Doublet Group distance statistics: 54841

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 2, 7, 8, 11, 15, 9, 4, 3, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.010, 0.013, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.007, 0.012, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.008, 0.016, 0.023, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.014, 0.031, 0.049, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.031 std_dev=0.017
O4	A	0, -0.001, 0.061, 0.122, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.061 std_dev=0.062
C2'	A	0, 0.157, 0.243, 0.330, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.243 std_dev=0.086
O4'	A	0, 0.116, 0.216, 0.316, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.216 std_dev=0.100
C4'	A	0, 0.223, 0.354, 0.485, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.354 std_dev=0.131
O2'	A	0, 0.207, 0.339, 0.470, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.339 std_dev=0.131
C3'	A	0, 0.258, 0.396, 0.534, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.396 std_dev=0.138
O5'	A	0, 0.334, 0.509, 0.685, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.509 std_dev=0.176
N1	B	0, 0.419, 0.615, 0.811, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.615 std_dev=0.196
C2	B	0, 0.441, 0.646, 0.851, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.646 std_dev=0.205
N2	B	0, 0.350, 0.557, 0.765, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.557 std_dev=0.207
O3'	A	0, 0.431, 0.656, 0.882, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.656 std_dev=0.226
N3	B	0, 0.591, 0.816, 1.042, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.816 std_dev=0.226
C6	B	0, 0.535, 0.762, 0.989, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.762 std_dev=0.227
O6	B	0, 0.586, 0.813, 1.040, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.813 std_dev=0.227
OP2	A	0, 0.405, 0.641, 0.877, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.641 std_dev=0.236
C5'	A	0, 0.330, 0.567, 0.803, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.567 std_dev=0.237
P	A	0, 0.357, 0.599, 0.840, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.599 std_dev=0.242
C4	B	0, 0.663, 0.917, 1.171, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.917 std_dev=0.254
OP1	A	0, 0.531, 0.790, 1.049, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.790 std_dev=0.259
C5	B	0, 0.635, 0.902, 1.169, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.902 std_dev=0.267
N9	B	0, 0.816, 1.110, 1.404, 1.699 max_d=1.699 avg_d=1.110 std_dev=0.294
C1'	B	0, 0.950, 1.256, 1.563, 1.909 max_d=1.909 avg_d=1.256 std_dev=0.307
N7	B	0, 0.751, 1.081, 1.411, 1.668 max_d=1.668 avg_d=1.081 std_dev=0.330
C3'	B	0, 1.027, 1.363, 1.699, 1.957 max_d=1.957 avg_d=1.363 std_dev=0.336
C8	B	0, 0.843, 1.183, 1.523, 1.843 max_d=1.843 avg_d=1.183 std_dev=0.340
C2'	B	0, 0.829, 1.197, 1.564, 2.278 max_d=2.278 avg_d=1.197 std_dev=0.367
C4'	B	0, 1.187, 1.581, 1.975, 2.611 max_d=2.611 avg_d=1.581 std_dev=0.394
O4'	B	0, 1.100, 1.546, 1.992, 2.814 max_d=2.814 avg_d=1.546 std_dev=0.446
O3'	B	0, 0.980, 1.499, 2.019, 2.964 max_d=2.964 avg_d=1.499 std_dev=0.519
O2'	B	0, 0.662, 1.472, 2.282, 4.329 max_d=4.329 avg_d=1.472 std_dev=0.810
C5'	B	0, 0.965, 1.940, 2.915, 5.400 max_d=5.400 avg_d=1.940 std_dev=0.975
O5'	B	0, 0.628, 1.924, 3.219, 6.629 max_d=6.629 avg_d=1.924 std_dev=1.296
P	B	0, 0.229, 2.283, 4.337, 9.668 max_d=9.668 avg_d=2.283 std_dev=2.054
OP2	B	0, 0.150, 2.271, 4.391, 9.961 max_d=9.961 avg_d=2.271 std_dev=2.121
OP1	B	0, 0.203, 2.622, 5.041, 11.259 max_d=11.259 avg_d=2.622 std_dev=2.419

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.05	0.15	0.06
C2	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.01	0.02	0.14	0.14	0.24	0.11
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.06	0.03	0.04	0.07	0.00	0.02	0.07	0.01	0.07	0.12	0.10	0.03
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.15	0.00	0.17	0.02	0.15	0.09	0.12	0.07	0.01	0.01	0.17	0.01	0.10	0.16	0.08	0.06
C4	0.01	0.00	0.05	0.15	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.17	0.00	0.02	0.24	0.26	0.35	0.22
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.06	0.03	0.04	0.02	0.10	0.00	0.01	0.08	0.11	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.17	0.00	0.11	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.20	0.01	0.03	0.27	0.26	0.36	0.23
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.17	0.01	0.19	0.00	0.16	0.09	0.13	0.05	0.04	0.03	0.19	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01	0.10	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.17	0.01	0.02	0.23	0.19	0.28	0.16
N1	0.00	0.01	0.03	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.01	0.14	0.13	0.22	0.10
N3	0.01	0.00	0.04	0.12	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.01	0.01	0.19	0.20	0.30	0.17
O2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.08	0.01	0.03	0.10	0.11	0.21	0.09
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.06	0.12	0.00	0.06	0.05	0.05	0.04	0.14	0.11	0.04
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.17	0.02	0.20	0.03	0.17	0.08	0.11	0.08	0.06	0.00	0.20	0.02	0.10	0.25	0.11	0.12
O4	0.01	0.01	0.07	0.17	0.00	0.10	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.20	0.00	0.02	0.26	0.30	0.39	0.25
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.02	0.00	0.06	0.07	0.17	0.11
O5'	0.05	0.14	0.07	0.10	0.24	0.01	0.27	0.01	0.23	0.14	0.19	0.10	0.04	0.10	0.26	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.14	0.12	0.16	0.26	0.08	0.26	0.06	0.19	0.13	0.20	0.11	0.14	0.25	0.30	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.24	0.10	0.08	0.35	0.11	0.36	0.10	0.28	0.22	0.30	0.21	0.11	0.11	0.39	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.11	0.03	0.06	0.22	0.02	0.23	0.01	0.16	0.10	0.17	0.09	0.04	0.12	0.25	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.11	0.08	0.17	0.11	0.52	0.14	1.16	0.17	0.13	0.14	0.13	0.11	0.15	0.12	0.23	0.12	0.35	1.06	0.22	1.71	1.87	1.68
C2	0.10	0.09	0.11	0.16	0.10	0.41	0.13	0.94	0.16	0.13	0.10	0.16	0.10	0.16	0.10	0.13	0.20	0.29	0.71	0.22	1.16	1.36	1.18
C2'	0.24	0.20	0.13	0.17	0.20	0.44	0.19	1.07	0.21	0.19	0.20	0.21	0.21	0.19	0.20	0.28	0.11	0.24	1.02	0.23	1.74	1.92	1.66
C3'	0.28	0.22	0.14	0.16	0.22	0.42	0.20	1.06	0.21	0.21	0.21	0.23	0.24	0.20	0.24	0.32	0.12	0.23	1.05	0.22	1.85	1.99	1.73
C4	0.11	0.12	0.13	0.20	0.11	0.35	0.15	0.81	0.17	0.16	0.11	0.17	0.11	0.19	0.12	0.13	0.25	0.26	0.58	0.24	0.99	1.14	0.98
C4'	0.21	0.17	0.13	0.17	0.17	0.50	0.17	1.19	0.19	0.17	0.18	0.17	0.18	0.17	0.18	0.34	0.14	0.28	1.19	0.22	2.01	2.10	1.89
C5	0.11	0.10	0.10	0.17	0.10	0.40	0.14	0.92	0.16	0.14	0.11	0.16	0.11	0.17	0.10	0.13	0.21	0.28	0.71	0.23	1.21	1.35	1.18
C5'	0.22	0.17	0.13	0.17	0.17	0.50	0.16	1.19	0.18	0.16	0.17	0.18	0.18	0.16	0.18	0.35	0.15	0.29	1.20	0.21	2.04	2.09	1.90
C6	0.11	0.10	0.08	0.15	0.10	0.44	0.13	1.02	0.16	0.12	0.11	0.15	0.11	0.16	0.10	0.15	0.17	0.30	0.84	0.23	1.41	1.55	1.38
N1	0.11	0.09	0.08	0.15	0.10	0.46	0.13	1.04	0.16	0.12	0.12	0.14	0.10	0.15	0.10	0.16	0.16	0.31	0.87	0.22	1.42	1.59	1.41
N3	0.11	0.12	0.14	0.20	0.11	0.36	0.15	0.82	0.16	0.15	0.11	0.17	0.11	0.18	0.12	0.13	0.24	0.27	0.58	0.23	0.96	1.13	0.97
O2	0.10	0.09	0.11	0.16	0.09	0.41	0.13	0.94	0.16	0.12	0.10	0.16	0.09	0.15	0.10	0.14	0.20	0.30	0.71	0.22	1.13	1.35	1.17
O2'	0.27	0.25	0.14	0.16	0.25	0.42	0.26	1.09	0.27	0.25	0.27	0.24	0.25	0.26	0.25	0.35	0.13	0.19	1.12	0.29	1.88	2.08	1.80
O3'	0.37	0.29	0.19	0.16	0.30	0.35	0.27	0.99	0.25	0.29	0.26	0.31	0.32	0.26	0.32	0.39	0.16	0.21	1.06	0.25	1.93	2.05	1.76
O4	0.13	0.13	0.16	0.23	0.13	0.32	0.17	0.73	0.18	0.18	0.13	0.18	0.12	0.21	0.14	0.17	0.28	0.25	0.51	0.24	0.86	1.01	0.85
O4'	0.14	0.11	0.09	0.19	0.11	0.57	0.14	1.24	0.17	0.12	0.14	0.12	0.12	0.15	0.12	0.27	0.13	0.39	1.18	0.21	1.90	2.00	1.83
O5'	0.22	0.17	0.12	0.18	0.17	0.49	0.16	1.15	0.18	0.16	0.17	0.18	0.18	0.16	0.18	0.29	0.12	0.30	1.10	0.22	1.89	1.95	1.76
OP1	0.23	0.15	0.14	0.25	0.16	0.56	0.15	1.22	0.17	0.15	0.15	0.17	0.18	0.15	0.17	0.28	0.13	0.36	1.22	0.21	2.08	2.10	1.91
OP2	0.24	0.21	0.18	0.22	0.21	0.48	0.22	1.08	0.23	0.21	0.22	0.22	0.22	0.22	0.21	0.25	0.17	0.32	0.97	0.27	1.71	1.78	1.59
P	0.21	0.16	0.12	0.16	0.16	0.47	0.16	1.12	0.18	0.16	0.16	0.18	0.18	0.16	0.17	0.28	0.13	0.29	1.07	0.22	1.87	1.91	1.73

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.22	0.00	0.16	0.01	0.14	0.19	0.12
C2	0.02	0.00	0.09	0.16	0.00	0.41	0.00	0.91	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.28	0.67	0.01	0.94	1.27	1.02
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.18	0.05	0.07	0.06	0.11	0.10	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.13	0.05	0.20	0.43	0.23
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.08	0.00	0.20	0.02	0.17	0.34	0.10	0.26	0.17	0.33	0.15	0.01	0.00	0.01	0.12	0.22	0.22	0.21	0.14
C4	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.17	0.00	0.44	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.08	0.15	0.21	0.01	0.26	0.49	0.33
C4'	0.01	0.41	0.01	0.00	0.17	0.00	0.06	0.00	0.14	0.27	0.29	0.53	0.40	0.19	0.05	0.18	0.02	0.00	0.01	0.09	0.15	0.17	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.20	0.00	0.06	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.10	0.07	0.37	0.01	0.35	0.41	0.35
C5'	0.10	0.91	0.18	0.02	0.44	0.00	0.25	0.00	0.42	0.31	0.71	1.14	0.84	0.20	0.11	0.03	0.14	0.02	0.00	0.33	0.22	0.24	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.17	0.01	0.14	0.01	0.42	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.13	0.13	0.29	0.00	0.36	0.51	0.38
C8	0.01	0.01	0.07	0.34	0.00	0.27	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.08	0.15	0.85	0.01	0.84	0.78	0.83
N1	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.29	0.01	0.71	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.22	0.42	0.00	0.66	0.91	0.72
N2	0.03	0.00	0.11	0.26	0.01	0.53	0.01	1.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.18	0.33	1.00	0.01	1.42	1.78	1.48
N3	0.02	0.00	0.10	0.17	0.00	0.40	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.15	0.27	0.59	0.01	0.77	1.09	0.86
N7	0.01	0.01	0.07	0.33	0.00	0.19	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.13	0.07	0.78	0.01	0.80	0.80	0.78
N9	0.00	0.01	0.03	0.15	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.06	0.01	0.36	0.01	0.30	0.27	0.29
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.08	0.18	0.13	0.03	0.12	0.17	0.07	0.10	0.06	0.18	0.10	0.00	0.04	0.12	0.06	0.14	0.20	0.45	0.18
O3'	0.22	0.14	0.02	0.00	0.08	0.02	0.10	0.14	0.13	0.08	0.13	0.18	0.15	0.13	0.06	0.04	0.00	0.18	0.17	0.17	0.43	0.26	0.27
O4'	0.00	0.28	0.01	0.01	0.15	0.00	0.07	0.02	0.13	0.15	0.22	0.33	0.27	0.07	0.01	0.12	0.18	0.00	0.22	0.10	0.24	0.16	0.21
O5'	0.16	0.67	0.13	0.12	0.21	0.01	0.37	0.00	0.29	0.85	0.42	1.00	0.59	0.78	0.36	0.06	0.17	0.22	0.00	0.38	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.22	0.01	0.09	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.17	0.10	0.38	0.00	0.43	0.51	0.40
OP1	0.14	0.94	0.20	0.22	0.26	0.15	0.35	0.22	0.36	0.84	0.66	1.42	0.77	0.80	0.30	0.20	0.43	0.24	0.01	0.43	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	1.27	0.43	0.21	0.49	0.17	0.41	0.24	0.51	0.78	0.91	1.78	1.09	0.80	0.27	0.45	0.26	0.16	0.01	0.51	0.01	0.00	0.00
P	0.12	1.02	0.23	0.14	0.33	0.01	0.35	0.01	0.38	0.83	0.72	1.48	0.86	0.78	0.29	0.18	0.27	0.21	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00