Doublet Group distance statistics: 54829

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 9, 11, 14, 8, 5, 2, 1, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.007, 0.013, 0.018, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.015 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.014, 0.029, 0.045, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.029 std_dev=0.016
O4	A	0, 0.013, 0.051, 0.089, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.051 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.047, 0.144, 0.241, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.144 std_dev=0.097
O2'	A	0, 0.136, 0.251, 0.367, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.251 std_dev=0.116
O4'	A	0, -0.019, 0.102, 0.223, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.102 std_dev=0.121
C4	B	0, 0.163, 0.301, 0.439, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.301 std_dev=0.138
C5	B	0, 0.146, 0.292, 0.438, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.292 std_dev=0.146
C3'	A	0, 0.012, 0.185, 0.358, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.185 std_dev=0.173
C4'	A	0, -0.003, 0.175, 0.353, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.175 std_dev=0.178
N3	B	0, 0.180, 0.360, 0.539, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.360 std_dev=0.180
N4	B	0, 0.133, 0.321, 0.509, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.321 std_dev=0.188
C2	B	0, 0.190, 0.384, 0.579, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.384 std_dev=0.195
C6	B	0, 0.142, 0.342, 0.542, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.342 std_dev=0.200
N1	B	0, 0.166, 0.380, 0.593, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.380 std_dev=0.214
O2	B	0, 0.197, 0.449, 0.701, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.449 std_dev=0.252
O5'	A	0, 0.009, 0.267, 0.525, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.267 std_dev=0.258
O3'	A	0, 0.013, 0.275, 0.537, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.275 std_dev=0.262
C5'	A	0, -0.031, 0.268, 0.566, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.268 std_dev=0.299
C1'	B	0, 0.145, 0.466, 0.787, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.466 std_dev=0.321
P	A	0, -0.012, 0.370, 0.752, 1.768 max_d=1.768 avg_d=0.370 std_dev=0.382
OP2	A	0, 0.060, 0.458, 0.856, 2.028 max_d=2.028 avg_d=0.458 std_dev=0.398
O4'	B	0, 0.113, 0.517, 0.922, 1.932 max_d=1.932 avg_d=0.517 std_dev=0.404
C2'	B	0, 0.102, 0.517, 0.931, 2.038 max_d=2.038 avg_d=0.517 std_dev=0.414
OP1	A	0, -0.022, 0.425, 0.872, 2.096 max_d=2.096 avg_d=0.425 std_dev=0.447
O2'	B	0, 0.100, 0.592, 1.084, 2.476 max_d=2.476 avg_d=0.592 std_dev=0.492
C3'	B	0, 0.067, 0.568, 1.069, 2.681 max_d=2.681 avg_d=0.568 std_dev=0.501
C4'	B	0, 0.059, 0.581, 1.102, 2.704 max_d=2.704 avg_d=0.581 std_dev=0.522
C5'	B	0, 0.008, 0.609, 1.209, 3.355 max_d=3.355 avg_d=0.609 std_dev=0.601
O3'	B	0, 0.036, 0.661, 1.287, 3.561 max_d=3.561 avg_d=0.661 std_dev=0.626
O5'	B	0, -0.266, 0.657, 1.579, 4.207 max_d=4.207 avg_d=0.657 std_dev=0.923
P	B	0, -0.424, 0.698, 1.821, 5.137 max_d=5.137 avg_d=0.698 std_dev=1.122
OP2	B	0, -0.541, 0.663, 1.866, 6.656 max_d=6.656 avg_d=0.663 std_dev=1.203
OP1	B	0, -0.637, 0.858, 2.353, 6.407 max_d=6.407 avg_d=0.858 std_dev=1.495

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.07	0.04
C2	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.08	0.01	0.03	0.10	0.11	0.15	0.13
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.10	0.00	0.02	0.05	0.01	0.06	0.08	0.09	0.06
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.04	0.07	0.09	0.01	0.01	0.07	0.02	0.06	0.09	0.08	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.04	0.18	0.22	0.26	0.24
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.03	0.19	0.23	0.26	0.24
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.14	0.00	0.16	0.00	0.14	0.08	0.11	0.04	0.06	0.03	0.16	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.03	0.16	0.17	0.18	0.18
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.10	0.11	0.13	0.11
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.01	0.04	0.14	0.17	0.22	0.19
O2	0.02	0.00	0.10	0.09	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.11	0.01	0.04	0.07	0.08	0.13	0.09
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.06	0.03	0.02	0.07	0.12	0.00	0.04	0.06	0.04	0.03	0.08	0.05	0.03
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.09	0.02	0.08	0.03	0.08	0.04	0.09	0.11	0.04	0.00	0.10	0.02	0.05	0.10	0.08	0.06
O4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.19	0.25	0.30	0.27
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.00	0.07	0.07	0.09	0.07
O5'	0.04	0.10	0.06	0.06	0.18	0.01	0.19	0.01	0.16	0.10	0.14	0.07	0.03	0.05	0.19	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.05	0.11	0.08	0.09	0.22	0.05	0.23	0.05	0.17	0.11	0.17	0.08	0.08	0.10	0.25	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.15	0.09	0.08	0.26	0.03	0.26	0.02	0.18	0.13	0.22	0.13	0.05	0.08	0.30	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.13	0.06	0.06	0.24	0.02	0.24	0.01	0.18	0.11	0.19	0.09	0.03	0.06	0.27	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.10	0.16	0.21	0.10	0.19	0.16	0.22	0.16	0.12	0.10	0.09	0.10	0.15	0.23	0.17	0.76	1.02	1.14	0.92
C2	0.17	0.10	0.19	0.25	0.09	0.24	0.17	0.26	0.19	0.15	0.08	0.10	0.09	0.18	0.27	0.21	0.79	1.05	1.19	0.96
C2'	0.13	0.13	0.10	0.14	0.10	0.15	0.13	0.18	0.13	0.12	0.13	0.10	0.16	0.11	0.14	0.16	0.62	0.85	1.02	0.79
C3'	0.14	0.14	0.10	0.13	0.10	0.15	0.12	0.18	0.13	0.13	0.14	0.09	0.18	0.11	0.15	0.16	0.62	0.88	1.05	0.81
C4	0.22	0.12	0.24	0.32	0.10	0.31	0.17	0.34	0.21	0.18	0.10	0.11	0.11	0.24	0.36	0.27	0.83	1.16	1.25	1.04
C4'	0.11	0.11	0.13	0.19	0.10	0.16	0.14	0.20	0.14	0.11	0.12	0.09	0.14	0.12	0.22	0.14	0.73	1.02	1.13	0.91
C5	0.19	0.10	0.21	0.29	0.09	0.28	0.16	0.32	0.20	0.16	0.08	0.10	0.09	0.21	0.33	0.24	0.83	1.16	1.25	1.04
C5'	0.11	0.11	0.15	0.23	0.10	0.20	0.16	0.24	0.15	0.11	0.12	0.10	0.15	0.14	0.27	0.15	0.79	1.12	1.21	0.98
C6	0.17	0.09	0.19	0.26	0.09	0.25	0.16	0.28	0.19	0.14	0.08	0.09	0.08	0.18	0.29	0.21	0.81	1.13	1.23	1.01
N1	0.16	0.09	0.18	0.24	0.09	0.23	0.17	0.25	0.18	0.14	0.08	0.09	0.08	0.17	0.26	0.20	0.79	1.07	1.19	0.97
N3	0.21	0.12	0.23	0.30	0.10	0.28	0.17	0.31	0.21	0.18	0.10	0.12	0.11	0.23	0.33	0.25	0.82	1.10	1.23	1.01
O2	0.16	0.10	0.18	0.23	0.09	0.21	0.17	0.23	0.18	0.15	0.09	0.11	0.09	0.17	0.24	0.20	0.76	0.98	1.12	0.91
O2'	0.16	0.15	0.12	0.14	0.12	0.17	0.15	0.19	0.16	0.15	0.14	0.10	0.18	0.13	0.14	0.19	0.60	0.80	0.96	0.76
O3'	0.21	0.20	0.14	0.15	0.13	0.20	0.15	0.22	0.17	0.18	0.18	0.11	0.24	0.17	0.15	0.23	0.56	0.79	0.98	0.74
O4	0.25	0.15	0.28	0.36	0.12	0.35	0.17	0.38	0.23	0.21	0.11	0.13	0.14	0.29	0.41	0.30	0.84	1.18	1.24	1.05
O4'	0.17	0.13	0.22	0.28	0.13	0.25	0.19	0.27	0.20	0.16	0.12	0.12	0.13	0.21	0.31	0.20	0.83	1.13	1.20	0.99
O5'	0.14	0.10	0.18	0.26	0.11	0.24	0.18	0.28	0.19	0.13	0.10	0.10	0.11	0.16	0.29	0.19	0.84	1.18	1.27	1.04
OP1	0.13	0.11	0.17	0.26	0.11	0.23	0.18	0.29	0.18	0.12	0.12	0.11	0.14	0.15	0.29	0.18	0.85	1.22	1.30	1.07
OP2	0.22	0.12	0.26	0.35	0.15	0.34	0.25	0.40	0.27	0.20	0.11	0.12	0.10	0.23	0.38	0.29	0.95	1.33	1.39	1.17
P	0.16	0.09	0.21	0.30	0.11	0.28	0.20	0.34	0.21	0.14	0.09	0.09	0.09	0.18	0.33	0.22	0.90	1.28	1.33	1.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.19	0.19	0.22	0.19
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.34	0.36	0.46	0.37
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.09	0.00	0.02	0.01	0.17	0.19	0.12	0.15
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.03	0.05	0.05	0.08	0.02	0.01	0.01	0.17	0.22	0.05	0.12
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.46	0.54	0.67	0.53
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.09	0.11	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.03	0.48	0.55	0.69	0.54
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.03	0.04	0.07	0.03	0.06	0.02	0.01	0.01	0.16	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.02	0.43	0.45	0.54	0.45
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.33	0.34	0.41	0.35
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.41	0.46	0.58	0.45
N4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.03	0.49	0.61	0.75	0.58
O2	0.02	0.01	0.09	0.08	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.10	0.02	0.27	0.29	0.37	0.29
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.06	0.03	0.06	0.03	0.03	0.07	0.06	0.10	0.00	0.04	0.04	0.05	0.09	0.06	0.04
O3'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.08	0.03	0.06	0.06	0.10	0.04	0.00	0.01	0.08	0.17	0.20	0.05
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.12	0.14	0.16	0.13
O5'	0.19	0.34	0.17	0.17	0.46	0.01	0.48	0.01	0.43	0.33	0.41	0.49	0.27	0.05	0.08	0.12	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.19	0.36	0.19	0.22	0.54	0.09	0.55	0.16	0.45	0.34	0.46	0.61	0.29	0.09	0.17	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.46	0.12	0.05	0.67	0.11	0.69	0.20	0.54	0.41	0.58	0.75	0.37	0.06	0.20	0.16	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.37	0.15	0.12	0.53	0.02	0.54	0.01	0.45	0.35	0.45	0.58	0.29	0.04	0.05	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00