Doublet Group distance statistics: 54806

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 4, 5, 6, 1, 2, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.010, 0.031, 0.051, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.031 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.013, 0.033, 0.054, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.012, 0.035, 0.057, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.035 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.015, 0.047, 0.079, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.047 std_dev=0.032
N6	A	0, 0.024, 0.057, 0.089, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.057 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.016, 0.055, 0.094, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.055 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.036, 0.105, 0.174, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.105 std_dev=0.069
C2'	A	0, 0.056, 0.149, 0.241, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.149 std_dev=0.092
C4'	A	0, 0.102, 0.228, 0.354, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.228 std_dev=0.126
C3'	A	0, 0.080, 0.220, 0.360, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.220 std_dev=0.140
O2'	A	0, 0.120, 0.268, 0.415, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.268 std_dev=0.147
O3'	A	0, 0.135, 0.339, 0.543, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.339 std_dev=0.204
O5'	B	0, 0.224, 0.437, 0.650, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.437 std_dev=0.213
C3'	B	0, 0.334, 0.550, 0.765, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.550 std_dev=0.216
C5'	A	0, 0.184, 0.405, 0.626, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.405 std_dev=0.221
C5	B	0, 0.216, 0.438, 0.660, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.438 std_dev=0.222
P	B	0, 0.210, 0.438, 0.667, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.438 std_dev=0.229
C6	B	0, 0.098, 0.330, 0.563, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.330 std_dev=0.233
C4	B	0, 0.179, 0.414, 0.649, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.414 std_dev=0.235
C4'	B	0, 0.268, 0.505, 0.743, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.505 std_dev=0.237
C5'	B	0, 0.273, 0.513, 0.752, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.513 std_dev=0.239
OP2	B	0, 0.223, 0.470, 0.717, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.470 std_dev=0.247
N1	B	0, 0.186, 0.433, 0.681, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.433 std_dev=0.247
N3	B	0, 0.178, 0.430, 0.682, 1.150 max_d=1.150 avg_d=0.430 std_dev=0.252
OP1	B	0, 0.301, 0.570, 0.839, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.570 std_dev=0.269
C2	B	0, 0.280, 0.554, 0.828, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.554 std_dev=0.274
O4	B	0, 0.399, 0.694, 0.989, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.694 std_dev=0.295
O3'	B	0, 0.429, 0.731, 1.033, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.731 std_dev=0.302
O4'	B	0, 0.268, 0.586, 0.904, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.586 std_dev=0.318
C1'	B	0, 0.308, 0.634, 0.959, 1.631 max_d=1.631 avg_d=0.634 std_dev=0.325
C2'	B	0, 0.331, 0.723, 1.115, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.723 std_dev=0.392
O2	B	0, 0.443, 0.845, 1.246, 1.939 max_d=1.939 avg_d=0.845 std_dev=0.402
O5'	A	0, 0.121, 0.553, 0.985, 1.986 max_d=1.986 avg_d=0.553 std_dev=0.432
P	A	0, 0.648, 1.168, 1.688, 2.543 max_d=2.543 avg_d=1.168 std_dev=0.520
OP2	A	0, 0.786, 1.384, 1.982, 3.162 max_d=3.162 avg_d=1.384 std_dev=0.598
OP1	A	0, 0.803, 1.434, 2.065, 2.889 max_d=2.889 avg_d=1.434 std_dev=0.631
O2'	B	0, 0.262, 1.054, 1.846, 3.967 max_d=3.967 avg_d=1.054 std_dev=0.792

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.16	0.14	0.11
C2	0.04	0.00	0.09	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.11	0.04	0.29	0.30	0.36	0.30
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.07	0.06	0.08	0.09	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.16	0.23	0.16	0.15
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.10	0.13	0.09	0.08	0.13	0.14	0.07	0.02	0.01	0.01	0.19	0.30	0.14	0.18
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.02	0.29	0.29	0.31	0.28
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.13	0.07	0.05	0.11	0.13	0.07	0.04	0.03	0.01	0.02	0.13	0.13	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.03	0.35	0.36	0.40	0.37
C5'	0.04	0.13	0.02	0.02	0.14	0.01	0.20	0.00	0.21	0.23	0.17	0.11	0.25	0.25	0.14	0.04	0.04	0.02	0.01	0.16	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.10	0.03	0.37	0.38	0.45	0.40
C8	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.13	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.14	0.04	0.35	0.33	0.31	0.33
N1	0.03	0.01	0.08	0.09	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.10	0.03	0.34	0.35	0.42	0.36
N3	0.04	0.00	0.09	0.08	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.10	0.04	0.26	0.26	0.30	0.25
N6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.11	0.01	0.25	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.14	0.05	0.39	0.44	0.51	0.45
N7	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.13	0.00	0.25	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.38	0.39	0.42	0.41
N9	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.26	0.25	0.24	0.23
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.08	0.04	0.07	0.04	0.10	0.04	0.14	0.14	0.09	0.04	0.03	0.00	0.04	0.05	0.06	0.17	0.12	0.07
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.06	0.03	0.10	0.04	0.10	0.14	0.10	0.10	0.14	0.14	0.06	0.04	0.00	0.02	0.14	0.34	0.17	0.19
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.07	0.10	0.16	0.09
O5'	0.14	0.29	0.16	0.19	0.29	0.02	0.35	0.01	0.37	0.35	0.34	0.26	0.39	0.38	0.26	0.06	0.14	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.16	0.30	0.23	0.30	0.29	0.13	0.36	0.16	0.38	0.33	0.35	0.26	0.44	0.39	0.25	0.17	0.34	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.36	0.16	0.14	0.31	0.13	0.40	0.21	0.45	0.31	0.42	0.30	0.51	0.42	0.24	0.12	0.17	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.30	0.15	0.18	0.28	0.02	0.37	0.02	0.40	0.33	0.36	0.25	0.45	0.41	0.23	0.07	0.19	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.17	0.22	0.20	0.31	0.25	0.34	0.20	0.24	0.20	0.20	0.22	0.26	0.20	0.42	0.34	0.11	0.04	0.06	0.05
C2	0.30	0.23	0.29	0.27	0.23	0.19	0.21	0.18	0.21	0.24	0.21	0.29	0.33	0.20	0.31	0.21	0.17	0.14	0.15	0.13
C2'	0.24	0.16	0.21	0.18	0.29	0.22	0.34	0.19	0.26	0.18	0.20	0.18	0.20	0.19	0.36	0.30	0.12	0.06	0.09	0.07
C3'	0.16	0.16	0.24	0.09	0.35	0.14	0.38	0.13	0.26	0.16	0.25	0.14	0.19	0.12	0.42	0.23	0.05	0.02	0.04	0.01
C4	0.26	0.17	0.18	0.23	0.30	0.19	0.28	0.16	0.20	0.19	0.21	0.21	0.21	0.16	0.42	0.26	0.14	0.09	0.12	0.09
C4'	0.19	0.15	0.23	0.11	0.36	0.19	0.38	0.16	0.25	0.16	0.24	0.15	0.20	0.13	0.46	0.28	0.04	0.05	0.09	0.04
C5	0.22	0.15	0.16	0.25	0.27	0.19	0.20	0.16	0.17	0.17	0.20	0.18	0.18	0.18	0.43	0.25	0.16	0.13	0.17	0.13
C5'	0.16	0.21	0.29	0.10	0.44	0.13	0.44	0.12	0.29	0.19	0.32	0.17	0.27	0.13	0.56	0.23	0.07	0.10	0.20	0.10
C6	0.23	0.17	0.20	0.28	0.18	0.19	0.18	0.17	0.20	0.19	0.16	0.21	0.21	0.19	0.33	0.23	0.17	0.15	0.20	0.15
C8	0.21	0.15	0.16	0.23	0.34	0.22	0.29	0.19	0.18	0.15	0.24	0.16	0.18	0.21	0.50	0.29	0.16	0.15	0.16	0.15
N1	0.27	0.21	0.26	0.28	0.20	0.19	0.20	0.18	0.21	0.22	0.18	0.25	0.27	0.20	0.31	0.21	0.17	0.14	0.18	0.14
N3	0.30	0.22	0.24	0.23	0.27	0.18	0.26	0.17	0.22	0.23	0.21	0.27	0.31	0.18	0.35	0.24	0.16	0.12	0.12	0.11
N6	0.22	0.17	0.19	0.30	0.14	0.20	0.20	0.18	0.21	0.19	0.15	0.21	0.22	0.21	0.25	0.23	0.19	0.19	0.25	0.19
N7	0.20	0.15	0.14	0.25	0.30	0.21	0.22	0.18	0.15	0.14	0.23	0.16	0.19	0.21	0.48	0.27	0.17	0.17	0.20	0.17
N9	0.25	0.16	0.17	0.21	0.33	0.21	0.32	0.17	0.21	0.18	0.22	0.19	0.20	0.17	0.45	0.29	0.13	0.08	0.09	0.08
O2'	0.34	0.22	0.31	0.30	0.27	0.34	0.32	0.29	0.29	0.25	0.20	0.27	0.37	0.34	0.32	0.38	0.20	0.11	0.10	0.11
O3'	0.14	0.16	0.28	0.09	0.32	0.10	0.36	0.10	0.26	0.16	0.23	0.13	0.20	0.12	0.38	0.19	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.25	0.15	0.21	0.15	0.35	0.23	0.37	0.18	0.24	0.17	0.22	0.19	0.23	0.16	0.47	0.32	0.07	0.03	0.08	0.02
O5'	0.33	0.50	0.48	0.32	0.75	0.23	0.71	0.21	0.53	0.44	0.63	0.44	0.46	0.31	0.88	0.28	0.28	0.22	0.42	0.27
OP1	0.43	0.58	0.66	0.53	0.82	0.37	0.77	0.39	0.61	0.53	0.72	0.53	0.68	0.56	0.96	0.32	0.48	0.51	0.67	0.51
OP2	0.45	0.63	0.67	0.50	0.86	0.33	0.76	0.31	0.59	0.55	0.77	0.59	0.75	0.53	1.02	0.31	0.38	0.29	0.46	0.32
P	0.36	0.54	0.57	0.40	0.80	0.26	0.74	0.26	0.55	0.48	0.69	0.49	0.60	0.42	0.96	0.26	0.35	0.32	0.51	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.19	0.02	0.01	0.14	0.14	0.19	0.14
C2	0.02	0.00	0.13	0.19	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.11	0.02	0.08	0.16	0.18	0.22	0.17
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.06	0.02	0.08	0.15	0.10	0.03	0.11	0.21	0.01	0.02	0.09	0.01	0.32	0.36	0.41	0.36
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.30	0.00	0.30	0.03	0.26	0.19	0.26	0.14	0.02	0.01	0.33	0.02	0.07	0.15	0.12	0.10
C4	0.01	0.01	0.06	0.30	0.00	0.13	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.23	0.01	0.03	0.28	0.31	0.35	0.31
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.13	0.00	0.18	0.01	0.17	0.08	0.07	0.07	0.22	0.02	0.14	0.01	0.02	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.30	0.01	0.18	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.02	0.26	0.26	0.01	0.08	0.30	0.32	0.33	0.33
C5'	0.07	0.10	0.15	0.03	0.19	0.01	0.24	0.00	0.20	0.11	0.14	0.10	0.12	0.13	0.21	0.02	0.01	0.08	0.01	0.02
C6	0.01	0.01	0.10	0.26	0.01	0.17	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.02	0.23	0.20	0.01	0.10	0.24	0.23	0.22	0.24
N1	0.00	0.01	0.03	0.19	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.12	0.10	0.02	0.02	0.16	0.16	0.19	0.16
N3	0.01	0.00	0.11	0.26	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.15	0.01	0.06	0.22	0.24	0.29	0.24
O2	0.05	0.01	0.21	0.14	0.01	0.07	0.02	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.18	0.19	0.02	0.13	0.14	0.15	0.20	0.14
O2'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.23	0.22	0.26	0.12	0.23	0.12	0.17	0.18	0.00	0.06	0.25	0.17	0.25	0.32	0.47	0.33
O3'	0.19	0.11	0.02	0.01	0.23	0.02	0.26	0.13	0.20	0.10	0.15	0.19	0.06	0.00	0.27	0.14	0.16	0.23	0.26	0.20
O4	0.02	0.02	0.09	0.33	0.01	0.14	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.02	0.25	0.27	0.00	0.04	0.30	0.35	0.41	0.36
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.02	0.10	0.02	0.06	0.13	0.17	0.14	0.04	0.00	0.09	0.09	0.13	0.11
O5'	0.14	0.16	0.32	0.07	0.28	0.02	0.30	0.01	0.24	0.16	0.22	0.14	0.25	0.16	0.30	0.09	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.18	0.36	0.15	0.31	0.07	0.32	0.08	0.23	0.16	0.24	0.15	0.32	0.23	0.35	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.22	0.41	0.12	0.35	0.03	0.33	0.01	0.22	0.19	0.29	0.20	0.47	0.26	0.41	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.17	0.36	0.10	0.31	0.02	0.33	0.02	0.24	0.16	0.24	0.14	0.33	0.20	0.36	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00