Doublet Group distance statistics: 54838

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.019, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.019 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.008, 0.025, 0.042, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.009, 0.027, 0.044, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.007, 0.026, 0.045, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.026 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.018, 0.049, 0.080, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.049 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.026, 0.100, 0.174, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.100 std_dev=0.074
O4'	A	0, 0.016, 0.099, 0.183, 0.253 max_d=0.253 avg_d=0.099 std_dev=0.084
O4	A	0, 0.042, 0.143, 0.244, 0.299 max_d=0.299 avg_d=0.143 std_dev=0.101
O2'	A	0, 0.039, 0.216, 0.392, 0.440 max_d=0.440 avg_d=0.216 std_dev=0.177
C4'	A	0, 0.045, 0.228, 0.411, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.228 std_dev=0.183
C3'	A	0, 0.042, 0.227, 0.411, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.227 std_dev=0.184
C6	B	0, 0.033, 0.246, 0.458, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.246 std_dev=0.212
N1	B	0, 0.039, 0.252, 0.465, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.252 std_dev=0.213
C2	B	0, 0.068, 0.313, 0.558, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.313 std_dev=0.245
N3	B	0, 0.108, 0.354, 0.599, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.354 std_dev=0.245
C5'	A	0, 0.053, 0.315, 0.577, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.315 std_dev=0.262
C4	B	0, 0.085, 0.354, 0.624, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.354 std_dev=0.270
C5	B	0, 0.058, 0.341, 0.624, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.341 std_dev=0.283
O3'	A	0, 0.067, 0.393, 0.718, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.393 std_dev=0.325
O5'	A	0, 0.090, 0.427, 0.765, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.427 std_dev=0.338
N6	B	0, -0.043, 0.319, 0.681, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.319 std_dev=0.362
N9	B	0, 0.109, 0.544, 0.979, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.544 std_dev=0.435
N7	B	0, 0.009, 0.519, 1.030, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.519 std_dev=0.510
C1'	B	0, 0.168, 0.695, 1.222, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.695 std_dev=0.527
C8	B	0, 0.062, 0.621, 1.181, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.621 std_dev=0.559
C2'	B	0, 0.221, 0.785, 1.349, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.785 std_dev=0.564
O4'	B	0, 0.182, 0.802, 1.422, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.802 std_dev=0.620
C3'	B	0, 0.228, 0.872, 1.516, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.872 std_dev=0.644
C4'	B	0, 0.220, 0.906, 1.592, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.906 std_dev=0.686
O2'	B	0, 0.278, 0.967, 1.656, 1.674 max_d=1.674 avg_d=0.967 std_dev=0.689
P	A	0, 0.193, 0.918, 1.644, 2.076 max_d=2.076 avg_d=0.918 std_dev=0.726
O3'	B	0, 0.247, 1.007, 1.767, 2.027 max_d=2.027 avg_d=1.007 std_dev=0.760
OP2	A	0, 0.183, 0.954, 1.726, 2.151 max_d=2.151 avg_d=0.954 std_dev=0.771
C5'	B	0, 0.237, 1.021, 1.805, 2.121 max_d=2.121 avg_d=1.021 std_dev=0.784
O5'	B	0, 0.206, 1.090, 1.974, 2.482 max_d=2.482 avg_d=1.090 std_dev=0.884
P	B	0, 0.120, 1.073, 2.027, 2.818 max_d=2.818 avg_d=1.073 std_dev=0.953
OP1	A	0, 0.248, 1.360, 2.471, 3.106 max_d=3.106 avg_d=1.360 std_dev=1.111
OP1	B	0, 0.095, 1.334, 2.574, 3.180 max_d=3.180 avg_d=1.334 std_dev=1.240
OP2	B	0, 0.178, 1.725, 3.272, 3.819 max_d=3.819 avg_d=1.725 std_dev=1.547

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.28	0.20	0.30
C2	0.02	0.00	0.03	0.08	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.07	0.01	0.02	0.08	0.25	0.21	0.27
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.02	0.06	0.01	0.05	0.08	0.08	0.13
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.17	0.00	0.19	0.01	0.16	0.09	0.13	0.04	0.01	0.00	0.19	0.01	0.11	0.12	0.16	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.17	0.00	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.18	0.00	0.03	0.25	0.26	0.36	0.26
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.13	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.12	0.01	0.01	0.17	0.08	0.16
C5	0.02	0.02	0.03	0.19	0.00	0.14	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.20	0.01	0.04	0.29	0.31	0.39	0.29
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.19	0.01	0.22	0.00	0.18	0.08	0.11	0.02	0.04	0.03	0.21	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.02	0.16	0.01	0.13	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.16	0.01	0.04	0.22	0.20	0.25	0.21
N1	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.01	0.01	0.09	0.20	0.19	0.23
N3	0.01	0.00	0.04	0.13	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.13	0.01	0.02	0.16	0.21	0.26	0.24
O2	0.04	0.00	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.05	0.02	0.05	0.02	0.35	0.22	0.33
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.07	0.05	0.03	0.04	0.01	0.04	0.10	0.13	0.00	0.01	0.08	0.06	0.06	0.14	0.07	0.16
O3'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.18	0.03	0.20	0.03	0.16	0.08	0.13	0.05	0.01	0.00	0.21	0.02	0.13	0.22	0.22	0.11
O4	0.01	0.01	0.06	0.19	0.00	0.12	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.21	0.00	0.04	0.28	0.32	0.44	0.31
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.06	0.02	0.04	0.00	0.10	0.39	0.29	0.38
O5'	0.03	0.08	0.05	0.11	0.25	0.01	0.29	0.01	0.22	0.09	0.16	0.02	0.06	0.13	0.28	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.28	0.25	0.08	0.12	0.26	0.17	0.31	0.06	0.20	0.20	0.21	0.35	0.14	0.22	0.32	0.39	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.21	0.08	0.16	0.36	0.08	0.39	0.01	0.25	0.19	0.26	0.22	0.07	0.22	0.44	0.29	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.30	0.27	0.13	0.05	0.26	0.16	0.29	0.01	0.21	0.23	0.24	0.33	0.16	0.11	0.31	0.38	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.18	0.14	0.19	0.13	0.17	0.14	0.28	0.15	0.21	0.21	0.13	0.17	0.21	0.16	0.14	0.20	0.17	0.37	0.50	1.20	0.28
C2	0.23	0.15	0.17	0.17	0.15	0.19	0.15	0.22	0.16	0.27	0.19	0.12	0.24	0.23	0.22	0.19	0.16	0.25	0.43	0.45	1.25	0.34
C2'	0.04	0.17	0.08	0.14	0.06	0.09	0.07	0.22	0.14	0.08	0.20	0.11	0.18	0.08	0.04	0.08	0.17	0.07	0.29	0.64	1.17	0.25
C3'	0.05	0.26	0.14	0.20	0.10	0.12	0.09	0.24	0.17	0.09	0.27	0.18	0.18	0.09	0.06	0.12	0.24	0.06	0.30	0.58	1.20	0.27
C4	0.24	0.15	0.18	0.19	0.14	0.22	0.13	0.24	0.17	0.26	0.20	0.12	0.24	0.20	0.21	0.20	0.19	0.28	0.47	0.40	1.23	0.40
C4'	0.09	0.29	0.18	0.28	0.13	0.22	0.12	0.36	0.17	0.14	0.28	0.21	0.16	0.16	0.10	0.15	0.32	0.10	0.30	0.54	1.15	0.24
C5	0.22	0.16	0.17	0.19	0.14	0.21	0.14	0.26	0.16	0.25	0.20	0.12	0.21	0.21	0.20	0.18	0.19	0.26	0.47	0.41	1.25	0.40
C5'	0.11	0.31	0.18	0.29	0.13	0.23	0.12	0.37	0.16	0.18	0.29	0.22	0.15	0.19	0.11	0.15	0.33	0.13	0.36	0.45	1.22	0.32
C6	0.20	0.17	0.16	0.19	0.14	0.20	0.15	0.26	0.15	0.25	0.20	0.13	0.19	0.22	0.19	0.17	0.19	0.24	0.45	0.42	1.27	0.38
N1	0.20	0.17	0.16	0.18	0.15	0.18	0.15	0.25	0.15	0.25	0.20	0.13	0.20	0.23	0.20	0.17	0.18	0.23	0.42	0.45	1.25	0.34
N3	0.25	0.14	0.19	0.18	0.14	0.21	0.13	0.23	0.16	0.27	0.19	0.12	0.25	0.21	0.22	0.21	0.17	0.28	0.46	0.42	1.25	0.38
O2	0.24	0.13	0.17	0.15	0.16	0.17	0.15	0.21	0.15	0.28	0.18	0.12	0.26	0.25	0.23	0.19	0.14	0.25	0.40	0.49	1.23	0.30
O2'	0.14	0.22	0.22	0.28	0.16	0.24	0.16	0.37	0.19	0.15	0.23	0.19	0.18	0.15	0.15	0.18	0.31	0.14	0.19	0.83	0.99	0.18
O3'	0.17	0.34	0.28	0.31	0.20	0.22	0.16	0.31	0.22	0.12	0.32	0.28	0.20	0.11	0.17	0.27	0.36	0.14	0.24	0.70	1.12	0.23
O4	0.25	0.14	0.19	0.20	0.13	0.23	0.12	0.25	0.17	0.25	0.20	0.11	0.26	0.18	0.21	0.21	0.20	0.29	0.47	0.40	1.17	0.41
O4'	0.18	0.22	0.18	0.26	0.15	0.24	0.16	0.36	0.15	0.25	0.23	0.17	0.15	0.25	0.18	0.17	0.29	0.20	0.39	0.45	1.20	0.31
O5'	0.14	0.29	0.15	0.25	0.13	0.21	0.13	0.33	0.18	0.22	0.29	0.20	0.17	0.22	0.14	0.13	0.28	0.18	0.41	0.38	1.27	0.37
OP1	0.38	0.73	0.56	0.65	0.47	0.54	0.39	0.69	0.51	0.21	0.70	0.63	0.44	0.21	0.35	0.53	0.74	0.33	0.11	0.73	0.84	0.11
OP2	0.24	0.48	0.31	0.41	0.29	0.36	0.28	0.50	0.37	0.26	0.50	0.38	0.37	0.25	0.24	0.28	0.46	0.26	0.32	0.49	1.07	0.32
P	0.29	0.63	0.43	0.52	0.39	0.44	0.34	0.59	0.46	0.18	0.62	0.52	0.43	0.19	0.28	0.40	0.58	0.26	0.11	0.64	0.92	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.10	0.46	0.49	0.12
C2	0.04	0.00	0.11	0.26	0.00	0.15	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.28	0.02	0.12	0.64	0.70	0.09
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.07	0.13	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.27	0.49	0.19
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.15	0.00	0.10	0.01	0.14	0.09	0.22	0.24	0.12	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.33	0.26	0.45	0.23
C4	0.02	0.00	0.05	0.15	0.00	0.11	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.15	0.02	0.14	0.63	0.73	0.10
C4'	0.00	0.15	0.01	0.00	0.11	0.00	0.12	0.01	0.14	0.06	0.15	0.13	0.15	0.09	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.18	0.17	0.05
C5	0.01	0.01	0.01	0.10	0.00	0.12	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.04	0.17	0.71	0.86	0.11
C5'	0.03	0.29	0.01	0.01	0.23	0.01	0.27	0.00	0.31	0.15	0.32	0.24	0.33	0.22	0.14	0.06	0.04	0.01	0.01	0.17	0.24	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.14	0.01	0.14	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.17	0.73	0.86	0.10
C8	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.03	0.22	0.65	0.88	0.16
N1	0.03	0.00	0.07	0.22	0.01	0.15	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.23	0.03	0.14	0.70	0.78	0.10
N3	0.04	0.00	0.13	0.24	0.00	0.13	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.26	0.02	0.11	0.59	0.65	0.09
N6	0.01	0.01	0.02	0.12	0.01	0.15	0.00	0.33	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.11	0.04	0.18	0.77	0.91	0.11
N7	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.04	0.21	0.73	0.95	0.13
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.16	0.57	0.71	0.13
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.06	0.06	0.06	0.06	0.08	0.04	0.10	0.09	0.08	0.06	0.03	0.00	0.03	0.06	0.11	0.22	0.32	0.10
O3'	0.02	0.28	0.01	0.00	0.15	0.01	0.09	0.04	0.14	0.10	0.23	0.26	0.11	0.07	0.04	0.03	0.00	0.01	0.31	0.37	0.36	0.23
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.06	0.01	0.00	0.05	0.43	0.32	0.09
O5'	0.10	0.12	0.23	0.33	0.14	0.01	0.17	0.01	0.17	0.22	0.14	0.11	0.18	0.21	0.16	0.11	0.31	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.46	0.64	0.27	0.26	0.63	0.18	0.71	0.17	0.73	0.65	0.70	0.59	0.77	0.73	0.57	0.22	0.37	0.43	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.49	0.70	0.49	0.45	0.73	0.17	0.86	0.24	0.86	0.88	0.78	0.65	0.91	0.95	0.71	0.32	0.36	0.32	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.09	0.19	0.23	0.10	0.05	0.11	0.01	0.10	0.16	0.10	0.09	0.11	0.13	0.13	0.10	0.23	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00