Doublet Group distance statistics: 54799

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 6, 19, 12, 11, 12, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.004, 0.020, 0.037, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.020 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.004, 0.024, 0.045, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.024 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.017, 0.043, 0.070, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.043 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.001, 0.028, 0.055, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.028 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N1	B	0, 0.245, 0.401, 0.557, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.401 std_dev=0.156
C6	B	0, 0.169, 0.327, 0.485, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.327 std_dev=0.158
O4'	A	0, 0.026, 0.190, 0.354, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.190 std_dev=0.164
C2'	A	0, 0.032, 0.211, 0.390, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.211 std_dev=0.179
C2	B	0, 0.265, 0.449, 0.632, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.449 std_dev=0.183
C5	B	0, 0.173, 0.358, 0.542, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.358 std_dev=0.184
N3	B	0, 0.243, 0.439, 0.635, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.439 std_dev=0.196
C4	B	0, 0.197, 0.410, 0.623, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.410 std_dev=0.213
O2'	A	0, 0.076, 0.294, 0.512, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.294 std_dev=0.218
C4'	A	0, 0.041, 0.290, 0.539, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.290 std_dev=0.249
C3'	A	0, 0.049, 0.327, 0.605, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.327 std_dev=0.278
O2	B	0, 0.302, 0.583, 0.864, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.583 std_dev=0.281
C1'	B	0, 0.304, 0.594, 0.884, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.594 std_dev=0.290
O4'	B	0, 0.274, 0.571, 0.868, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.571 std_dev=0.297
O4	B	0, 0.241, 0.539, 0.837, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.539 std_dev=0.298
O3'	A	0, 0.105, 0.498, 0.890, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.498 std_dev=0.392
O5'	B	0, 0.201, 0.626, 1.050, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.626 std_dev=0.425
C2'	B	0, 0.373, 0.802, 1.231, 1.797 max_d=1.797 avg_d=0.802 std_dev=0.429
C5'	A	0, 0.080, 0.520, 0.960, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.520 std_dev=0.440
C4'	B	0, 0.286, 0.744, 1.202, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.744 std_dev=0.458
P	B	0, 0.158, 0.630, 1.101, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.630 std_dev=0.471
C5'	B	0, 0.215, 0.693, 1.170, 1.903 max_d=1.903 avg_d=0.693 std_dev=0.477
OP2	B	0, 0.163, 0.647, 1.131, 1.888 max_d=1.888 avg_d=0.647 std_dev=0.484
C3'	B	0, 0.348, 0.857, 1.366, 1.904 max_d=1.904 avg_d=0.857 std_dev=0.509
O5'	A	0, 0.058, 0.625, 1.193, 1.956 max_d=1.956 avg_d=0.625 std_dev=0.567
O2'	B	0, 0.516, 1.093, 1.670, 2.329 max_d=2.329 avg_d=1.093 std_dev=0.577
OP1	B	0, 0.171, 0.779, 1.387, 2.307 max_d=2.307 avg_d=0.779 std_dev=0.608
O3'	B	0, 0.524, 1.272, 2.019, 3.006 max_d=3.006 avg_d=1.272 std_dev=0.747
P	A	0, 0.060, 1.099, 2.138, 4.220 max_d=4.220 avg_d=1.099 std_dev=1.039
OP1	A	0, 0.186, 1.351, 2.516, 4.872 max_d=4.872 avg_d=1.351 std_dev=1.165
OP2	A	0, -0.047, 1.330, 2.707, 5.641 max_d=5.641 avg_d=1.330 std_dev=1.377

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.20	0.17	0.32	0.18
C2	0.03	0.00	0.13	0.15	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.19	0.04	0.36	0.33	0.75	0.38
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.07	0.11	0.13	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.20	0.25	0.29	0.10
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.11	0.12	0.13	0.14	0.12	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.26	0.27	0.28	0.15
C4	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.09	0.02	0.38	0.32	0.73	0.40
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.07	0.06	0.10	0.11	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.26	0.16	0.13
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02	0.46	0.48	0.94	0.57
C5'	0.03	0.12	0.02	0.02	0.13	0.01	0.18	0.00	0.19	0.20	0.15	0.10	0.22	0.22	0.12	0.04	0.04	0.01	0.01	0.15	0.22	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.03	0.47	0.52	1.01	0.60
C8	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.11	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.14	0.04	0.47	0.45	0.84	0.55
N1	0.02	0.00	0.11	0.13	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.03	0.42	0.43	0.91	0.50
N3	0.03	0.00	0.13	0.14	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.17	0.04	0.32	0.27	0.63	0.31
N6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.10	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.14	0.04	0.51	0.64	1.15	0.70
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.11	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.13	0.04	0.51	0.58	1.04	0.67
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.35	0.26	0.62	0.36
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.08	0.04	0.06	0.04	0.09	0.04	0.12	0.14	0.08	0.04	0.03	0.00	0.04	0.04	0.07	0.41	0.14	0.21
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.04	0.13	0.14	0.16	0.17	0.14	0.13	0.05	0.04	0.00	0.02	0.26	0.43	0.23	0.23
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.18	0.19	0.23	0.22
O5'	0.20	0.36	0.20	0.26	0.38	0.02	0.46	0.01	0.47	0.47	0.42	0.32	0.51	0.51	0.35	0.07	0.26	0.18	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.17	0.33	0.25	0.27	0.32	0.26	0.48	0.15	0.52	0.45	0.43	0.27	0.64	0.58	0.26	0.41	0.43	0.19	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.32	0.75	0.29	0.28	0.73	0.16	0.94	0.22	1.01	0.84	0.91	0.63	1.15	1.04	0.62	0.14	0.23	0.23	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.18	0.38	0.10	0.15	0.40	0.13	0.57	0.02	0.60	0.55	0.50	0.31	0.70	0.67	0.36	0.21	0.23	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.20	0.13	0.13	0.22	0.14	0.21	0.19	0.18	0.16	0.21	0.23	0.17	0.14	0.25	0.14	0.19	0.05	0.09	0.05
C2	0.34	0.15	0.35	0.32	0.20	0.37	0.19	0.34	0.19	0.19	0.18	0.24	0.45	0.36	0.26	0.36	0.28	0.23	0.18	0.19
C2'	0.17	0.19	0.13	0.13	0.20	0.13	0.20	0.19	0.19	0.18	0.20	0.21	0.16	0.14	0.21	0.14	0.21	0.09	0.09	0.10
C3'	0.20	0.22	0.16	0.10	0.24	0.11	0.25	0.09	0.23	0.22	0.23	0.22	0.17	0.10	0.25	0.19	0.08	0.03	0.07	0.02
C4	0.22	0.18	0.19	0.17	0.19	0.21	0.18	0.23	0.16	0.14	0.19	0.23	0.26	0.18	0.23	0.22	0.20	0.12	0.16	0.11
C4'	0.18	0.22	0.15	0.09	0.29	0.09	0.29	0.09	0.24	0.21	0.26	0.22	0.16	0.10	0.33	0.16	0.06	0.10	0.16	0.07
C5	0.25	0.21	0.22	0.19	0.15	0.21	0.18	0.21	0.17	0.18	0.18	0.27	0.28	0.19	0.22	0.24	0.21	0.14	0.22	0.15
C5'	0.24	0.32	0.22	0.16	0.43	0.14	0.42	0.10	0.34	0.30	0.38	0.30	0.21	0.15	0.48	0.21	0.11	0.21	0.28	0.16
C6	0.33	0.24	0.31	0.27	0.16	0.28	0.21	0.26	0.21	0.24	0.15	0.33	0.38	0.27	0.25	0.30	0.24	0.17	0.23	0.17
C8	0.15	0.20	0.11	0.13	0.21	0.13	0.17	0.18	0.14	0.14	0.23	0.23	0.16	0.13	0.27	0.14	0.21	0.17	0.25	0.18
N1	0.37	0.20	0.38	0.33	0.20	0.35	0.21	0.31	0.21	0.24	0.14	0.31	0.47	0.36	0.27	0.36	0.27	0.21	0.21	0.19
N3	0.26	0.18	0.26	0.25	0.20	0.30	0.19	0.30	0.18	0.15	0.21	0.24	0.34	0.28	0.24	0.29	0.25	0.20	0.15	0.16
N6	0.34	0.30	0.34	0.29	0.19	0.29	0.24	0.25	0.24	0.28	0.21	0.40	0.41	0.29	0.27	0.30	0.25	0.20	0.28	0.20
N7	0.20	0.22	0.16	0.16	0.18	0.16	0.16	0.18	0.15	0.17	0.23	0.27	0.21	0.15	0.24	0.18	0.22	0.19	0.28	0.19
N9	0.16	0.19	0.12	0.12	0.21	0.14	0.19	0.18	0.15	0.14	0.21	0.22	0.17	0.12	0.25	0.15	0.19	0.07	0.15	0.09
O2'	0.25	0.25	0.23	0.23	0.22	0.23	0.22	0.27	0.22	0.24	0.24	0.28	0.27	0.24	0.22	0.24	0.26	0.15	0.09	0.13
O3'	0.20	0.20	0.16	0.10	0.22	0.13	0.22	0.09	0.21	0.20	0.21	0.20	0.17	0.10	0.22	0.21	0.02	0.03	0.03	0.02
O4'	0.16	0.20	0.13	0.10	0.26	0.10	0.26	0.13	0.20	0.17	0.24	0.22	0.16	0.10	0.31	0.13	0.12	0.06	0.14	0.04
O5'	0.35	0.45	0.38	0.36	0.54	0.31	0.52	0.31	0.44	0.41	0.50	0.43	0.35	0.37	0.59	0.31	0.36	0.32	0.38	0.32
OP1	0.45	0.57	0.48	0.46	0.72	0.45	0.63	0.46	0.52	0.50	0.66	0.55	0.47	0.47	0.83	0.44	0.46	0.66	0.57	0.52
OP2	0.63	0.89	0.68	0.61	1.09	0.45	0.97	0.37	0.80	0.78	1.03	0.87	0.62	0.59	1.21	0.48	0.46	0.32	0.49	0.33
P	0.35	0.53	0.39	0.36	0.71	0.28	0.63	0.27	0.49	0.45	0.64	0.50	0.35	0.37	0.81	0.27	0.33	0.42	0.45	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.08	0.03	0.01	0.06	0.07	0.12	0.09
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.02	0.04	0.11	0.13	0.21	0.15
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.07	0.02	0.08	0.05	0.08	0.03	0.08	0.15	0.00	0.02	0.09	0.01	0.11	0.14	0.15	0.12
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.14	0.00	0.13	0.02	0.11	0.08	0.13	0.13	0.02	0.01	0.16	0.01	0.06	0.13	0.09	0.07
C4	0.02	0.01	0.07	0.14	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.13	0.15	0.01	0.04	0.14	0.20	0.27	0.20
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.04	0.05	0.05	0.10	0.02	0.06	0.01	0.01	0.08	0.04	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.14	0.01	0.04	0.15	0.20	0.26	0.20
C5'	0.03	0.06	0.05	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.09	0.05	0.07	0.05	0.06	0.06	0.10	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.01	0.04	0.13	0.15	0.21	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.02	0.10	0.11	0.18	0.14
N3	0.02	0.00	0.08	0.13	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.14	0.02	0.04	0.13	0.16	0.25	0.18
O2	0.03	0.01	0.15	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.15	0.02	0.05	0.10	0.11	0.19	0.14
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.13	0.10	0.14	0.06	0.12	0.06	0.09	0.10	0.00	0.06	0.14	0.07	0.08	0.13	0.15	0.10
O3'	0.08	0.11	0.02	0.01	0.15	0.02	0.14	0.06	0.10	0.06	0.14	0.15	0.06	0.00	0.18	0.06	0.11	0.23	0.19	0.14
O4	0.03	0.02	0.09	0.16	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.02	0.02	0.14	0.18	0.00	0.04	0.15	0.22	0.29	0.21
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.07	0.06	0.04	0.00	0.06	0.08	0.12	0.10
O5'	0.06	0.11	0.11	0.06	0.14	0.01	0.15	0.01	0.13	0.10	0.13	0.10	0.08	0.11	0.15	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.07	0.13	0.14	0.13	0.20	0.08	0.20	0.07	0.15	0.11	0.16	0.11	0.13	0.23	0.22	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.21	0.15	0.09	0.27	0.04	0.26	0.02	0.21	0.18	0.25	0.19	0.15	0.19	0.29	0.12	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.15	0.12	0.07	0.20	0.03	0.20	0.02	0.17	0.14	0.18	0.14	0.10	0.14	0.21	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00