Doublet Group distance statistics: 54816

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.016, 0.029, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.003, 0.016, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.018 std_dev=0.014
C6	A	0, -0.003, 0.014, 0.032, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.014 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.008, 0.026, 0.045, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.002, 0.026, 0.050, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.026 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.001, 0.030, 0.060, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N6	A	0, 0.003, 0.040, 0.076, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.040 std_dev=0.036
C8	A	0, -0.001, 0.037, 0.076, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.037 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.023, 0.187, 0.350, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.187 std_dev=0.164
O4'	A	0, -0.014, 0.180, 0.374, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.180 std_dev=0.194
O2'	A	0, 0.099, 0.341, 0.582, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.341 std_dev=0.242
C3'	A	0, 0.055, 0.383, 0.711, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.383 std_dev=0.328
C4'	A	0, 0.063, 0.392, 0.721, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.392 std_dev=0.329
O3'	A	0, 0.062, 0.508, 0.953, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.508 std_dev=0.445
N3	B	0, 0.159, 0.649, 1.139, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.649 std_dev=0.490
N1	B	0, 0.155, 0.661, 1.167, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.661 std_dev=0.506
C6	B	0, 0.190, 0.698, 1.205, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.698 std_dev=0.508
C2	B	0, 0.090, 0.614, 1.137, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.614 std_dev=0.524
C4	B	0, 0.140, 0.668, 1.196, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.668 std_dev=0.528
C5	B	0, 0.131, 0.681, 1.231, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.681 std_dev=0.550
C1'	B	0, 0.177, 0.742, 1.308, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.742 std_dev=0.566
C5'	A	0, 0.082, 0.662, 1.241, 1.603 max_d=1.603 avg_d=0.662 std_dev=0.580
O4'	B	0, 0.235, 0.818, 1.402, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.818 std_dev=0.584
O4	B	0, 0.120, 0.733, 1.347, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.733 std_dev=0.613
O5'	B	0, 0.162, 0.776, 1.390, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.776 std_dev=0.614
O2	B	0, 0.028, 0.648, 1.269, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.648 std_dev=0.621
C2'	B	0, 0.165, 0.798, 1.431, 1.902 max_d=1.902 avg_d=0.798 std_dev=0.633
P	B	0, 0.042, 0.702, 1.362, 1.785 max_d=1.785 avg_d=0.702 std_dev=0.660
O5'	A	0, 0.079, 0.751, 1.423, 1.817 max_d=1.817 avg_d=0.751 std_dev=0.672
OP2	B	0, 0.044, 0.731, 1.418, 1.863 max_d=1.863 avg_d=0.731 std_dev=0.687
C4'	B	0, 0.228, 0.917, 1.606, 2.006 max_d=2.006 avg_d=0.917 std_dev=0.689
C5'	B	0, 0.207, 0.923, 1.639, 2.032 max_d=2.032 avg_d=0.923 std_dev=0.716
C3'	B	0, 0.212, 0.935, 1.657, 2.053 max_d=2.053 avg_d=0.935 std_dev=0.723
OP2	A	0, 0.182, 1.000, 1.817, 1.964 max_d=1.964 avg_d=1.000 std_dev=0.818
O2'	B	0, 0.200, 1.035, 1.870, 2.517 max_d=2.517 avg_d=1.035 std_dev=0.835
OP1	B	0, 0.137, 1.009, 1.881, 2.355 max_d=2.355 avg_d=1.009 std_dev=0.872
O3'	B	0, 0.227, 1.149, 2.072, 2.677 max_d=2.677 avg_d=1.149 std_dev=0.923
P	A	0, 0.064, 0.989, 1.914, 2.437 max_d=2.437 avg_d=0.989 std_dev=0.925
OP1	A	0, -0.064, 1.273, 2.609, 3.846 max_d=3.846 avg_d=1.273 std_dev=1.337

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.30	0.08	0.12
C2	0.05	0.00	0.12	0.21	0.02	0.10	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.18	0.24	0.06	0.26	0.77	0.35	0.34
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.04	0.05	0.05	0.08	0.10	0.09	0.12	0.09	0.07	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.14	0.10	0.08
C3'	0.03	0.21	0.01	0.00	0.15	0.01	0.17	0.04	0.20	0.20	0.21	0.18	0.22	0.19	0.12	0.02	0.01	0.02	0.04	0.18	0.08	0.07
C4	0.02	0.02	0.06	0.15	0.00	0.10	0.00	0.16	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.11	0.15	0.03	0.23	0.71	0.32	0.30
C4'	0.03	0.10	0.04	0.01	0.10	0.00	0.13	0.01	0.15	0.15	0.13	0.08	0.18	0.15	0.10	0.09	0.04	0.02	0.03	0.12	0.22	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.17	0.00	0.13	0.00	0.22	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.10	0.17	0.02	0.31	0.91	0.47	0.38
C5'	0.04	0.17	0.05	0.04	0.16	0.01	0.22	0.00	0.25	0.23	0.21	0.13	0.30	0.25	0.14	0.09	0.05	0.02	0.01	0.28	0.35	0.02
C6	0.04	0.00	0.08	0.20	0.03	0.15	0.03	0.25	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.13	0.21	0.05	0.35	0.99	0.55	0.44
C8	0.01	0.02	0.10	0.20	0.00	0.15	0.01	0.23	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.21	0.02	0.29	0.75	0.39	0.32
N1	0.05	0.01	0.09	0.21	0.03	0.13	0.02	0.21	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.16	0.24	0.06	0.32	0.91	0.47	0.40
N3	0.04	0.01	0.12	0.18	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.17	0.20	0.05	0.21	0.65	0.26	0.27
N6	0.05	0.01	0.09	0.22	0.03	0.18	0.04	0.30	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.13	0.23	0.06	0.40	1.11	0.67	0.51
N7	0.01	0.01	0.07	0.19	0.00	0.15	0.01	0.25	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.07	0.20	0.02	0.33	0.96	0.54	0.40
N9	0.01	0.03	0.05	0.12	0.01	0.10	0.01	0.14	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.00	0.05	0.12	0.01	0.19	0.58	0.23	0.23
O2'	0.01	0.18	0.01	0.02	0.11	0.09	0.10	0.09	0.13	0.05	0.16	0.17	0.13	0.07	0.05	0.00	0.09	0.10	0.03	0.06	0.08	0.04
O3'	0.06	0.24	0.05	0.01	0.15	0.04	0.17	0.05	0.21	0.21	0.24	0.20	0.23	0.20	0.12	0.09	0.00	0.05	0.04	0.40	0.13	0.12
O4'	0.00	0.06	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.05	0.02	0.06	0.05	0.06	0.02	0.01	0.10	0.05	0.00	0.08	0.19	0.19	0.10
O5'	0.08	0.26	0.06	0.04	0.23	0.03	0.31	0.01	0.35	0.29	0.32	0.21	0.40	0.33	0.19	0.03	0.04	0.08	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.30	0.77	0.14	0.18	0.71	0.12	0.91	0.28	0.99	0.75	0.91	0.65	1.11	0.96	0.58	0.06	0.40	0.19	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.35	0.10	0.08	0.32	0.22	0.47	0.35	0.55	0.39	0.47	0.26	0.67	0.54	0.23	0.08	0.13	0.19	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.12	0.34	0.08	0.07	0.30	0.03	0.38	0.02	0.44	0.32	0.40	0.27	0.51	0.40	0.23	0.04	0.12	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.40	0.41	0.38	0.27	0.41	0.22	0.41	0.16	0.38	0.39	0.41	0.45	0.51	0.21	0.43	0.31	0.15	0.08	0.19	0.05
C2	0.14	0.25	0.14	0.22	0.27	0.33	0.19	0.35	0.17	0.14	0.32	0.30	0.19	0.30	0.30	0.30	0.45	0.42	0.28	0.32
C2'	0.43	0.44	0.41	0.29	0.44	0.26	0.45	0.20	0.43	0.43	0.43	0.47	0.56	0.23	0.44	0.37	0.17	0.11	0.22	0.08
C3'	0.30	0.25	0.30	0.20	0.26	0.19	0.29	0.12	0.25	0.24	0.22	0.30	0.48	0.19	0.28	0.26	0.07	0.05	0.15	0.04
C4	0.21	0.32	0.20	0.13	0.36	0.10	0.32	0.12	0.27	0.27	0.36	0.34	0.23	0.09	0.37	0.09	0.28	0.22	0.18	0.15
C4'	0.31	0.27	0.31	0.21	0.31	0.19	0.33	0.12	0.28	0.26	0.25	0.32	0.50	0.20	0.34	0.27	0.05	0.11	0.14	0.08
C5	0.17	0.25	0.17	0.21	0.35	0.18	0.30	0.18	0.25	0.21	0.33	0.23	0.16	0.18	0.38	0.16	0.27	0.21	0.23	0.16
C5'	0.31	0.24	0.32	0.28	0.33	0.25	0.36	0.20	0.30	0.26	0.24	0.28	0.48	0.28	0.39	0.30	0.08	0.22	0.23	0.15
C6	0.16	0.15	0.15	0.19	0.28	0.24	0.23	0.23	0.22	0.14	0.27	0.13	0.17	0.19	0.32	0.23	0.34	0.27	0.25	0.22
C8	0.32	0.31	0.34	0.37	0.41	0.31	0.39	0.31	0.34	0.31	0.35	0.30	0.38	0.35	0.45	0.31	0.21	0.25	0.37	0.23
N1	0.22	0.15	0.20	0.22	0.25	0.33	0.18	0.32	0.19	0.13	0.26	0.15	0.27	0.28	0.30	0.32	0.42	0.37	0.27	0.29
N3	0.15	0.33	0.14	0.11	0.32	0.19	0.27	0.25	0.23	0.23	0.35	0.38	0.17	0.17	0.33	0.14	0.39	0.35	0.23	0.26
N6	0.22	0.11	0.20	0.26	0.23	0.28	0.28	0.27	0.27	0.18	0.20	0.13	0.25	0.26	0.30	0.28	0.33	0.27	0.30	0.24
N7	0.24	0.25	0.26	0.35	0.38	0.28	0.34	0.29	0.29	0.25	0.32	0.22	0.26	0.33	0.43	0.26	0.24	0.24	0.34	0.21
N9	0.33	0.36	0.31	0.25	0.40	0.19	0.38	0.16	0.34	0.34	0.38	0.37	0.39	0.21	0.42	0.24	0.17	0.14	0.22	0.09
O2'	0.62	0.60	0.61	0.48	0.54	0.46	0.53	0.37	0.54	0.59	0.57	0.65	0.79	0.42	0.52	0.56	0.32	0.11	0.21	0.14
O3'	0.27	0.22	0.28	0.16	0.21	0.17	0.25	0.09	0.20	0.21	0.18	0.29	0.51	0.17	0.24	0.24	0.04	0.03	0.02	0.02
O4'	0.34	0.34	0.33	0.23	0.40	0.19	0.41	0.13	0.35	0.33	0.35	0.38	0.48	0.19	0.44	0.28	0.11	0.08	0.18	0.06
O5'	0.32	0.29	0.32	0.30	0.40	0.25	0.42	0.18	0.36	0.31	0.31	0.29	0.41	0.29	0.46	0.30	0.13	0.13	0.17	0.07
OP1	0.63	0.95	0.54	0.36	1.25	0.25	1.16	0.11	0.93	0.84	1.13	0.88	0.52	0.25	1.40	0.46	0.17	0.55	0.27	0.34
OP2	0.45	0.41	0.45	0.50	0.31	0.43	0.30	0.41	0.35	0.40	0.36	0.45	0.52	0.51	0.31	0.45	0.33	0.10	0.23	0.15
P	0.33	0.36	0.31	0.28	0.53	0.21	0.52	0.13	0.42	0.36	0.43	0.34	0.37	0.26	0.62	0.29	0.14	0.16	0.10	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.03	0.26	0.13
C2	0.04	0.00	0.09	0.17	0.03	0.11	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.18	0.04	0.03	0.06	0.06	0.29	0.13
C2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.10	0.09	0.07	0.06	0.07	0.04	0.10	0.14	0.01	0.02	0.12	0.03	0.11	0.08	0.21	0.13
C3'	0.02	0.17	0.02	0.00	0.23	0.01	0.21	0.03	0.18	0.13	0.21	0.17	0.04	0.01	0.27	0.02	0.04	0.13	0.17	0.06
C4	0.03	0.03	0.10	0.23	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.27	0.01	0.02	0.21	0.19	0.32	0.20
C4'	0.05	0.11	0.09	0.01	0.09	0.00	0.07	0.01	0.07	0.07	0.11	0.14	0.20	0.01	0.11	0.02	0.03	0.11	0.16	0.06
C5	0.01	0.02	0.07	0.21	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.24	0.02	0.01	0.27	0.22	0.33	0.23
C5'	0.03	0.05	0.06	0.03	0.07	0.01	0.12	0.00	0.10	0.05	0.04	0.09	0.23	0.09	0.07	0.03	0.00	0.08	0.11	0.03
C6	0.01	0.02	0.07	0.18	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.18	0.02	0.01	0.21	0.16	0.29	0.18
N1	0.01	0.02	0.04	0.13	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.12	0.04	0.01	0.10	0.08	0.28	0.13
N3	0.04	0.01	0.10	0.21	0.02	0.11	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.24	0.03	0.02	0.12	0.12	0.30	0.14
O2	0.06	0.01	0.14	0.17	0.03	0.14	0.03	0.09	0.03	0.03	0.02	0.00	0.10	0.19	0.04	0.05	0.06	0.04	0.30	0.16
O2'	0.02	0.06	0.01	0.04	0.04	0.20	0.03	0.23	0.03	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.06	0.10	0.36	0.24	0.36	0.35
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.27	0.01	0.24	0.09	0.18	0.12	0.24	0.19	0.06	0.00	0.33	0.01	0.13	0.16	0.17	0.10
O4	0.05	0.04	0.12	0.27	0.01	0.11	0.02	0.07	0.02	0.04	0.03	0.04	0.06	0.33	0.00	0.03	0.22	0.20	0.33	0.22
O4'	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.05	0.10	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.27	0.13
O5'	0.03	0.06	0.11	0.04	0.21	0.03	0.27	0.00	0.21	0.10	0.12	0.06	0.36	0.13	0.22	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.03	0.06	0.08	0.13	0.19	0.11	0.22	0.08	0.16	0.08	0.12	0.04	0.24	0.16	0.20	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.29	0.21	0.17	0.32	0.16	0.33	0.11	0.29	0.28	0.30	0.30	0.36	0.17	0.33	0.27	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.13	0.13	0.06	0.20	0.06	0.23	0.03	0.18	0.13	0.14	0.16	0.35	0.10	0.22	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00