05	0.14	0.11	0.23	0.11	0.28	0.10	0.28	0.13	0.07	0.32	0.05	0.05	0.09	0.08	0.09	0.08
C3'	0.18	0.20	0.21	0.07	0.11	0.06	0.16	0.12	0.21	0.18	0.25	0.09	0.25	0.18	0.14	0.34	0.05	0.07	0.11	0.10	0.11	0.11
C4	0.22	0.25	0.28	0.17	0.16	0.11	0.23	0.11	0.19	0.33	0.21	0.14	0.22	0.33	0.24	0.32	0.09	0.15	0.07	0.04	0.07	0.05
C4'	0.16	0.17	0.16	0.05	0.12	0.06	0.18	0.14	0.21	0.20	0.22	0.08	0.25	0.22	0.14	0.31	0.12	0.07	0.12	0.11	0.13	0.12
C5	0.22	0.30	0.29	0.17	0.16	0.10	0.22	0.10	0.20	0.32	0.25	0.18	0.23	0.31	0.24	0.33	0.09	0.14	0.05	0.04	0.05	0.03
C5'	0.20	0.20	0.20	0.06	0.18	0.06	0.22	0.14	0.22	0.25	0.22	0.14	0.24	0.25	0.21	0.33	0.14	0.10	0.13	0.12	0.13	0.12
C6	0.18	0.30	0.26	0.12	0.12	0.07	0.16	0.11	0.19	0.20	0.28	0.17	0.21	0.19	0.16	0.33	0.07	0.11	0.06	0.07	0.08	0.06
N1	0.15	0.25	0.23	0.10	0.08	0.07	0.11	0.12	0.18	0.12	0.27	0.12	0.20	0.10	0.11	0.33	0.06	0.10	0.07	0.06	0.06	0.06
N3	0.20	0.21	0.26	0.14	0.13	0.09	0.17	0.11	0.16	0.26	0.20	0.11	0.18	0.25	0.20	0.33	0.06	0.13	0.05	0.03	0.06	0.04
N4	0.25	0.26	0.30	0.20	0.20	0.14	0.29	0.14	0.23	0.42	0.21	0.17	0.28	0.42	0.29	0.32	0.11	0.18	0.12	0.09	0.13	0.11
O2	0.15	0.22	0.21	0.09	0.11	0.08	0.12	0.13	0.18	0.11	0.25	0.14	0.20	0.10	0.12	0.31	0.08	0.12	0.06	0.03	0.03	0.03
O2'	0.09	0.24	0.12	0.06	0.11	0.07	0.20	0.15	0.28	0.15	0.31	0.14	0.35	0.21	0.07	0.27	0.11	0.08	0.10	0.08	0.08	0.08
O3'	0.22	0.15	0.21	0.07	0.12	0.07	0.18	0.14	0.20	0.24	0.20	0.07	0.24	0.24	0.19	0.35	0.08	0.10	0.12	0.11	0.12	0.12
O4'	0.12	0.20	0.17	0.08	0.07	0.09	0.14	0.14	0.21	0.09	0.24	0.08	0.25	0.13	0.06	0.32	0.12	0.08	0.12	0.12	0.13	0.12
O5'	0.22	0.28	0.27	0.11	0.20	0.06	0.21	0.12	0.22	0.23	0.26	0.23	0.21	0.22	0.22	0.34	0.01	0.10	0.16	0.15	0.15	0.16
OP1	0.18	0.25	0.25	0.07	0.17	0.08	0.17	0.27	0.19	0.21	0.23	0.20	0.18	0.20	0.18	0.33	0.03	0.08	0.20	0.22	0.23	0.22
OP2	0.15	0.41	0.06	0.12	0.24	0.28	0.19	0.47	0.23	0.16	0.34	0.37	0.20	0.15	0.17	0.09	0.02	0.30	0.39	0.29	0.25	0.32
P	0.07	0.31	0.14	0.02	0.14	0.09	0.11	0.24	0.17	0.09	0.26	0.26	0.14	0.08	0.07	0.21	0.01	0.06	0.18	0.16	0.18	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.08	0.08	0.14	0.09
C2	0.03	0.00	0.07	0.25	0.01	0.28	0.01	0.37	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.15	0.27	0.22	0.41	0.40	0.38	0.40
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.04	0.07	0.07	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.23	0.13
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.13	0.00	0.07	0.01	0.11	0.07	0.19	0.26	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.08	0.12	0.23	0.13
C4	0.02	0.01	0.05	0.13	0.00	0.12	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.11	0.09	0.05	0.11	0.06
C4'	0.01	0.28	0.01	0.00	0.12	0.00	0.06	0.01	0.10	0.16	0.19	0.28	0.07	0.13	0.02	0.05	0.03	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.04	0.14	0.17	0.17	0.17
C5'	0.03	0.37	0.02	0.01	0.12	0.01	0.11	0.00	0.13	0.30	0.25	0.35	0.16	0.27	0.08	0.05	0.04	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.08	0.13	0.11	0.14	0.12
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.16	0.01	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.09	0.06	0.16	0.38	0.43	0.36	0.40
N1	0.03	0.01	0.07	0.19	0.01	0.19	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.22	0.16	0.27	0.24	0.23	0.24
N3	0.03	0.00	0.07	0.26	0.01	0.28	0.01	0.35	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.25	0.23	0.37	0.35	0.32	0.34
N6	0.03	0.02	0.07	0.07	0.01	0.07	0.02	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.11	0.06	0.18	0.23	0.20	0.21
N7	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.13	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.07	0.04	0.12	0.35	0.43	0.35	0.40
N9	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.14	0.16	0.17	0.16
O2'	0.03	0.15	0.01	0.01	0.07	0.05	0.06	0.05	0.09	0.09	0.12	0.15	0.09	0.07	0.02	0.00	0.05	0.05	0.05	0.09	0.24	0.11
O3'	0.03	0.27	0.01	0.01	0.12	0.03	0.08	0.04	0.13	0.06	0.22	0.25	0.11	0.04	0.02	0.05	0.00	0.03	0.11	0.21	0.29	0.19
O4'	0.01	0.22	0.01	0.02	0.11	0.00	0.04	0.02	0.08	0.16	0.16	0.23	0.06	0.12	0.02	0.05	0.03	0.00	0.09	0.10	0.04	0.09
O5'	0.08	0.41	0.08	0.08	0.09	0.01	0.14	0.01	0.13	0.38	0.27	0.37	0.18	0.35	0.14	0.05	0.11	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.08	0.40	0.10	0.12	0.05	0.04	0.17	0.06	0.11	0.43	0.24	0.35	0.23	0.43	0.16	0.09	0.21	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.38	0.23	0.23	0.11	0.11	0.17	0.03	0.14	0.36	0.23	0.32	0.20	0.35	0.17	0.24	0.29	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.40	0.13	0.13	0.06	0.03	0.17	0.01	0.12	0.40	0.24	0.34	0.21	0.40	0.16	0.11	0.19	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00