Doublet Group distance statistics: 54776

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.015, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.003, 0.021, 0.040, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.018
N3	A	0, -0.002, 0.018, 0.038, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.018 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.001, 0.022, 0.043, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.021
C1'	A	0, -0.003, 0.020, 0.043, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.020 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.026 std_dev=0.027
O2	A	0, 0.001, 0.036, 0.070, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.036 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.038, 0.103, 0.168, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.103 std_dev=0.065
C2'	A	0, 0.030, 0.103, 0.177, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.103 std_dev=0.073
N4	A	0, -0.011, 0.071, 0.153, 0.210 max_d=0.210 avg_d=0.071 std_dev=0.082
C3'	A	0, 0.065, 0.176, 0.287, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.176 std_dev=0.111
O2'	A	0, -0.009, 0.137, 0.283, 0.382 max_d=0.382 avg_d=0.137 std_dev=0.146
C4'	A	0, 0.069, 0.230, 0.390, 0.433 max_d=0.433 avg_d=0.230 std_dev=0.161
O3'	A	0, 0.083, 0.256, 0.428, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.256 std_dev=0.172
P	A	0, 0.083, 0.344, 0.605, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.344 std_dev=0.261
OP1	B	0, 0.075, 0.366, 0.656, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.366 std_dev=0.291
P	B	0, 0.041, 0.338, 0.635, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.338 std_dev=0.297
C5'	B	0, 0.068, 0.372, 0.677, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.372 std_dev=0.304
O5'	B	0, 0.038, 0.351, 0.664, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.351 std_dev=0.313
C4'	B	0, 0.097, 0.416, 0.734, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.416 std_dev=0.319
OP2	B	0, 0.022, 0.344, 0.666, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.344 std_dev=0.322
O4'	B	0, 0.094, 0.426, 0.758, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.426 std_dev=0.332
OP2	A	0, 0.191, 0.524, 0.857, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.524 std_dev=0.333
C5'	A	0, 0.110, 0.447, 0.784, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.447 std_dev=0.337
C3'	B	0, 0.087, 0.446, 0.805, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.446 std_dev=0.359
C2'	B	0, 0.007, 0.405, 0.804, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.405 std_dev=0.399
C1'	B	0, -0.029, 0.389, 0.808, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.389 std_dev=0.418
O3'	B	0, 0.088, 0.520, 0.952, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.520 std_dev=0.432
O2'	B	0, 0.043, 0.515, 0.986, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.515 std_dev=0.472
OP1	A	0, 0.169, 0.641, 1.113, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.641 std_dev=0.472
C4	B	0, 0.013, 0.503, 0.992, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.503 std_dev=0.490
N9	B	0, -0.065, 0.438, 0.942, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.438 std_dev=0.503
O5'	A	0, 0.132, 0.666, 1.200, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.666 std_dev=0.534
C5	B	0, -0.081, 0.471, 1.022, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.471 std_dev=0.551
C6	B	0, -0.032, 0.526, 1.083, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.526 std_dev=0.557
O6	B	0, -0.072, 0.536, 1.144, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.536 std_dev=0.608
N3	B	0, 0.151, 0.763, 1.375, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.763 std_dev=0.612
C8	B	0, 0.081, 0.716, 1.351, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.716 std_dev=0.635
N7	B	0, 0.089, 0.734, 1.379, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.734 std_dev=0.645
N1	B	0, 0.096, 0.759, 1.421, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.759 std_dev=0.662
C2	B	0, 0.140, 0.904, 1.667, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.904 std_dev=0.764
N2	B	0, 0.179, 1.245, 2.310, 2.317 max_d=2.317 avg_d=1.245 std_dev=1.065

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.26	0.21	0.33	0.07
C2	0.04	0.00	0.08	0.05	0.03	0.04	0.02	0.12	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.09	0.07	0.02	0.37	0.11	0.32	0.06
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.09	0.08	0.11	0.00	0.01	0.00	0.12	0.19	0.29	0.05
C3'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.02	0.08	0.02	0.04	0.02	0.09	0.02	0.01	0.01	0.05	0.19	0.29	0.06
C4	0.02	0.03	0.05	0.02	0.00	0.06	0.01	0.23	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.02	0.43	0.10	0.35	0.07
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.11	0.03	0.03	0.06	0.07	0.07	0.02	0.00	0.02	0.24	0.37	0.03
C5	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.05	0.43	0.13	0.39	0.10
C5'	0.05	0.12	0.02	0.02	0.23	0.01	0.29	0.00	0.25	0.14	0.17	0.26	0.06	0.08	0.08	0.04	0.01	0.31	0.43	0.02
C6	0.02	0.02	0.03	0.08	0.02	0.11	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.08	0.04	0.41	0.12	0.38	0.08
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.37	0.14	0.33	0.07
N3	0.04	0.01	0.09	0.04	0.01	0.03	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.11	0.06	0.01	0.40	0.07	0.33	0.05
N4	0.04	0.05	0.08	0.02	0.01	0.06	0.02	0.26	0.03	0.03	0.04	0.00	0.08	0.10	0.03	0.02	0.43	0.15	0.36	0.10
O2	0.05	0.01	0.11	0.09	0.05	0.07	0.03	0.06	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.13	0.12	0.04	0.33	0.15	0.30	0.08
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.07	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.11	0.10	0.13	0.00	0.03	0.02	0.04	0.23	0.29	0.06
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.08	0.08	0.00	0.06	0.03	0.12	0.03	0.00	0.01	0.19	0.20	0.24	0.11
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.05	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.25	0.27	0.32	0.10
O5'	0.26	0.37	0.12	0.05	0.43	0.02	0.43	0.01	0.41	0.37	0.40	0.43	0.33	0.04	0.19	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.21	0.11	0.19	0.19	0.10	0.24	0.13	0.31	0.12	0.14	0.07	0.15	0.15	0.23	0.20	0.27	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.33	0.32	0.29	0.29	0.35	0.37	0.39	0.43	0.38	0.33	0.33	0.36	0.30	0.29	0.24	0.32	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.06	0.05	0.06	0.07	0.03	0.10	0.02	0.08	0.07	0.05	0.10	0.08	0.06	0.11	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.27	0.08	0.18	0.15	0.23	0.11	0.19	0.14	0.07	0.22	0.35	0.25	0.06	0.09	0.06	0.20	0.20	0.16	0.12	0.03	0.05	0.06
C2	0.16	0.23	0.12	0.19	0.18	0.26	0.17	0.22	0.19	0.12	0.22	0.27	0.21	0.13	0.15	0.06	0.17	0.23	0.20	0.18	0.05	0.10	0.10
C2'	0.05	0.22	0.04	0.10	0.07	0.18	0.03	0.14	0.05	0.13	0.15	0.32	0.19	0.11	0.04	0.13	0.14	0.14	0.11	0.03	0.06	0.03	0.04
C3'	0.03	0.19	0.08	0.06	0.04	0.13	0.03	0.09	0.02	0.16	0.13	0.29	0.17	0.14	0.05	0.18	0.11	0.11	0.07	0.03	0.14	0.14	0.11
C4	0.13	0.15	0.10	0.13	0.14	0.21	0.17	0.18	0.17	0.18	0.15	0.19	0.14	0.18	0.15	0.07	0.10	0.20	0.17	0.18	0.07	0.10	0.09
C4'	0.04	0.22	0.08	0.05	0.06	0.09	0.05	0.03	0.04	0.19	0.15	0.33	0.19	0.17	0.07	0.14	0.14	0.08	0.03	0.04	0.18	0.18	0.15
C5	0.12	0.15	0.09	0.12	0.13	0.21	0.15	0.18	0.15	0.16	0.14	0.19	0.14	0.17	0.14	0.07	0.10	0.19	0.17	0.17	0.04	0.07	0.07
C5'	0.07	0.30	0.06	0.04	0.13	0.05	0.07	0.07	0.12	0.13	0.23	0.39	0.26	0.09	0.05	0.07	0.18	0.08	0.17	0.09	0.35	0.40	0.34
C6	0.13	0.18	0.09	0.15	0.14	0.24	0.15	0.20	0.16	0.12	0.17	0.22	0.17	0.13	0.13	0.06	0.14	0.21	0.18	0.17	0.03	0.07	0.07
N1	0.15	0.23	0.11	0.19	0.17	0.26	0.15	0.22	0.17	0.10	0.21	0.28	0.22	0.11	0.13	0.06	0.18	0.23	0.20	0.17	0.04	0.08	0.09
N3	0.15	0.18	0.11	0.16	0.16	0.24	0.17	0.20	0.18	0.15	0.18	0.21	0.17	0.16	0.15	0.06	0.13	0.22	0.18	0.18	0.06	0.10	0.10
N4	0.13	0.16	0.11	0.12	0.14	0.19	0.17	0.17	0.16	0.21	0.14	0.21	0.15	0.21	0.16	0.10	0.10	0.18	0.16	0.17	0.14	0.14	0.13
O2	0.17	0.27	0.12	0.20	0.19	0.27	0.16	0.23	0.19	0.10	0.24	0.31	0.25	0.11	0.14	0.07	0.20	0.24	0.21	0.18	0.06	0.11	0.11
O2'	0.06	0.25	0.07	0.11	0.07	0.16	0.06	0.12	0.05	0.20	0.17	0.38	0.22	0.19	0.07	0.15	0.16	0.13	0.10	0.04	0.07	0.03	0.04
O3'	0.10	0.17	0.16	0.08	0.07	0.11	0.13	0.09	0.09	0.27	0.09	0.29	0.14	0.26	0.14	0.28	0.10	0.09	0.11	0.13	0.18	0.18	0.16
O4'	0.14	0.30	0.09	0.19	0.16	0.23	0.11	0.17	0.15	0.08	0.24	0.38	0.27	0.07	0.10	0.07	0.25	0.19	0.14	0.13	0.05	0.02	0.03
O5'	0.09	0.09	0.14	0.07	0.12	0.20	0.15	0.25	0.14	0.19	0.11	0.13	0.08	0.19	0.14	0.36	0.02	0.10	0.30	0.17	0.24	0.26	0.25
OP1	0.09	0.15	0.03	0.01	0.12	0.03	0.11	0.05	0.12	0.08	0.13	0.18	0.14	0.08	0.09	0.05	0.01	0.10	0.17	0.12	0.21	0.32	0.22
OP2	0.16	0.25	0.07	0.06	0.20	0.22	0.19	0.11	0.21	0.12	0.24	0.28	0.24	0.14	0.16	0.19	0.02	0.30	0.14	0.20	0.32	0.49	0.36
P	0.06	0.11	0.06	0.02	0.07	0.11	0.06	0.07	0.07	0.05	0.09	0.16	0.10	0.04	0.05	0.16	0.01	0.14	0.09	0.08	0.15	0.22	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.03	0.03	0.12	0.06	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.03	0.08	0.03	0.03
C2	0.07	0.00	0.11	0.06	0.03	0.19	0.03	0.19	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.26	0.07	0.21	0.20	0.02	0.13	0.18	0.15
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.06	0.08	0.04	0.09	0.15	0.09	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.09	0.06	0.05	0.02
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.02	0.13	0.06	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.06	0.09	0.06
C4	0.01	0.03	0.06	0.01	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.13	0.05	0.10	0.04	0.02	0.10	0.05	0.05
C4'	0.00	0.19	0.01	0.00	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.16	0.12	0.28	0.19	0.12	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02	0.01
C5	0.02	0.03	0.06	0.04	0.01	0.03	0.00	0.11	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.09	0.06	0.04	0.11	0.03	0.21	0.10	0.13
C5'	0.06	0.19	0.06	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.07	0.30	0.10	0.30	0.18	0.26	0.12	0.06	0.02	0.03	0.02	0.13	0.02	0.01	0.02
C6	0.01	0.02	0.08	0.04	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.15	0.06	0.07	0.07	0.01	0.17	0.08	0.11
C8	0.03	0.04	0.04	0.07	0.02	0.16	0.01	0.30	0.03	0.00	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.11	0.06	0.13	0.29	0.05	0.39	0.22	0.28
N1	0.03	0.01	0.09	0.02	0.02	0.12	0.02	0.10	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.22	0.05	0.15	0.10	0.01	0.07	0.09	0.07
N2	0.12	0.01	0.15	0.13	0.04	0.28	0.04	0.30	0.04	0.05	0.03	0.00	0.04	0.06	0.06	0.32	0.12	0.28	0.32	0.05	0.25	0.30	0.26
N3	0.06	0.01	0.09	0.06	0.00	0.19	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.23	0.05	0.22	0.19	0.02	0.14	0.18	0.15
N7	0.02	0.05	0.04	0.07	0.03	0.12	0.01	0.26	0.03	0.01	0.04	0.06	0.03	0.00	0.02	0.04	0.06	0.08	0.26	0.05	0.39	0.23	0.27
N9	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.12	0.03	0.01	0.02	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.04	0.18	0.06	0.11
O2'	0.01	0.26	0.01	0.01	0.13	0.01	0.09	0.06	0.15	0.11	0.22	0.32	0.23	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.05	0.09	0.03
O3'	0.05	0.07	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.06	0.05	0.12	0.05	0.06	0.05	0.02	0.00	0.05	0.10	0.08	0.10	0.18	0.12
O4'	0.00	0.21	0.01	0.01	0.10	0.00	0.04	0.03	0.07	0.13	0.15	0.28	0.22	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.07	0.05	0.01	0.02
O5'	0.03	0.20	0.02	0.04	0.04	0.01	0.11	0.02	0.07	0.29	0.10	0.32	0.19	0.26	0.10	0.01	0.10	0.03	0.00	0.13	0.02	0.01	0.00
O6	0.03	0.02	0.09	0.07	0.02	0.06	0.03	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.04	0.13	0.08	0.07	0.13	0.00	0.26	0.14	0.17
OP1	0.08	0.13	0.06	0.06	0.10	0.03	0.21	0.02	0.17	0.39	0.07	0.25	0.14	0.39	0.18	0.05	0.10	0.05	0.02	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.18	0.05	0.09	0.05	0.02	0.10	0.01	0.08	0.22	0.09	0.30	0.18	0.23	0.06	0.09	0.18	0.01	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.15	0.02	0.06	0.05	0.01	0.13	0.02	0.11	0.28	0.07	0.26	0.15	0.27	0.11	0.03	0.12	0.02	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00