Doublet Group distance statistics: 54850

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 8, 15, 17, 11, 7, 1, 2, 2, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.014 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.000, 0.033, 0.067, 0.225 max_d=0.225 avg_d=0.033 std_dev=0.033
O4	A	0, 0.026, 0.076, 0.127, 0.232 max_d=0.232 avg_d=0.076 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.056, 0.135, 0.213, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.135 std_dev=0.078
C2'	A	0, 0.080, 0.159, 0.237, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.159 std_dev=0.079
C4'	A	0, 0.134, 0.238, 0.343, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.238 std_dev=0.105
O2'	A	0, 0.123, 0.249, 0.374, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.249 std_dev=0.125
C3'	A	0, 0.103, 0.230, 0.357, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.230 std_dev=0.127
C5'	A	0, 0.210, 0.388, 0.567, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.388 std_dev=0.179
C4	B	0, 0.269, 0.452, 0.635, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.452 std_dev=0.183
O5'	A	0, 0.186, 0.381, 0.577, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.381 std_dev=0.195
O3'	A	0, 0.148, 0.345, 0.543, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.345 std_dev=0.197
N9	B	0, 0.326, 0.528, 0.731, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.528 std_dev=0.203
C1'	B	0, 0.359, 0.602, 0.845, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.602 std_dev=0.243
C5	B	0, 0.226, 0.476, 0.725, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.476 std_dev=0.249
N1	B	0, 0.114, 0.366, 0.619, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.366 std_dev=0.253
P	A	0, 0.216, 0.483, 0.751, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.483 std_dev=0.268
C6	B	0, 0.152, 0.424, 0.697, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.424 std_dev=0.273
N3	B	0, 0.195, 0.481, 0.766, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.481 std_dev=0.286
O4'	B	0, 0.394, 0.696, 0.998, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.696 std_dev=0.302
C2	B	0, 0.125, 0.431, 0.737, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.431 std_dev=0.306
C8	B	0, 0.315, 0.623, 0.932, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.623 std_dev=0.308
OP2	A	0, 0.184, 0.508, 0.831, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.508 std_dev=0.323
OP1	A	0, 0.236, 0.572, 0.908, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.572 std_dev=0.336
C4'	B	0, 0.422, 0.798, 1.173, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.798 std_dev=0.376
C5'	B	0, 0.512, 0.893, 1.274, 1.965 max_d=1.965 avg_d=0.893 std_dev=0.381
C3'	B	0, 0.361, 0.757, 1.153, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.757 std_dev=0.396
N7	B	0, 0.214, 0.613, 1.012, 1.988 max_d=1.988 avg_d=0.613 std_dev=0.399
C2'	B	0, 0.290, 0.695, 1.100, 2.482 max_d=2.482 avg_d=0.695 std_dev=0.405
N6	B	0, 0.092, 0.516, 0.940, 1.923 max_d=1.923 avg_d=0.516 std_dev=0.424
O3'	B	0, 0.342, 0.772, 1.201, 2.097 max_d=2.097 avg_d=0.772 std_dev=0.430
O2'	B	0, 0.188, 0.771, 1.353, 3.711 max_d=3.711 avg_d=0.771 std_dev=0.582
O5'	B	0, 0.533, 1.128, 1.723, 3.384 max_d=3.384 avg_d=1.128 std_dev=0.595
OP1	B	0, 0.621, 1.271, 1.920, 2.995 max_d=2.995 avg_d=1.271 std_dev=0.649
P	B	0, 0.632, 1.285, 1.937, 3.480 max_d=3.480 avg_d=1.285 std_dev=0.652
OP2	B	0, 0.480, 1.624, 2.768, 5.509 max_d=5.509 avg_d=1.624 std_dev=1.144

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.07	0.14	0.08
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.02	0.12	0.14	0.24	0.15
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.10	0.00	0.02	0.06	0.01	0.07	0.09	0.14	0.08
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.03	0.11	0.06	0.09	0.10	0.02	0.01	0.10	0.02	0.07	0.11	0.11	0.08
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.04	0.21	0.26	0.35	0.26
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.10	0.04	0.05	0.06	0.07	0.03	0.08	0.00	0.02	0.05	0.05	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.11	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.13	0.01	0.04	0.22	0.26	0.33	0.26
C5'	0.02	0.07	0.02	0.03	0.16	0.01	0.19	0.00	0.16	0.08	0.11	0.04	0.07	0.04	0.17	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.10	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.12	0.01	0.04	0.18	0.19	0.25	0.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.01	0.12	0.13	0.21	0.13
N3	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.11	0.01	0.03	0.17	0.20	0.31	0.21
O2	0.04	0.01	0.10	0.10	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.13	0.13	0.02	0.04	0.09	0.09	0.21	0.11
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.06	0.07	0.03	0.07	0.03	0.03	0.08	0.13	0.00	0.05	0.07	0.05	0.06	0.07	0.10	0.06
O3'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.11	0.03	0.13	0.04	0.12	0.06	0.11	0.13	0.05	0.00	0.13	0.02	0.12	0.17	0.14	0.14
O4	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.08	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.13	0.00	0.04	0.22	0.29	0.38	0.29
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.03	0.04	0.05	0.02	0.04	0.00	0.09	0.10	0.12	0.10
O5'	0.08	0.12	0.07	0.07	0.21	0.02	0.22	0.01	0.18	0.12	0.17	0.09	0.06	0.12	0.22	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.14	0.09	0.11	0.26	0.05	0.26	0.06	0.19	0.13	0.20	0.09	0.07	0.17	0.29	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.24	0.14	0.11	0.35	0.05	0.33	0.02	0.25	0.21	0.31	0.21	0.10	0.14	0.38	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.08	0.08	0.26	0.02	0.26	0.01	0.19	0.13	0.21	0.11	0.06	0.14	0.29	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.13	0.14	0.19	0.12	0.18	0.13	0.21	0.12	0.14	0.11	0.13	0.17	0.14	0.13	0.22	0.15	0.19	0.32	0.17	0.57	0.35
C2	0.12	0.18	0.12	0.15	0.13	0.14	0.14	0.16	0.15	0.14	0.18	0.15	0.19	0.15	0.12	0.33	0.15	0.17	0.31	0.21	0.61	0.35
C2'	0.15	0.16	0.16	0.20	0.10	0.20	0.10	0.20	0.12	0.09	0.09	0.16	0.21	0.12	0.10	0.17	0.16	0.20	0.29	0.16	0.44	0.29
C3'	0.15	0.11	0.20	0.22	0.10	0.20	0.11	0.20	0.14	0.10	0.11	0.13	0.21	0.13	0.11	0.16	0.18	0.19	0.28	0.16	0.43	0.29
C4	0.12	0.17	0.13	0.15	0.13	0.13	0.15	0.16	0.17	0.15	0.18	0.15	0.21	0.17	0.13	0.36	0.16	0.16	0.32	0.24	0.67	0.36
C4'	0.13	0.13	0.20	0.22	0.11	0.17	0.12	0.19	0.15	0.12	0.16	0.11	0.19	0.13	0.11	0.19	0.20	0.16	0.28	0.17	0.49	0.30
C5	0.12	0.15	0.12	0.17	0.13	0.14	0.15	0.18	0.16	0.15	0.15	0.14	0.20	0.18	0.13	0.31	0.15	0.16	0.33	0.21	0.67	0.37
C5'	0.12	0.17	0.21	0.22	0.12	0.16	0.13	0.18	0.15	0.13	0.18	0.14	0.18	0.14	0.12	0.20	0.23	0.14	0.27	0.18	0.49	0.30
C6	0.12	0.14	0.12	0.18	0.13	0.16	0.14	0.19	0.14	0.15	0.13	0.13	0.19	0.17	0.13	0.27	0.15	0.17	0.33	0.20	0.64	0.36
N1	0.12	0.15	0.12	0.17	0.12	0.16	0.14	0.19	0.14	0.14	0.14	0.14	0.18	0.15	0.12	0.27	0.14	0.17	0.32	0.18	0.61	0.35
N3	0.12	0.19	0.14	0.14	0.14	0.13	0.15	0.15	0.17	0.15	0.20	0.16	0.21	0.16	0.13	0.37	0.16	0.16	0.31	0.24	0.65	0.35
O2	0.14	0.21	0.15	0.14	0.14	0.14	0.14	0.16	0.16	0.14	0.21	0.18	0.17	0.15	0.13	0.36	0.17	0.18	0.31	0.22	0.59	0.34
O2'	0.15	0.15	0.19	0.21	0.10	0.21	0.15	0.20	0.20	0.12	0.13	0.16	0.33	0.18	0.10	0.16	0.19	0.20	0.29	0.18	0.38	0.28
O3'	0.18	0.15	0.25	0.26	0.14	0.24	0.18	0.22	0.22	0.15	0.17	0.17	0.31	0.20	0.14	0.21	0.23	0.22	0.30	0.20	0.35	0.28
O4	0.12	0.18	0.15	0.16	0.14	0.12	0.16	0.16	0.18	0.17	0.19	0.15	0.23	0.19	0.13	0.39	0.16	0.16	0.32	0.26	0.69	0.37
O4'	0.17	0.14	0.20	0.23	0.14	0.21	0.16	0.24	0.15	0.18	0.13	0.14	0.19	0.19	0.16	0.21	0.18	0.20	0.36	0.21	0.62	0.39
O5'	0.14	0.12	0.21	0.24	0.12	0.19	0.14	0.21	0.14	0.16	0.12	0.11	0.19	0.17	0.14	0.19	0.22	0.17	0.32	0.19	0.56	0.35
OP1	0.13	0.19	0.22	0.23	0.14	0.15	0.15	0.18	0.17	0.15	0.18	0.17	0.20	0.16	0.13	0.22	0.30	0.13	0.23	0.20	0.46	0.26
OP2	0.15	0.11	0.19	0.22	0.14	0.19	0.19	0.21	0.19	0.21	0.13	0.12	0.25	0.23	0.16	0.23	0.23	0.20	0.36	0.20	0.64	0.40
P	0.10	0.14	0.18	0.21	0.10	0.14	0.13	0.17	0.13	0.14	0.12	0.12	0.19	0.16	0.11	0.23	0.26	0.13	0.28	0.18	0.54	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.18	0.01	0.22	0.12	0.33	0.20
C2	0.02	0.00	0.13	0.09	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.26	0.13	0.25	0.12	0.38	0.26
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.08	0.02	0.06	0.10	0.09	0.05	0.12	0.13	0.08	0.05	0.03	0.00	0.04	0.02	0.33	0.23	0.53	0.30
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.10	0.01	0.14	0.02	0.13	0.16	0.11	0.08	0.15	0.17	0.10	0.02	0.01	0.01	0.34	0.29	0.46	0.28
C4	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.18	0.07	0.26	0.13	0.41	0.27
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.13	0.08	0.08	0.09	0.13	0.06	0.11	0.03	0.01	0.02	0.12	0.28	0.09
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.14	0.03	0.28	0.17	0.48	0.29
C5'	0.04	0.12	0.10	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.15	0.19	0.13	0.11	0.18	0.21	0.11	0.06	0.08	0.02	0.01	0.11	0.27	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.17	0.06	0.28	0.17	0.48	0.30
C8	0.02	0.01	0.05	0.16	0.01	0.13	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.14	0.11	0.10	0.29	0.18	0.50	0.29
N1	0.02	0.00	0.12	0.11	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.21	0.10	0.27	0.14	0.43	0.28
N3	0.02	0.00	0.13	0.08	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.26	0.14	0.25	0.12	0.36	0.25
N6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.24	0.15	0.05	0.28	0.21	0.52	0.31
N7	0.01	0.01	0.05	0.17	0.01	0.13	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.17	0.13	0.07	0.29	0.21	0.54	0.30
N9	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.11	0.13	0.02	0.27	0.13	0.41	0.26
O2'	0.03	0.24	0.00	0.02	0.17	0.11	0.19	0.06	0.22	0.14	0.23	0.22	0.24	0.17	0.11	0.00	0.05	0.10	0.37	0.28	0.70	0.37
O3'	0.18	0.26	0.04	0.01	0.18	0.03	0.14	0.08	0.17	0.11	0.21	0.26	0.15	0.13	0.13	0.05	0.00	0.12	0.37	0.39	0.55	0.36
O4'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.07	0.01	0.03	0.02	0.06	0.10	0.10	0.14	0.05	0.07	0.02	0.10	0.12	0.00	0.23	0.21	0.16	0.15
O5'	0.22	0.25	0.33	0.34	0.26	0.02	0.28	0.01	0.28	0.29	0.27	0.25	0.28	0.29	0.27	0.37	0.37	0.23	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.12	0.23	0.29	0.13	0.12	0.17	0.11	0.17	0.18	0.14	0.12	0.21	0.21	0.13	0.28	0.39	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.38	0.53	0.46	0.41	0.28	0.48	0.27	0.48	0.50	0.43	0.36	0.52	0.54	0.41	0.70	0.55	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.26	0.30	0.28	0.27	0.09	0.29	0.01	0.30	0.29	0.28	0.25	0.31	0.30	0.26	0.37	0.36	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00