Doublet Group distance statistics: 54807

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 1, 4, 1, 4, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.011, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.009, 0.019, 0.030, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C2	A	0, -0.002, 0.011, 0.025, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.011 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.008, 0.023, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.010, 0.025, 0.039, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.002, 0.019, 0.036, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.012, 0.034, 0.056, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.034 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.013, 0.036, 0.059, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.036 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.016, 0.040, 0.064, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.040 std_dev=0.024
C2'	A	0, 0.043, 0.098, 0.152, 0.207 max_d=0.207 avg_d=0.098 std_dev=0.054
O4'	A	0, 0.025, 0.080, 0.135, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.080 std_dev=0.055
O2'	A	0, 0.084, 0.160, 0.235, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.160 std_dev=0.076
C4'	A	0, 0.040, 0.123, 0.205, 0.279 max_d=0.279 avg_d=0.123 std_dev=0.083
C3'	A	0, 0.051, 0.139, 0.227, 0.312 max_d=0.312 avg_d=0.139 std_dev=0.088
O3'	A	0, 0.082, 0.218, 0.354, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.218 std_dev=0.136
C5'	A	0, 0.063, 0.214, 0.366, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.214 std_dev=0.151
O5'	B	0, 0.126, 0.277, 0.428, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.277 std_dev=0.151
P	B	0, 0.078, 0.246, 0.414, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.246 std_dev=0.168
O4'	B	0, 0.119, 0.292, 0.465, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.292 std_dev=0.173
C1'	B	0, 0.214, 0.387, 0.560, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.387 std_dev=0.173
O5'	A	0, 0.105, 0.290, 0.475, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.290 std_dev=0.185
OP2	B	0, 0.093, 0.284, 0.475, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.284 std_dev=0.191
C3'	B	0, 0.225, 0.431, 0.636, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.431 std_dev=0.206
OP1	B	0, 0.151, 0.369, 0.587, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.369 std_dev=0.218
C4'	B	0, 0.143, 0.361, 0.578, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.361 std_dev=0.218
C2'	B	0, 0.278, 0.503, 0.729, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.503 std_dev=0.226
N1	B	0, 0.197, 0.428, 0.660, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.428 std_dev=0.232
P	A	0, 0.078, 0.345, 0.613, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.345 std_dev=0.268
O3'	B	0, 0.294, 0.572, 0.851, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.572 std_dev=0.279
C6	B	0, 0.230, 0.513, 0.795, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.513 std_dev=0.282
O2'	B	0, 0.376, 0.676, 0.977, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.676 std_dev=0.300
C5'	B	0, 0.034, 0.360, 0.687, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.360 std_dev=0.327
C2	B	0, 0.220, 0.567, 0.914, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.567 std_dev=0.347
C5	B	0, 0.300, 0.698, 1.097, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.698 std_dev=0.398
O2	B	0, 0.284, 0.683, 1.081, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.683 std_dev=0.399
N3	B	0, 0.227, 0.680, 1.133, 1.757 max_d=1.757 avg_d=0.680 std_dev=0.453
C4	B	0, 0.289, 0.760, 1.232, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.760 std_dev=0.471
O4	B	0, 0.355, 0.938, 1.522, 2.343 max_d=2.343 avg_d=0.938 std_dev=0.583
OP1	A	0, 1.126, 2.170, 3.215, 3.615 max_d=3.615 avg_d=2.170 std_dev=1.044
OP2	A	0, 1.105, 2.202, 3.300, 3.133 max_d=3.133 avg_d=2.202 std_dev=1.098

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.17	0.16	0.05
C2	0.04	0.00	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.04	0.11	0.37	0.55	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.06	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.07	0.09	0.05
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.05	0.08	0.05	0.05	0.06	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.07	0.18	0.12	0.08
C4	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.12	0.37	0.51	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.03	0.04	0.04	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.13	0.20	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.16	0.48	0.69	0.18
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.08	0.10	0.06	0.05	0.09	0.11	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.21	0.35	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.02	0.16	0.51	0.75	0.20
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.01	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.09	0.03	0.17	0.45	0.58	0.17
N1	0.03	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.06	0.02	0.14	0.45	0.68	0.17
N3	0.04	0.00	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.04	0.09	0.31	0.44	0.11
N6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.08	0.03	0.18	0.58	0.86	0.23
N7	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.09	0.03	0.19	0.54	0.76	0.21
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.11	0.33	0.41	0.11
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.07	0.07	0.05	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.13	0.11	0.05
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.07	0.09	0.06	0.06	0.08	0.09	0.04	0.03	0.00	0.01	0.12	0.40	0.28	0.13
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.16	0.07	0.07
O5'	0.05	0.11	0.05	0.07	0.12	0.02	0.16	0.01	0.16	0.17	0.14	0.09	0.18	0.19	0.11	0.05	0.12	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.17	0.37	0.07	0.18	0.37	0.13	0.48	0.21	0.51	0.45	0.45	0.31	0.58	0.54	0.33	0.13	0.40	0.16	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.55	0.09	0.12	0.51	0.20	0.69	0.35	0.75	0.58	0.68	0.44	0.86	0.76	0.41	0.11	0.28	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.13	0.05	0.08	0.13	0.03	0.18	0.02	0.20	0.17	0.17	0.11	0.23	0.21	0.11	0.05	0.13	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.24	0.18	0.18	0.27	0.18	0.27	0.24	0.25	0.22	0.26	0.24	0.22	0.18	0.30	0.18	0.09	0.05	0.08	0.03
C2	0.20	0.19	0.24	0.22	0.18	0.24	0.14	0.25	0.10	0.12	0.20	0.26	0.34	0.25	0.22	0.21	0.14	0.14	0.11	0.09
C2'	0.19	0.22	0.17	0.20	0.27	0.18	0.28	0.26	0.26	0.22	0.25	0.22	0.20	0.19	0.29	0.18	0.11	0.07	0.07	0.05
C3'	0.21	0.30	0.19	0.21	0.39	0.15	0.38	0.19	0.33	0.28	0.35	0.28	0.18	0.20	0.42	0.18	0.05	0.02	0.06	0.01
C4	0.20	0.20	0.20	0.18	0.13	0.19	0.10	0.21	0.11	0.15	0.18	0.27	0.27	0.19	0.16	0.18	0.13	0.09	0.13	0.08
C4'	0.22	0.32	0.19	0.21	0.43	0.16	0.42	0.20	0.34	0.29	0.38	0.30	0.19	0.20	0.48	0.19	0.04	0.04	0.10	0.04
C5	0.18	0.20	0.18	0.14	0.12	0.16	0.13	0.17	0.09	0.11	0.17	0.30	0.24	0.15	0.16	0.16	0.16	0.11	0.17	0.11
C5'	0.24	0.38	0.22	0.23	0.52	0.15	0.48	0.15	0.38	0.33	0.47	0.36	0.20	0.21	0.59	0.19	0.08	0.08	0.17	0.08
C6	0.16	0.16	0.18	0.15	0.24	0.17	0.24	0.17	0.16	0.10	0.20	0.27	0.26	0.16	0.29	0.17	0.17	0.12	0.17	0.11
C8	0.19	0.30	0.17	0.14	0.27	0.12	0.20	0.15	0.17	0.21	0.32	0.33	0.20	0.13	0.29	0.14	0.15	0.11	0.18	0.12
N1	0.17	0.20	0.21	0.18	0.26	0.20	0.22	0.20	0.16	0.13	0.25	0.27	0.30	0.21	0.31	0.19	0.15	0.13	0.14	0.09
N3	0.22	0.18	0.24	0.22	0.12	0.24	0.10	0.26	0.11	0.14	0.16	0.25	0.32	0.24	0.15	0.22	0.13	0.12	0.10	0.08
N6	0.15	0.15	0.16	0.14	0.35	0.16	0.33	0.16	0.23	0.13	0.25	0.25	0.23	0.14	0.41	0.17	0.18	0.14	0.19	0.13
N7	0.17	0.27	0.16	0.12	0.15	0.12	0.11	0.15	0.10	0.16	0.26	0.34	0.21	0.13	0.19	0.13	0.17	0.13	0.20	0.13
N9	0.20	0.25	0.18	0.17	0.22	0.16	0.20	0.20	0.19	0.21	0.25	0.28	0.23	0.17	0.25	0.17	0.12	0.07	0.12	0.07
O2'	0.16	0.17	0.15	0.20	0.24	0.21	0.26	0.32	0.23	0.18	0.20	0.17	0.20	0.22	0.27	0.17	0.14	0.10	0.05	0.07
O3'	0.19	0.29	0.18	0.21	0.39	0.14	0.39	0.19	0.33	0.27	0.34	0.25	0.15	0.21	0.42	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01
O4'	0.22	0.30	0.19	0.19	0.38	0.17	0.36	0.21	0.31	0.27	0.35	0.29	0.21	0.19	0.42	0.19	0.07	0.02	0.09	0.03
O5'	0.26	0.44	0.26	0.26	0.56	0.17	0.50	0.16	0.39	0.36	0.53	0.42	0.23	0.26	0.64	0.19	0.18	0.10	0.15	0.12
OP1	0.32	0.63	0.34	0.35	0.81	0.25	0.63	0.32	0.46	0.47	0.78	0.63	0.29	0.40	0.96	0.21	0.37	0.59	0.54	0.49
OP2	0.49	0.74	0.47	0.39	0.82	0.28	0.64	0.18	0.53	0.59	0.83	0.76	0.46	0.37	0.94	0.37	0.26	0.36	0.27	0.26
P	0.29	0.49	0.31	0.31	0.64	0.19	0.54	0.15	0.41	0.39	0.60	0.48	0.27	0.32	0.74	0.20	0.22	0.14	0.22	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.09	0.14	0.11
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.04	0.24	0.23	0.29	0.25
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.04	0.12	0.00	0.01	0.04	0.01	0.15	0.15	0.11	0.12
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.10	0.04	0.06	0.11	0.02	0.00	0.07	0.01	0.20	0.21	0.11	0.16
C4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.03	0.35	0.37	0.44	0.39
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.04	0.05	0.02	0.06	0.00	0.01	0.06	0.13	0.02
C5	0.02	0.02	0.07	0.09	0.01	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.03	0.37	0.38	0.42	0.39
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.08	0.04	0.05	0.02	0.13	0.01	0.01	0.07	0.19	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.03	0.32	0.29	0.30	0.31
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.23	0.21	0.24	0.23
N3	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.01	0.04	0.30	0.31	0.37	0.33
O2	0.04	0.01	0.12	0.11	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.14	0.03	0.07	0.20	0.18	0.25	0.21
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.04	0.05	0.06	0.05	0.06	0.02	0.03	0.10	0.00	0.03	0.04	0.04	0.07	0.11	0.08	0.06
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.08	0.02	0.11	0.02	0.11	0.04	0.08	0.14	0.03	0.00	0.09	0.01	0.18	0.25	0.15	0.18
O4	0.02	0.02	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.09	0.00	0.04	0.37	0.42	0.49	0.42
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.07	0.04	0.01	0.04	0.00	0.07	0.07	0.16	0.09
O5'	0.11	0.24	0.15	0.20	0.35	0.01	0.37	0.01	0.32	0.23	0.30	0.20	0.07	0.18	0.37	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.09	0.23	0.15	0.21	0.37	0.06	0.38	0.07	0.29	0.21	0.31	0.18	0.11	0.25	0.42	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.29	0.11	0.11	0.44	0.13	0.42	0.19	0.30	0.24	0.37	0.25	0.08	0.15	0.49	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.25	0.12	0.16	0.39	0.02	0.39	0.01	0.31	0.23	0.33	0.21	0.06	0.18	0.42	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00