Doublet Group distance statistics: 54753

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.002, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.002 std_dev=0.002
C1'	A	0, 0.000, 0.002, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.002 std_dev=0.002
N4	A	0, 0.000, 0.003, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.000, 0.003, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C4	A	0, 0.000, 0.003, 0.007, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.003 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
O4'	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C2'	A	0, 0.000, 0.043, 0.085, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.043 std_dev=0.043
P	B	0, 0.000, 0.081, 0.163, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.081 std_dev=0.081
C4'	A	0, 0.000, 0.259, 0.519, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.259 std_dev=0.259
C5'	A	0, 0.000, 0.300, 0.600, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.300 std_dev=0.300
OP1	B	0, 0.000, 0.454, 0.907, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.454 std_dev=0.454
O2'	A	0, 0.000, 0.626, 1.252, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.626 std_dev=0.626
C3'	A	0, 0.000, 0.663, 1.326, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.663 std_dev=0.663
O5'	A	0, 0.000, 0.991, 1.981, 1.981 max_d=1.981 avg_d=0.991 std_dev=0.991
OP2	B	0, 0.000, 1.276, 2.552, 2.552 max_d=2.552 avg_d=1.276 std_dev=1.276
O3'	A	0, 0.000, 1.372, 2.744, 2.744 max_d=2.744 avg_d=1.372 std_dev=1.372
O5'	B	0, 0.000, 1.497, 2.994, 2.994 max_d=2.994 avg_d=1.497 std_dev=1.497
P	A	0, 0.000, 1.509, 3.018, 3.018 max_d=3.018 avg_d=1.509 std_dev=1.509
OP2	A	0, 0.000, 1.608, 3.217, 3.217 max_d=3.217 avg_d=1.608 std_dev=1.608
OP1	A	0, 0.000, 1.748, 3.496, 3.496 max_d=3.496 avg_d=1.748 std_dev=1.748
C5'	B	0, 0.000, 2.422, 4.845, 4.845 max_d=4.845 avg_d=2.422 std_dev=2.422
C4'	B	0, 0.000, 3.560, 7.119, 7.119 max_d=7.119 avg_d=3.560 std_dev=3.560
C3'	B	0, 0.000, 4.471, 8.943, 8.943 max_d=8.943 avg_d=4.471 std_dev=4.471
O4'	B	0, 0.000, 4.538, 9.075, 9.075 max_d=9.075 avg_d=4.538 std_dev=4.538
O3'	B	0, 0.000, 4.831, 9.662, 9.662 max_d=9.662 avg_d=4.831 std_dev=4.831
C1'	B	0, 0.000, 5.771, 11.543, 11.543 max_d=11.543 avg_d=5.771 std_dev=5.771
C2'	B	0, 0.000, 5.797, 11.594, 11.594 max_d=11.594 avg_d=5.797 std_dev=5.797
O2'	B	0, 0.000, 6.644, 13.287, 13.287 max_d=13.287 avg_d=6.644 std_dev=6.644
N9	B	0, 0.000, 6.795, 13.590, 13.590 max_d=13.590 avg_d=6.795 std_dev=6.795
C8	B	0, 0.000, 6.873, 13.746, 13.746 max_d=13.746 avg_d=6.873 std_dev=6.873
N7	B	0, 0.000, 8.064, 16.129, 16.129 max_d=16.129 avg_d=8.064 std_dev=8.064
C4	B	0, 0.000, 8.090, 16.180, 16.180 max_d=16.180 avg_d=8.090 std_dev=8.090
C5	B	0, 0.000, 8.759, 17.519, 17.519 max_d=17.519 avg_d=8.759 std_dev=8.759
N3	B	0, 0.000, 8.772, 17.544, 17.544 max_d=17.544 avg_d=8.772 std_dev=8.772
C2	B	0, 0.000, 10.033, 20.065, 20.065 max_d=20.065 avg_d=10.033 std_dev=10.033
C6	B	0, 0.000, 10.115, 20.230, 20.230 max_d=20.230 avg_d=10.115 std_dev=10.115
N1	B	0, 0.000, 10.688, 21.377, 21.377 max_d=21.377 avg_d=10.688 std_dev=10.688
N6	B	0, 0.000, 10.969, 21.937, 21.937 max_d=21.937 avg_d=10.969 std_dev=10.969

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.00	0.06	0.09	0.03	0.03
C2	0.00	0.00	0.01	0.11	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.12	0.00	0.01	0.00	0.12	0.05
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.36	0.43	0.30	0.37
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.25	0.00	0.29	0.01	0.26	0.15	0.18	0.28	0.00	0.02	0.00	0.01	0.12	0.20	0.06	0.10
C4	0.00	0.00	0.01	0.25	0.00	0.09	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.10	0.00	0.08	0.20	0.32	0.21
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.10	0.05	0.06	0.10	0.01	0.21	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.01
C5	0.01	0.01	0.01	0.29	0.00	0.11	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.19	0.18	0.01	0.12	0.27	0.41	0.27
C5'	0.04	0.00	0.14	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.03	0.08	0.04	0.06	0.13	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00
C6	0.00	0.00	0.01	0.26	0.00	0.10	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.13	0.01	0.09	0.19	0.31	0.20
N1	0.00	0.00	0.00	0.15	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.05	0.00	0.01	0.03	0.15	0.07
N3	0.00	0.00	0.01	0.18	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.03	0.00	0.02	0.08	0.20	0.12
N4	0.00	0.00	0.01	0.28	0.00	0.10	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.14	0.00	0.09	0.25	0.36	0.24
O2	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.29	0.01	0.06	0.11	0.03	0.02
O2'	0.01	0.25	0.00	0.02	0.26	0.21	0.19	0.06	0.13	0.15	0.29	0.28	0.27	0.00	0.00	0.16	0.23	0.37	0.37	0.32
O3'	0.22	0.12	0.01	0.00	0.10	0.02	0.18	0.13	0.13	0.05	0.03	0.14	0.29	0.00	0.00	0.16	0.01	0.02	0.20	0.05
O4'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.16	0.00	0.11	0.08	0.18	0.12
O5'	0.06	0.01	0.36	0.12	0.08	0.01	0.12	0.00	0.09	0.01	0.02	0.09	0.06	0.23	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.09	0.00	0.43	0.20	0.20	0.02	0.27	0.04	0.19	0.03	0.08	0.25	0.11	0.37	0.02	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.12	0.30	0.06	0.32	0.11	0.41	0.10	0.31	0.15	0.20	0.36	0.03	0.37	0.20	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.05	0.37	0.10	0.21	0.01	0.27	0.00	0.20	0.07	0.12	0.24	0.02	0.32	0.05	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.83	0.40	1.44	1.27	0.46	0.67	0.22	0.20	0.11	0.36	0.21	0.55	0.08	0.16	0.55	1.83	1.44	0.37	0.04	0.06	0.71	0.00
C2	0.19	0.44	0.63	0.47	0.21	0.14	0.31	0.10	0.48	0.00	0.53	0.28	0.57	0.19	0.02	0.88	0.45	0.10	0.25	0.15	0.49	0.02
C2'	0.44	0.07	1.09	1.05	0.06	0.44	0.39	0.02	0.52	0.26	0.34	0.11	0.77	0.53	0.04	1.52	1.40	0.02	0.00	0.08	0.73	0.01
C3'	0.46	0.21	1.17	1.08	0.09	0.33	0.26	0.26	0.31	0.28	0.07	0.34	0.58	0.50	0.10	1.67	1.52	0.07	0.28	0.40	1.28	0.46
C4	0.19	0.32	0.44	0.22	0.03	0.07	0.03	0.04	0.12	0.36	0.28	0.22	0.08	0.26	0.15	0.49	0.04	0.00	0.31	0.18	0.32	0.02
C4'	1.32	1.18	2.02	1.81	1.05	1.00	0.74	0.34	0.70	0.68	0.93	1.28	0.46	0.50	1.03	2.53	2.15	0.72	0.15	0.19	1.02	0.19
C5	0.72	0.35	1.04	0.81	0.55	0.52	0.58	0.31	0.47	0.82	0.37	0.43	0.47	0.73	0.69	1.07	0.55	0.45	0.06	0.09	0.47	0.01
C5'	1.81	1.78	2.48	2.27	1.60	1.42	1.28	0.66	1.28	1.15	1.53	1.86	1.03	1.00	1.54	2.95	2.65	1.18	0.41	0.19	0.95	0.11
C6	0.94	0.58	1.41	1.21	0.71	0.74	0.63	0.37	0.53	0.81	0.51	0.67	0.45	0.68	0.82	1.56	1.10	0.57	0.06	0.05	0.62	0.00
N1	0.65	0.18	1.16	0.98	0.31	0.51	0.17	0.14	0.05	0.38	0.06	0.31	0.07	0.21	0.44	1.42	1.00	0.27	0.06	0.09	0.62	0.01
N3	0.02	0.67	0.30	0.12	0.37	0.07	0.38	0.19	0.56	0.01	0.69	0.53	0.57	0.16	0.15	0.45	0.03	0.22	0.37	0.19	0.36	0.03
N4	0.04	0.56	0.06	0.19	0.21	0.17	0.05	0.14	0.20	0.33	0.45	0.48	0.09	0.27	0.00	0.02	0.58	0.14	0.44	0.22	0.13	0.03
O2	0.02	0.72	0.50	0.37	0.48	0.03	0.64	0.21	0.84	0.28	0.87	0.52	0.97	0.53	0.26	0.82	0.43	0.26	0.29	0.16	0.50	0.03
O2'	0.31	0.32	0.99	0.99	0.28	0.43	0.66	0.03	0.82	0.46	0.63	0.10	1.12	0.78	0.13	1.42	1.37	0.06	0.13	0.31	0.50	0.22
O3'	0.12	0.08	0.91	0.83	0.25	0.03	0.64	0.52	0.68	0.70	0.40	0.04	0.98	0.93	0.26	1.46	1.32	0.43	0.49	0.50	1.52	0.65
O4'	1.43	1.19	2.08	1.81	1.17	1.09	0.94	0.51	0.87	0.98	1.01	1.30	0.68	0.81	1.20	2.50	1.96	0.87	0.24	0.00	0.78	0.01
O5'	1.92	1.76	2.48	2.39	1.67	1.64	1.40	0.93	1.37	1.35	1.55	1.85	1.17	1.20	1.66	2.77	2.68	1.40	0.65	0.09	0.64	0.12
OP1	1.97	2.11	2.41	2.34	1.83	1.64	1.51	0.82	1.56	1.27	1.85	2.16	1.32	1.17	1.70	2.71	2.89	1.46	0.63	0.47	0.84	0.14
OP2	1.55	1.43	1.85	1.91	1.36	1.48	1.16	0.85	1.15	1.11	1.28	1.50	1.00	1.00	1.35	1.88	2.11	1.26	0.67	0.44	0.58	0.00
P	2.10	2.04	2.52	2.50	1.90	1.85	1.64	1.06	1.64	1.51	1.84	2.12	1.44	1.40	1.85	2.72	2.92	1.65	0.79	0.29	0.61	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.00	0.04	0.33	0.32	0.04
C2	0.01	0.00	0.38	0.39	0.01	0.09	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.22	0.10	0.06	0.27	0.22	0.05
C2'	0.01	0.38	0.00	0.00	0.18	0.01	0.05	0.10	0.14	0.22	0.28	0.39	0.08	0.14	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.32	0.26	0.02
C3'	0.00	0.39	0.00	0.00	0.22	0.00	0.16	0.00	0.24	0.08	0.34	0.36	0.21	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.16	0.16	0.27	0.07
C4	0.01	0.01	0.18	0.22	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.06	0.05	0.44	0.22	0.04
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.06	0.08	0.08	0.03	0.04	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.20	0.30	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.16	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.02	0.03	0.12	0.62	0.18	0.14
C5'	0.05	0.05	0.10	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.04	0.19	0.02	0.04	0.07	0.17	0.09	0.08	0.14	0.01	0.00	0.33	0.32	0.00
C6	0.01	0.00	0.14	0.24	0.00	0.04	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.05	0.08	0.57	0.17	0.11
C8	0.00	0.01	0.22	0.08	0.00	0.06	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.25	0.16	0.05	0.23	0.78	0.20	0.22
N1	0.01	0.00	0.28	0.34	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.19	0.08	0.00	0.41	0.19	0.02
N3	0.02	0.00	0.39	0.36	0.00	0.08	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.17	0.10	0.05	0.25	0.24	0.07
N6	0.00	0.00	0.08	0.21	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.14	0.08	0.03	0.12	0.68	0.14	0.17
N7	0.01	0.01	0.14	0.00	0.00	0.04	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.25	0.09	0.02	0.22	0.82	0.16	0.25
N9	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.08	0.01	0.10	0.51	0.25	0.07
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.02	0.18	0.13	0.08	0.09	0.25	0.03	0.16	0.14	0.25	0.11	0.00	0.02	0.09	0.31	0.01	0.52	0.33
O3'	0.17	0.22	0.02	0.00	0.05	0.01	0.02	0.14	0.10	0.16	0.19	0.17	0.08	0.09	0.08	0.02	0.00	0.11	0.41	0.30	0.39	0.35
O4'	0.00	0.10	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.05	0.08	0.10	0.03	0.02	0.01	0.09	0.11	0.00	0.11	0.32	0.32	0.02
O5'	0.04	0.06	0.07	0.16	0.05	0.00	0.12	0.00	0.08	0.23	0.00	0.05	0.12	0.22	0.10	0.31	0.41	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.33	0.27	0.32	0.16	0.44	0.20	0.62	0.33	0.57	0.78	0.41	0.25	0.68	0.82	0.51	0.01	0.30	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.32	0.22	0.26	0.27	0.22	0.30	0.18	0.32	0.17	0.20	0.19	0.24	0.14	0.16	0.25	0.52	0.39	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.05	0.02	0.07	0.04	0.07	0.14	0.00	0.11	0.22	0.02	0.07	0.17	0.25	0.07	0.33	0.35	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00