Doublet Group distance statistics: 54812

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.027 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.016, 0.031, 0.045, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.031 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.029 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.013, 0.030, 0.048, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.019, 0.041, 0.063, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.041 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.025, 0.050, 0.074, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.050 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.031, 0.064, 0.098, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.064 std_dev=0.034
N7	A	0, 0.026, 0.064, 0.103, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.064 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.031, 0.078, 0.125, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.078 std_dev=0.047
C4	B	0, 0.209, 0.412, 0.616, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.412 std_dev=0.203
C6	B	0, 0.242, 0.453, 0.663, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.453 std_dev=0.210
O4	B	0, 0.319, 0.531, 0.742, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.531 std_dev=0.212
N3	B	0, 0.309, 0.534, 0.758, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.534 std_dev=0.225
N1	B	0, 0.336, 0.569, 0.803, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.569 std_dev=0.234
C5	B	0, 0.055, 0.296, 0.538, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.296 std_dev=0.241
C2	B	0, 0.353, 0.599, 0.845, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.599 std_dev=0.246
O4'	A	0, 0.381, 0.688, 0.994, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.688 std_dev=0.306
O2	B	0, 0.464, 0.778, 1.092, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.778 std_dev=0.314
C1'	B	0, 0.429, 0.774, 1.120, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.774 std_dev=0.346
O4'	B	0, 0.441, 0.821, 1.201, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.821 std_dev=0.380
C2'	B	0, 0.446, 0.836, 1.225, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.836 std_dev=0.390
C2'	A	0, 0.332, 0.728, 1.124, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.728 std_dev=0.396
C3'	A	0, 0.580, 1.015, 1.450, 1.355 max_d=1.355 avg_d=1.015 std_dev=0.435
C4'	A	0, 0.589, 1.026, 1.463, 1.400 max_d=1.400 avg_d=1.026 std_dev=0.437
C3'	B	0, 0.347, 0.813, 1.279, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.813 std_dev=0.466
C4'	B	0, 0.459, 0.950, 1.442, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.950 std_dev=0.491
C5'	B	0, 0.526, 1.028, 1.529, 1.533 max_d=1.533 avg_d=1.028 std_dev=0.502
O2'	B	0, 0.653, 1.156, 1.660, 1.733 max_d=1.733 avg_d=1.156 std_dev=0.504
C5'	A	0, 0.879, 1.434, 1.989, 1.798 max_d=1.798 avg_d=1.434 std_dev=0.555
O3'	B	0, 0.375, 0.971, 1.567, 1.726 max_d=1.726 avg_d=0.971 std_dev=0.596
O5'	B	0, 0.956, 1.559, 2.162, 2.057 max_d=2.057 avg_d=1.559 std_dev=0.603
O5'	A	0, 0.727, 1.340, 1.954, 2.078 max_d=2.078 avg_d=1.340 std_dev=0.613
P	A	0, 0.902, 1.559, 2.215, 2.310 max_d=2.310 avg_d=1.559 std_dev=0.656
OP2	B	0, 0.823, 1.486, 2.149, 2.100 max_d=2.100 avg_d=1.486 std_dev=0.663
P	B	0, 0.953, 1.621, 2.289, 2.166 max_d=2.166 avg_d=1.621 std_dev=0.668
O3'	A	0, 0.853, 1.532, 2.210, 2.093 max_d=2.093 avg_d=1.532 std_dev=0.679
OP2	A	0, 0.896, 1.582, 2.268, 2.447 max_d=2.447 avg_d=1.582 std_dev=0.686
OP1	A	0, 1.117, 1.834, 2.550, 2.456 max_d=2.456 avg_d=1.834 std_dev=0.716
OP1	B	0, 1.167, 2.104, 3.041, 2.924 max_d=2.924 avg_d=2.104 std_dev=0.937
O2'	A	0, 0.252, 1.244, 2.236, 2.268 max_d=2.268 avg_d=1.244 std_dev=0.992

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.34	0.01	0.21	0.48	0.39	0.29
C2	0.02	0.00	0.33	0.13	0.01	0.26	0.00	0.37	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.35	0.39	0.28	0.36	0.20	0.22
C2'	0.00	0.33	0.00	0.01	0.17	0.01	0.08	0.24	0.16	0.18	0.26	0.33	0.11	0.09	0.01	0.00	0.03	0.02	0.51	0.96	0.89	0.76
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.20	0.01	0.30	0.02	0.30	0.37	0.22	0.09	0.35	0.39	0.22	0.04	0.01	0.02	0.04	0.55	0.24	0.25
C4	0.01	0.01	0.17	0.20	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.21	0.20	0.17	0.28	0.19	0.16
C4'	0.01	0.26	0.01	0.01	0.08	0.00	0.06	0.01	0.04	0.30	0.16	0.25	0.05	0.24	0.08	0.33	0.03	0.01	0.03	0.29	0.13	0.11
C5	0.01	0.00	0.08	0.30	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.27	0.07	0.08	0.12	0.15	0.22	0.18
C5'	0.09	0.37	0.24	0.02	0.18	0.01	0.09	0.00	0.14	0.28	0.27	0.36	0.10	0.23	0.05	0.09	0.24	0.03	0.02	0.08	0.04	0.03
C6	0.02	0.00	0.16	0.30	0.01	0.04	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.10	0.16	0.13	0.16	0.26	0.20
C8	0.01	0.01	0.18	0.37	0.01	0.30	0.01	0.28	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.55	0.14	0.24	0.25	0.14	0.17	0.23
N1	0.02	0.00	0.26	0.22	0.01	0.16	0.01	0.27	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.23	0.29	0.19	0.23	0.21	0.17
N3	0.02	0.00	0.33	0.09	0.00	0.25	0.01	0.36	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.29	0.39	0.39	0.30	0.42	0.24	0.26
N6	0.01	0.01	0.11	0.35	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.06	0.10	0.15	0.20	0.37	0.29
N7	0.02	0.01	0.09	0.39	0.01	0.24	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.51	0.14	0.14	0.26	0.22	0.30	0.32
N9	0.00	0.01	0.01	0.22	0.00	0.08	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.23	0.13	0.01	0.11	0.27	0.21	0.14
O2'	0.02	0.27	0.00	0.04	0.09	0.33	0.27	0.09	0.18	0.55	0.11	0.29	0.28	0.51	0.23	0.00	0.08	0.22	0.38	0.92	1.07	0.74
O3'	0.34	0.35	0.03	0.01	0.21	0.03	0.07	0.24	0.10	0.14	0.23	0.39	0.06	0.14	0.13	0.08	0.00	0.24	0.25	0.16	0.14	0.11
O4'	0.01	0.39	0.02	0.02	0.20	0.01	0.08	0.03	0.16	0.24	0.29	0.39	0.10	0.14	0.01	0.22	0.24	0.00	0.08	0.20	0.12	0.07
O5'	0.21	0.28	0.51	0.04	0.17	0.03	0.12	0.02	0.13	0.25	0.19	0.30	0.15	0.26	0.11	0.38	0.25	0.08	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.48	0.36	0.96	0.55	0.28	0.29	0.15	0.08	0.16	0.14	0.23	0.42	0.20	0.22	0.27	0.92	0.16	0.20	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.20	0.89	0.24	0.19	0.13	0.22	0.04	0.26	0.17	0.21	0.24	0.37	0.30	0.21	1.07	0.14	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.29	0.22	0.76	0.25	0.16	0.11	0.18	0.03	0.20	0.23	0.17	0.26	0.29	0.32	0.14	0.74	0.11	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.38	0.27	0.35	0.31	0.17	0.31	0.22	0.28	0.32	0.33	0.21	0.27	0.43	0.30	0.11	0.36	0.14	0.32	0.27	0.28
C2	0.43	0.28	0.45	0.36	0.14	0.31	0.07	0.26	0.13	0.28	0.09	0.42	0.56	0.38	0.27	0.31	0.12	0.22	0.13	0.12
C2'	0.50	0.39	0.48	0.43	0.19	0.43	0.15	0.29	0.25	0.39	0.30	0.44	0.48	0.42	0.13	0.51	0.43	0.09	0.31	0.06
C3'	0.26	0.30	0.28	0.33	0.44	0.21	0.47	0.22	0.40	0.31	0.36	0.24	0.19	0.31	0.46	0.26	0.26	0.17	0.08	0.02
C4	0.40	0.33	0.36	0.29	0.09	0.27	0.09	0.22	0.23	0.34	0.22	0.38	0.45	0.28	0.09	0.30	0.20	0.10	0.17	0.04
C4'	0.25	0.13	0.16	0.09	0.13	0.10	0.20	0.16	0.14	0.14	0.05	0.23	0.35	0.09	0.19	0.22	0.11	0.15	0.19	0.04
C5	0.35	0.36	0.31	0.23	0.12	0.21	0.09	0.17	0.20	0.31	0.28	0.42	0.39	0.22	0.08	0.25	0.38	0.14	0.39	0.21
C5'	0.21	0.14	0.11	0.23	0.16	0.14	0.26	0.31	0.18	0.12	0.05	0.25	0.27	0.26	0.22	0.19	0.33	0.20	0.54	0.32
C6	0.35	0.35	0.33	0.24	0.05	0.21	0.07	0.17	0.14	0.28	0.24	0.46	0.42	0.24	0.18	0.24	0.39	0.13	0.43	0.21
C8	0.31	0.33	0.24	0.18	0.24	0.18	0.21	0.14	0.26	0.31	0.30	0.35	0.31	0.17	0.20	0.25	0.43	0.24	0.40	0.29
N1	0.38	0.32	0.40	0.31	0.12	0.27	0.09	0.21	0.11	0.27	0.13	0.46	0.50	0.32	0.29	0.27	0.25	0.08	0.28	0.08
N3	0.45	0.29	0.45	0.37	0.09	0.33	0.05	0.27	0.19	0.33	0.13	0.37	0.55	0.37	0.18	0.35	0.10	0.28	0.10	0.18
N6	0.31	0.34	0.28	0.19	0.08	0.18	0.11	0.14	0.13	0.25	0.25	0.45	0.37	0.20	0.18	0.20	0.50	0.25	0.57	0.33
N7	0.31	0.35	0.24	0.17	0.23	0.16	0.16	0.13	0.22	0.30	0.33	0.39	0.31	0.16	0.18	0.23	0.51	0.30	0.53	0.36
N9	0.36	0.31	0.31	0.25	0.17	0.24	0.18	0.20	0.28	0.33	0.24	0.32	0.39	0.24	0.10	0.30	0.22	0.09	0.15	0.06
O2'	0.31	0.12	0.23	0.09	0.51	0.27	0.68	0.10	0.48	0.13	0.24	0.25	0.41	0.11	0.60	0.37	0.19	0.14	1.00	0.34
O3'	0.27	0.15	0.17	0.13	0.12	0.17	0.17	0.14	0.12	0.16	0.07	0.22	0.35	0.13	0.16	0.30	0.01	0.03	0.04	0.01
O4'	0.53	0.43	0.46	0.31	0.15	0.34	0.11	0.17	0.26	0.42	0.30	0.52	0.64	0.30	0.07	0.46	0.12	0.26	0.09	0.15
O5'	0.16	0.09	0.14	0.30	0.23	0.15	0.33	0.26	0.23	0.11	0.09	0.17	0.16	0.34	0.29	0.18	0.50	0.33	0.71	0.45
OP1	0.34	0.24	0.16	0.05	0.09	0.24	0.11	0.16	0.12	0.23	0.13	0.33	0.36	0.08	0.16	0.37	0.10	0.20	0.23	0.10
OP2	0.18	0.11	0.13	0.20	0.23	0.12	0.26	0.12	0.17	0.13	0.13	0.15	0.14	0.24	0.31	0.23	0.44	0.29	0.60	0.35
P	0.19	0.10	0.09	0.19	0.21	0.09	0.26	0.09	0.16	0.11	0.09	0.18	0.19	0.23	0.29	0.22	0.33	0.20	0.53	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.00	0.23	0.12	0.13	0.09
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.06	0.02	0.03	0.43	0.22	0.22	0.19
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.11	0.03	0.04	0.13	0.00	0.03	0.08	0.01	0.28	0.27	0.09	0.14
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.12	0.04	0.06	0.11	0.01	0.01	0.10	0.02	0.37	0.46	0.09	0.24
C4	0.03	0.01	0.07	0.09	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.03	0.00	0.01	0.08	0.10	0.01	0.05	0.66	0.43	0.48	0.42
C4'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.04	0.03	0.05	0.02	0.07	0.00	0.01	0.17	0.28	0.07
C5	0.02	0.02	0.10	0.12	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.13	0.00	0.05	0.71	0.48	0.49	0.46
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.14	0.00	0.16	0.00	0.15	0.10	0.11	0.06	0.04	0.03	0.15	0.01	0.01	0.35	0.45	0.03
C6	0.02	0.01	0.11	0.12	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.13	0.02	0.04	0.62	0.38	0.32	0.34
N1	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.43	0.24	0.19	0.19
N3	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.06	0.02	0.04	0.55	0.31	0.36	0.30
O2	0.03	0.00	0.13	0.11	0.01	0.03	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.12	0.03	0.05	0.32	0.14	0.16	0.10
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.08	0.05	0.08	0.04	0.08	0.03	0.07	0.13	0.00	0.05	0.10	0.08	0.05	0.09	0.16	0.12
O3'	0.03	0.06	0.03	0.01	0.10	0.02	0.13	0.03	0.13	0.04	0.06	0.12	0.05	0.00	0.12	0.02	0.23	0.48	0.11	0.21
O4	0.03	0.02	0.08	0.10	0.01	0.07	0.00	0.15	0.02	0.03	0.02	0.03	0.10	0.12	0.00	0.06	0.70	0.47	0.55	0.47
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.08	0.02	0.06	0.00	0.13	0.08	0.25	0.15
O5'	0.23	0.43	0.28	0.37	0.66	0.01	0.71	0.01	0.62	0.43	0.55	0.32	0.05	0.23	0.70	0.13	0.00	0.06	0.02	0.02
OP1	0.12	0.22	0.27	0.46	0.43	0.17	0.48	0.35	0.38	0.24	0.31	0.14	0.09	0.48	0.47	0.08	0.06	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.22	0.09	0.09	0.48	0.28	0.49	0.45	0.32	0.19	0.36	0.16	0.16	0.11	0.55	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.19	0.14	0.24	0.42	0.07	0.46	0.03	0.34	0.19	0.30	0.10	0.12	0.21	0.47	0.15	0.02	0.00	0.01	0.00