Doublet Group distance statistics: 54873

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.014, 0.027, 0.039, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.027 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.013, 0.027, 0.041, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.027 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.002, 0.020, 0.038, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.020 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.014, 0.033, 0.052, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.033 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.016, 0.038, 0.061, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.038 std_dev=0.022
O2	A	0, 0.037, 0.087, 0.136, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.087 std_dev=0.049
O4	A	0, 0.069, 0.167, 0.265, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.167 std_dev=0.098
O4'	A	0, 0.046, 0.166, 0.285, 0.361 max_d=0.361 avg_d=0.166 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.082, 0.209, 0.336, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.209 std_dev=0.127
C4'	A	0, 0.100, 0.274, 0.449, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.274 std_dev=0.175
C3'	A	0, 0.130, 0.320, 0.510, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.320 std_dev=0.190
C4	B	0, 0.189, 0.380, 0.571, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.380 std_dev=0.191
N1	B	0, 0.202, 0.393, 0.584, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.393 std_dev=0.191
O2'	A	0, 0.145, 0.342, 0.538, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.342 std_dev=0.196
C5	B	0, 0.127, 0.326, 0.524, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.326 std_dev=0.198
C2	B	0, 0.201, 0.409, 0.617, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.409 std_dev=0.208
C6	B	0, 0.133, 0.342, 0.552, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.342 std_dev=0.210
N3	B	0, 0.176, 0.420, 0.665, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.420 std_dev=0.245
N9	B	0, 0.245, 0.512, 0.780, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.512 std_dev=0.268
N7	B	0, 0.169, 0.437, 0.706, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.437 std_dev=0.269
N6	B	0, 0.225, 0.502, 0.780, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.502 std_dev=0.277
C8	B	0, 0.233, 0.520, 0.808, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.520 std_dev=0.287
C5'	A	0, 0.188, 0.477, 0.766, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.477 std_dev=0.289
O3'	A	0, 0.255, 0.565, 0.874, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.565 std_dev=0.309
C1'	B	0, 0.268, 0.670, 1.072, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.670 std_dev=0.402
OP1	A	0, 0.321, 0.744, 1.166, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.744 std_dev=0.423
O5'	A	0, 0.053, 0.484, 0.914, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.484 std_dev=0.431
C2'	B	0, 0.282, 0.727, 1.172, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.727 std_dev=0.445
P	A	0, 0.218, 0.674, 1.131, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.674 std_dev=0.457
O4'	B	0, 0.276, 0.773, 1.269, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.773 std_dev=0.497
C3'	B	0, 0.305, 0.811, 1.316, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.811 std_dev=0.505
O2'	B	0, 0.392, 0.937, 1.482, 1.612 max_d=1.612 avg_d=0.937 std_dev=0.545
C4'	B	0, 0.297, 0.850, 1.403, 1.757 max_d=1.757 avg_d=0.850 std_dev=0.553
OP2	A	0, 0.325, 0.883, 1.440, 1.790 max_d=1.790 avg_d=0.883 std_dev=0.558
O3'	B	0, 0.400, 0.995, 1.590, 1.816 max_d=1.816 avg_d=0.995 std_dev=0.595
C5'	B	0, 0.347, 0.947, 1.548, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.947 std_dev=0.601
O5'	B	0, 0.377, 1.173, 1.969, 2.742 max_d=2.742 avg_d=1.173 std_dev=0.796
OP2	B	0, 0.243, 1.080, 1.917, 3.006 max_d=3.006 avg_d=1.080 std_dev=0.837
P	B	0, 0.241, 1.126, 2.011, 3.135 max_d=3.135 avg_d=1.126 std_dev=0.885
OP1	B	0, 0.244, 1.368, 2.491, 3.903 max_d=3.903 avg_d=1.368 std_dev=1.124

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.06	0.11	0.02	0.01	0.04	0.01	0.12	0.11	0.24	0.08
C2	0.06	0.00	0.07	0.05	0.02	0.07	0.02	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.12	0.05	0.02	0.07	0.29	0.22	0.23	0.21
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.02	0.07	0.03	0.06	0.03	0.07	0.12	0.00	0.02	0.07	0.01	0.18	0.18	0.18	0.12
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.09	0.01	0.13	0.04	0.13	0.06	0.06	0.09	0.01	0.01	0.08	0.01	0.24	0.21	0.15	0.17
C4	0.04	0.02	0.07	0.09	0.00	0.09	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.02	0.09	0.10	0.00	0.05	0.42	0.31	0.30	0.33
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.11	0.06	0.07	0.10	0.08	0.03	0.09	0.01	0.02	0.10	0.23	0.04
C5	0.03	0.02	0.07	0.13	0.01	0.11	0.00	0.20	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.15	0.01	0.03	0.43	0.31	0.27	0.33
C5'	0.04	0.12	0.03	0.04	0.18	0.01	0.20	0.00	0.18	0.11	0.14	0.13	0.06	0.07	0.19	0.02	0.01	0.07	0.24	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.11	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.14	0.01	0.03	0.37	0.25	0.22	0.24
N1	0.02	0.02	0.03	0.06	0.02	0.06	0.02	0.11	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.06	0.02	0.04	0.27	0.20	0.22	0.17
N3	0.06	0.01	0.07	0.06	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.12	0.05	0.01	0.06	0.36	0.27	0.26	0.27
O2	0.11	0.01	0.12	0.09	0.02	0.10	0.03	0.13	0.03	0.04	0.01	0.00	0.19	0.10	0.02	0.12	0.25	0.22	0.24	0.19
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.09	0.08	0.06	0.06	0.05	0.05	0.12	0.19	0.00	0.02	0.11	0.07	0.13	0.19	0.16	0.10
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.10	0.03	0.15	0.07	0.14	0.06	0.05	0.10	0.02	0.00	0.09	0.02	0.23	0.26	0.19	0.21
O4	0.04	0.02	0.07	0.08	0.00	0.09	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.11	0.09	0.00	0.05	0.45	0.34	0.34	0.37
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.06	0.12	0.07	0.02	0.05	0.00	0.10	0.08	0.33	0.13
O5'	0.12	0.29	0.18	0.24	0.42	0.02	0.43	0.01	0.37	0.27	0.36	0.25	0.13	0.23	0.45	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.11	0.22	0.18	0.21	0.31	0.10	0.31	0.07	0.25	0.20	0.27	0.22	0.19	0.26	0.34	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.23	0.18	0.15	0.30	0.23	0.27	0.24	0.22	0.22	0.26	0.24	0.16	0.19	0.34	0.33	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.21	0.12	0.17	0.33	0.04	0.33	0.02	0.24	0.17	0.27	0.19	0.10	0.21	0.37	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.27	0.28	0.25	0.24	0.29	0.20	0.32	0.18	0.21	0.19	0.30	0.23	0.19	0.26	0.34	0.24	0.32	0.44	0.44	0.58	0.45
C2	0.27	0.25	0.24	0.24	0.22	0.25	0.17	0.29	0.17	0.18	0.17	0.27	0.23	0.17	0.22	0.29	0.23	0.27	0.42	0.41	0.55	0.42
C2'	0.36	0.29	0.34	0.32	0.27	0.34	0.22	0.37	0.21	0.24	0.21	0.33	0.26	0.22	0.29	0.41	0.31	0.37	0.40	0.40	0.55	0.41
C3'	0.31	0.25	0.29	0.26	0.22	0.30	0.17	0.32	0.15	0.19	0.14	0.29	0.24	0.18	0.24	0.38	0.26	0.33	0.35	0.34	0.48	0.35
C4	0.21	0.26	0.17	0.18	0.19	0.20	0.15	0.26	0.13	0.16	0.19	0.25	0.20	0.16	0.18	0.21	0.18	0.22	0.45	0.47	0.62	0.49
C4'	0.31	0.26	0.28	0.25	0.23	0.29	0.18	0.31	0.17	0.20	0.17	0.30	0.23	0.19	0.25	0.36	0.24	0.32	0.40	0.40	0.55	0.41
C5	0.22	0.26	0.18	0.18	0.19	0.20	0.15	0.26	0.13	0.16	0.18	0.25	0.19	0.16	0.18	0.22	0.18	0.23	0.46	0.49	0.64	0.51
C5'	0.29	0.26	0.25	0.22	0.22	0.26	0.20	0.28	0.19	0.21	0.18	0.28	0.27	0.22	0.23	0.33	0.20	0.30	0.35	0.37	0.53	0.38
C6	0.24	0.26	0.20	0.19	0.20	0.22	0.16	0.27	0.15	0.16	0.17	0.26	0.21	0.16	0.20	0.26	0.19	0.24	0.44	0.46	0.62	0.48
N1	0.27	0.25	0.23	0.22	0.21	0.24	0.17	0.28	0.16	0.17	0.17	0.27	0.22	0.17	0.22	0.29	0.21	0.27	0.43	0.43	0.58	0.44
N3	0.24	0.27	0.21	0.20	0.20	0.23	0.16	0.28	0.15	0.17	0.17	0.26	0.23	0.17	0.20	0.25	0.19	0.25	0.43	0.43	0.57	0.45
O2	0.30	0.24	0.29	0.28	0.23	0.29	0.18	0.31	0.18	0.20	0.17	0.27	0.23	0.18	0.24	0.33	0.28	0.30	0.41	0.40	0.50	0.39
O2'	0.45	0.37	0.46	0.45	0.37	0.45	0.31	0.48	0.29	0.33	0.30	0.42	0.31	0.30	0.39	0.53	0.46	0.47	0.47	0.47	0.63	0.49
O3'	0.34	0.26	0.33	0.30	0.23	0.33	0.16	0.34	0.15	0.19	0.13	0.31	0.25	0.18	0.25	0.43	0.31	0.35	0.34	0.32	0.45	0.33
O4	0.19	0.26	0.14	0.16	0.17	0.18	0.12	0.25	0.10	0.15	0.21	0.23	0.16	0.15	0.17	0.18	0.17	0.21	0.46	0.50	0.64	0.52
O4'	0.30	0.26	0.26	0.23	0.24	0.27	0.19	0.29	0.18	0.20	0.19	0.29	0.22	0.19	0.25	0.33	0.21	0.31	0.46	0.46	0.61	0.47
O5'	0.36	0.34	0.27	0.23	0.32	0.30	0.32	0.26	0.32	0.33	0.30	0.34	0.37	0.35	0.33	0.33	0.20	0.38	0.51	0.48	0.55	0.49
OP1	0.31	0.29	0.24	0.20	0.26	0.27	0.27	0.26	0.26	0.29	0.24	0.30	0.34	0.32	0.28	0.30	0.18	0.33	0.39	0.39	0.52	0.41
OP2	0.32	0.30	0.28	0.27	0.29	0.30	0.31	0.33	0.29	0.34	0.26	0.30	0.37	0.36	0.30	0.31	0.26	0.34	0.32	0.37	0.51	0.38
P	0.30	0.29	0.24	0.21	0.27	0.26	0.28	0.25	0.27	0.30	0.25	0.29	0.34	0.32	0.28	0.29	0.19	0.32	0.42	0.42	0.54	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.11	0.13	0.19	0.08
C2	0.03	0.00	0.14	0.16	0.01	0.07	0.02	0.12	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.13	0.21	0.05	0.30	0.29	0.40	0.31
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.07	0.02	0.04	0.01	0.07	0.08	0.12	0.14	0.06	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.20	0.22	0.18	0.16
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.08	0.01	0.05	0.02	0.08	0.11	0.14	0.15	0.06	0.08	0.03	0.02	0.01	0.02	0.31	0.33	0.16	0.24
C4	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.32	0.30	0.37	0.31
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.03	0.06	0.02	0.00	0.03	0.11	0.25	0.02
C5	0.01	0.02	0.04	0.05	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.44	0.43	0.50	0.44
C5'	0.03	0.12	0.01	0.02	0.10	0.00	0.13	0.00	0.14	0.14	0.13	0.10	0.16	0.15	0.09	0.06	0.03	0.01	0.01	0.17	0.34	0.01
C6	0.02	0.02	0.07	0.08	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.07	0.10	0.03	0.45	0.46	0.56	0.47
C8	0.01	0.03	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.06	0.12	0.03	0.44	0.41	0.40	0.41
N1	0.03	0.00	0.12	0.14	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.17	0.04	0.38	0.38	0.50	0.40
N3	0.03	0.01	0.14	0.15	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.19	0.05	0.25	0.23	0.33	0.24
N6	0.02	0.02	0.06	0.06	0.01	0.06	0.02	0.16	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.08	0.04	0.51	0.55	0.65	0.56
N7	0.01	0.03	0.06	0.08	0.01	0.07	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.00	0.05	0.09	0.03	0.51	0.50	0.54	0.51
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.29	0.27	0.30	0.26
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.07	0.06	0.11	0.12	0.06	0.05	0.03	0.00	0.04	0.02	0.09	0.17	0.16	0.08
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.09	0.02	0.06	0.03	0.10	0.12	0.17	0.19	0.08	0.09	0.04	0.04	0.00	0.02	0.30	0.35	0.14	0.25
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.14	0.11	0.27	0.11
O5'	0.11	0.30	0.20	0.31	0.32	0.03	0.44	0.01	0.45	0.44	0.38	0.25	0.51	0.51	0.29	0.09	0.30	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.13	0.29	0.22	0.33	0.30	0.11	0.43	0.17	0.46	0.41	0.38	0.23	0.55	0.50	0.27	0.17	0.35	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.40	0.18	0.16	0.37	0.25	0.50	0.34	0.56	0.40	0.50	0.33	0.65	0.54	0.30	0.16	0.14	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.31	0.16	0.24	0.31	0.02	0.44	0.01	0.47	0.41	0.40	0.24	0.56	0.51	0.26	0.08	0.25	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00