Doublet Group distance statistics: 54803

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 2, 4, 3, 6, 8, 7, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.011, 0.020, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.011, 0.022, 0.032, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.011, 0.021, 0.032, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.015, 0.028, 0.042, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.011, 0.026, 0.040, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.026 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.014, 0.029, 0.044, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.029 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.021, 0.040, 0.059, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.040 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.025, 0.049, 0.073, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.049 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.016, 0.040, 0.065, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.040 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.048, 0.166, 0.283, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.166 std_dev=0.118
C6	B	0, 0.169, 0.311, 0.453, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.311 std_dev=0.142
C2'	A	0, 0.095, 0.240, 0.384, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.240 std_dev=0.144
C4'	A	0, 0.092, 0.262, 0.433, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.262 std_dev=0.170
C5	B	0, 0.144, 0.320, 0.497, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.320 std_dev=0.176
N1	B	0, 0.202, 0.392, 0.582, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.392 std_dev=0.190
O2'	A	0, 0.163, 0.360, 0.557, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.360 std_dev=0.197
C4	B	0, 0.187, 0.386, 0.584, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.386 std_dev=0.198
C3'	A	0, 0.123, 0.341, 0.559, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.341 std_dev=0.218
O4	B	0, 0.243, 0.474, 0.706, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.474 std_dev=0.232
N3	B	0, 0.243, 0.489, 0.734, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.489 std_dev=0.246
C1'	B	0, 0.245, 0.500, 0.755, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.500 std_dev=0.255
C2	B	0, 0.235, 0.510, 0.786, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.510 std_dev=0.276
C2'	B	0, 0.279, 0.584, 0.890, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.584 std_dev=0.306
C5'	A	0, 0.157, 0.466, 0.775, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.466 std_dev=0.309
O3'	A	0, 0.214, 0.549, 0.885, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.549 std_dev=0.335
O5'	A	0, 0.156, 0.505, 0.853, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.505 std_dev=0.349
O2	B	0, 0.274, 0.682, 1.090, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.682 std_dev=0.408
O4'	B	0, 0.378, 0.841, 1.304, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.841 std_dev=0.463
OP2	A	0, 0.265, 0.753, 1.241, 1.940 max_d=1.940 avg_d=0.753 std_dev=0.488
P	A	0, 0.281, 0.808, 1.334, 1.966 max_d=1.966 avg_d=0.808 std_dev=0.527
O5'	B	0, 0.460, 1.013, 1.566, 1.971 max_d=1.971 avg_d=1.013 std_dev=0.553
P	B	0, 0.393, 0.958, 1.523, 2.101 max_d=2.101 avg_d=0.958 std_dev=0.565
OP2	B	0, 0.440, 1.050, 1.660, 2.269 max_d=2.269 avg_d=1.050 std_dev=0.610
C4'	B	0, 0.503, 1.205, 1.907, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.205 std_dev=0.702
C5'	B	0, 0.542, 1.248, 1.955, 2.447 max_d=2.447 avg_d=1.248 std_dev=0.707
OP1	A	0, 0.312, 1.077, 1.841, 3.595 max_d=3.595 avg_d=1.077 std_dev=0.764
C3'	B	0, 0.538, 1.318, 2.097, 2.536 max_d=2.536 avg_d=1.318 std_dev=0.780
OP1	B	0, 0.549, 1.360, 2.170, 2.945 max_d=2.945 avg_d=1.360 std_dev=0.810
O2'	B	0, 0.671, 1.504, 2.336, 2.514 max_d=2.514 avg_d=1.504 std_dev=0.832
O3'	B	0, 1.067, 2.470, 3.872, 4.290 max_d=4.290 avg_d=2.470 std_dev=1.403

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.14	0.10	0.08
C2	0.03	0.00	0.11	0.09	0.01	0.03	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.16	0.12	0.05	0.13	0.37	0.23	0.18
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.07	0.10	0.11	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.14	0.11	0.11
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.06	0.12	0.07	0.08	0.08	0.11	0.05	0.02	0.01	0.02	0.09	0.11	0.12	0.11
C4	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.05	0.03	0.13	0.33	0.22	0.17
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.08	0.03	0.03	0.06	0.07	0.03	0.05	0.03	0.01	0.02	0.10	0.08	0.03
C5	0.01	0.02	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.08	0.04	0.16	0.41	0.29	0.21
C5'	0.03	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.11	0.13	0.08	0.06	0.13	0.14	0.08	0.06	0.04	0.02	0.01	0.16	0.14	0.01
C6	0.02	0.02	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.04	0.17	0.45	0.31	0.23
C8	0.01	0.02	0.07	0.12	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.14	0.04	0.17	0.32	0.25	0.19
N1	0.03	0.01	0.10	0.07	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.10	0.04	0.15	0.43	0.28	0.21
N3	0.03	0.00	0.11	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.12	0.04	0.12	0.32	0.19	0.16
N6	0.03	0.02	0.06	0.08	0.01	0.06	0.02	0.13	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.10	0.05	0.19	0.50	0.36	0.26
N7	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.19	0.41	0.32	0.24
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.03	0.12	0.26	0.18	0.14
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.08	0.05	0.07	0.06	0.10	0.05	0.14	0.15	0.08	0.04	0.03	0.00	0.05	0.04	0.07	0.11	0.09	0.09
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.05	0.03	0.08	0.04	0.08	0.14	0.10	0.12	0.10	0.14	0.05	0.05	0.00	0.02	0.11	0.17	0.18	0.14
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.03	0.04	0.02	0.00	0.06	0.08	0.09	0.07
O5'	0.07	0.13	0.08	0.09	0.13	0.02	0.16	0.01	0.17	0.17	0.15	0.12	0.19	0.19	0.12	0.07	0.11	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.37	0.14	0.11	0.33	0.10	0.41	0.16	0.45	0.32	0.43	0.32	0.50	0.41	0.26	0.11	0.17	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.23	0.11	0.12	0.22	0.08	0.29	0.14	0.31	0.25	0.28	0.19	0.36	0.32	0.18	0.09	0.18	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.18	0.11	0.11	0.17	0.03	0.21	0.01	0.23	0.19	0.21	0.16	0.26	0.24	0.14	0.09	0.14	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.17	0.18	0.13	0.14	0.17	0.21	0.26	0.17	0.12	0.15	0.26	0.20	0.16	0.19	0.16	0.18	0.05	0.13	0.05
C2	0.27	0.31	0.28	0.25	0.19	0.37	0.22	0.37	0.19	0.22	0.24	0.45	0.33	0.60	0.23	0.35	0.30	0.19	0.21	0.16
C2'	0.16	0.16	0.20	0.11	0.14	0.16	0.21	0.26	0.18	0.12	0.14	0.22	0.18	0.14	0.17	0.16	0.19	0.09	0.14	0.08
C3'	0.17	0.18	0.32	0.10	0.15	0.12	0.17	0.20	0.14	0.15	0.16	0.22	0.21	0.16	0.17	0.16	0.11	0.03	0.07	0.03
C4	0.20	0.24	0.20	0.15	0.15	0.22	0.21	0.28	0.16	0.16	0.21	0.34	0.23	0.29	0.20	0.23	0.22	0.07	0.18	0.07
C4'	0.16	0.19	0.29	0.10	0.17	0.13	0.18	0.21	0.14	0.14	0.18	0.24	0.19	0.16	0.21	0.16	0.09	0.07	0.08	0.04
C5	0.18	0.26	0.18	0.18	0.16	0.17	0.19	0.25	0.13	0.16	0.24	0.34	0.27	0.23	0.22	0.20	0.23	0.11	0.24	0.12
C5'	0.18	0.22	0.37	0.12	0.22	0.12	0.22	0.19	0.17	0.18	0.23	0.25	0.29	0.22	0.26	0.17	0.09	0.17	0.15	0.10
C6	0.21	0.29	0.20	0.18	0.17	0.21	0.19	0.26	0.14	0.18	0.27	0.39	0.31	0.34	0.23	0.25	0.24	0.11	0.23	0.11
C8	0.16	0.21	0.19	0.24	0.17	0.16	0.19	0.28	0.14	0.14	0.21	0.27	0.24	0.17	0.23	0.16	0.25	0.22	0.31	0.22
N1	0.25	0.32	0.25	0.21	0.19	0.30	0.21	0.31	0.17	0.21	0.27	0.45	0.32	0.52	0.24	0.32	0.26	0.13	0.21	0.12
N3	0.25	0.26	0.25	0.22	0.16	0.34	0.23	0.36	0.19	0.19	0.20	0.39	0.30	0.50	0.21	0.31	0.29	0.18	0.19	0.15
N6	0.20	0.28	0.19	0.20	0.16	0.17	0.17	0.24	0.13	0.18	0.27	0.37	0.36	0.30	0.21	0.23	0.25	0.16	0.28	0.16
N7	0.16	0.23	0.18	0.25	0.17	0.15	0.17	0.27	0.12	0.15	0.23	0.29	0.29	0.17	0.23	0.16	0.27	0.22	0.33	0.22
N9	0.17	0.21	0.18	0.16	0.15	0.16	0.21	0.26	0.15	0.13	0.18	0.29	0.19	0.16	0.20	0.17	0.20	0.07	0.19	0.09
O2'	0.22	0.16	0.18	0.16	0.17	0.20	0.24	0.29	0.24	0.17	0.15	0.21	0.34	0.20	0.19	0.19	0.24	0.17	0.16	0.14
O3'	0.17	0.17	0.33	0.13	0.17	0.14	0.19	0.18	0.16	0.16	0.17	0.20	0.20	0.27	0.19	0.19	0.02	0.03	0.03	0.01
O4'	0.16	0.19	0.22	0.11	0.17	0.15	0.19	0.24	0.14	0.12	0.18	0.26	0.18	0.13	0.22	0.16	0.14	0.05	0.11	0.04
O5'	0.23	0.27	0.41	0.18	0.28	0.11	0.26	0.18	0.23	0.24	0.28	0.29	0.41	0.25	0.30	0.18	0.17	0.25	0.24	0.18
OP1	0.50	0.60	0.71	0.32	0.67	0.23	0.63	0.19	0.56	0.56	0.65	0.60	0.78	0.40	0.70	0.35	0.19	0.34	0.25	0.21
OP2	0.24	0.27	0.44	0.33	0.28	0.19	0.26	0.25	0.24	0.25	0.28	0.28	0.56	0.43	0.31	0.18	0.31	0.33	0.38	0.28
P	0.34	0.37	0.55	0.28	0.37	0.18	0.38	0.16	0.36	0.36	0.37	0.37	0.61	0.35	0.38	0.27	0.20	0.28	0.25	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.08	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.30	0.03	0.01	0.22	0.23	0.37	0.21
C2	0.02	0.00	0.16	0.23	0.02	0.06	0.02	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.19	0.03	0.11	0.19	0.13	0.30	0.15
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.03	0.12	0.18	0.15	0.04	0.13	0.26	0.01	0.03	0.10	0.02	0.43	0.50	0.63	0.47
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.39	0.01	0.41	0.02	0.35	0.23	0.32	0.14	0.03	0.01	0.42	0.02	0.16	0.22	0.25	0.11
C4	0.03	0.02	0.08	0.39	0.00	0.18	0.00	0.29	0.01	0.02	0.01	0.03	0.36	0.23	0.01	0.04	0.26	0.22	0.32	0.21
C4'	0.01	0.06	0.03	0.01	0.18	0.00	0.24	0.01	0.23	0.10	0.11	0.09	0.30	0.03	0.19	0.01	0.02	0.15	0.25	0.06
C5	0.02	0.02	0.12	0.41	0.00	0.24	0.00	0.34	0.00	0.02	0.01	0.02	0.40	0.30	0.01	0.09	0.30	0.23	0.30	0.22
C5'	0.08	0.16	0.18	0.02	0.29	0.01	0.34	0.00	0.29	0.15	0.22	0.15	0.14	0.21	0.32	0.01	0.01	0.17	0.23	0.05
C6	0.01	0.01	0.15	0.35	0.01	0.23	0.00	0.29	0.00	0.01	0.02	0.02	0.35	0.22	0.01	0.12	0.27	0.14	0.26	0.14
N1	0.01	0.01	0.04	0.23	0.02	0.10	0.02	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.21	0.11	0.02	0.03	0.20	0.14	0.30	0.14
N3	0.02	0.01	0.13	0.32	0.01	0.11	0.01	0.22	0.02	0.01	0.00	0.02	0.26	0.15	0.03	0.08	0.21	0.15	0.30	0.16
O2	0.04	0.00	0.26	0.14	0.03	0.09	0.02	0.15	0.02	0.02	0.02	0.00	0.13	0.36	0.05	0.18	0.20	0.17	0.32	0.17
O2'	0.02	0.17	0.01	0.03	0.36	0.30	0.40	0.14	0.35	0.21	0.26	0.13	0.00	0.08	0.39	0.20	0.31	0.39	0.65	0.37
O3'	0.30	0.19	0.03	0.01	0.23	0.03	0.30	0.21	0.22	0.11	0.15	0.36	0.08	0.00	0.28	0.21	0.30	0.43	0.38	0.32
O4	0.03	0.03	0.10	0.42	0.01	0.19	0.01	0.32	0.01	0.02	0.03	0.05	0.39	0.28	0.00	0.05	0.28	0.28	0.37	0.25
O4'	0.01	0.11	0.02	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.12	0.03	0.08	0.18	0.20	0.21	0.05	0.00	0.15	0.17	0.32	0.16
O5'	0.22	0.19	0.43	0.16	0.26	0.02	0.30	0.01	0.27	0.20	0.21	0.20	0.31	0.30	0.28	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.23	0.13	0.50	0.22	0.22	0.15	0.23	0.17	0.14	0.14	0.15	0.17	0.39	0.43	0.28	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.37	0.30	0.63	0.25	0.32	0.25	0.30	0.23	0.26	0.30	0.30	0.32	0.65	0.38	0.37	0.32	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.21	0.15	0.47	0.11	0.21	0.06	0.22	0.05	0.14	0.14	0.16	0.17	0.37	0.32	0.25	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00