Doublet Group distance statistics: 54801

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 6, 17, 15, 7, 5, 6, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.001, 0.013, 0.026, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.010, 0.025, 0.039, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.012, 0.030, 0.048, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.018, 0.041, 0.064, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.041 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.018, 0.044, 0.069, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.044 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.020, 0.050, 0.079, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.050 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.056, 0.168, 0.281, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.168 std_dev=0.112
C2'	A	0, 0.075, 0.214, 0.353, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.214 std_dev=0.139
C4'	A	0, 0.100, 0.264, 0.427, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.264 std_dev=0.163
O2'	A	0, 0.123, 0.304, 0.484, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.304 std_dev=0.180
O4'	B	0, 0.421, 0.618, 0.815, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.618 std_dev=0.197
C6	B	0, 0.348, 0.551, 0.754, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.551 std_dev=0.203
C3'	A	0, 0.111, 0.315, 0.520, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.315 std_dev=0.204
N1	B	0, 0.309, 0.515, 0.722, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.515 std_dev=0.207
C1'	B	0, 0.372, 0.581, 0.790, 1.061 max_d=1.061 avg_d=0.581 std_dev=0.209
N3	B	0, 0.311, 0.533, 0.755, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.533 std_dev=0.222
C5	B	0, 0.354, 0.583, 0.811, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.583 std_dev=0.228
C2	B	0, 0.282, 0.520, 0.757, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.520 std_dev=0.237
C4	B	0, 0.329, 0.568, 0.808, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.568 std_dev=0.240
C2'	B	0, 0.426, 0.671, 0.915, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.671 std_dev=0.244
O4	B	0, 0.434, 0.693, 0.952, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.693 std_dev=0.259
C3'	B	0, 0.482, 0.743, 1.005, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.743 std_dev=0.262
O2	B	0, 0.334, 0.608, 0.883, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.608 std_dev=0.274
C4'	B	0, 0.452, 0.731, 1.010, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.731 std_dev=0.279
O5'	B	0, 0.332, 0.624, 0.917, 1.831 max_d=1.831 avg_d=0.624 std_dev=0.292
O3'	A	0, 0.169, 0.463, 0.758, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.463 std_dev=0.294
O2'	B	0, 0.537, 0.848, 1.158, 1.758 max_d=1.758 avg_d=0.848 std_dev=0.311
C5'	A	0, 0.203, 0.521, 0.839, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.521 std_dev=0.318
P	B	0, 0.213, 0.542, 0.871, 2.068 max_d=2.068 avg_d=0.542 std_dev=0.329
OP2	B	0, 0.196, 0.556, 0.915, 2.187 max_d=2.187 avg_d=0.556 std_dev=0.360
O3'	B	0, 0.555, 0.932, 1.309, 2.498 max_d=2.498 avg_d=0.932 std_dev=0.377
OP1	B	0, 0.263, 0.680, 1.098, 2.483 max_d=2.483 avg_d=0.680 std_dev=0.418
C5'	B	0, 0.329, 0.814, 1.299, 2.023 max_d=2.023 avg_d=0.814 std_dev=0.485
O5'	A	0, 0.213, 0.810, 1.406, 3.126 max_d=3.126 avg_d=0.810 std_dev=0.597
P	A	0, 0.481, 1.152, 1.823, 4.015 max_d=4.015 avg_d=1.152 std_dev=0.671
OP2	A	0, 0.524, 1.251, 1.978, 4.369 max_d=4.369 avg_d=1.251 std_dev=0.727
OP1	A	0, 0.640, 1.422, 2.204, 4.667 max_d=4.667 avg_d=1.422 std_dev=0.782

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.17	0.18	0.17	0.13
C2	0.04	0.00	0.12	0.15	0.01	0.07	0.02	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.13	0.18	0.04	0.41	0.46	0.42	0.38
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.08	0.09	0.13	0.06	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.23	0.26	0.13	0.18
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.09	0.13	0.11	0.14	0.09	0.12	0.05	0.02	0.01	0.01	0.30	0.34	0.13	0.24
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.42	0.44	0.37	0.37
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.06	0.08	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.12	0.24	0.07
C5	0.01	0.02	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.02	0.54	0.58	0.51	0.51
C5'	0.03	0.12	0.02	0.03	0.11	0.01	0.15	0.00	0.16	0.16	0.14	0.10	0.19	0.18	0.10	0.04	0.05	0.01	0.01	0.19	0.34	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.11	0.02	0.55	0.63	0.58	0.54
C8	0.02	0.02	0.08	0.13	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.15	0.05	0.53	0.52	0.39	0.46
N1	0.03	0.01	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.14	0.03	0.50	0.56	0.52	0.48
N3	0.04	0.01	0.13	0.14	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.17	0.04	0.36	0.38	0.33	0.32
N6	0.02	0.02	0.06	0.09	0.02	0.08	0.02	0.19	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.08	0.12	0.04	0.61	0.72	0.68	0.63
N7	0.01	0.02	0.07	0.12	0.01	0.08	0.00	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.15	0.04	0.59	0.64	0.55	0.57
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.39	0.37	0.27	0.31
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.04	0.05	0.04	0.08	0.05	0.10	0.13	0.08	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.08	0.16	0.16	0.12
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.05	0.11	0.15	0.14	0.17	0.12	0.15	0.05	0.04	0.00	0.02	0.24	0.35	0.17	0.21
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.08	0.27	0.11
O5'	0.17	0.41	0.23	0.30	0.42	0.02	0.54	0.01	0.55	0.53	0.50	0.36	0.61	0.59	0.39	0.08	0.24	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.18	0.46	0.26	0.34	0.44	0.12	0.58	0.19	0.63	0.52	0.56	0.38	0.72	0.64	0.37	0.16	0.35	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.42	0.13	0.13	0.37	0.24	0.51	0.34	0.58	0.39	0.52	0.33	0.68	0.55	0.27	0.16	0.17	0.27	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.38	0.18	0.24	0.37	0.07	0.51	0.02	0.54	0.46	0.48	0.32	0.63	0.57	0.31	0.12	0.21	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.17	0.19	0.12	0.34	0.15	0.33	0.18	0.22	0.16	0.25	0.20	0.32	0.12	0.43	0.21	0.23	0.07	0.10	0.08
C2	0.29	0.20	0.33	0.25	0.25	0.24	0.22	0.22	0.18	0.19	0.22	0.30	0.40	0.29	0.34	0.23	0.20	0.16	0.18	0.14
C2'	0.18	0.20	0.13	0.13	0.33	0.13	0.34	0.20	0.26	0.18	0.27	0.19	0.23	0.12	0.39	0.17	0.26	0.12	0.14	0.14
C3'	0.17	0.28	0.20	0.23	0.43	0.13	0.42	0.20	0.32	0.24	0.36	0.25	0.15	0.21	0.48	0.17	0.08	0.03	0.07	0.02
C4	0.27	0.18	0.24	0.17	0.30	0.19	0.27	0.17	0.20	0.17	0.24	0.24	0.32	0.18	0.41	0.23	0.18	0.09	0.17	0.09
C4'	0.15	0.24	0.16	0.20	0.44	0.12	0.43	0.24	0.29	0.20	0.34	0.21	0.18	0.20	0.53	0.15	0.08	0.10	0.19	0.08
C5	0.30	0.21	0.27	0.25	0.27	0.26	0.25	0.25	0.25	0.23	0.23	0.26	0.32	0.25	0.41	0.28	0.21	0.15	0.24	0.15
C5'	0.21	0.34	0.29	0.31	0.55	0.17	0.53	0.24	0.38	0.30	0.46	0.30	0.23	0.30	0.66	0.18	0.14	0.21	0.38	0.20
C6	0.32	0.24	0.32	0.31	0.22	0.28	0.26	0.28	0.29	0.27	0.21	0.31	0.34	0.30	0.35	0.28	0.21	0.16	0.25	0.16
C8	0.27	0.19	0.22	0.21	0.33	0.25	0.28	0.25	0.22	0.19	0.26	0.22	0.29	0.21	0.47	0.29	0.25	0.19	0.26	0.20
N1	0.32	0.24	0.34	0.29	0.21	0.26	0.22	0.23	0.23	0.24	0.19	0.33	0.38	0.31	0.32	0.25	0.20	0.14	0.21	0.14
N3	0.26	0.19	0.27	0.18	0.30	0.20	0.27	0.21	0.19	0.16	0.24	0.26	0.36	0.23	0.38	0.20	0.19	0.14	0.16	0.12
N6	0.34	0.29	0.35	0.37	0.25	0.32	0.33	0.35	0.35	0.31	0.25	0.34	0.34	0.36	0.32	0.31	0.24	0.21	0.30	0.20
N7	0.30	0.21	0.25	0.27	0.30	0.29	0.27	0.31	0.27	0.23	0.25	0.25	0.30	0.26	0.45	0.31	0.25	0.21	0.30	0.22
N9	0.25	0.18	0.20	0.15	0.33	0.19	0.30	0.16	0.20	0.16	0.25	0.21	0.30	0.15	0.44	0.24	0.20	0.09	0.17	0.11
O2'	0.26	0.21	0.24	0.21	0.30	0.22	0.32	0.33	0.27	0.22	0.24	0.22	0.38	0.22	0.34	0.25	0.39	0.20	0.17	0.20
O3'	0.22	0.31	0.28	0.34	0.43	0.20	0.43	0.30	0.36	0.29	0.37	0.28	0.17	0.33	0.46	0.20	0.02	0.02	0.03	0.01
O4'	0.19	0.19	0.14	0.10	0.39	0.11	0.37	0.19	0.22	0.15	0.29	0.19	0.25	0.10	0.50	0.17	0.14	0.06	0.14	0.04
O5'	0.49	0.61	0.46	0.41	0.76	0.35	0.73	0.27	0.62	0.57	0.70	0.59	0.43	0.36	0.84	0.45	0.38	0.21	0.44	0.30
OP1	0.58	0.77	0.61	0.57	0.96	0.44	0.89	0.38	0.75	0.70	0.88	0.73	0.52	0.54	1.07	0.50	0.49	0.42	0.68	0.47
OP2	0.51	0.69	0.53	0.44	0.85	0.35	0.76	0.28	0.63	0.61	0.79	0.67	0.50	0.41	0.97	0.43	0.34	0.30	0.46	0.30
P	0.48	0.64	0.48	0.42	0.81	0.33	0.75	0.26	0.62	0.58	0.74	0.61	0.43	0.39	0.92	0.42	0.36	0.25	0.49	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.08	0.02	0.01	0.14	0.15	0.13	0.11
C2	0.02	0.00	0.11	0.16	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.16	0.02	0.05	0.30	0.27	0.22	0.26
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.02	0.07	0.05	0.09	0.03	0.10	0.18	0.00	0.02	0.09	0.01	0.26	0.28	0.18	0.23
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.19	0.01	0.17	0.02	0.15	0.11	0.19	0.18	0.02	0.01	0.22	0.02	0.32	0.36	0.10	0.26
C4	0.02	0.01	0.07	0.19	0.00	0.11	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.12	0.20	0.00	0.04	0.45	0.41	0.39	0.41
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.11	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.09	0.08	0.10	0.02	0.13	0.00	0.02	0.11	0.23	0.03
C5	0.02	0.01	0.07	0.17	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.18	0.01	0.05	0.47	0.43	0.38	0.42
C5'	0.03	0.12	0.05	0.02	0.19	0.01	0.19	0.00	0.15	0.10	0.16	0.10	0.07	0.07	0.21	0.02	0.01	0.15	0.34	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.14	0.02	0.06	0.41	0.35	0.26	0.33
N1	0.01	0.01	0.03	0.11	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.02	0.30	0.26	0.18	0.23
N3	0.02	0.01	0.10	0.19	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.20	0.01	0.04	0.38	0.34	0.31	0.34
O2	0.04	0.01	0.18	0.18	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.22	0.02	0.09	0.24	0.22	0.18	0.20
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.12	0.10	0.13	0.07	0.12	0.06	0.10	0.16	0.00	0.06	0.13	0.08	0.10	0.17	0.19	0.12
O3'	0.08	0.16	0.02	0.01	0.20	0.02	0.18	0.07	0.14	0.08	0.20	0.22	0.06	0.00	0.25	0.06	0.27	0.39	0.17	0.26
O4	0.02	0.02	0.09	0.22	0.00	0.13	0.01	0.21	0.02	0.02	0.01	0.02	0.13	0.25	0.00	0.04	0.48	0.46	0.45	0.45
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.02	0.06	0.02	0.04	0.09	0.08	0.06	0.04	0.00	0.08	0.09	0.24	0.11
O5'	0.14	0.30	0.26	0.32	0.45	0.02	0.47	0.01	0.41	0.30	0.38	0.24	0.10	0.27	0.48	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.15	0.27	0.28	0.36	0.41	0.11	0.43	0.15	0.35	0.26	0.34	0.22	0.17	0.39	0.46	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.22	0.18	0.10	0.39	0.23	0.38	0.34	0.26	0.18	0.31	0.18	0.19	0.17	0.45	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.26	0.23	0.26	0.41	0.03	0.42	0.01	0.33	0.23	0.34	0.20	0.12	0.26	0.45	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00