Doublet Group distance statistics: 54808

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 4, 3, 0, 0, 0, 2, 2, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.008, 0.014, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.002, 0.015, 0.028, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.004, 0.023, 0.042, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.023 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.002, 0.022, 0.041, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.022 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.007, 0.031, 0.055, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.031 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.004, 0.029, 0.055, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.029 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.007, 0.039, 0.071, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.039 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.031, 0.181, 0.332, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.181 std_dev=0.151
O4'	A	0, 0.041, 0.200, 0.360, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.200 std_dev=0.160
O2'	A	0, -0.001, 0.176, 0.352, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.176 std_dev=0.176
C4'	A	0, 0.080, 0.328, 0.576, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.328 std_dev=0.248
C3'	A	0, 0.077, 0.332, 0.586, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.332 std_dev=0.255
C6	B	0, 0.179, 0.481, 0.783, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.481 std_dev=0.302
O4'	B	0, 0.195, 0.510, 0.825, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.510 std_dev=0.315
C5	B	0, 0.167, 0.499, 0.831, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.499 std_dev=0.332
N1	B	0, 0.152, 0.488, 0.824, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.488 std_dev=0.336
O3'	A	0, 0.151, 0.508, 0.864, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.508 std_dev=0.357
N3	B	0, 0.167, 0.532, 0.897, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.532 std_dev=0.365
C2	B	0, 0.131, 0.497, 0.864, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.497 std_dev=0.366
C4	B	0, 0.183, 0.552, 0.921, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.552 std_dev=0.369
O5'	A	0, 0.145, 0.540, 0.934, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.540 std_dev=0.394
C1'	B	0, 0.240, 0.636, 1.033, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.636 std_dev=0.396
C5'	B	0, 0.221, 0.621, 1.021, 1.841 max_d=1.841 avg_d=0.621 std_dev=0.400
O2	B	0, 0.201, 0.607, 1.013, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.607 std_dev=0.406
C5'	A	0, 0.118, 0.525, 0.933, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.525 std_dev=0.408
O4	B	0, 0.282, 0.718, 1.154, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.718 std_dev=0.436
C4'	B	0, 0.191, 0.640, 1.089, 1.885 max_d=1.885 avg_d=0.640 std_dev=0.449
P	B	0, 0.234, 0.708, 1.182, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.708 std_dev=0.474
OP1	B	0, 0.306, 0.820, 1.334, 2.108 max_d=2.108 avg_d=0.820 std_dev=0.514
O5'	B	0, 0.205, 0.772, 1.339, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.772 std_dev=0.567
OP2	B	0, 0.264, 0.854, 1.445, 2.005 max_d=2.005 avg_d=0.854 std_dev=0.591
C2'	B	0, 0.337, 0.938, 1.540, 1.960 max_d=1.960 avg_d=0.938 std_dev=0.602
C3'	B	0, 0.240, 0.852, 1.463, 2.193 max_d=2.193 avg_d=0.852 std_dev=0.611
O3'	B	0, 0.416, 1.242, 2.067, 2.908 max_d=2.908 avg_d=1.242 std_dev=0.826
P	A	0, 0.329, 1.165, 2.001, 3.084 max_d=3.084 avg_d=1.165 std_dev=0.836
O2'	B	0, 0.429, 1.281, 2.133, 3.409 max_d=3.409 avg_d=1.281 std_dev=0.852
OP2	A	0, 0.917, 1.870, 2.823, 3.487 max_d=3.487 avg_d=1.870 std_dev=0.953
OP1	A	0, 1.022, 1.983, 2.944, 3.545 max_d=3.545 avg_d=1.983 std_dev=0.961

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.08	0.24	0.20	0.10
C2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.04	0.18	0.70	0.52	0.26
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.06	0.08	0.10	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.22	0.29	0.11
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.10	0.08	0.12	0.11	0.10	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.26	0.32	0.13
C4	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.03	0.17	0.65	0.47	0.22
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.07	0.04	0.03	0.07	0.07	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.21	0.16	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.21	0.83	0.58	0.27
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.09	0.00	0.12	0.00	0.13	0.13	0.10	0.06	0.15	0.15	0.08	0.04	0.03	0.01	0.01	0.34	0.30	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.12	0.03	0.22	0.91	0.63	0.30
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.03	0.19	0.68	0.49	0.21
N1	0.02	0.00	0.08	0.12	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.15	0.04	0.21	0.84	0.59	0.29
N3	0.02	0.00	0.10	0.11	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.13	0.04	0.15	0.58	0.44	0.22
N6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.03	0.24	1.03	0.69	0.33
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.22	0.88	0.62	0.27
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.15	0.52	0.37	0.17
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.04	0.08	0.09	0.06	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.05	0.21	0.25	0.08
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.08	0.01	0.09	0.03	0.12	0.09	0.15	0.13	0.13	0.09	0.04	0.05	0.00	0.02	0.13	0.47	0.46	0.19
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.11	0.12	0.09
O5'	0.08	0.18	0.05	0.08	0.17	0.01	0.21	0.01	0.22	0.19	0.21	0.15	0.24	0.22	0.15	0.05	0.13	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.24	0.70	0.22	0.26	0.65	0.21	0.83	0.34	0.91	0.68	0.84	0.58	1.03	0.88	0.52	0.21	0.47	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.20	0.52	0.29	0.32	0.47	0.16	0.58	0.30	0.63	0.49	0.59	0.44	0.69	0.62	0.37	0.25	0.46	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.26	0.11	0.13	0.22	0.03	0.27	0.01	0.30	0.21	0.29	0.22	0.33	0.27	0.17	0.08	0.19	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.16	0.09	0.12	0.16	0.09	0.19	0.22	0.17	0.12	0.16	0.21	0.20	0.07	0.18	0.12	0.17	0.07	0.14	0.07
C2	0.31	0.32	0.39	0.33	0.26	0.35	0.19	0.30	0.21	0.24	0.33	0.40	0.54	0.53	0.30	0.27	0.28	0.23	0.46	0.27
C2'	0.15	0.15	0.09	0.13	0.14	0.10	0.15	0.22	0.14	0.13	0.15	0.18	0.19	0.09	0.15	0.15	0.19	0.11	0.19	0.12
C3'	0.16	0.13	0.14	0.15	0.17	0.11	0.21	0.23	0.20	0.15	0.14	0.13	0.12	0.17	0.18	0.17	0.09	0.02	0.07	0.01
C4	0.20	0.16	0.20	0.14	0.14	0.18	0.12	0.20	0.15	0.11	0.18	0.22	0.32	0.24	0.20	0.16	0.15	0.11	0.31	0.14
C4'	0.14	0.14	0.12	0.15	0.23	0.11	0.28	0.24	0.24	0.16	0.17	0.13	0.11	0.16	0.25	0.15	0.07	0.05	0.11	0.04
C5	0.19	0.12	0.21	0.14	0.18	0.17	0.15	0.19	0.15	0.11	0.18	0.18	0.35	0.23	0.26	0.16	0.14	0.11	0.31	0.13
C5'	0.20	0.23	0.20	0.17	0.35	0.12	0.39	0.24	0.33	0.25	0.27	0.19	0.16	0.21	0.37	0.18	0.12	0.15	0.26	0.15
C6	0.23	0.17	0.29	0.21	0.27	0.25	0.20	0.21	0.18	0.15	0.28	0.21	0.46	0.36	0.36	0.22	0.17	0.15	0.38	0.19
C8	0.17	0.20	0.16	0.20	0.24	0.11	0.24	0.23	0.22	0.18	0.23	0.21	0.22	0.16	0.26	0.11	0.21	0.12	0.21	0.12
N1	0.28	0.30	0.37	0.31	0.31	0.33	0.22	0.28	0.21	0.22	0.36	0.36	0.55	0.51	0.37	0.26	0.23	0.21	0.45	0.25
N3	0.27	0.24	0.29	0.24	0.18	0.28	0.13	0.26	0.18	0.19	0.24	0.32	0.43	0.40	0.22	0.22	0.26	0.20	0.40	0.23
N6	0.22	0.14	0.29	0.20	0.31	0.24	0.23	0.20	0.19	0.15	0.28	0.16	0.49	0.35	0.43	0.22	0.18	0.17	0.39	0.19
N7	0.18	0.17	0.19	0.17	0.21	0.12	0.20	0.20	0.18	0.16	0.21	0.20	0.30	0.17	0.27	0.13	0.20	0.12	0.26	0.13
N9	0.16	0.15	0.12	0.13	0.16	0.10	0.17	0.21	0.18	0.12	0.17	0.20	0.21	0.11	0.19	0.11	0.14	0.06	0.20	0.06
O2'	0.22	0.22	0.19	0.17	0.15	0.18	0.14	0.23	0.14	0.18	0.19	0.26	0.34	0.17	0.15	0.23	0.35	0.20	0.23	0.20
O3'	0.16	0.13	0.18	0.18	0.17	0.16	0.19	0.26	0.17	0.15	0.14	0.13	0.16	0.26	0.17	0.19	0.01	0.02	0.02	0.01
O4'	0.14	0.14	0.09	0.13	0.22	0.09	0.28	0.23	0.23	0.14	0.17	0.16	0.15	0.09	0.25	0.12	0.12	0.03	0.10	0.02
O5'	0.28	0.31	0.26	0.26	0.41	0.17	0.45	0.27	0.38	0.32	0.35	0.28	0.26	0.29	0.43	0.24	0.27	0.28	0.40	0.28
OP1	0.77	1.04	0.74	0.49	1.23	0.44	1.09	0.47	0.90	0.91	1.17	1.03	0.80	0.48	1.35	0.59	0.56	0.78	0.75	0.66
OP2	0.61	0.67	0.65	0.83	0.73	0.69	0.70	0.75	0.66	0.64	0.71	0.66	0.60	0.90	0.76	0.61	0.82	0.82	1.04	0.80
P	0.48	0.53	0.49	0.35	0.63	0.32	0.65	0.33	0.58	0.53	0.57	0.50	0.51	0.36	0.65	0.41	0.37	0.44	0.54	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.11	0.01	0.01	0.13	0.15	0.55	0.21
C2	0.01	0.00	0.10	0.16	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.10	0.01	0.05	0.26	0.10	0.41	0.14
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.07	0.03	0.10	0.10	0.11	0.04	0.08	0.19	0.00	0.02	0.08	0.01	0.28	0.27	0.54	0.26
C3'	0.02	0.16	0.01	0.00	0.32	0.00	0.36	0.03	0.33	0.19	0.23	0.14	0.03	0.00	0.34	0.01	0.24	0.16	0.32	0.08
C4	0.01	0.01	0.07	0.32	0.00	0.14	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.30	0.00	0.02	0.44	0.21	0.29	0.22
C4'	0.01	0.04	0.03	0.00	0.14	0.00	0.19	0.00	0.18	0.08	0.08	0.06	0.19	0.03	0.15	0.00	0.01	0.07	0.42	0.10
C5	0.01	0.01	0.10	0.36	0.00	0.19	0.00	0.28	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.37	0.01	0.05	0.47	0.22	0.29	0.24
C5'	0.05	0.09	0.10	0.03	0.22	0.00	0.28	0.00	0.24	0.12	0.14	0.08	0.11	0.10	0.25	0.01	0.01	0.09	0.28	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.33	0.00	0.18	0.00	0.24	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.31	0.01	0.07	0.39	0.15	0.33	0.16
N1	0.00	0.01	0.04	0.19	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01	0.01	0.25	0.10	0.43	0.14
N3	0.01	0.00	0.08	0.23	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.17	0.01	0.04	0.35	0.14	0.33	0.16
O2	0.03	0.00	0.19	0.14	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.29	0.22	0.01	0.09	0.19	0.12	0.47	0.15
O2'	0.01	0.20	0.00	0.03	0.18	0.19	0.15	0.11	0.12	0.11	0.21	0.29	0.00	0.08	0.20	0.14	0.22	0.23	0.50	0.18
O3'	0.11	0.10	0.02	0.00	0.30	0.03	0.37	0.10	0.31	0.12	0.17	0.22	0.08	0.00	0.34	0.08	0.26	0.31	0.28	0.19
O4	0.01	0.01	0.08	0.34	0.00	0.15	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.34	0.00	0.02	0.47	0.25	0.32	0.26
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.04	0.09	0.14	0.08	0.02	0.00	0.08	0.15	0.60	0.26
O5'	0.13	0.26	0.28	0.24	0.44	0.01	0.47	0.01	0.39	0.25	0.35	0.19	0.22	0.26	0.47	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.15	0.10	0.27	0.16	0.21	0.07	0.22	0.09	0.15	0.10	0.14	0.12	0.23	0.31	0.25	0.15	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.55	0.41	0.54	0.32	0.29	0.42	0.29	0.28	0.33	0.43	0.33	0.47	0.50	0.28	0.32	0.60	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.14	0.26	0.08	0.22	0.10	0.24	0.01	0.16	0.14	0.16	0.15	0.18	0.19	0.26	0.26	0.00	0.00	0.01	0.00