Doublet Group distance statistics: 54832

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.016, 0.028, 0.040, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.028 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.021, 0.036, 0.052, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.036 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.024, 0.041, 0.057, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.041 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.023, 0.040, 0.056, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.040 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.018, 0.035, 0.053, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.035 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.049, 0.091, 0.133, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.091 std_dev=0.042
O4	A	0, 0.093, 0.161, 0.230, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.161 std_dev=0.068
O4'	A	0, 0.054, 0.148, 0.243, 0.342 max_d=0.342 avg_d=0.148 std_dev=0.094
C2'	A	0, 0.080, 0.182, 0.285, 0.335 max_d=0.335 avg_d=0.182 std_dev=0.103
O2'	A	0, 0.116, 0.243, 0.369, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.243 std_dev=0.127
C4'	A	0, 0.094, 0.259, 0.424, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.259 std_dev=0.165
C3'	A	0, 0.076, 0.260, 0.444, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.260 std_dev=0.184
O5'	A	0, 0.135, 0.354, 0.573, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.354 std_dev=0.219
C5'	A	0, 0.094, 0.323, 0.552, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.323 std_dev=0.229
C5	B	0, 0.344, 0.663, 0.983, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.663 std_dev=0.320
O3'	A	0, 0.121, 0.473, 0.826, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.473 std_dev=0.352
P	A	0, 0.228, 0.645, 1.063, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.645 std_dev=0.418
C6	B	0, 0.406, 0.861, 1.315, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.861 std_dev=0.455
N1	B	0, 0.391, 0.848, 1.306, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.848 std_dev=0.458
OP2	A	0, 0.269, 0.773, 1.278, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.773 std_dev=0.504
C4	B	0, 0.379, 0.890, 1.401, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.890 std_dev=0.511
OP1	A	0, 0.273, 0.800, 1.327, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.800 std_dev=0.527
C2	B	0, 0.359, 0.904, 1.450, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.904 std_dev=0.546
C2'	B	0, 0.315, 0.955, 1.595, 2.190 max_d=2.190 avg_d=0.955 std_dev=0.640
N3	B	0, 0.432, 1.089, 1.745, 2.054 max_d=2.054 avg_d=1.089 std_dev=0.656
O2'	B	0, 0.377, 1.042, 1.706, 2.422 max_d=2.422 avg_d=1.042 std_dev=0.664
C1'	B	0, 0.475, 1.148, 1.820, 2.238 max_d=2.238 avg_d=1.148 std_dev=0.673
N4	B	0, 0.498, 1.180, 1.863, 1.887 max_d=1.887 avg_d=1.180 std_dev=0.683
O2	B	0, 0.380, 1.075, 1.770, 2.360 max_d=2.360 avg_d=1.075 std_dev=0.695
C3'	B	0, 0.565, 1.690, 2.814, 3.250 max_d=3.250 avg_d=1.690 std_dev=1.124
O4'	B	0, 0.702, 1.870, 3.038, 3.351 max_d=3.351 avg_d=1.870 std_dev=1.168
OP2	B	0, 0.792, 2.171, 3.551, 3.546 max_d=3.546 avg_d=2.171 std_dev=1.380
C4'	B	0, 0.759, 2.150, 3.542, 3.930 max_d=3.930 avg_d=2.150 std_dev=1.392
O3'	B	0, 0.722, 2.214, 3.706, 4.042 max_d=4.042 avg_d=2.214 std_dev=1.492
O5'	B	0, 0.829, 2.422, 4.014, 4.142 max_d=4.142 avg_d=2.422 std_dev=1.592
C5'	B	0, 0.919, 2.764, 4.609, 4.765 max_d=4.765 avg_d=2.764 std_dev=1.845
P	B	0, 0.977, 2.956, 4.935, 4.822 max_d=4.822 avg_d=2.956 std_dev=1.979
OP1	B	0, 1.312, 3.944, 6.576, 6.405 max_d=6.405 avg_d=3.944 std_dev=2.632

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.05	0.13	0.09
C2	0.01	0.00	0.05	0.08	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.09	0.01	0.02	0.09	0.10	0.21	0.16
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.06	0.00	0.02	0.06	0.01	0.06	0.13	0.09	0.08
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.03	0.09	0.07	0.10	0.07	0.02	0.01	0.12	0.01	0.06	0.15	0.08	0.09
C4	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.00	0.03	0.13	0.20	0.31	0.24
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.03	0.02	0.06	0.03	0.05	0.00	0.01	0.08	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.15	0.01	0.02	0.13	0.21	0.31	0.24
C5'	0.03	0.05	0.02	0.03	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.06	0.07	0.03	0.05	0.03	0.09	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.02	0.11	0.15	0.24	0.19
N1	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.01	0.08	0.09	0.19	0.14
N3	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.01	0.03	0.11	0.15	0.27	0.20
O2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.08	0.02	0.03	0.07	0.06	0.19	0.13
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.05	0.03	0.03	0.07	0.09	0.00	0.07	0.06	0.05	0.04	0.12	0.06	0.05
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.15	0.03	0.15	0.03	0.11	0.07	0.12	0.08	0.07	0.00	0.17	0.02	0.08	0.25	0.18	0.16
O4	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.17	0.00	0.03	0.14	0.23	0.34	0.26
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.02	0.03	0.00	0.06	0.04	0.13	0.09
O5'	0.06	0.09	0.06	0.06	0.13	0.01	0.13	0.01	0.11	0.08	0.11	0.07	0.04	0.08	0.14	0.06	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.05	0.10	0.13	0.15	0.20	0.08	0.21	0.05	0.15	0.09	0.15	0.06	0.12	0.25	0.23	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.21	0.09	0.08	0.31	0.04	0.31	0.02	0.24	0.19	0.27	0.19	0.06	0.18	0.34	0.13	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.08	0.09	0.24	0.02	0.24	0.02	0.19	0.14	0.20	0.13	0.05	0.16	0.26	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.21	0.11	0.13	0.20	0.24	0.23	0.28	0.25	0.23	0.20	0.18	0.22	0.13	0.14	0.31	0.27	0.24	0.28	0.33
C2	0.12	0.11	0.10	0.15	0.13	0.19	0.11	0.24	0.13	0.11	0.13	0.18	0.11	0.10	0.18	0.17	0.24	0.27	0.29	0.31
C2'	0.35	0.21	0.20	0.26	0.18	0.44	0.30	0.54	0.35	0.31	0.15	0.15	0.19	0.22	0.23	0.49	0.51	0.49	0.47	0.61
C3'	0.35	0.22	0.19	0.24	0.18	0.44	0.29	0.53	0.35	0.31	0.15	0.13	0.20	0.21	0.20	0.50	0.49	0.46	0.44	0.59
C4	0.06	0.09	0.08	0.14	0.13	0.14	0.07	0.19	0.05	0.05	0.14	0.19	0.10	0.08	0.20	0.13	0.19	0.32	0.26	0.25
C4'	0.29	0.26	0.11	0.13	0.23	0.28	0.27	0.32	0.29	0.28	0.23	0.20	0.26	0.13	0.15	0.39	0.28	0.22	0.27	0.34
C5	0.07	0.11	0.07	0.12	0.13	0.14	0.08	0.19	0.08	0.08	0.14	0.18	0.12	0.06	0.16	0.12	0.18	0.31	0.26	0.25
C5'	0.26	0.25	0.08	0.10	0.23	0.22	0.24	0.24	0.25	0.25	0.24	0.21	0.26	0.10	0.16	0.33	0.20	0.21	0.21	0.26
C6	0.13	0.14	0.07	0.12	0.15	0.16	0.13	0.21	0.14	0.13	0.16	0.18	0.15	0.08	0.15	0.17	0.20	0.28	0.27	0.27
N1	0.16	0.15	0.09	0.14	0.15	0.20	0.16	0.24	0.17	0.16	0.16	0.17	0.15	0.10	0.15	0.21	0.24	0.27	0.28	0.30
N3	0.06	0.09	0.09	0.16	0.13	0.15	0.07	0.20	0.06	0.05	0.13	0.19	0.09	0.09	0.21	0.12	0.21	0.30	0.28	0.27
O2	0.15	0.11	0.12	0.18	0.12	0.22	0.14	0.28	0.17	0.13	0.13	0.19	0.10	0.12	0.20	0.21	0.29	0.28	0.31	0.35
O2'	0.42	0.25	0.22	0.28	0.22	0.51	0.36	0.61	0.42	0.37	0.16	0.19	0.22	0.24	0.23	0.60	0.57	0.53	0.50	0.67
O3'	0.39	0.19	0.19	0.27	0.15	0.52	0.30	0.65	0.38	0.32	0.10	0.14	0.16	0.21	0.22	0.59	0.60	0.60	0.53	0.73
O4	0.10	0.11	0.09	0.14	0.15	0.15	0.10	0.21	0.09	0.09	0.15	0.20	0.11	0.09	0.22	0.18	0.19	0.34	0.24	0.25
O4'	0.21	0.24	0.07	0.11	0.23	0.17	0.22	0.19	0.22	0.22	0.25	0.24	0.25	0.09	0.18	0.26	0.17	0.27	0.24	0.23
O5'	0.19	0.17	0.07	0.11	0.16	0.17	0.17	0.21	0.18	0.18	0.16	0.15	0.18	0.08	0.16	0.25	0.18	0.21	0.20	0.24
OP1	0.25	0.24	0.07	0.08	0.19	0.21	0.19	0.24	0.21	0.23	0.22	0.17	0.26	0.11	0.14	0.32	0.19	0.20	0.19	0.24
OP2	0.11	0.12	0.15	0.20	0.13	0.13	0.13	0.13	0.13	0.12	0.13	0.15	0.12	0.12	0.27	0.13	0.13	0.30	0.21	0.18
P	0.13	0.15	0.10	0.15	0.13	0.10	0.12	0.11	0.13	0.13	0.15	0.14	0.16	0.08	0.24	0.17	0.10	0.28	0.19	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.14	0.05
C2	0.03	0.00	0.10	0.09	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.10	0.03	0.07	0.09	0.19	0.10
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.09	0.07	0.15	0.00	0.02	0.00	0.04	0.05	0.10	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.07	0.14	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.07	0.04
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.05	0.11	0.18	0.10
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.06	0.06	0.16	0.08
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.04	0.01	0.01	0.11	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.03	0.07	0.04	0.15	0.07
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.05	0.17	0.07
N3	0.03	0.00	0.09	0.09	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.03	0.07	0.12	0.19	0.10
N4	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.08	0.01	0.05	0.14	0.17	0.10
O2	0.04	0.00	0.15	0.14	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.13	0.16	0.05	0.08	0.10	0.19	0.10
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.06	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.08	0.07	0.13	0.00	0.04	0.02	0.03	0.06	0.10	0.04
O3'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.06	0.01	0.07	0.04	0.09	0.02	0.11	0.08	0.16	0.04	0.00	0.01	0.07	0.11	0.10	0.07
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.00	0.04	0.07	0.15	0.05
O5'	0.03	0.07	0.04	0.04	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.05	0.07	0.05	0.08	0.03	0.07	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.03	0.09	0.05	0.07	0.11	0.07	0.06	0.11	0.04	0.05	0.12	0.14	0.10	0.06	0.11	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.19	0.10	0.07	0.18	0.07	0.16	0.04	0.15	0.17	0.19	0.17	0.19	0.10	0.10	0.15	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.05	0.04	0.10	0.02	0.08	0.01	0.07	0.07	0.10	0.10	0.10	0.04	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00