Doublet Group distance statistics: 54815

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.011 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.001, 0.009, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.010, 0.025, 0.039, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.030 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.006, 0.025, 0.045, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.025 std_dev=0.020
O4'	A	0, -0.012, 0.107, 0.225, 0.357 max_d=0.357 avg_d=0.107 std_dev=0.119
O5'	A	0, 0.068, 0.207, 0.345, 0.390 max_d=0.390 avg_d=0.207 std_dev=0.139
C2'	A	0, -0.011, 0.131, 0.273, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.131 std_dev=0.142
C4'	A	0, 0.008, 0.171, 0.334, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.171 std_dev=0.163
O2'	A	0, -0.007, 0.182, 0.371, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.182 std_dev=0.189
C3'	A	0, 0.000, 0.200, 0.399, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.200 std_dev=0.199
N1	B	0, 0.114, 0.356, 0.598, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.356 std_dev=0.242
C6	B	0, 0.178, 0.423, 0.667, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.423 std_dev=0.245
C5'	A	0, -0.011, 0.262, 0.536, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.262 std_dev=0.274
O3'	A	0, 0.023, 0.311, 0.598, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.311 std_dev=0.288
C5	B	0, 0.114, 0.409, 0.704, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.409 std_dev=0.295
C1'	B	0, 0.149, 0.484, 0.818, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.484 std_dev=0.334
C4	B	0, -0.029, 0.325, 0.679, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.325 std_dev=0.354
C2'	B	0, 0.183, 0.568, 0.952, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.568 std_dev=0.384
O5'	B	0, 0.081, 0.498, 0.914, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.498 std_dev=0.416
C2	B	0, 0.131, 0.548, 0.965, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.548 std_dev=0.417
P	B	0, 0.028, 0.456, 0.885, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.456 std_dev=0.428
O4'	B	0, 0.110, 0.550, 0.990, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.550 std_dev=0.440
OP2	B	0, 0.033, 0.485, 0.936, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.485 std_dev=0.452
N3	B	0, 0.060, 0.517, 0.974, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.517 std_dev=0.457
O4	B	0, 0.005, 0.462, 0.919, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.462 std_dev=0.457
O2'	B	0, 0.261, 0.724, 1.187, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.724 std_dev=0.463
OP1	B	0, 0.093, 0.604, 1.116, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.604 std_dev=0.512
C4'	B	0, 0.139, 0.652, 1.165, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.652 std_dev=0.513
C5'	B	0, 0.096, 0.611, 1.126, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.611 std_dev=0.515
P	A	0, -0.047, 0.505, 1.057, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.505 std_dev=0.552
C3'	B	0, 0.132, 0.710, 1.288, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.710 std_dev=0.578
O2	B	0, 0.165, 0.814, 1.463, 2.045 max_d=2.045 avg_d=0.814 std_dev=0.649
O3'	B	0, 0.078, 1.024, 1.970, 2.651 max_d=2.651 avg_d=1.024 std_dev=0.946
OP1	A	0, -0.304, 0.783, 1.871, 3.066 max_d=3.066 avg_d=0.783 std_dev=1.088
OP2	A	0, -0.509, 1.020, 2.550, 4.330 max_d=4.330 avg_d=1.020 std_dev=1.529

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.07	0.37	0.29	0.19
C2	0.02	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.15	0.02	0.10	0.53	0.29	0.15
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.08	0.10	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.10	0.08	0.02
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.07	0.08	0.09	0.11	0.07	0.07	0.03	0.01	0.00	0.01	0.16	0.31	0.10	0.17
C4	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.10	0.54	0.26	0.15
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.10	0.38	0.08
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.12	0.62	0.49	0.17
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.08	0.06	0.06	0.07	0.08	0.04	0.05	0.04	0.02	0.00	0.31	0.30	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.13	0.64	0.56	0.18
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.02	0.13	0.62	0.37	0.17
N1	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.02	0.12	0.59	0.46	0.17
N3	0.02	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.14	0.02	0.09	0.49	0.19	0.15
N6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.09	0.02	0.14	0.70	0.71	0.21
N7	0.02	0.02	0.04	0.07	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.02	0.14	0.68	0.60	0.19
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.10	0.50	0.18	0.16
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.01	0.07	0.07	0.05	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.03	0.13	0.38	0.12
O3'	0.02	0.15	0.02	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.09	0.09	0.12	0.14	0.09	0.08	0.04	0.03	0.00	0.01	0.22	0.62	0.20	0.30
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.15	0.37	0.52	0.30
O5'	0.07	0.10	0.08	0.16	0.10	0.00	0.12	0.00	0.13	0.13	0.12	0.09	0.14	0.14	0.10	0.03	0.22	0.15	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.37	0.53	0.10	0.31	0.54	0.10	0.62	0.31	0.64	0.62	0.59	0.49	0.70	0.68	0.50	0.13	0.62	0.37	0.02	0.00	0.03	0.02
OP2	0.29	0.29	0.08	0.10	0.26	0.38	0.49	0.30	0.56	0.37	0.46	0.19	0.71	0.60	0.18	0.38	0.20	0.52	0.03	0.03	0.00	0.01
P	0.19	0.15	0.02	0.17	0.15	0.08	0.17	0.01	0.18	0.17	0.17	0.15	0.21	0.19	0.16	0.12	0.30	0.30	0.01	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.29	0.28	0.09	0.14	0.22	0.25	0.14	0.17	0.18	0.21	0.43	0.19	0.17	0.17	0.28	0.11	0.04	0.06	0.03
C2	0.14	0.19	0.11	0.22	0.13	0.23	0.11	0.32	0.17	0.06	0.27	0.27	0.12	0.16	0.20	0.22	0.35	0.26	0.15	0.22
C2'	0.24	0.25	0.29	0.10	0.15	0.22	0.26	0.13	0.18	0.16	0.17	0.37	0.18	0.13	0.19	0.29	0.10	0.06	0.08	0.04
C3'	0.19	0.15	0.28	0.01	0.25	0.16	0.34	0.11	0.21	0.09	0.14	0.25	0.16	0.09	0.33	0.25	0.06	0.01	0.03	0.01
C4	0.09	0.20	0.12	0.12	0.11	0.11	0.21	0.17	0.16	0.09	0.18	0.29	0.14	0.08	0.12	0.15	0.24	0.12	0.07	0.11
C4'	0.22	0.20	0.29	0.06	0.24	0.22	0.34	0.15	0.20	0.12	0.14	0.33	0.15	0.05	0.32	0.28	0.04	0.03	0.02	0.02
C5	0.06	0.11	0.09	0.20	0.14	0.08	0.21	0.14	0.15	0.07	0.12	0.16	0.16	0.08	0.17	0.12	0.23	0.10	0.09	0.10
C5'	0.19	0.15	0.27	0.03	0.30	0.19	0.37	0.14	0.21	0.09	0.16	0.25	0.16	0.11	0.41	0.26	0.05	0.10	0.06	0.07
C6	0.09	0.05	0.04	0.25	0.08	0.13	0.15	0.21	0.13	0.07	0.08	0.09	0.12	0.07	0.10	0.13	0.27	0.14	0.09	0.13
C8	0.17	0.17	0.23	0.15	0.21	0.14	0.27	0.08	0.18	0.14	0.15	0.24	0.24	0.13	0.28	0.22	0.15	0.11	0.17	0.12
N1	0.16	0.05	0.11	0.26	0.10	0.21	0.11	0.28	0.15	0.09	0.13	0.10	0.10	0.06	0.19	0.20	0.32	0.21	0.12	0.19
N3	0.08	0.26	0.08	0.15	0.10	0.19	0.16	0.28	0.17	0.06	0.27	0.37	0.10	0.19	0.11	0.16	0.32	0.23	0.14	0.20
N6	0.10	0.09	0.05	0.30	0.11	0.13	0.13	0.19	0.11	0.09	0.10	0.11	0.14	0.13	0.13	0.12	0.26	0.12	0.09	0.12
N7	0.11	0.12	0.17	0.21	0.21	0.09	0.25	0.08	0.16	0.10	0.14	0.16	0.22	0.16	0.29	0.16	0.19	0.11	0.16	0.11
N9	0.17	0.22	0.21	0.08	0.15	0.14	0.26	0.11	0.17	0.13	0.17	0.32	0.19	0.09	0.20	0.22	0.16	0.05	0.07	0.06
O2'	0.34	0.36	0.36	0.26	0.13	0.33	0.22	0.20	0.19	0.26	0.26	0.52	0.24	0.32	0.13	0.36	0.11	0.11	0.09	0.08
O3'	0.17	0.11	0.27	0.04	0.27	0.14	0.35	0.12	0.22	0.07	0.14	0.19	0.12	0.17	0.35	0.21	0.01	0.01	0.02	0.01
O4'	0.23	0.25	0.28	0.07	0.19	0.23	0.30	0.14	0.18	0.14	0.17	0.39	0.17	0.11	0.26	0.28	0.08	0.02	0.03	0.01
O5'	0.29	0.19	0.38	0.23	0.28	0.28	0.33	0.23	0.23	0.21	0.17	0.25	0.34	0.26	0.39	0.35	0.23	0.35	0.35	0.31
OP1	0.37	0.27	0.58	0.51	0.48	0.51	0.39	0.57	0.25	0.25	0.37	0.30	0.55	0.60	0.67	0.43	0.57	1.05	0.85	0.82
OP2	0.49	0.60	0.63	0.52	0.73	0.34	0.69	0.26	0.59	0.56	0.67	0.58	0.58	0.56	0.81	0.41	0.43	0.53	0.83	0.52
P	0.34	0.25	0.48	0.36	0.33	0.34	0.35	0.31	0.28	0.27	0.24	0.28	0.44	0.41	0.42	0.37	0.36	0.58	0.61	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.01	0.01	0.05	0.05	0.15	0.09
C2	0.01	0.00	0.14	0.20	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.15	0.01	0.08	0.16	0.18	0.13	0.13
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.02	0.09	0.10	0.12	0.02	0.11	0.23	0.01	0.01	0.07	0.02	0.23	0.15	0.27	0.23
C3'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.34	0.01	0.35	0.02	0.30	0.20	0.28	0.12	0.01	0.01	0.37	0.02	0.07	0.22	0.19	0.14
C4	0.01	0.00	0.06	0.34	0.00	0.16	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00	0.32	0.19	0.01	0.03	0.36	0.36	0.31	0.33
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.16	0.00	0.23	0.00	0.22	0.09	0.08	0.08	0.25	0.02	0.18	0.00	0.01	0.12	0.01	0.01
C5	0.01	0.00	0.09	0.35	0.01	0.23	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00	0.01	0.36	0.24	0.02	0.08	0.41	0.36	0.28	0.35
C5'	0.02	0.08	0.10	0.02	0.26	0.00	0.33	0.00	0.29	0.12	0.15	0.07	0.13	0.16	0.29	0.01	0.00	0.10	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.12	0.30	0.01	0.22	0.00	0.29	0.00	0.00	0.01	0.02	0.31	0.17	0.02	0.10	0.32	0.26	0.13	0.23
N1	0.00	0.01	0.02	0.20	0.01	0.09	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.02	0.19	0.06	0.01	0.01	0.15	0.16	0.08	0.10
N3	0.01	0.00	0.11	0.28	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.13	0.01	0.06	0.26	0.27	0.23	0.23
O2	0.01	0.01	0.23	0.12	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.02	0.00	0.00	0.05	0.29	0.01	0.13	0.09	0.13	0.12	0.09
O2'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.32	0.25	0.36	0.13	0.31	0.19	0.22	0.05	0.00	0.03	0.35	0.16	0.12	0.07	0.25	0.12
O3'	0.23	0.15	0.01	0.01	0.19	0.02	0.24	0.16	0.17	0.06	0.13	0.29	0.03	0.00	0.23	0.13	0.25	0.60	0.46	0.41
O4	0.01	0.01	0.07	0.37	0.01	0.18	0.02	0.29	0.02	0.01	0.01	0.01	0.35	0.23	0.00	0.03	0.41	0.42	0.40	0.40
O4'	0.01	0.08	0.02	0.02	0.03	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.06	0.13	0.16	0.13	0.03	0.00	0.03	0.03	0.17	0.10
O5'	0.05	0.16	0.23	0.07	0.36	0.01	0.41	0.00	0.32	0.15	0.26	0.09	0.12	0.25	0.41	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.18	0.15	0.22	0.36	0.12	0.36	0.10	0.26	0.16	0.27	0.13	0.07	0.60	0.42	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.13	0.27	0.19	0.31	0.01	0.28	0.02	0.13	0.08	0.23	0.12	0.25	0.46	0.40	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.13	0.23	0.14	0.33	0.01	0.35	0.01	0.23	0.10	0.23	0.09	0.12	0.41	0.40	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00