Doublet Group distance statistics: 54866

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 7, 6, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.027, 0.037, 0.047, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.037 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.021, 0.033, 0.044, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.033 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.043, 0.056, 0.069, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.056 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.027, 0.041, 0.055, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.041 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.025, 0.040, 0.054, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.040 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.048, 0.069, 0.090, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.069 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.066, 0.088, 0.110, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.088 std_dev=0.022
O4	A	0, 0.037, 0.114, 0.192, 0.295 max_d=0.295 avg_d=0.114 std_dev=0.078
O2	A	0, 0.292, 0.383, 0.475, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.383 std_dev=0.092
C2'	A	0, 0.122, 0.244, 0.366, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.244 std_dev=0.122
O4'	A	0, 0.100, 0.234, 0.367, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.234 std_dev=0.134
O2'	A	0, 0.122, 0.265, 0.407, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.265 std_dev=0.143
N3	B	0, 0.173, 0.316, 0.459, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.316 std_dev=0.143
C5	B	0, 0.139, 0.293, 0.447, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.293 std_dev=0.154
C4	B	0, 0.137, 0.291, 0.445, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.291 std_dev=0.154
N9	B	0, 0.211, 0.380, 0.548, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.380 std_dev=0.169
C6	B	0, 0.167, 0.337, 0.506, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.337 std_dev=0.169
N1	B	0, 0.205, 0.379, 0.553, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.379 std_dev=0.174
C2	B	0, 0.229, 0.403, 0.577, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.403 std_dev=0.174
C1'	B	0, 0.307, 0.484, 0.660, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.484 std_dev=0.176
C4'	A	0, 0.325, 0.526, 0.727, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.526 std_dev=0.201
N7	B	0, 0.194, 0.396, 0.597, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.396 std_dev=0.201
C3'	A	0, 0.237, 0.440, 0.642, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.440 std_dev=0.203
C8	B	0, 0.231, 0.438, 0.645, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.438 std_dev=0.207
N6	B	0, 0.215, 0.449, 0.682, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.449 std_dev=0.234
O4'	B	0, 0.380, 0.632, 0.883, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.632 std_dev=0.251
C2'	B	0, 0.319, 0.583, 0.847, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.583 std_dev=0.264
O3'	A	0, 0.229, 0.506, 0.783, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.506 std_dev=0.277
C4'	B	0, 0.465, 0.768, 1.070, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.768 std_dev=0.303
O2'	B	0, 0.601, 0.911, 1.221, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.911 std_dev=0.310
C5'	A	0, 0.522, 0.839, 1.155, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.839 std_dev=0.317
C3'	B	0, 0.350, 0.699, 1.048, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.699 std_dev=0.349
C5'	B	0, 0.574, 0.956, 1.338, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.956 std_dev=0.382
O5'	A	0, 0.640, 1.023, 1.406, 1.624 max_d=1.624 avg_d=1.023 std_dev=0.383
O5'	B	0, 0.498, 0.889, 1.281, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.889 std_dev=0.392
P	A	0, 0.756, 1.197, 1.638, 1.937 max_d=1.937 avg_d=1.197 std_dev=0.441
OP2	A	0, 0.700, 1.147, 1.595, 2.017 max_d=2.017 avg_d=1.147 std_dev=0.447
O3'	B	0, 0.352, 0.821, 1.290, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.821 std_dev=0.469
OP2	B	0, 0.644, 1.130, 1.616, 1.973 max_d=1.973 avg_d=1.130 std_dev=0.486
P	B	0, 0.577, 1.070, 1.563, 1.893 max_d=1.893 avg_d=1.070 std_dev=0.493
OP1	A	0, 0.955, 1.580, 2.204, 2.579 max_d=2.579 avg_d=1.580 std_dev=0.625
OP1	B	0, 0.445, 1.128, 1.812, 3.013 max_d=3.013 avg_d=1.128 std_dev=0.683

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.03	0.03	0.01	0.11	0.14	0.24	0.18
C2	0.03	0.00	0.07	0.09	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.02	0.03	0.24	0.21	0.23	0.21
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.06	0.03	0.06	0.12	0.00	0.04	0.08	0.01	0.14	0.21	0.09	0.11
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.01	0.12	0.02	0.11	0.06	0.10	0.12	0.03	0.01	0.13	0.02	0.21	0.31	0.12	0.17
C4	0.03	0.02	0.06	0.11	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.13	0.01	0.04	0.37	0.32	0.31	0.32
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.06	0.06	0.06	0.04	0.09	0.01	0.02	0.12	0.18	0.09
C5	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.10	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.01	0.04	0.39	0.33	0.30	0.33
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.08	0.11	0.07	0.06	0.04	0.16	0.02	0.01	0.14	0.20	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.01	0.03	0.33	0.26	0.22	0.25
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.07	0.02	0.02	0.23	0.20	0.21	0.20
N3	0.03	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.09	0.12	0.01	0.03	0.31	0.27	0.27	0.26
O2	0.05	0.01	0.12	0.12	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.15	0.14	0.02	0.06	0.19	0.19	0.23	0.20
O2'	0.03	0.09	0.00	0.03	0.07	0.06	0.05	0.06	0.04	0.04	0.09	0.15	0.00	0.07	0.08	0.06	0.06	0.16	0.16	0.12
O3'	0.03	0.10	0.04	0.01	0.13	0.04	0.14	0.04	0.12	0.07	0.12	0.14	0.07	0.00	0.16	0.03	0.19	0.41	0.21	0.22
O4	0.03	0.02	0.08	0.13	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.16	0.00	0.04	0.39	0.36	0.36	0.36
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.06	0.06	0.03	0.04	0.00	0.14	0.18	0.35	0.26
O5'	0.11	0.24	0.14	0.21	0.37	0.02	0.39	0.01	0.33	0.23	0.31	0.19	0.06	0.19	0.39	0.14	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.14	0.21	0.21	0.31	0.32	0.12	0.33	0.14	0.26	0.20	0.27	0.19	0.16	0.41	0.36	0.18	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.24	0.23	0.09	0.12	0.31	0.18	0.30	0.20	0.22	0.21	0.27	0.23	0.16	0.21	0.36	0.35	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.18	0.21	0.11	0.17	0.32	0.09	0.33	0.02	0.25	0.20	0.26	0.20	0.12	0.22	0.36	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.14	0.18	0.21	0.14	0.16	0.16	0.17	0.18	0.15	0.16	0.15	0.22	0.16	0.14	0.19	0.27	0.16	0.21	0.53	0.30	0.26
C2	0.15	0.15	0.17	0.19	0.14	0.15	0.16	0.16	0.17	0.15	0.16	0.15	0.21	0.16	0.14	0.19	0.24	0.15	0.20	0.53	0.29	0.26
C2'	0.15	0.17	0.22	0.24	0.16	0.16	0.17	0.17	0.19	0.15	0.19	0.16	0.22	0.17	0.15	0.21	0.29	0.15	0.22	0.50	0.28	0.25
C3'	0.16	0.17	0.21	0.23	0.16	0.16	0.18	0.17	0.19	0.17	0.18	0.17	0.23	0.18	0.16	0.21	0.28	0.16	0.23	0.51	0.28	0.25
C4	0.14	0.16	0.17	0.19	0.15	0.16	0.15	0.19	0.17	0.15	0.15	0.15	0.20	0.16	0.14	0.18	0.23	0.15	0.22	0.57	0.32	0.27
C4'	0.14	0.15	0.19	0.21	0.14	0.15	0.15	0.16	0.17	0.14	0.16	0.14	0.21	0.16	0.14	0.19	0.27	0.14	0.21	0.53	0.29	0.25
C5	0.14	0.16	0.16	0.19	0.14	0.16	0.15	0.18	0.17	0.15	0.15	0.15	0.21	0.17	0.14	0.18	0.23	0.15	0.22	0.58	0.32	0.27
C5'	0.14	0.14	0.17	0.20	0.14	0.14	0.16	0.16	0.18	0.15	0.16	0.14	0.22	0.17	0.14	0.18	0.25	0.14	0.21	0.54	0.29	0.25
C6	0.14	0.16	0.17	0.19	0.14	0.15	0.15	0.17	0.17	0.14	0.15	0.15	0.21	0.16	0.14	0.19	0.24	0.15	0.20	0.56	0.31	0.26
N1	0.15	0.15	0.17	0.20	0.14	0.15	0.15	0.16	0.17	0.14	0.15	0.15	0.21	0.16	0.14	0.19	0.24	0.15	0.20	0.54	0.30	0.26
N3	0.15	0.16	0.17	0.19	0.15	0.16	0.16	0.18	0.17	0.15	0.16	0.16	0.21	0.17	0.15	0.19	0.23	0.15	0.21	0.54	0.30	0.26
O2	0.15	0.14	0.18	0.20	0.14	0.16	0.15	0.16	0.17	0.15	0.16	0.15	0.20	0.16	0.14	0.21	0.25	0.16	0.20	0.50	0.28	0.25
O2'	0.21	0.22	0.28	0.31	0.21	0.23	0.21	0.22	0.22	0.20	0.22	0.21	0.23	0.20	0.20	0.27	0.37	0.20	0.26	0.49	0.31	0.28
O3'	0.20	0.20	0.25	0.26	0.20	0.20	0.21	0.21	0.23	0.21	0.21	0.20	0.26	0.22	0.20	0.25	0.31	0.20	0.26	0.50	0.30	0.27
O4	0.15	0.16	0.17	0.21	0.15	0.17	0.16	0.21	0.17	0.16	0.16	0.15	0.21	0.17	0.15	0.17	0.24	0.16	0.23	0.58	0.33	0.28
O4'	0.16	0.15	0.19	0.21	0.15	0.17	0.16	0.17	0.18	0.16	0.16	0.15	0.22	0.17	0.15	0.20	0.27	0.16	0.21	0.54	0.31	0.27
O5'	0.32	0.31	0.28	0.29	0.32	0.31	0.34	0.31	0.35	0.34	0.33	0.31	0.37	0.35	0.32	0.28	0.30	0.34	0.30	0.37	0.50	0.31
OP1	0.32	0.30	0.27	0.28	0.31	0.30	0.32	0.30	0.32	0.33	0.30	0.30	0.34	0.33	0.32	0.28	0.28	0.34	0.30	0.39	0.50	0.29
OP2	0.29	0.26	0.27	0.29	0.28	0.29	0.30	0.31	0.30	0.32	0.27	0.27	0.33	0.32	0.29	0.27	0.31	0.32	0.33	0.47	0.52	0.34
P	0.28	0.27	0.25	0.27	0.28	0.27	0.30	0.29	0.30	0.30	0.28	0.27	0.33	0.31	0.29	0.25	0.29	0.31	0.30	0.43	0.50	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.13	0.11	0.08
C2	0.04	0.00	0.11	0.14	0.02	0.06	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.10	0.18	0.06	0.13	0.40	0.20	0.16
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.09	0.11	0.06	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.18	0.12	0.09
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.11	0.13	0.13	0.13	0.12	0.12	0.06	0.02	0.01	0.01	0.09	0.21	0.14	0.12
C4	0.02	0.02	0.06	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.12	0.35	0.17	0.14
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.06	0.07	0.08	0.04	0.05	0.03	0.01	0.02	0.13	0.12	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.02	0.15	0.43	0.22	0.17
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.12	0.13	0.10	0.08	0.13	0.14	0.08	0.05	0.04	0.02	0.01	0.19	0.16	0.02
C6	0.02	0.02	0.06	0.11	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.14	0.03	0.16	0.48	0.26	0.19
C8	0.01	0.02	0.08	0.13	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.14	0.04	0.14	0.33	0.17	0.15
N1	0.04	0.01	0.09	0.13	0.02	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.16	0.05	0.15	0.46	0.24	0.18
N3	0.04	0.01	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.16	0.06	0.12	0.34	0.16	0.14
N6	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.15	0.02	0.17	0.53	0.30	0.21
N7	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.03	0.16	0.44	0.24	0.18
N9	0.00	0.03	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.09	0.27	0.14	0.12
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.05	0.08	0.09	0.05	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.17	0.10	0.07
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.10	0.03	0.11	0.04	0.14	0.14	0.16	0.16	0.15	0.14	0.06	0.04	0.00	0.02	0.11	0.32	0.22	0.18
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.05	0.06	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.06	0.18	0.11
O5'	0.05	0.13	0.07	0.09	0.12	0.02	0.15	0.01	0.16	0.14	0.15	0.12	0.17	0.16	0.09	0.06	0.11	0.06	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.13	0.40	0.18	0.21	0.35	0.13	0.43	0.19	0.48	0.33	0.46	0.34	0.53	0.44	0.27	0.17	0.32	0.06	0.03	0.00	0.03	0.01
OP2	0.11	0.20	0.12	0.14	0.17	0.12	0.22	0.16	0.26	0.17	0.24	0.16	0.30	0.24	0.14	0.10	0.22	0.18	0.02	0.03	0.00	0.01
P	0.08	0.16	0.09	0.12	0.14	0.03	0.17	0.02	0.19	0.15	0.18	0.14	0.21	0.18	0.12	0.07	0.18	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00