Doublet Group distance statistics: 54819

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.007, 0.026, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.005, 0.025, 0.044, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.025 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.007, 0.029, 0.051, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.029 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.002, 0.033, 0.065, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.033 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.014, 0.059, 0.103, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.059 std_dev=0.045
C8	A	0, 0.013, 0.066, 0.119, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.066 std_dev=0.053
O4'	A	0, -0.021, 0.205, 0.430, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.205 std_dev=0.226
C2'	A	0, -0.003, 0.250, 0.504, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.250 std_dev=0.253
O2'	A	0, 0.063, 0.351, 0.638, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.351 std_dev=0.287
C4'	A	0, -0.001, 0.314, 0.629, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.314 std_dev=0.315
OP2	B	0, 0.122, 0.487, 0.851, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.487 std_dev=0.365
C3'	A	0, 0.031, 0.405, 0.778, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.405 std_dev=0.374
N1	B	0, 0.147, 0.530, 0.913, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.530 std_dev=0.383
C4	B	0, 0.160, 0.569, 0.978, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.569 std_dev=0.409
O5'	A	0, 0.053, 0.470, 0.887, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.470 std_dev=0.417
O4'	B	0, 0.173, 0.597, 1.020, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.597 std_dev=0.424
C6	B	0, 0.066, 0.509, 0.951, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.509 std_dev=0.442
C1'	B	0, 0.184, 0.631, 1.077, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.631 std_dev=0.446
P	B	0, 0.171, 0.623, 1.075, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.623 std_dev=0.452
C5	B	0, 0.113, 0.567, 1.022, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.567 std_dev=0.454
O4	B	0, 0.186, 0.654, 1.122, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.654 std_dev=0.468
N3	B	0, 0.150, 0.621, 1.091, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.621 std_dev=0.471
C2	B	0, 0.130, 0.608, 1.085, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.608 std_dev=0.477
OP2	A	0, 0.072, 0.566, 1.060, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.566 std_dev=0.494
O5'	B	0, 0.197, 0.703, 1.209, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.703 std_dev=0.506
O3'	A	0, 0.071, 0.620, 1.168, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.620 std_dev=0.549
C4'	B	0, 0.195, 0.762, 1.329, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.762 std_dev=0.567
C5'	A	0, -0.059, 0.538, 1.135, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.538 std_dev=0.597
C2'	B	0, 0.247, 0.858, 1.468, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.858 std_dev=0.611
P	A	0, 0.003, 0.626, 1.249, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.626 std_dev=0.623
C5'	B	0, 0.242, 0.878, 1.514, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.878 std_dev=0.636
O2	B	0, 0.018, 0.687, 1.356, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.687 std_dev=0.669
OP1	B	0, 0.181, 0.860, 1.539, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.860 std_dev=0.679
O2'	B	0, 0.324, 1.117, 1.910, 1.765 max_d=1.765 avg_d=1.117 std_dev=0.793
OP1	A	0, -0.019, 0.793, 1.605, 1.909 max_d=1.909 avg_d=0.793 std_dev=0.812
C3'	B	0, -0.018, 0.832, 1.682, 2.000 max_d=2.000 avg_d=0.832 std_dev=0.850
O3'	B	0, 0.004, 1.160, 2.317, 2.739 max_d=2.739 avg_d=1.160 std_dev=1.157

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.12	0.12
C2	0.01	0.00	0.16	0.12	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.18	0.05	0.04	0.05	0.12	0.10
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.13	0.10	0.18	0.01	0.10	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.13	0.08
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.04	0.21	0.06	0.13	0.08	0.18	0.07	0.01	0.00	0.01	0.13	0.22	0.22	0.16
C4	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.05	0.03	0.04	0.05	0.13	0.10
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.09	0.01	0.03	0.04	0.08	0.03	0.04	0.01	0.00	0.02	0.07	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.02	0.04	0.06	0.12	0.09
C5'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.08	0.03	0.02	0.06	0.08	0.04	0.04	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.05	0.02	0.04	0.06	0.12	0.09
C8	0.02	0.01	0.13	0.21	0.01	0.09	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.24	0.05	0.05	0.06	0.13	0.10
N1	0.01	0.00	0.10	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.10	0.04	0.04	0.05	0.12	0.10
N3	0.01	0.00	0.18	0.13	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.19	0.18	0.05	0.04	0.05	0.13	0.10
N6	0.01	0.01	0.01	0.08	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.10	0.02	0.05	0.06	0.11	0.09
N7	0.02	0.01	0.10	0.18	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.22	0.04	0.06	0.07	0.12	0.08
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.04	0.06	0.13	0.11
O2'	0.01	0.19	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01	0.04	0.05	0.10	0.13	0.19	0.02	0.08	0.02	0.00	0.01	0.03	0.07	0.16	0.11	0.05
O3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.05	0.01	0.09	0.02	0.05	0.24	0.10	0.18	0.10	0.22	0.07	0.01	0.00	0.01	0.18	0.36	0.34	0.26
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.04	0.05	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.09	0.17	0.16
O5'	0.04	0.04	0.07	0.13	0.04	0.02	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04	0.07	0.18	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.04	0.05	0.14	0.22	0.05	0.07	0.06	0.04	0.06	0.06	0.05	0.05	0.06	0.07	0.06	0.16	0.36	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.12	0.13	0.22	0.13	0.04	0.12	0.02	0.12	0.13	0.12	0.13	0.11	0.12	0.13	0.11	0.34	0.17	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.10	0.08	0.16	0.10	0.03	0.09	0.01	0.09	0.10	0.10	0.10	0.09	0.08	0.11	0.05	0.26	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.40	0.23	0.15	0.18	0.17	0.22	0.20	0.12	0.03	0.20	0.15	0.33	0.39	0.19	0.26	0.39	0.17	0.08	0.08	0.09
C2	0.36	0.32	0.28	0.23	0.14	0.05	0.10	0.19	0.21	0.30	0.27	0.37	0.42	0.08	0.16	0.10	0.19	0.17	0.04	0.11
C2'	0.20	0.09	0.15	0.05	0.27	0.14	0.29	0.17	0.15	0.04	0.17	0.12	0.22	0.13	0.32	0.27	0.20	0.11	0.17	0.14
C3'	0.05	0.17	0.44	0.21	0.37	0.03	0.42	0.24	0.33	0.19	0.26	0.10	0.21	0.16	0.40	0.12	0.02	0.01	0.03	0.01
C4	0.37	0.21	0.15	0.29	0.11	0.19	0.10	0.03	0.14	0.24	0.13	0.28	0.27	0.13	0.21	0.31	0.08	0.05	0.11	0.05
C4'	0.09	0.07	0.32	0.15	0.33	0.03	0.41	0.26	0.28	0.08	0.18	0.08	0.09	0.14	0.39	0.21	0.07	0.01	0.16	0.03
C5	0.35	0.16	0.14	0.40	0.08	0.29	0.12	0.16	0.22	0.25	0.06	0.19	0.13	0.23	0.21	0.35	0.12	0.13	0.21	0.13
C5'	0.03	0.15	0.50	0.27	0.43	0.04	0.51	0.26	0.39	0.19	0.27	0.06	0.30	0.22	0.48	0.15	0.07	0.08	0.34	0.14
C6	0.34	0.19	0.22	0.42	0.05	0.25	0.20	0.15	0.30	0.28	0.10	0.18	0.15	0.18	0.10	0.27	0.13	0.09	0.20	0.09
C8	0.33	0.11	0.02	0.36	0.20	0.37	0.20	0.23	0.12	0.17	0.08	0.18	0.09	0.34	0.33	0.45	0.20	0.26	0.27	0.26
N1	0.34	0.27	0.28	0.35	0.17	0.14	0.21	0.03	0.29	0.31	0.23	0.26	0.28	0.04	0.16	0.16	0.18	0.10	0.11	0.06
N3	0.38	0.30	0.22	0.19	0.10	0.03	0.05	0.24	0.12	0.26	0.21	0.37	0.43	0.04	0.16	0.16	0.14	0.15	0.02	0.10
N6	0.32	0.16	0.23	0.50	0.11	0.32	0.29	0.27	0.34	0.28	0.08	0.11	0.08	0.25	0.03	0.30	0.14	0.14	0.27	0.15
N7	0.33	0.10	0.07	0.44	0.17	0.39	0.15	0.30	0.19	0.20	0.05	0.13	0.02	0.36	0.31	0.43	0.18	0.26	0.31	0.25
N9	0.37	0.18	0.09	0.27	0.17	0.26	0.18	0.03	0.08	0.20	0.11	0.26	0.25	0.22	0.27	0.39	0.12	0.12	0.15	0.13
O2'	0.33	0.19	0.23	0.15	0.23	0.19	0.23	0.30	0.11	0.16	0.19	0.25	0.53	0.21	0.29	0.30	0.38	0.16	0.20	0.20
O3'	0.22	0.29	0.62	0.39	0.40	0.16	0.45	0.34	0.40	0.31	0.34	0.24	0.38	0.22	0.41	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00
O4'	0.29	0.15	0.13	0.07	0.24	0.14	0.31	0.19	0.15	0.09	0.11	0.27	0.24	0.15	0.32	0.33	0.11	0.03	0.09	0.02
O5'	0.02	0.17	0.46	0.16	0.44	0.10	0.50	0.04	0.34	0.17	0.29	0.09	0.37	0.21	0.52	0.21	0.04	0.10	0.16	0.04
OP1	0.06	0.17	0.47	0.26	0.44	0.24	0.47	0.17	0.32	0.17	0.29	0.08	0.41	0.44	0.53	0.31	0.22	0.35	0.24	0.26
OP2	0.05	0.15	0.36	0.22	0.41	0.28	0.39	0.26	0.22	0.10	0.29	0.10	0.41	0.38	0.53	0.32	0.16	0.35	0.21	0.26
P	0.01	0.16	0.44	0.18	0.43	0.16	0.46	0.07	0.30	0.15	0.29	0.09	0.40	0.31	0.52	0.25	0.11	0.23	0.16	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.32	0.02	0.00	0.33	0.39	0.18	0.28
C2	0.05	0.00	0.20	0.20	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.20	0.01	0.09	0.41	0.40	0.22	0.33
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.05	0.01	0.12	0.19	0.16	0.02	0.15	0.35	0.00	0.03	0.06	0.02	0.68	0.83	0.63	0.71
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.29	0.01	0.29	0.03	0.25	0.19	0.26	0.17	0.02	0.01	0.30	0.03	0.35	0.55	0.09	0.35
C4	0.02	0.01	0.05	0.29	0.00	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.31	0.03	0.01	0.02	0.49	0.42	0.31	0.40
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.13	0.06	0.04	0.10	0.25	0.01	0.09	0.01	0.01	0.18	0.24	0.02
C5	0.01	0.00	0.12	0.29	0.01	0.13	0.00	0.16	0.00	0.02	0.01	0.00	0.41	0.11	0.02	0.05	0.51	0.43	0.33	0.42
C5'	0.06	0.04	0.19	0.03	0.12	0.01	0.16	0.00	0.13	0.04	0.06	0.09	0.07	0.25	0.14	0.01	0.01	0.15	0.39	0.01
C6	0.02	0.01	0.16	0.25	0.01	0.13	0.00	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01	0.38	0.07	0.02	0.09	0.50	0.43	0.28	0.40
N1	0.01	0.01	0.02	0.19	0.01	0.06	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.12	0.01	0.01	0.43	0.41	0.22	0.34
N3	0.04	0.00	0.15	0.26	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.17	0.11	0.01	0.06	0.45	0.41	0.26	0.36
O2	0.08	0.01	0.35	0.17	0.01	0.10	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.33	0.00	0.15	0.36	0.40	0.19	0.30
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.31	0.25	0.41	0.07	0.38	0.18	0.17	0.24	0.00	0.04	0.33	0.15	0.43	0.67	0.66	0.56
O3'	0.32	0.20	0.03	0.01	0.03	0.01	0.11	0.25	0.07	0.12	0.11	0.33	0.04	0.00	0.05	0.21	0.18	0.31	0.31	0.23
O4	0.02	0.01	0.06	0.30	0.01	0.09	0.02	0.14	0.02	0.01	0.01	0.00	0.33	0.05	0.00	0.03	0.49	0.41	0.33	0.40
O4'	0.00	0.09	0.02	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.06	0.15	0.15	0.21	0.03	0.00	0.04	0.11	0.24	0.04
O5'	0.33	0.41	0.68	0.35	0.49	0.01	0.51	0.01	0.50	0.43	0.45	0.36	0.43	0.18	0.49	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.39	0.40	0.83	0.55	0.42	0.18	0.43	0.15	0.43	0.41	0.41	0.40	0.67	0.31	0.41	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.22	0.63	0.09	0.31	0.24	0.33	0.39	0.28	0.22	0.26	0.19	0.66	0.31	0.33	0.24	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.28	0.33	0.71	0.35	0.40	0.02	0.42	0.01	0.40	0.34	0.36	0.30	0.56	0.23	0.40	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00