Doublet Group distance statistics: 54822

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N1	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.000, 0.027, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C2	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.000, 0.032, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C1'	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.000, 0.294, 0.587, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.294 std_dev=0.294
C2'	A	0, 0.000, 0.350, 0.699, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.350 std_dev=0.350
O2'	A	0, 0.000, 0.379, 0.759, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.379 std_dev=0.379
O2	B	0, 0.000, 0.441, 0.882, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.441 std_dev=0.441
C2	B	0, 0.000, 0.460, 0.919, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.460 std_dev=0.460
C4'	A	0, 0.000, 0.489, 0.979, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.489 std_dev=0.489
N1	B	0, 0.000, 0.491, 0.981, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.491 std_dev=0.491
O5'	A	0, 0.000, 0.515, 1.030, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.515 std_dev=0.515
N3	B	0, 0.000, 0.517, 1.035, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.517 std_dev=0.517
C3'	A	0, 0.000, 0.539, 1.078, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.539 std_dev=0.539
C1'	B	0, 0.000, 0.546, 1.093, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.546 std_dev=0.546
C2'	B	0, 0.000, 0.581, 1.162, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.581 std_dev=0.581
C6	B	0, 0.000, 0.596, 1.192, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.596 std_dev=0.596
C4	B	0, 0.000, 0.647, 1.294, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.647 std_dev=0.647
C5	B	0, 0.000, 0.685, 1.369, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.685 std_dev=0.685
O4	B	0, 0.000, 0.744, 1.489, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.744 std_dev=0.744
C5'	A	0, 0.000, 0.792, 1.583, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.792 std_dev=0.792
O3'	A	0, 0.000, 0.793, 1.586, 1.586 max_d=1.586 avg_d=0.793 std_dev=0.793
O2'	B	0, 0.000, 0.917, 1.834, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.917 std_dev=0.917
P	A	0, 0.000, 1.037, 2.075, 2.075 max_d=2.075 avg_d=1.037 std_dev=1.037
O4'	B	0, 0.000, 1.217, 2.435, 2.435 max_d=2.435 avg_d=1.217 std_dev=1.217
OP2	A	0, 0.000, 1.220, 2.440, 2.440 max_d=2.440 avg_d=1.220 std_dev=1.220
OP1	A	0, 0.000, 1.350, 2.701, 2.701 max_d=2.701 avg_d=1.350 std_dev=1.350
O5'	B	0, 0.000, 1.377, 2.754, 2.754 max_d=2.754 avg_d=1.377 std_dev=1.377
C3'	B	0, 0.000, 1.385, 2.771, 2.771 max_d=2.771 avg_d=1.385 std_dev=1.385
C4'	B	0, 0.000, 1.558, 3.116, 3.116 max_d=3.116 avg_d=1.558 std_dev=1.558
O3'	B	0, 0.000, 1.692, 3.384, 3.384 max_d=3.384 avg_d=1.692 std_dev=1.692
P	B	0, 0.000, 1.753, 3.505, 3.505 max_d=3.505 avg_d=1.753 std_dev=1.753
C5'	B	0, 0.000, 2.113, 4.226, 4.226 max_d=4.226 avg_d=2.113 std_dev=2.113
OP2	B	0, 0.000, 2.200, 4.401, 4.401 max_d=4.401 avg_d=2.200 std_dev=2.200
OP1	B	0, 0.000, 3.006, 6.012, 6.012 max_d=6.012 avg_d=3.006 std_dev=3.006

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.00	0.22	0.07
C2	0.05	0.00	0.19	0.24	0.00	0.14	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.30	0.03	0.28	0.18	0.29	0.21
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.10	0.00	0.05	0.01	0.09	0.06	0.15	0.19	0.07	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.18	0.01
C3'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.13	0.00	0.07	0.00	0.12	0.09	0.19	0.23	0.08	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.11	0.17	0.13	0.04
C4	0.03	0.00	0.10	0.13	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.07	0.14	0.02	0.27	0.19	0.22	0.18
C4'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.05	0.11	0.13	0.05	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.15	0.21	0.01
C5	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.00	0.28	0.29	0.15	0.20
C5'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.03	0.14	0.16	0.07	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01
C6	0.04	0.00	0.09	0.12	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.15	0.01	0.30	0.31	0.16	0.22
C8	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.27	0.29	0.09	0.16
N1	0.04	0.00	0.15	0.19	0.01	0.11	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.13	0.24	0.02	0.29	0.25	0.23	0.22
N3	0.05	0.00	0.19	0.23	0.00	0.13	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.27	0.04	0.26	0.14	0.30	0.19
N6	0.03	0.00	0.07	0.08	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.10	0.01	0.30	0.37	0.10	0.23
N7	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.28	0.35	0.07	0.19
N9	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.25	0.16	0.19	0.15
O2'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.07	0.02	0.04	0.02	0.08	0.05	0.13	0.15	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.30	0.21	0.08
O3'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.14	0.01	0.08	0.01	0.15	0.09	0.24	0.27	0.10	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00	0.30	0.32	0.09	0.13
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.23	0.02	0.24	0.08
O5'	0.17	0.28	0.01	0.11	0.27	0.00	0.28	0.01	0.30	0.27	0.29	0.26	0.30	0.28	0.25	0.09	0.30	0.23	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.00	0.18	0.14	0.17	0.19	0.15	0.29	0.06	0.31	0.29	0.25	0.14	0.37	0.35	0.16	0.30	0.32	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.22	0.29	0.18	0.13	0.22	0.21	0.15	0.14	0.16	0.09	0.23	0.30	0.10	0.07	0.19	0.21	0.09	0.24	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.21	0.01	0.04	0.18	0.01	0.20	0.01	0.22	0.16	0.22	0.19	0.23	0.19	0.15	0.08	0.13	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.12	0.22	0.37	0.07	0.82	0.07	0.99	0.09	0.13	0.09	0.16	0.60	0.72	0.04	0.82	0.86	1.49	0.64	0.95
C2	0.05	0.03	0.32	0.02	0.11	0.48	0.09	0.67	0.07	0.01	0.07	0.00	0.39	0.30	0.15	0.57	0.75	1.57	0.25	0.85
C2'	0.08	0.09	0.45	0.09	0.08	0.53	0.05	0.65	0.04	0.06	0.09	0.12	0.76	0.45	0.08	0.63	0.61	1.15	0.35	0.68
C3'	0.10	0.20	0.45	0.06	0.18	0.39	0.12	0.46	0.09	0.11	0.22	0.27	0.79	0.43	0.20	0.53	0.46	0.85	0.23	0.50
C4	0.08	0.01	0.27	0.12	0.03	0.60	0.02	0.81	0.01	0.03	0.01	0.04	0.46	0.43	0.06	0.67	0.82	1.60	0.42	0.93
C4'	0.27	0.29	0.12	0.50	0.22	0.76	0.18	0.82	0.19	0.24	0.26	0.38	0.59	0.90	0.21	0.75	0.67	1.03	0.55	0.70
C5	0.01	0.08	0.27	0.01	0.10	0.47	0.09	0.71	0.08	0.06	0.10	0.07	0.39	0.29	0.12	0.53	0.77	1.61	0.33	0.90
C5'	0.38	0.42	0.09	0.68	0.34	0.76	0.29	0.76	0.28	0.36	0.39	0.52	0.42	1.11	0.33	0.71	0.60	0.82	0.55	0.61
C6	0.06	0.14	0.29	0.11	0.20	0.35	0.17	0.57	0.15	0.11	0.18	0.12	0.33	0.16	0.22	0.41	0.69	1.57	0.18	0.82
C8	0.06	0.01	0.19	0.25	0.01	0.70	0.02	0.94	0.03	0.03	0.00	0.02	0.49	0.52	0.01	0.72	0.88	1.60	0.58	0.99
N1	0.01	0.10	0.32	0.11	0.17	0.37	0.15	0.57	0.12	0.08	0.14	0.08	0.34	0.18	0.21	0.46	0.69	1.56	0.16	0.81
N3	0.11	0.03	0.29	0.09	0.04	0.59	0.03	0.78	0.01	0.04	0.01	0.06	0.44	0.43	0.08	0.67	0.80	1.58	0.38	0.90
N6	0.13	0.22	0.28	0.20	0.31	0.21	0.27	0.44	0.23	0.19	0.28	0.20	0.27	0.03	0.34	0.25	0.61	1.53	0.06	0.76
N7	0.05	0.10	0.22	0.08	0.07	0.50	0.07	0.77	0.07	0.07	0.09	0.09	0.40	0.32	0.08	0.52	0.81	1.63	0.43	0.94
N9	0.13	0.06	0.23	0.26	0.02	0.72	0.03	0.93	0.05	0.08	0.04	0.09	0.52	0.57	0.00	0.76	0.87	1.58	0.56	0.96
O2'	0.12	0.10	0.41	0.18	0.07	0.61	0.06	0.73	0.05	0.08	0.09	0.13	0.77	0.54	0.07	0.67	0.65	1.18	0.44	0.72
O3'	0.04	0.19	0.57	0.12	0.21	0.18	0.13	0.21	0.07	0.09	0.24	0.26	0.86	0.22	0.24	0.38	0.26	0.55	0.05	0.29
O4'	0.30	0.24	0.02	0.63	0.15	0.99	0.14	1.13	0.18	0.23	0.19	0.30	0.50	1.00	0.11	0.92	0.91	1.43	0.78	0.97
O5'	0.59	0.54	0.36	1.05	0.52	1.14	0.53	1.16	0.54	0.55	0.52	0.55	0.31	1.38	0.51	0.97	0.91	1.08	1.00	0.94
OP1	0.93	0.78	1.05	1.86	0.81	1.70	0.88	1.84	0.92	0.88	0.76	0.74	0.36	2.04	0.77	1.21	1.44	1.46	1.83	1.50
OP2	0.33	0.42	0.32	0.85	0.36	0.50	0.29	0.43	0.28	0.34	0.41	0.52	0.15	1.28	0.36	0.35	0.18	0.06	0.44	0.18
P	0.69	0.63	0.73	1.43	0.60	1.18	0.59	1.17	0.62	0.64	0.61	0.66	0.13	1.84	0.58	0.86	0.87	0.85	1.10	0.87

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.26	0.03	0.00	0.28	0.47	0.06	0.25
C2	0.05	0.00	0.21	0.30	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.01	0.01	0.15	0.37	0.73	0.24	0.35
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.05	0.01	0.21	0.18	0.25	0.00	0.13	0.39	0.00	0.02	0.04	0.01	0.59	0.57	0.36	0.56
C3'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.25	0.01	0.13	0.02	0.06	0.17	0.32	0.33	0.01	0.01	0.27	0.02	0.26	0.16	0.06	0.18
C4	0.03	0.01	0.05	0.25	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.33	0.05	0.00	0.02	0.40	0.88	0.33	0.41
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.05	0.04	0.06	0.02	0.26	0.01	0.08	0.00	0.01	0.11	0.10	0.02
C5	0.01	0.00	0.21	0.13	0.01	0.07	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.41	0.02	0.00	0.09	0.41	0.87	0.24	0.45
C5'	0.08	0.03	0.18	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.05	0.00	0.05	0.08	0.22	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.25	0.06	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.36	0.09	0.01	0.12	0.44	0.79	0.14	0.44
N1	0.01	0.01	0.00	0.17	0.02	0.04	0.02	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.17	0.07	0.02	0.02	0.38	0.69	0.16	0.36
N3	0.04	0.00	0.13	0.32	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.18	0.07	0.00	0.10	0.38	0.81	0.33	0.37
O2	0.09	0.00	0.39	0.33	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00	0.11	0.00	0.00	0.26	0.36	0.68	0.22	0.33
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.33	0.26	0.41	0.08	0.36	0.17	0.18	0.11	0.00	0.04	0.35	0.17	0.31	0.28	0.28	0.36
O3'	0.26	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.22	0.09	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.18	0.03	0.17	0.16	0.08
O4	0.03	0.01	0.04	0.27	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.35	0.08	0.00	0.01	0.38	0.91	0.38	0.40
O4'	0.00	0.15	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.01	0.12	0.02	0.10	0.26	0.17	0.18	0.01	0.00	0.02	0.28	0.28	0.03
O5'	0.28	0.37	0.59	0.26	0.40	0.01	0.41	0.01	0.44	0.38	0.38	0.36	0.31	0.03	0.38	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.47	0.73	0.57	0.16	0.88	0.11	0.87	0.09	0.79	0.69	0.81	0.68	0.28	0.17	0.91	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.06	0.24	0.36	0.06	0.33	0.10	0.24	0.07	0.14	0.16	0.33	0.22	0.28	0.16	0.38	0.28	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.25	0.35	0.56	0.18	0.41	0.02	0.45	0.02	0.44	0.36	0.37	0.33	0.36	0.08	0.40	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00