Doublet Group distance statistics: 54762

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 9, 9, 8, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.005, 0.008, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.010 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.007, 0.031, 0.055, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.031 std_dev=0.024
C2'	A	0, 0.022, 0.071, 0.119, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.071 std_dev=0.049
O4'	A	0, 0.001, 0.053, 0.104, 0.297 max_d=0.297 avg_d=0.053 std_dev=0.052
O3'	A	0, 0.070, 0.124, 0.178, 0.307 max_d=0.307 avg_d=0.124 std_dev=0.054
C3'	A	0, 0.023, 0.087, 0.150, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.087 std_dev=0.063
C4'	A	0, 0.014, 0.090, 0.167, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.090 std_dev=0.076
O2'	A	0, 0.067, 0.165, 0.262, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.165 std_dev=0.098
OP2	B	0, 0.144, 0.248, 0.352, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.248 std_dev=0.104
P	B	0, 0.193, 0.313, 0.433, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.313 std_dev=0.120
C5'	A	0, 0.032, 0.174, 0.315, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.174 std_dev=0.142
OP1	B	0, 0.310, 0.461, 0.612, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.461 std_dev=0.151
O5'	B	0, 0.138, 0.351, 0.563, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.351 std_dev=0.212
C2'	B	0, 0.128, 0.364, 0.600, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.364 std_dev=0.236
OP2	A	0, 0.298, 0.542, 0.786, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.542 std_dev=0.244
P	A	0, 0.180, 0.434, 0.688, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.434 std_dev=0.254
O2'	B	0, 0.139, 0.405, 0.670, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.405 std_dev=0.266
C1'	B	0, 0.158, 0.436, 0.713, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.436 std_dev=0.277
C3'	B	0, 0.091, 0.382, 0.674, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.382 std_dev=0.292
O4'	B	0, 0.163, 0.475, 0.788, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.475 std_dev=0.313
O5'	A	0, -0.083, 0.242, 0.568, 1.948 max_d=1.948 avg_d=0.242 std_dev=0.326
C4'	B	0, 0.082, 0.412, 0.742, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.412 std_dev=0.330
N9	B	0, 0.089, 0.526, 0.963, 2.612 max_d=2.612 avg_d=0.526 std_dev=0.437
O3'	B	0, 0.024, 0.527, 1.030, 2.916 max_d=2.916 avg_d=0.527 std_dev=0.503
N3	B	0, 0.031, 0.573, 1.116, 3.245 max_d=3.245 avg_d=0.573 std_dev=0.543
OP1	A	0, 0.089, 0.643, 1.196, 3.366 max_d=3.366 avg_d=0.643 std_dev=0.554
C5'	B	0, -0.036, 0.519, 1.074, 1.957 max_d=1.957 avg_d=0.519 std_dev=0.555
C8	B	0, 0.115, 0.695, 1.274, 3.487 max_d=3.487 avg_d=0.695 std_dev=0.580
C4	B	0, -0.031, 0.550, 1.130, 3.481 max_d=3.481 avg_d=0.550 std_dev=0.580
C2	B	0, -0.011, 0.734, 1.480, 4.486 max_d=4.486 avg_d=0.734 std_dev=0.745
N2	B	0, 0.100, 0.872, 1.643, 4.631 max_d=4.631 avg_d=0.872 std_dev=0.772
N7	B	0, -0.012, 0.772, 1.556, 4.729 max_d=4.729 avg_d=0.772 std_dev=0.784
C5	B	0, -0.111, 0.682, 1.474, 4.772 max_d=4.772 avg_d=0.682 std_dev=0.793
N1	B	0, -0.144, 0.818, 1.779, 5.762 max_d=5.762 avg_d=0.818 std_dev=0.962
C6	B	0, -0.215, 0.788, 1.791, 5.999 max_d=5.999 avg_d=0.788 std_dev=1.003
O6	B	0, -0.305, 0.909, 2.123, 7.233 max_d=7.233 avg_d=0.909 std_dev=1.214

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.18	0.17	0.13	0.17
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.03	0.02	0.25	0.26	0.12	0.22
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.00	0.02	0.01	0.18	0.15	0.17	0.20
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.20	0.11
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.33	0.39	0.12	0.28
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.05
C5	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.02	0.35	0.42	0.12	0.28
C5'	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.04	0.04	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.05	0.01
C6	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.32	0.36	0.11	0.26
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.26	0.27	0.11	0.22
N3	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.03	0.02	0.29	0.32	0.12	0.25
N4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02	0.34	0.42	0.13	0.29
O2	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.04	0.03	0.20	0.19	0.14	0.20
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.06	0.06	0.09	0.00	0.05	0.01	0.17	0.14	0.20	0.22
O3'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.05	0.00	0.02	0.04	0.08	0.23	0.08
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.13	0.15	0.09	0.10
O5'	0.18	0.25	0.18	0.04	0.33	0.01	0.35	0.00	0.32	0.26	0.29	0.34	0.20	0.17	0.04	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.17	0.26	0.15	0.05	0.39	0.06	0.42	0.12	0.36	0.27	0.32	0.42	0.19	0.14	0.08	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.12	0.17	0.20	0.12	0.11	0.12	0.05	0.11	0.11	0.12	0.13	0.14	0.20	0.23	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.22	0.20	0.11	0.28	0.05	0.28	0.01	0.26	0.22	0.25	0.29	0.20	0.22	0.08	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.54	0.11	0.20	0.59	0.22	0.78	0.45	0.83	0.73	0.70	0.46	0.46	0.86	0.53	0.15	0.48	0.18	0.25	0.94	0.16	0.10	0.12
C2	0.21	0.68	0.13	0.18	0.64	0.26	0.88	0.42	1.00	0.68	0.88	0.61	0.54	0.91	0.50	0.16	0.42	0.11	0.26	1.14	0.16	0.13	0.14
C2'	0.24	0.47	0.11	0.25	0.53	0.25	0.72	0.40	0.74	0.72	0.61	0.38	0.39	0.83	0.49	0.16	0.55	0.15	0.25	0.84	0.19	0.08	0.13
C3'	0.28	0.41	0.10	0.24	0.49	0.19	0.66	0.39	0.67	0.69	0.55	0.33	0.35	0.77	0.48	0.16	0.55	0.21	0.24	0.78	0.20	0.07	0.13
C4	0.16	0.73	0.12	0.15	0.61	0.27	0.80	0.39	0.96	0.53	0.91	0.68	0.56	0.74	0.42	0.14	0.31	0.10	0.25	1.06	0.16	0.15	0.16
C4'	0.35	0.44	0.12	0.19	0.52	0.17	0.67	0.44	0.68	0.70	0.56	0.35	0.39	0.77	0.52	0.16	0.44	0.32	0.23	0.77	0.18	0.08	0.12
C5	0.18	0.66	0.11	0.14	0.59	0.24	0.73	0.40	0.83	0.53	0.78	0.60	0.54	0.68	0.44	0.12	0.29	0.08	0.26	0.88	0.16	0.13	0.15
C5'	0.39	0.38	0.15	0.15	0.48	0.19	0.59	0.42	0.58	0.65	0.48	0.31	0.36	0.68	0.51	0.19	0.35	0.41	0.22	0.64	0.20	0.07	0.13
C6	0.24	0.59	0.10	0.15	0.60	0.22	0.75	0.45	0.80	0.62	0.72	0.51	0.50	0.75	0.50	0.12	0.35	0.13	0.27	0.86	0.16	0.11	0.13
N1	0.24	0.61	0.11	0.18	0.62	0.23	0.82	0.44	0.89	0.70	0.78	0.53	0.51	0.86	0.52	0.14	0.42	0.12	0.26	0.99	0.16	0.11	0.13
N3	0.18	0.73	0.13	0.17	0.63	0.28	0.87	0.40	1.04	0.60	0.95	0.68	0.56	0.84	0.45	0.16	0.37	0.12	0.26	1.19	0.16	0.15	0.15
N4	0.13	0.75	0.13	0.15	0.55	0.28	0.73	0.37	0.94	0.44	0.94	0.74	0.55	0.64	0.35	0.13	0.27	0.13	0.22	1.04	0.17	0.17	0.16
O2	0.21	0.68	0.14	0.20	0.63	0.26	0.89	0.42	1.02	0.70	0.89	0.61	0.53	0.94	0.50	0.18	0.46	0.12	0.27	1.19	0.16	0.13	0.14
O2'	0.21	0.50	0.16	0.28	0.53	0.30	0.75	0.39	0.80	0.70	0.67	0.42	0.40	0.87	0.46	0.20	0.58	0.18	0.25	0.93	0.19	0.10	0.13
O3'	0.25	0.44	0.10	0.25	0.49	0.20	0.69	0.40	0.72	0.68	0.59	0.36	0.36	0.80	0.47	0.17	0.57	0.19	0.24	0.85	0.19	0.08	0.13
O4'	0.34	0.52	0.13	0.17	0.58	0.17	0.74	0.48	0.77	0.72	0.65	0.43	0.45	0.82	0.55	0.16	0.40	0.30	0.24	0.86	0.15	0.09	0.11
O5'	0.11	0.11	0.20	0.46	0.08	0.29	0.18	0.43	0.16	0.30	0.07	0.22	0.10	0.31	0.15	0.08	0.61	0.08	0.47	0.22	0.48	0.34	0.41
OP1	0.12	0.41	0.35	0.57	0.21	0.27	0.12	0.34	0.18	0.08	0.32	0.54	0.38	0.06	0.09	0.22	0.60	0.11	0.61	0.14	0.75	0.52	0.62
OP2	0.34	0.25	0.21	0.02	0.32	0.24	0.36	0.26	0.34	0.42	0.29	0.22	0.26	0.41	0.36	0.27	0.24	0.36	0.20	0.37	0.21	0.17	0.14
P	0.04	0.17	0.20	0.41	0.04	0.14	0.05	0.20	0.04	0.16	0.10	0.27	0.16	0.15	0.05	0.11	0.58	0.04	0.35	0.07	0.41	0.25	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.12	0.00	0.20	0.01	0.07	0.18	0.16
C2	0.03	0.00	0.07	0.13	0.00	0.20	0.00	0.50	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.08	0.08	0.29	0.00	0.25	0.41	0.28
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.14	0.05	0.03	0.06	0.09	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.23	0.05	0.16	0.13	0.16
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.04	0.08	0.01	0.11	0.15	0.12	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.09	0.10	0.08
C4	0.02	0.00	0.04	0.08	0.00	0.11	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.05	0.04	0.27	0.01	0.15	0.33	0.24
C4'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.11	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.17	0.24	0.18	0.03	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.11	0.12	0.06	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.08	0.00	0.32	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.07	0.03	0.27	0.01	0.17	0.36	0.26
C5'	0.09	0.50	0.14	0.04	0.33	0.01	0.32	0.00	0.39	0.15	0.47	0.56	0.45	0.22	0.19	0.11	0.08	0.03	0.01	0.38	0.21	0.10	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.12	0.01	0.39	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.15	0.05	0.04	0.28	0.00	0.22	0.41	0.28
C8	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.16	0.03	0.24	0.03	0.10	0.29	0.22
N1	0.02	0.00	0.06	0.11	0.00	0.17	0.01	0.47	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.05	0.06	0.28	0.00	0.25	0.43	0.29
N2	0.04	0.00	0.09	0.15	0.01	0.24	0.00	0.56	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.13	0.10	0.28	0.01	0.31	0.43	0.31
N3	0.03	0.00	0.07	0.12	0.00	0.18	0.00	0.45	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.07	0.08	0.28	0.00	0.19	0.36	0.25
N7	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.22	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.14	0.02	0.25	0.03	0.14	0.33	0.24
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.10	0.01	0.24	0.01	0.10	0.27	0.21
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.12	0.06	0.12	0.11	0.15	0.06	0.17	0.19	0.16	0.10	0.07	0.00	0.04	0.03	0.20	0.14	0.18	0.13	0.15
O3'	0.12	0.08	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.08	0.05	0.16	0.05	0.13	0.07	0.14	0.10	0.04	0.00	0.09	0.13	0.06	0.17	0.13	0.11
O4'	0.00	0.08	0.03	0.01	0.04	0.00	0.03	0.03	0.04	0.03	0.06	0.10	0.08	0.02	0.01	0.03	0.09	0.00	0.19	0.03	0.07	0.15	0.17
O5'	0.20	0.29	0.23	0.09	0.27	0.02	0.27	0.01	0.28	0.24	0.28	0.28	0.28	0.25	0.24	0.20	0.13	0.19	0.00	0.28	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.11	0.01	0.38	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.14	0.06	0.03	0.28	0.00	0.23	0.42	0.29
OP1	0.07	0.25	0.16	0.09	0.15	0.12	0.17	0.21	0.22	0.10	0.25	0.31	0.19	0.14	0.10	0.18	0.17	0.07	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.41	0.13	0.10	0.33	0.06	0.36	0.10	0.41	0.29	0.43	0.43	0.36	0.33	0.27	0.13	0.13	0.15	0.01	0.42	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.28	0.16	0.08	0.24	0.03	0.26	0.01	0.28	0.22	0.29	0.31	0.25	0.24	0.21	0.15	0.11	0.17	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00