Doublet Group distance statistics: 54823

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.000, 0.019, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.000, 0.025, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C6	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C2'	A	0, 0.000, 0.039, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.039 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.000, 0.050, 0.101, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.050 std_dev=0.050
C3'	A	0, 0.000, 0.070, 0.140, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.070 std_dev=0.070
N6	A	0, 0.000, 0.072, 0.145, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.072 std_dev=0.072
O2'	A	0, 0.000, 0.080, 0.160, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.080 std_dev=0.080
C4'	A	0, 0.000, 0.144, 0.288, 0.288 max_d=0.288 avg_d=0.144 std_dev=0.144
O3'	A	0, 0.000, 0.280, 0.560, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.280 std_dev=0.280
C2	B	0, 0.000, 0.304, 0.609, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.304 std_dev=0.304
C4	B	0, 0.000, 0.336, 0.672, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.336 std_dev=0.336
C5'	A	0, 0.000, 0.342, 0.683, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.342 std_dev=0.342
C5	B	0, 0.000, 0.353, 0.706, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.353 std_dev=0.353
O2	B	0, 0.000, 0.365, 0.729, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.365 std_dev=0.365
N1	B	0, 0.000, 0.367, 0.735, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.367 std_dev=0.367
N3	B	0, 0.000, 0.371, 0.742, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.371 std_dev=0.371
O4	B	0, 0.000, 0.432, 0.864, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.432 std_dev=0.432
C6	B	0, 0.000, 0.461, 0.922, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.461 std_dev=0.461
O5'	A	0, 0.000, 0.477, 0.954, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.477 std_dev=0.477
O4'	B	0, 0.000, 0.483, 0.966, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.483 std_dev=0.483
C1'	B	0, 0.000, 0.498, 0.995, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.498 std_dev=0.498
C2'	B	0, 0.000, 0.507, 1.013, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.507 std_dev=0.507
C4'	B	0, 0.000, 0.555, 1.109, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.555 std_dev=0.555
C5'	B	0, 0.000, 0.583, 1.166, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.583 std_dev=0.583
OP1	B	0, 0.000, 0.723, 1.445, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.723 std_dev=0.723
P	A	0, 0.000, 0.788, 1.577, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.788 std_dev=0.788
OP2	A	0, 0.000, 0.885, 1.770, 1.770 max_d=1.770 avg_d=0.885 std_dev=0.885
C3'	B	0, 0.000, 0.885, 1.771, 1.771 max_d=1.771 avg_d=0.885 std_dev=0.885
OP1	A	0, 0.000, 1.078, 2.156, 2.156 max_d=2.156 avg_d=1.078 std_dev=1.078
O5'	B	0, 0.000, 1.088, 2.175, 2.175 max_d=2.175 avg_d=1.088 std_dev=1.088
O2'	B	0, 0.000, 1.125, 2.250, 2.250 max_d=2.250 avg_d=1.125 std_dev=1.125
P	B	0, 0.000, 1.150, 2.300, 2.300 max_d=2.300 avg_d=1.150 std_dev=1.150
O3'	B	0, 0.000, 1.433, 2.867, 2.867 max_d=2.867 avg_d=1.433 std_dev=1.433
OP2	B	0, 0.000, 1.766, 3.532, 3.532 max_d=3.532 avg_d=1.766 std_dev=1.766

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.12	0.00	0.21	0.34	0.17	0.04
C2	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.00	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.15	0.01	0.26	0.38	0.28	0.07
C2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.09	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.18	0.48	0.01	0.10
C3'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.41	0.04	0.12
C4	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.13	0.00	0.28	0.30	0.30	0.12
C4'	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.04	0.03	0.00	0.08	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.29	0.02	0.05
C5	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.13	0.01	0.31	0.23	0.36	0.17
C5'	0.05	0.07	0.09	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.13	0.11	0.11	0.06	0.17	0.12	0.08	0.09	0.03	0.00	0.00	0.16	0.09	0.00
C6	0.03	0.00	0.04	0.05	0.02	0.05	0.02	0.13	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.15	0.02	0.29	0.27	0.35	0.15
C8	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.11	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.34	0.12	0.39	0.24
N1	0.02	0.00	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.11	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.15	0.01	0.27	0.34	0.31	0.10
N3	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.15	0.01	0.25	0.39	0.25	0.06
N6	0.05	0.00	0.06	0.06	0.03	0.08	0.03	0.17	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.06	0.05	0.08	0.16	0.05	0.28	0.24	0.35	0.16
N7	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.12	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.34	0.11	0.42	0.25
N9	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.08	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.11	0.00	0.29	0.26	0.29	0.14
O2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.09	0.06	0.03	0.06	0.03	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.15	0.59	0.05	0.18
O3'	0.12	0.15	0.02	0.01	0.13	0.02	0.13	0.03	0.15	0.09	0.15	0.15	0.16	0.09	0.11	0.01	0.00	0.12	0.03	0.38	0.06	0.13
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.12	0.00	0.16	0.22	0.19	0.10
O5'	0.21	0.26	0.18	0.09	0.28	0.01	0.31	0.00	0.29	0.34	0.27	0.25	0.28	0.34	0.29	0.15	0.03	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.34	0.38	0.48	0.41	0.30	0.29	0.23	0.16	0.27	0.12	0.34	0.39	0.24	0.11	0.26	0.59	0.38	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.28	0.01	0.04	0.30	0.02	0.36	0.09	0.35	0.39	0.31	0.25	0.35	0.42	0.29	0.05	0.06	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.07	0.10	0.12	0.12	0.05	0.17	0.00	0.15	0.24	0.10	0.06	0.16	0.25	0.14	0.18	0.13	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.12	0.21	0.56	0.08	0.35	0.23	0.30	0.30	0.24	0.04	0.08	0.01	0.40	0.08	0.29	0.44	0.22	0.34	0.19
C2	0.24	0.04	0.14	0.59	0.04	0.39	0.15	0.38	0.26	0.18	0.05	0.00	0.13	0.60	0.16	0.30	0.49	0.20	0.55	0.25
C2'	0.22	0.14	0.17	0.55	0.12	0.32	0.21	0.25	0.26	0.21	0.09	0.12	0.12	0.41	0.01	0.24	0.33	0.17	0.17	0.07
C3'	0.24	0.16	0.18	0.54	0.14	0.32	0.21	0.25	0.25	0.22	0.11	0.15	0.12	0.38	0.05	0.24	0.34	0.17	0.17	0.08
C4	0.29	0.08	0.21	0.57	0.02	0.38	0.21	0.34	0.32	0.24	0.04	0.03	0.13	0.44	0.19	0.32	0.49	0.25	0.44	0.25
C4'	0.22	0.07	0.16	0.48	0.04	0.28	0.17	0.24	0.23	0.18	0.01	0.03	0.08	0.25	0.08	0.22	0.40	0.21	0.28	0.16
C5	0.32	0.03	0.25	0.54	0.10	0.37	0.15	0.34	0.31	0.23	0.11	0.01	0.22	0.35	0.26	0.34	0.53	0.30	0.47	0.30
C5'	0.09	0.06	0.05	0.30	0.11	0.13	0.02	0.10	0.09	0.05	0.16	0.10	0.20	0.01	0.22	0.09	0.28	0.13	0.14	0.06
C6	0.29	0.03	0.22	0.53	0.15	0.39	0.07	0.38	0.25	0.18	0.15	0.06	0.28	0.40	0.27	0.34	0.58	0.32	0.57	0.35
C8	0.32	0.08	0.27	0.50	0.04	0.32	0.18	0.27	0.30	0.25	0.07	0.03	0.15	0.22	0.22	0.29	0.47	0.29	0.36	0.25
N1	0.23	0.02	0.15	0.55	0.11	0.39	0.08	0.40	0.22	0.15	0.11	0.05	0.21	0.54	0.23	0.30	0.55	0.26	0.63	0.32
N3	0.26	0.07	0.17	0.60	0.00	0.39	0.20	0.36	0.29	0.21	0.01	0.04	0.08	0.56	0.14	0.31	0.47	0.20	0.47	0.22
N6	0.27	0.11	0.23	0.46	0.22	0.36	0.02	0.38	0.17	0.11	0.23	0.15	0.39	0.28	0.32	0.34	0.65	0.40	0.62	0.44
N7	0.33	0.03	0.29	0.48	0.11	0.32	0.13	0.28	0.30	0.24	0.13	0.02	0.24	0.19	0.27	0.31	0.50	0.31	0.40	0.29
N9	0.30	0.10	0.23	0.55	0.02	0.35	0.22	0.31	0.32	0.25	0.01	0.06	0.09	0.36	0.16	0.30	0.47	0.25	0.38	0.23
O2'	0.16	0.12	0.09	0.54	0.13	0.29	0.18	0.21	0.20	0.16	0.10	0.10	0.22	0.49	0.06	0.19	0.25	0.09	0.06	0.03
O3'	0.19	0.15	0.14	0.53	0.15	0.28	0.19	0.20	0.22	0.19	0.12	0.13	0.16	0.43	0.10	0.19	0.27	0.07	0.12	0.01
O4'	0.28	0.10	0.23	0.53	0.05	0.33	0.21	0.30	0.30	0.23	0.00	0.06	0.04	0.30	0.10	0.29	0.48	0.26	0.40	0.24
O5'	0.58	0.47	0.55	0.79	0.39	0.61	0.47	0.54	0.55	0.54	0.38	0.45	0.24	0.49	0.26	0.56	0.69	0.56	0.47	0.45
OP1	0.02	0.01	0.02	0.17	0.27	0.02	0.27	0.12	0.15	0.05	0.11	0.13	0.36	0.09	0.41	0.01	0.00	0.08	0.38	0.28
OP2	0.51	0.33	0.47	0.61	0.13	0.52	0.26	0.47	0.39	0.42	0.17	0.34	0.18	0.21	0.05	0.51	0.66	0.60	0.39	0.45
P	0.36	0.25	0.31	0.50	0.06	0.38	0.13	0.30	0.25	0.29	0.13	0.29	0.01	0.18	0.09	0.36	0.46	0.37	0.16	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.10	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.28	0.06	0.01	0.01	0.15	0.25	0.10
C2	0.00	0.00	0.13	0.22	0.03	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.09	0.04	0.09	0.00	0.10	0.23	0.14
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.02	0.01	0.11	0.20	0.13	0.01	0.09	0.22	0.00	0.04	0.03	0.01	0.23	0.06	0.58	0.31
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.34	0.01	0.36	0.01	0.31	0.23	0.31	0.14	0.01	0.01	0.35	0.02	0.22	0.11	0.29	0.17
C4	0.05	0.03	0.02	0.34	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.35	0.21	0.01	0.06	0.01	0.00	0.24	0.22
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.12	0.06	0.05	0.04	0.29	0.02	0.07	0.00	0.00	0.22	0.04	0.01
C5	0.05	0.01	0.11	0.36	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.37	0.30	0.01	0.00	0.01	0.00	0.24	0.22
C5'	0.10	0.08	0.20	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.11	0.10	0.20	0.04	0.03	0.01	0.13	0.05	0.02
C6	0.04	0.01	0.13	0.31	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.32	0.21	0.01	0.03	0.00	0.03	0.25	0.19
N1	0.01	0.00	0.01	0.23	0.04	0.06	0.03	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.02	0.04	0.02	0.01	0.10	0.24	0.14
N3	0.01	0.00	0.09	0.31	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.00	0.00	0.01	0.23	0.06	0.03	0.07	0.01	0.07	0.23	0.17
O2	0.02	0.00	0.22	0.14	0.03	0.04	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.27	0.04	0.13	0.01	0.14	0.23	0.12
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.35	0.29	0.37	0.10	0.32	0.18	0.23	0.00	0.00	0.08	0.38	0.21	0.15	0.49	0.35	0.07
O3'	0.28	0.09	0.04	0.01	0.21	0.02	0.30	0.20	0.21	0.02	0.06	0.27	0.08	0.00	0.25	0.20	0.00	0.56	0.13	0.21
O4	0.06	0.04	0.03	0.35	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.38	0.25	0.00	0.07	0.02	0.03	0.25	0.24
O4'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.06	0.00	0.00	0.03	0.03	0.02	0.07	0.13	0.21	0.20	0.07	0.00	0.13	0.21	0.00	0.05
O5'	0.01	0.00	0.23	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.00	0.02	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.15	0.10	0.06	0.11	0.00	0.22	0.00	0.13	0.03	0.10	0.07	0.14	0.49	0.56	0.03	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.25	0.23	0.58	0.29	0.24	0.04	0.24	0.05	0.25	0.24	0.23	0.23	0.35	0.13	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.14	0.31	0.17	0.22	0.01	0.22	0.02	0.19	0.14	0.17	0.12	0.07	0.21	0.24	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00