Doublet Group distance statistics: 54802

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 8, 8, 16, 9, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.009, 0.024, 0.040, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.004, 0.021, 0.039, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.021 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.012, 0.034, 0.057, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.034 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.012, 0.038, 0.064, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.038 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.014, 0.039, 0.065, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.039 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.079, 0.203, 0.328, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.203 std_dev=0.124
C5	B	0, 0.217, 0.346, 0.475, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.346 std_dev=0.129
C6	B	0, 0.254, 0.388, 0.521, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.388 std_dev=0.134
C2'	A	0, 0.090, 0.233, 0.376, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.233 std_dev=0.143
C4	B	0, 0.192, 0.350, 0.507, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.350 std_dev=0.157
N3	B	0, 0.228, 0.398, 0.567, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.398 std_dev=0.169
O2'	A	0, 0.116, 0.286, 0.456, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.286 std_dev=0.170
N1	B	0, 0.200, 0.375, 0.550, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.375 std_dev=0.175
C2	B	0, 0.221, 0.397, 0.573, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.397 std_dev=0.176
C4'	A	0, 0.141, 0.325, 0.510, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.325 std_dev=0.184
C3'	A	0, 0.152, 0.365, 0.577, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.365 std_dev=0.212
O4	B	0, 0.281, 0.520, 0.760, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.520 std_dev=0.239
O2	B	0, 0.282, 0.538, 0.793, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.538 std_dev=0.255
C1'	B	0, 0.277, 0.536, 0.796, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.536 std_dev=0.260
O3'	A	0, 0.249, 0.538, 0.826, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.538 std_dev=0.288
C2'	B	0, 0.317, 0.615, 0.913, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.615 std_dev=0.298
O4'	B	0, 0.289, 0.598, 0.907, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.598 std_dev=0.309
C3'	B	0, 0.306, 0.645, 0.983, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.645 std_dev=0.338
C5'	B	0, 0.363, 0.706, 1.048, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.706 std_dev=0.343
P	B	0, 0.337, 0.682, 1.027, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.682 std_dev=0.345
C5'	A	0, 0.244, 0.597, 0.950, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.597 std_dev=0.353
C4'	B	0, 0.279, 0.639, 1.000, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.639 std_dev=0.361
O2'	B	0, 0.475, 0.837, 1.199, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.837 std_dev=0.362
O5'	B	0, 0.364, 0.727, 1.090, 2.020 max_d=2.020 avg_d=0.727 std_dev=0.363
O3'	B	0, 0.442, 0.853, 1.263, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.853 std_dev=0.411
OP2	B	0, 0.363, 0.774, 1.185, 1.876 max_d=1.876 avg_d=0.774 std_dev=0.411
OP1	B	0, 0.389, 0.877, 1.365, 2.110 max_d=2.110 avg_d=0.877 std_dev=0.488
O5'	A	0, 0.206, 0.698, 1.189, 2.286 max_d=2.286 avg_d=0.698 std_dev=0.491
P	A	0, 0.270, 0.794, 1.318, 2.491 max_d=2.491 avg_d=0.794 std_dev=0.524
OP1	A	0, 0.625, 1.438, 2.252, 3.166 max_d=3.166 avg_d=1.438 std_dev=0.813
OP2	A	0, 0.265, 1.118, 1.970, 3.126 max_d=3.126 avg_d=1.118 std_dev=0.853

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.18	0.46	0.23	0.13
C2	0.04	0.00	0.13	0.20	0.01	0.10	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.23	0.04	0.41	0.89	0.47	0.34
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.08	0.10	0.14	0.05	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.27	0.37	0.21	0.20
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.07	0.03	0.10	0.12	0.16	0.19	0.09	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.35	0.33	0.30	0.27
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.02	0.41	0.84	0.44	0.31
C4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.07	0.09	0.09	0.08	0.07	0.04	0.04	0.03	0.00	0.01	0.21	0.28	0.04
C5	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.50	1.01	0.58	0.40
C5'	0.03	0.17	0.02	0.03	0.13	0.01	0.15	0.00	0.18	0.12	0.18	0.15	0.19	0.15	0.09	0.04	0.06	0.02	0.01	0.28	0.40	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.07	0.11	0.02	0.52	1.08	0.64	0.44
C8	0.01	0.02	0.08	0.12	0.01	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.13	0.03	0.47	0.87	0.49	0.33
N1	0.03	0.01	0.10	0.16	0.02	0.09	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.18	0.03	0.48	1.02	0.58	0.41
N3	0.04	0.00	0.14	0.19	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.21	0.04	0.36	0.78	0.39	0.29
N6	0.03	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.10	0.03	0.56	1.17	0.73	0.49
N7	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.07	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.53	1.05	0.64	0.42
N9	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.36	0.72	0.36	0.25
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05	0.10	0.11	0.07	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.11	0.24	0.18	0.10
O3'	0.02	0.23	0.02	0.01	0.11	0.03	0.07	0.06	0.11	0.13	0.18	0.21	0.10	0.10	0.04	0.04	0.00	0.02	0.29	0.36	0.39	0.27
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.35	0.32	0.14
O5'	0.18	0.41	0.27	0.35	0.41	0.01	0.50	0.01	0.52	0.47	0.48	0.36	0.56	0.53	0.36	0.11	0.29	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.46	0.89	0.37	0.33	0.84	0.21	1.01	0.28	1.08	0.87	1.02	0.78	1.17	1.05	0.72	0.24	0.36	0.35	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.47	0.21	0.30	0.44	0.28	0.58	0.40	0.64	0.49	0.58	0.39	0.73	0.64	0.36	0.18	0.39	0.32	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.34	0.20	0.27	0.31	0.04	0.40	0.01	0.44	0.33	0.41	0.29	0.49	0.42	0.25	0.10	0.27	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.17	0.16	0.18	0.18	0.22	0.21	0.26	0.16	0.13	0.17	0.23	0.20	0.20	0.24	0.20	0.20	0.06	0.11	0.05
C2	0.28	0.17	0.29	0.28	0.18	0.31	0.23	0.30	0.25	0.20	0.17	0.25	0.36	0.32	0.20	0.30	0.27	0.24	0.27	0.22
C2'	0.16	0.16	0.17	0.20	0.18	0.22	0.20	0.28	0.17	0.14	0.16	0.20	0.19	0.23	0.21	0.19	0.25	0.12	0.10	0.11
C3'	0.18	0.20	0.14	0.12	0.27	0.11	0.28	0.12	0.23	0.19	0.23	0.19	0.14	0.15	0.30	0.18	0.08	0.03	0.08	0.02
C4	0.17	0.17	0.16	0.14	0.16	0.19	0.21	0.22	0.19	0.13	0.17	0.24	0.21	0.16	0.19	0.18	0.20	0.10	0.18	0.10
C4'	0.18	0.24	0.15	0.14	0.35	0.11	0.36	0.12	0.28	0.22	0.29	0.22	0.14	0.15	0.41	0.16	0.08	0.13	0.25	0.12
C5	0.16	0.17	0.14	0.12	0.14	0.16	0.19	0.19	0.16	0.12	0.17	0.24	0.20	0.13	0.20	0.17	0.21	0.10	0.19	0.10
C5'	0.32	0.41	0.32	0.30	0.53	0.22	0.54	0.16	0.44	0.39	0.47	0.38	0.28	0.30	0.59	0.27	0.22	0.25	0.43	0.25
C6	0.21	0.16	0.20	0.17	0.18	0.19	0.22	0.20	0.20	0.15	0.15	0.24	0.28	0.18	0.23	0.20	0.22	0.14	0.21	0.13
C8	0.16	0.19	0.14	0.17	0.17	0.19	0.14	0.25	0.11	0.13	0.20	0.23	0.16	0.18	0.24	0.19	0.27	0.16	0.22	0.17
N1	0.27	0.16	0.28	0.25	0.19	0.27	0.23	0.26	0.23	0.19	0.17	0.24	0.36	0.28	0.23	0.27	0.25	0.20	0.25	0.19
N3	0.22	0.17	0.23	0.23	0.16	0.27	0.23	0.28	0.24	0.17	0.16	0.25	0.28	0.26	0.18	0.25	0.24	0.20	0.24	0.19
N6	0.21	0.16	0.21	0.17	0.21	0.18	0.24	0.19	0.19	0.15	0.14	0.25	0.28	0.18	0.28	0.19	0.23	0.15	0.22	0.14
N7	0.15	0.19	0.12	0.14	0.14	0.16	0.15	0.21	0.12	0.12	0.19	0.24	0.16	0.15	0.22	0.16	0.26	0.15	0.22	0.16
N9	0.16	0.18	0.14	0.15	0.17	0.18	0.19	0.23	0.15	0.12	0.17	0.23	0.18	0.16	0.22	0.18	0.21	0.07	0.15	0.07
O2'	0.26	0.21	0.29	0.33	0.17	0.35	0.19	0.40	0.19	0.20	0.18	0.27	0.32	0.37	0.19	0.29	0.30	0.17	0.08	0.14
O3'	0.17	0.19	0.13	0.13	0.26	0.12	0.26	0.10	0.21	0.18	0.22	0.18	0.14	0.16	0.29	0.19	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.15	0.19	0.12	0.12	0.29	0.14	0.30	0.18	0.22	0.16	0.23	0.21	0.15	0.14	0.36	0.16	0.11	0.07	0.20	0.06
O5'	0.48	0.56	0.49	0.47	0.64	0.41	0.62	0.39	0.55	0.53	0.60	0.55	0.47	0.47	0.67	0.43	0.46	0.23	0.35	0.32
OP1	0.85	1.14	0.79	0.63	1.31	0.55	1.14	0.42	0.96	0.99	1.27	1.13	0.78	0.58	1.44	0.69	0.50	0.47	0.53	0.43
OP2	0.49	0.62	0.59	0.63	0.72	0.48	0.65	0.46	0.57	0.56	0.69	0.61	0.54	0.69	0.80	0.42	0.56	0.53	0.58	0.51
P	0.47	0.58	0.49	0.48	0.70	0.39	0.65	0.35	0.55	0.53	0.65	0.57	0.47	0.50	0.77	0.40	0.45	0.30	0.43	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.12	0.10	0.24	0.10
C2	0.01	0.00	0.08	0.09	0.01	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.11	0.01	0.03	0.20	0.17	0.30	0.18
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.08	0.03	0.07	0.13	0.00	0.02	0.09	0.01	0.06	0.13	0.28	0.12
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.11	0.05	0.10	0.12	0.02	0.01	0.13	0.01	0.06	0.15	0.27	0.14
C4	0.02	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.04	0.25	0.25	0.34	0.25
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.07	0.00	0.02	0.10	0.17	0.05
C5	0.02	0.02	0.08	0.12	0.01	0.07	0.00	0.15	0.00	0.02	0.01	0.02	0.06	0.15	0.01	0.04	0.25	0.24	0.31	0.24
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.14	0.01	0.15	0.00	0.12	0.08	0.11	0.05	0.05	0.04	0.15	0.01	0.01	0.14	0.09	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.04	0.22	0.18	0.28	0.19
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.18	0.15	0.27	0.16
N3	0.01	0.00	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.01	0.03	0.23	0.22	0.33	0.23
O2	0.02	0.00	0.13	0.12	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.15	0.02	0.04	0.18	0.16	0.30	0.16
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05	0.05	0.02	0.07	0.12	0.00	0.05	0.07	0.03	0.04	0.13	0.26	0.11
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.14	0.02	0.15	0.04	0.13	0.05	0.13	0.15	0.05	0.00	0.18	0.02	0.15	0.23	0.32	0.21
O4	0.02	0.01	0.09	0.13	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.18	0.00	0.05	0.26	0.28	0.36	0.28
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.05	0.00	0.12	0.12	0.19	0.10
O5'	0.12	0.20	0.06	0.06	0.25	0.02	0.25	0.01	0.22	0.18	0.23	0.18	0.04	0.15	0.26	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.17	0.13	0.15	0.25	0.10	0.24	0.14	0.18	0.15	0.22	0.16	0.13	0.23	0.28	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.30	0.28	0.27	0.34	0.17	0.31	0.09	0.28	0.27	0.33	0.30	0.26	0.32	0.36	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.18	0.12	0.14	0.25	0.05	0.24	0.02	0.19	0.16	0.23	0.16	0.11	0.21	0.28	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00