Doublet Group distance statistics: 54820

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, -0.001, 0.013, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.013 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C2	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.010, 0.034, 0.058, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.034 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.009, 0.034, 0.059, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.034 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.005, 0.033, 0.062, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.033 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.006, 0.038, 0.070, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.038 std_dev=0.032
N9	A	0, 0.013, 0.045, 0.078, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.045 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.012, 0.051, 0.090, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.051 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.042, 0.305, 0.567, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.305 std_dev=0.263
C6	B	0, 0.089, 0.361, 0.634, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.361 std_dev=0.272
C2'	A	0, 0.034, 0.308, 0.583, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.308 std_dev=0.275
C5	B	0, 0.110, 0.400, 0.689, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.400 std_dev=0.289
C4'	A	0, 0.084, 0.425, 0.766, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.425 std_dev=0.341
O2'	A	0, 0.034, 0.377, 0.720, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.377 std_dev=0.343
C4	B	0, 0.147, 0.520, 0.894, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.520 std_dev=0.373
C3'	A	0, 0.064, 0.468, 0.873, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.468 std_dev=0.405
N1	B	0, 0.165, 0.593, 1.021, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.593 std_dev=0.428
N3	B	0, 0.142, 0.573, 1.004, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.573 std_dev=0.431
C2	B	0, 0.167, 0.687, 1.206, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.687 std_dev=0.520
O3'	A	0, 0.147, 0.726, 1.305, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.726 std_dev=0.579
P	B	0, 0.251, 0.859, 1.468, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.859 std_dev=0.608
OP1	A	0, -0.126, 0.494, 1.114, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.494 std_dev=0.620
O4	B	0, 0.170, 0.804, 1.438, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.804 std_dev=0.634
C5'	A	0, 0.083, 0.735, 1.386, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.735 std_dev=0.652
C4'	B	0, 0.203, 0.872, 1.542, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.872 std_dev=0.669
O5'	A	0, 0.094, 0.778, 1.463, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.778 std_dev=0.685
O5'	B	0, 0.221, 0.921, 1.621, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.921 std_dev=0.700
C5'	B	0, 0.300, 1.027, 1.755, 1.590 max_d=1.590 avg_d=1.027 std_dev=0.728
C1'	B	0, 0.194, 0.962, 1.730, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.962 std_dev=0.768
O4'	B	0, -0.035, 0.770, 1.574, 1.880 max_d=1.880 avg_d=0.770 std_dev=0.805
O2	B	0, 0.178, 0.990, 1.803, 1.990 max_d=1.990 avg_d=0.990 std_dev=0.812
C3'	B	0, 0.298, 1.113, 1.927, 1.926 max_d=1.926 avg_d=1.113 std_dev=0.814
P	A	0, -0.112, 0.704, 1.520, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.704 std_dev=0.816
OP1	B	0, 0.345, 1.252, 2.159, 2.120 max_d=2.120 avg_d=1.252 std_dev=0.907
OP2	B	0, 0.072, 1.014, 1.956, 2.269 max_d=2.269 avg_d=1.014 std_dev=0.942
C2'	B	0, 0.398, 1.390, 2.382, 2.248 max_d=2.248 avg_d=1.390 std_dev=0.992
O3'	B	0, 0.403, 1.487, 2.571, 2.552 max_d=2.552 avg_d=1.487 std_dev=1.084
OP2	A	0, -0.255, 0.839, 1.933, 2.385 max_d=2.385 avg_d=0.839 std_dev=1.094
O2'	B	0, 0.483, 1.889, 3.296, 3.374 max_d=3.374 avg_d=1.889 std_dev=1.407

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.22	0.07	0.16
C2	0.05	0.00	0.16	0.30	0.01	0.14	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.37	0.01	0.20	0.27	0.13	0.32
C2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.08	0.00	0.04	0.01	0.06	0.08	0.12	0.17	0.04	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.08	0.12	0.04
C3'	0.00	0.30	0.01	0.00	0.14	0.00	0.07	0.00	0.14	0.16	0.24	0.28	0.10	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.17	0.12	0.03
C4	0.03	0.01	0.08	0.14	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.16	0.02	0.07	0.22	0.03	0.23
C4'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.13	0.11	0.13	0.03	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.03	0.07
C5	0.03	0.01	0.04	0.07	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.06	0.20	0.07	0.19
C5'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.20	0.14	0.15	0.05	0.14	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00
C6	0.04	0.00	0.06	0.14	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.18	0.03	0.09	0.22	0.02	0.24
C8	0.01	0.01	0.08	0.16	0.00	0.13	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.16	0.04	0.26	0.12	0.28	0.03
N1	0.04	0.00	0.12	0.24	0.01	0.11	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.31	0.02	0.17	0.26	0.11	0.31
N3	0.05	0.00	0.17	0.28	0.00	0.13	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.32	0.01	0.17	0.25	0.09	0.29
N6	0.04	0.00	0.04	0.10	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.15	0.04	0.08	0.20	0.02	0.21
N7	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.04	0.19	0.13	0.23	0.07
N9	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.19	0.11	0.15
O2'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.05	0.05	0.05	0.03	0.04	0.01	0.00	0.06	0.02	0.03	0.09	0.09	0.06
O3'	0.03	0.37	0.03	0.00	0.16	0.02	0.09	0.01	0.18	0.16	0.31	0.32	0.15	0.09	0.01	0.06	0.00	0.03	0.05	0.30	0.10	0.09
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.34	0.05	0.22
O5'	0.05	0.20	0.05	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.09	0.26	0.17	0.17	0.08	0.19	0.08	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.22	0.27	0.08	0.17	0.22	0.11	0.20	0.07	0.22	0.12	0.26	0.25	0.20	0.13	0.19	0.09	0.30	0.34	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.13	0.12	0.12	0.03	0.03	0.07	0.00	0.02	0.28	0.11	0.09	0.02	0.23	0.11	0.09	0.10	0.05	0.03	0.00	0.00	0.01
P	0.16	0.32	0.04	0.03	0.23	0.07	0.19	0.00	0.24	0.03	0.31	0.29	0.21	0.07	0.15	0.06	0.09	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.64	0.40	0.60	0.55	0.15	0.64	0.13	0.56	0.26	0.44	0.22	0.51	0.75	0.56	0.27	0.70	0.13	0.05	0.16	0.07
C2	0.18	0.16	0.20	0.13	0.05	0.11	0.17	0.17	0.17	0.13	0.13	0.24	0.25	0.15	0.11	0.10	0.46	0.47	0.69	0.50
C2'	0.56	0.33	0.56	0.55	0.09	0.61	0.09	0.55	0.22	0.38	0.17	0.42	0.67	0.57	0.18	0.63	0.15	0.09	0.23	0.11
C3'	0.22	0.04	0.21	0.28	0.32	0.33	0.31	0.37	0.09	0.04	0.18	0.06	0.32	0.31	0.42	0.32	0.08	0.02	0.03	0.01
C4	0.34	0.23	0.30	0.25	0.16	0.28	0.12	0.20	0.11	0.24	0.14	0.29	0.39	0.24	0.27	0.33	0.16	0.20	0.39	0.22
C4'	0.35	0.08	0.28	0.30	0.34	0.42	0.32	0.43	0.06	0.13	0.17	0.16	0.46	0.32	0.50	0.46	0.06	0.03	0.07	0.02
C5	0.23	0.09	0.18	0.17	0.18	0.22	0.09	0.19	0.09	0.13	0.10	0.12	0.25	0.17	0.32	0.25	0.14	0.18	0.33	0.16
C5'	0.16	0.16	0.08	0.20	0.51	0.25	0.44	0.30	0.19	0.07	0.35	0.09	0.22	0.23	0.68	0.30	0.04	0.13	0.22	0.10
C6	0.12	0.05	0.11	0.04	0.15	0.06	0.07	0.02	0.07	0.07	0.11	0.04	0.16	0.04	0.24	0.09	0.24	0.30	0.47	0.28
C8	0.42	0.21	0.38	0.42	0.21	0.49	0.16	0.48	0.24	0.29	0.14	0.24	0.47	0.42	0.38	0.51	0.23	0.18	0.18	0.17
N1	0.18	0.08	0.19	0.15	0.08	0.13	0.13	0.15	0.17	0.15	0.03	0.06	0.21	0.16	0.11	0.13	0.39	0.43	0.64	0.44
N3	0.32	0.29	0.29	0.17	0.11	0.15	0.15	0.04	0.04	0.22	0.19	0.38	0.39	0.18	0.17	0.21	0.36	0.37	0.59	0.41
N6	0.13	0.17	0.14	0.06	0.16	0.05	0.04	0.01	0.08	0.12	0.20	0.19	0.18	0.08	0.23	0.07	0.21	0.29	0.42	0.25
N7	0.29	0.10	0.24	0.29	0.21	0.35	0.12	0.35	0.17	0.19	0.12	0.12	0.31	0.29	0.38	0.37	0.17	0.15	0.18	0.10
N9	0.48	0.28	0.43	0.41	0.18	0.48	0.15	0.42	0.22	0.33	0.16	0.35	0.54	0.41	0.31	0.52	0.11	0.07	0.19	0.05
O2'	0.82	0.56	0.85	0.80	0.14	0.87	0.10	0.74	0.34	0.58	0.35	0.69	1.01	0.83	0.08	0.88	0.26	0.15	0.26	0.18
O3'	0.10	0.11	0.13	0.23	0.34	0.23	0.34	0.30	0.18	0.06	0.23	0.04	0.23	0.29	0.42	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01
O4'	0.51	0.23	0.44	0.41	0.27	0.55	0.23	0.51	0.11	0.28	0.12	0.34	0.63	0.42	0.45	0.60	0.10	0.00	0.07	0.01
O5'	0.04	0.29	0.13	0.23	0.59	0.16	0.48	0.23	0.24	0.16	0.47	0.23	0.06	0.27	0.77	0.21	0.09	0.15	0.22	0.08
OP1	0.23	0.24	0.29	0.44	0.52	0.46	0.36	0.56	0.18	0.15	0.42	0.20	0.32	0.51	0.73	0.39	0.43	0.41	0.59	0.45
OP2	0.02	0.36	0.22	0.30	0.61	0.17	0.40	0.26	0.19	0.19	0.54	0.36	0.08	0.37	0.81	0.18	0.22	0.05	0.24	0.11
P	0.01	0.38	0.17	0.27	0.69	0.20	0.51	0.30	0.26	0.22	0.58	0.34	0.04	0.32	0.90	0.18	0.17	0.07	0.27	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.16	0.48	0.19
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.02	0.20	0.30	0.61	0.31
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.04	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.21	0.37	0.13
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.07	0.14	0.02	0.00	0.03	0.00	0.24	0.27	0.26	0.16
C4	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.28	0.42	0.65	0.41
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.06	0.02	0.04	0.00	0.01	0.11	0.28	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.00	0.03	0.30	0.40	0.61	0.40
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.10	0.01	0.08	0.00	0.06	0.04	0.09	0.06	0.07	0.03	0.11	0.00	0.00	0.10	0.19	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.07	0.01	0.03	0.27	0.31	0.56	0.33
N1	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.27	0.56	0.28
N3	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.00	0.01	0.24	0.38	0.66	0.37
O2	0.03	0.01	0.11	0.14	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.16	0.01	0.05	0.16	0.26	0.60	0.28
O2'	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.06	0.04	0.07	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.04	0.09	0.16	0.33	0.04
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.07	0.01	0.09	0.16	0.03	0.00	0.04	0.01	0.28	0.36	0.21	0.21
O4	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.29	0.47	0.65	0.44
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01	0.02	0.00	0.14	0.13	0.46	0.20
O5'	0.11	0.20	0.15	0.24	0.28	0.01	0.30	0.00	0.27	0.20	0.24	0.16	0.09	0.28	0.29	0.14	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.16	0.30	0.21	0.27	0.42	0.11	0.40	0.10	0.31	0.27	0.38	0.26	0.16	0.36	0.47	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.48	0.61	0.37	0.26	0.65	0.28	0.61	0.19	0.56	0.56	0.66	0.60	0.33	0.21	0.65	0.46	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.31	0.13	0.16	0.41	0.05	0.40	0.01	0.33	0.28	0.37	0.28	0.04	0.21	0.44	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00