Doublet Group distance statistics: 54831

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 6, 5, 4, 6, 3, 2, 1, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 4, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.009, 0.013, 0.017, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.002, 0.015, 0.029, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.017 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.023, 0.046, 0.068, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.046 std_dev=0.022
O4	A	0, 0.026, 0.058, 0.091, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.058 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.005, 0.100, 0.195, 0.560 max_d=0.560 avg_d=0.100 std_dev=0.095
C2'	A	0, 0.026, 0.123, 0.220, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.123 std_dev=0.097
O2'	A	0, 0.042, 0.173, 0.304, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.173 std_dev=0.131
C4'	A	0, 0.030, 0.194, 0.358, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.194 std_dev=0.164
C3'	A	0, 0.039, 0.210, 0.382, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.210 std_dev=0.171
O3'	A	0, 0.074, 0.323, 0.572, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.323 std_dev=0.249
C5'	A	0, 0.039, 0.320, 0.602, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.320 std_dev=0.282
O5'	A	0, 0.063, 0.350, 0.637, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.350 std_dev=0.287
C4	B	0, 0.224, 0.572, 0.920, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.572 std_dev=0.348
C5	B	0, 0.206, 0.577, 0.947, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.577 std_dev=0.370
N4	B	0, 0.209, 0.597, 0.985, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.597 std_dev=0.388
N3	B	0, 0.259, 0.658, 1.057, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.658 std_dev=0.399
C6	B	0, 0.245, 0.662, 1.079, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.662 std_dev=0.417
P	A	0, 0.044, 0.468, 0.892, 1.716 max_d=1.716 avg_d=0.468 std_dev=0.424
N1	B	0, 0.230, 0.677, 1.125, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.677 std_dev=0.448
C2	B	0, 0.234, 0.683, 1.132, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.683 std_dev=0.449
OP2	A	0, 0.017, 0.513, 1.008, 2.051 max_d=2.051 avg_d=0.513 std_dev=0.495
OP1	A	0, 0.078, 0.576, 1.074, 2.051 max_d=2.051 avg_d=0.576 std_dev=0.498
C1'	B	0, 0.300, 0.818, 1.336, 1.975 max_d=1.975 avg_d=0.818 std_dev=0.518
O2	B	0, 0.283, 0.810, 1.336, 1.962 max_d=1.962 avg_d=0.810 std_dev=0.526
O4'	B	0, 0.400, 0.960, 1.520, 2.031 max_d=2.031 avg_d=0.960 std_dev=0.560
C2'	B	0, 0.305, 0.943, 1.582, 2.228 max_d=2.228 avg_d=0.943 std_dev=0.638
C4'	B	0, 0.380, 1.109, 1.837, 2.504 max_d=2.504 avg_d=1.109 std_dev=0.728
C3'	B	0, 0.324, 1.059, 1.794, 2.405 max_d=2.405 avg_d=1.059 std_dev=0.735
O2'	B	0, 0.335, 1.116, 1.896, 2.779 max_d=2.779 avg_d=1.116 std_dev=0.780
C5'	B	0, 0.276, 1.231, 2.186, 3.899 max_d=3.899 avg_d=1.231 std_dev=0.955
O3'	B	0, 0.340, 1.301, 2.262, 3.148 max_d=3.148 avg_d=1.301 std_dev=0.961
O5'	B	0, 0.139, 1.125, 2.110, 4.098 max_d=4.098 avg_d=1.125 std_dev=0.985
OP2	B	0, -0.097, 1.036, 2.169, 4.392 max_d=4.392 avg_d=1.036 std_dev=1.133
P	B	0, -0.066, 1.186, 2.438, 4.930 max_d=4.930 avg_d=1.186 std_dev=1.252
OP1	B	0, -0.013, 1.511, 3.034, 5.858 max_d=5.858 avg_d=1.511 std_dev=1.523

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.06	0.10	0.07
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.16	0.16	0.26	0.19
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.04	0.10	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.09	0.09	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.12	0.06	0.08	0.08	0.01	0.01	0.12	0.01	0.07	0.12	0.11	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.08	0.01	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.00	0.03	0.27	0.33	0.42	0.34
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.09	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
C5	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.02	0.04	0.28	0.34	0.41	0.34
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.16	0.00	0.18	0.00	0.14	0.07	0.11	0.03	0.04	0.02	0.18	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.02	0.09	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.02	0.04	0.23	0.25	0.29	0.25
N1	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.15	0.15	0.21	0.17
N3	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.03	0.22	0.25	0.35	0.27
O2	0.03	0.00	0.10	0.08	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.10	0.01	0.05	0.11	0.11	0.22	0.15
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.06	0.13	0.00	0.03	0.04	0.04	0.03	0.08	0.06	0.03
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.12	0.02	0.15	0.02	0.13	0.05	0.09	0.10	0.03	0.00	0.14	0.01	0.10	0.18	0.16	0.14
O4	0.02	0.01	0.03	0.12	0.00	0.09	0.02	0.18	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.04	0.30	0.38	0.48	0.38
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.04	0.00	0.06	0.07	0.08	0.08
O5'	0.06	0.16	0.04	0.07	0.27	0.01	0.28	0.01	0.23	0.15	0.22	0.11	0.03	0.10	0.30	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.16	0.09	0.12	0.33	0.05	0.34	0.04	0.25	0.15	0.25	0.11	0.08	0.18	0.38	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.26	0.09	0.11	0.42	0.02	0.41	0.01	0.29	0.21	0.35	0.22	0.06	0.16	0.48	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.19	0.04	0.08	0.34	0.01	0.34	0.01	0.25	0.17	0.27	0.15	0.03	0.14	0.38	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.21	0.20	0.19	0.24	0.26	0.27	0.39	0.26	0.22	0.23	0.27	0.22	0.21	0.17	0.26	0.46	0.62	0.66	0.61
C2	0.17	0.12	0.18	0.27	0.12	0.30	0.17	0.42	0.19	0.15	0.13	0.15	0.12	0.16	0.30	0.22	0.49	0.66	0.68	0.62
C2'	0.21	0.22	0.19	0.19	0.26	0.29	0.29	0.45	0.28	0.21	0.28	0.35	0.24	0.21	0.17	0.28	0.54	0.74	0.77	0.73
C3'	0.20	0.22	0.19	0.18	0.25	0.29	0.28	0.46	0.27	0.20	0.27	0.32	0.25	0.22	0.16	0.28	0.55	0.78	0.79	0.76
C4	0.21	0.12	0.28	0.41	0.11	0.41	0.16	0.55	0.20	0.17	0.12	0.16	0.12	0.26	0.49	0.26	0.61	0.87	0.82	0.76
C4'	0.21	0.22	0.21	0.17	0.24	0.25	0.28	0.39	0.27	0.22	0.25	0.26	0.25	0.25	0.14	0.26	0.47	0.65	0.68	0.64
C5	0.19	0.12	0.22	0.36	0.13	0.39	0.17	0.55	0.21	0.16	0.14	0.18	0.12	0.19	0.41	0.27	0.61	0.88	0.84	0.79
C5'	0.21	0.22	0.22	0.17	0.24	0.24	0.27	0.38	0.26	0.22	0.25	0.26	0.25	0.25	0.15	0.25	0.46	0.65	0.68	0.64
C6	0.18	0.15	0.17	0.27	0.17	0.33	0.20	0.49	0.22	0.17	0.18	0.22	0.15	0.15	0.30	0.26	0.56	0.81	0.80	0.74
N1	0.18	0.15	0.16	0.24	0.17	0.29	0.21	0.43	0.22	0.17	0.18	0.21	0.16	0.16	0.24	0.24	0.50	0.70	0.72	0.66
N3	0.19	0.12	0.26	0.37	0.11	0.36	0.15	0.48	0.19	0.16	0.12	0.15	0.12	0.24	0.44	0.23	0.55	0.75	0.75	0.68
O2	0.17	0.13	0.17	0.24	0.11	0.26	0.17	0.35	0.18	0.15	0.12	0.12	0.13	0.16	0.25	0.20	0.42	0.53	0.57	0.52
O2'	0.20	0.23	0.20	0.15	0.25	0.26	0.28	0.41	0.27	0.20	0.29	0.34	0.26	0.24	0.13	0.27	0.50	0.67	0.71	0.67
O3'	0.20	0.25	0.21	0.18	0.26	0.29	0.28	0.49	0.27	0.20	0.31	0.33	0.31	0.25	0.16	0.29	0.58	0.82	0.83	0.80
O4	0.25	0.15	0.35	0.50	0.13	0.46	0.18	0.60	0.23	0.21	0.13	0.16	0.15	0.34	0.61	0.29	0.64	0.93	0.84	0.79
O4'	0.24	0.25	0.23	0.20	0.26	0.25	0.28	0.36	0.27	0.24	0.27	0.28	0.26	0.26	0.17	0.26	0.43	0.58	0.62	0.57
O5'	0.23	0.23	0.22	0.20	0.26	0.28	0.29	0.43	0.28	0.23	0.26	0.29	0.24	0.24	0.17	0.27	0.50	0.72	0.72	0.68
OP1	0.22	0.22	0.21	0.19	0.25	0.28	0.29	0.45	0.28	0.22	0.25	0.28	0.25	0.24	0.16	0.28	0.52	0.76	0.74	0.72
OP2	0.27	0.26	0.26	0.28	0.30	0.35	0.34	0.50	0.33	0.27	0.29	0.33	0.26	0.27	0.26	0.32	0.56	0.81	0.77	0.75
P	0.23	0.23	0.22	0.21	0.26	0.28	0.30	0.43	0.29	0.23	0.26	0.29	0.24	0.24	0.17	0.28	0.50	0.73	0.71	0.69

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.06	0.05
C2	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.08	0.03	0.11	0.11	0.16	0.12
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.06	0.04	0.16	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.06	0.03
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.15	0.05	0.06	0.09	0.13	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.06	0.05
C4	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.17	0.20	0.26	0.21
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.03	0.03	0.06	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.08	0.14	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.18	0.03	0.20	0.23	0.28	0.23
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.11	0.00	0.14	0.00	0.12	0.06	0.08	0.12	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.15	0.01	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.18	0.04	0.18	0.17	0.20	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.11	0.11	0.14	0.11
N3	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.14	0.15	0.21	0.17
N4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.02	0.18	0.23	0.30	0.24
O2	0.02	0.00	0.16	0.13	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.18	0.05	0.09	0.09	0.13	0.09
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.04	0.03	0.05	0.03	0.06	0.02	0.08	0.04	0.18	0.00	0.03	0.04	0.03	0.06	0.05	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.10	0.01	0.18	0.03	0.18	0.05	0.07	0.11	0.18	0.03	0.00	0.01	0.10	0.11	0.09	0.09
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.00	0.08	0.09	0.06	0.06
O5'	0.06	0.11	0.03	0.05	0.17	0.01	0.20	0.01	0.18	0.11	0.14	0.18	0.09	0.03	0.10	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.11	0.07	0.08	0.20	0.07	0.23	0.08	0.17	0.11	0.15	0.23	0.09	0.06	0.11	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.16	0.06	0.06	0.26	0.02	0.28	0.01	0.20	0.14	0.21	0.30	0.13	0.05	0.09	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.12	0.03	0.05	0.21	0.01	0.23	0.01	0.17	0.11	0.17	0.24	0.09	0.03	0.09	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00