Doublet Group distance statistics: 54868

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 5, 3, 0, 4, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.010, 0.020, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C4	A	0, -0.003, 0.022, 0.047, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.022 std_dev=0.025
C2	A	0, -0.005, 0.024, 0.053, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.024 std_dev=0.029
C5	A	0, -0.027, 0.018, 0.064, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.018 std_dev=0.046
N1	A	0, -0.021, 0.027, 0.075, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.027 std_dev=0.048
O2	A	0, 0.008, 0.057, 0.106, 0.218 max_d=0.218 avg_d=0.057 std_dev=0.049
C6	A	0, -0.022, 0.030, 0.082, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.030 std_dev=0.052
O4	A	0, 0.014, 0.069, 0.124, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.069 std_dev=0.055
C1'	A	0, -0.034, 0.036, 0.105, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.036 std_dev=0.069
O2'	A	0, 0.035, 0.225, 0.415, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.225 std_dev=0.190
O4'	A	0, -0.022, 0.198, 0.417, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.198 std_dev=0.219
C8	B	0, 0.302, 0.524, 0.746, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.524 std_dev=0.222
C2'	A	0, -0.013, 0.217, 0.446, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.217 std_dev=0.229
N7	B	0, 0.297, 0.527, 0.757, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.527 std_dev=0.230
C5	B	0, 0.218, 0.451, 0.684, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.451 std_dev=0.233
N9	B	0, 0.210, 0.457, 0.704, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.457 std_dev=0.247
C4	B	0, 0.183, 0.438, 0.694, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.438 std_dev=0.256
N6	B	0, 0.294, 0.573, 0.853, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.573 std_dev=0.279
C6	B	0, 0.199, 0.482, 0.764, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.482 std_dev=0.282
N3	B	0, 0.247, 0.537, 0.827, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.537 std_dev=0.290
C1'	B	0, 0.231, 0.524, 0.817, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.524 std_dev=0.293
C2	B	0, 0.297, 0.596, 0.894, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.596 std_dev=0.298
N1	B	0, 0.253, 0.554, 0.855, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.554 std_dev=0.301
C2'	B	0, 0.272, 0.582, 0.892, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.582 std_dev=0.310
O2'	B	0, 0.368, 0.708, 1.048, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.708 std_dev=0.340
O4'	B	0, 0.248, 0.610, 0.972, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.610 std_dev=0.362
C3'	A	0, -0.011, 0.365, 0.741, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.365 std_dev=0.376
C4'	A	0, -0.048, 0.332, 0.713, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.332 std_dev=0.380
C3'	B	0, 0.287, 0.687, 1.087, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.687 std_dev=0.400
C4'	B	0, 0.310, 0.737, 1.165, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.737 std_dev=0.427
O5'	B	0, 0.408, 0.838, 1.268, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.838 std_dev=0.430
OP2	B	0, 0.490, 0.949, 1.409, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.949 std_dev=0.460
P	B	0, 0.506, 0.987, 1.467, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.987 std_dev=0.480
C5'	B	0, 0.392, 0.882, 1.371, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.882 std_dev=0.489
O3'	A	0, 0.050, 0.559, 1.068, 2.352 max_d=2.352 avg_d=0.559 std_dev=0.509
O3'	B	0, 0.364, 0.886, 1.408, 1.939 max_d=1.939 avg_d=0.886 std_dev=0.522
OP1	B	0, 0.578, 1.191, 1.805, 2.156 max_d=2.156 avg_d=1.191 std_dev=0.614
C5'	A	0, -0.066, 0.555, 1.176, 2.729 max_d=2.729 avg_d=0.555 std_dev=0.621
O5'	A	0, -0.109, 0.723, 1.554, 2.795 max_d=2.795 avg_d=0.723 std_dev=0.832
OP2	A	0, -0.031, 0.953, 1.937, 3.488 max_d=3.488 avg_d=0.953 std_dev=0.984
P	A	0, -0.117, 0.890, 1.897, 3.586 max_d=3.586 avg_d=0.890 std_dev=1.007
OP1	A	0, -0.211, 1.119, 2.448, 4.667 max_d=4.667 avg_d=1.119 std_dev=1.330

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.08	0.01	0.11	0.03	0.13	0.06	0.03	0.07	0.01	0.02	0.08	0.00	0.15	0.11	0.14	0.07
C2	0.02	0.00	0.14	0.16	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.01	0.08	0.31	0.20	0.28	0.21
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.05	0.02	0.12	0.02	0.13	0.03	0.09	0.24	0.00	0.02	0.05	0.01	0.22	0.29	0.14	0.15
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.13	0.00	0.11	0.03	0.10	0.10	0.15	0.20	0.01	0.01	0.13	0.01	0.28	0.41	0.14	0.22
C4	0.08	0.01	0.05	0.13	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.16	0.00	0.09	0.47	0.38	0.47	0.39
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.04	0.07	0.03	0.06	0.00	0.01	0.14	0.20	0.03
C5	0.11	0.01	0.12	0.11	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.15	0.01	0.07	0.51	0.42	0.47	0.43
C5'	0.03	0.08	0.02	0.03	0.13	0.01	0.16	0.00	0.15	0.09	0.10	0.07	0.07	0.06	0.14	0.01	0.01	0.22	0.30	0.02
C6	0.13	0.01	0.13	0.10	0.01	0.06	0.00	0.15	0.00	0.00	0.02	0.01	0.15	0.12	0.00	0.06	0.45	0.34	0.35	0.34
N1	0.06	0.01	0.03	0.10	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.01	0.06	0.32	0.22	0.25	0.21
N3	0.03	0.00	0.09	0.15	0.00	0.04	0.01	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.01	0.09	0.39	0.28	0.38	0.29
O2	0.07	0.00	0.24	0.20	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.18	0.01	0.09	0.24	0.14	0.23	0.15
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.09	0.07	0.15	0.07	0.15	0.06	0.05	0.15	0.00	0.06	0.10	0.06	0.08	0.20	0.11	0.06
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.16	0.03	0.15	0.06	0.12	0.08	0.17	0.18	0.06	0.00	0.18	0.02	0.23	0.50	0.20	0.27
O4	0.08	0.01	0.05	0.13	0.00	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.18	0.00	0.09	0.50	0.42	0.53	0.43
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.09	0.00	0.07	0.01	0.06	0.06	0.09	0.09	0.06	0.02	0.09	0.00	0.08	0.06	0.23	0.13
O5'	0.15	0.31	0.22	0.28	0.47	0.01	0.51	0.01	0.45	0.32	0.39	0.24	0.08	0.23	0.50	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.20	0.29	0.41	0.38	0.14	0.42	0.22	0.34	0.22	0.28	0.14	0.20	0.50	0.42	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.28	0.14	0.14	0.47	0.20	0.47	0.30	0.35	0.25	0.38	0.23	0.11	0.20	0.53	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.21	0.15	0.22	0.39	0.03	0.43	0.02	0.34	0.21	0.29	0.15	0.06	0.27	0.43	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.18	0.18	0.19	0.18	0.16	0.22	0.19	0.25	0.21	0.22	0.17	0.29	0.24	0.18	0.24	0.24	0.19	0.28	0.27	0.32	0.27
C2	0.17	0.18	0.15	0.16	0.19	0.16	0.23	0.20	0.25	0.21	0.23	0.17	0.30	0.24	0.18	0.20	0.18	0.19	0.29	0.28	0.32	0.27
C2'	0.28	0.25	0.35	0.35	0.25	0.29	0.25	0.27	0.25	0.27	0.23	0.26	0.26	0.27	0.26	0.37	0.40	0.26	0.31	0.31	0.35	0.31
C3'	0.32	0.29	0.36	0.36	0.30	0.33	0.30	0.32	0.28	0.32	0.27	0.30	0.29	0.32	0.31	0.38	0.40	0.32	0.34	0.34	0.38	0.34
C4	0.17	0.17	0.16	0.18	0.17	0.18	0.20	0.26	0.20	0.22	0.16	0.16	0.26	0.24	0.18	0.18	0.19	0.20	0.27	0.26	0.31	0.25
C4'	0.20	0.19	0.20	0.20	0.20	0.19	0.22	0.21	0.23	0.22	0.21	0.19	0.27	0.24	0.20	0.25	0.23	0.21	0.28	0.27	0.32	0.27
C5	0.17	0.17	0.15	0.17	0.17	0.18	0.20	0.25	0.20	0.22	0.16	0.16	0.25	0.24	0.18	0.18	0.18	0.20	0.27	0.25	0.31	0.25
C5'	0.20	0.20	0.18	0.19	0.20	0.19	0.23	0.23	0.24	0.23	0.21	0.20	0.28	0.25	0.20	0.23	0.21	0.22	0.29	0.27	0.34	0.28
C6	0.17	0.16	0.14	0.16	0.17	0.16	0.21	0.22	0.21	0.21	0.17	0.16	0.26	0.24	0.18	0.19	0.17	0.19	0.27	0.26	0.31	0.25
N1	0.17	0.17	0.15	0.16	0.18	0.15	0.22	0.20	0.23	0.21	0.20	0.16	0.28	0.24	0.18	0.20	0.18	0.19	0.28	0.27	0.32	0.26
N3	0.17	0.16	0.15	0.17	0.18	0.17	0.22	0.23	0.24	0.21	0.19	0.16	0.30	0.24	0.18	0.18	0.18	0.19	0.27	0.26	0.32	0.26
O2	0.19	0.22	0.17	0.18	0.21	0.17	0.24	0.19	0.28	0.22	0.28	0.20	0.31	0.24	0.20	0.22	0.20	0.20	0.32	0.31	0.34	0.30
O2'	0.22	0.20	0.29	0.29	0.21	0.24	0.22	0.22	0.23	0.22	0.21	0.21	0.26	0.23	0.21	0.32	0.36	0.23	0.31	0.30	0.34	0.30
O3'	0.37	0.33	0.41	0.40	0.33	0.38	0.33	0.37	0.30	0.36	0.29	0.35	0.31	0.35	0.35	0.43	0.44	0.37	0.38	0.38	0.42	0.39
O4	0.18	0.19	0.18	0.20	0.18	0.20	0.20	0.29	0.19	0.22	0.18	0.18	0.24	0.24	0.19	0.19	0.21	0.20	0.27	0.26	0.31	0.25
O4'	0.20	0.21	0.17	0.17	0.22	0.18	0.25	0.21	0.28	0.24	0.25	0.20	0.33	0.27	0.21	0.24	0.19	0.22	0.30	0.29	0.34	0.29
O5'	0.44	0.43	0.38	0.39	0.47	0.43	0.53	0.45	0.55	0.53	0.49	0.42	0.61	0.57	0.48	0.38	0.37	0.47	0.40	0.38	0.40	0.38
OP1	0.37	0.36	0.29	0.29	0.39	0.34	0.44	0.37	0.45	0.46	0.40	0.35	0.51	0.49	0.40	0.31	0.27	0.41	0.33	0.31	0.36	0.32
OP2	0.53	0.48	0.47	0.49	0.55	0.53	0.61	0.58	0.60	0.63	0.53	0.49	0.66	0.66	0.57	0.44	0.46	0.57	0.53	0.51	0.53	0.51
P	0.36	0.34	0.30	0.31	0.38	0.34	0.44	0.39	0.45	0.45	0.39	0.33	0.51	0.49	0.39	0.30	0.30	0.39	0.35	0.34	0.38	0.34

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.14	0.12	0.11
C2	0.03	0.00	0.14	0.16	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.20	0.05	0.26	0.25	0.27	0.25
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.02	0.06	0.08	0.11	0.14	0.04	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.17	0.22	0.10	0.15
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.02	0.09	0.12	0.13	0.15	0.08	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.21	0.27	0.11	0.18
C4	0.02	0.00	0.07	0.08	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.03	0.27	0.24	0.25	0.24
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.08	0.05	0.04	0.08	0.08	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.10	0.14	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.02	0.31	0.29	0.31	0.30
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.11	0.00	0.16	0.00	0.17	0.16	0.15	0.09	0.20	0.19	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.11	0.22	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.03	0.32	0.30	0.34	0.31
C8	0.01	0.00	0.08	0.12	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.13	0.04	0.31	0.27	0.26	0.28
N1	0.03	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.16	0.04	0.30	0.29	0.32	0.29
N3	0.03	0.00	0.14	0.15	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.19	0.05	0.24	0.23	0.23	0.22
N6	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.03	0.33	0.33	0.38	0.34
N7	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.03	0.34	0.31	0.34	0.32
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.25	0.22	0.20	0.21
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.08	0.05	0.12	0.14	0.06	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.06	0.16	0.08	0.06
O3'	0.01	0.20	0.02	0.01	0.09	0.01	0.07	0.02	0.10	0.13	0.16	0.19	0.10	0.10	0.04	0.04	0.00	0.01	0.17	0.31	0.17	0.20
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.08	0.17	0.09
O5'	0.13	0.26	0.17	0.21	0.27	0.01	0.31	0.01	0.32	0.31	0.30	0.24	0.33	0.34	0.25	0.06	0.17	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.14	0.25	0.22	0.27	0.24	0.10	0.29	0.11	0.30	0.27	0.29	0.23	0.33	0.31	0.22	0.16	0.31	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.27	0.10	0.11	0.25	0.14	0.31	0.22	0.34	0.26	0.32	0.23	0.38	0.34	0.20	0.08	0.17	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.25	0.15	0.18	0.24	0.02	0.30	0.01	0.31	0.28	0.29	0.22	0.34	0.32	0.21	0.06	0.20	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00