Doublet Group distance statistics: 54890

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 17, 31, 30, 16, 14, 9, 4, 0, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.011, 0.027, 0.044, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.010, 0.032, 0.055, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.011, 0.036, 0.060, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.036 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.010, 0.037, 0.065, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.037 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.014, 0.048, 0.082, 0.192 max_d=0.192 avg_d=0.048 std_dev=0.034
C2	B	0, 0.289, 0.480, 0.672, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.480 std_dev=0.191
O2'	B	0, 0.279, 0.476, 0.673, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.476 std_dev=0.197
O2	B	0, 0.241, 0.442, 0.644, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.442 std_dev=0.201
N1	B	0, 0.340, 0.542, 0.744, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.542 std_dev=0.202
C1'	B	0, 0.305, 0.518, 0.731, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.518 std_dev=0.213
C2'	B	0, 0.287, 0.504, 0.721, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.504 std_dev=0.217
N3	B	0, 0.298, 0.538, 0.777, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.538 std_dev=0.239
C6	B	0, 0.422, 0.662, 0.901, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.662 std_dev=0.239
C4	B	0, 0.376, 0.622, 0.867, 1.460 max_d=1.460 avg_d=0.622 std_dev=0.245
C5	B	0, 0.434, 0.682, 0.929, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.682 std_dev=0.248
O4'	B	0, 0.290, 0.607, 0.925, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.607 std_dev=0.317
O4	B	0, 0.371, 0.689, 1.008, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.689 std_dev=0.319
C3'	B	0, 0.252, 0.580, 0.908, 1.942 max_d=1.942 avg_d=0.580 std_dev=0.328
C2'	A	0, -0.024, 0.335, 0.693, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.335 std_dev=0.358
O4'	A	0, -0.057, 0.312, 0.681, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.312 std_dev=0.369
C4'	B	0, 0.254, 0.628, 1.001, 2.056 max_d=2.056 avg_d=0.628 std_dev=0.374
O3'	B	0, 0.204, 0.595, 0.986, 2.170 max_d=2.170 avg_d=0.595 std_dev=0.391
C4'	A	0, 0.100, 0.540, 0.981, 2.243 max_d=2.243 avg_d=0.540 std_dev=0.441
O5'	B	0, 0.292, 0.758, 1.224, 2.519 max_d=2.519 avg_d=0.758 std_dev=0.466
C5'	B	0, 0.251, 0.747, 1.242, 2.577 max_d=2.577 avg_d=0.747 std_dev=0.496
OP2	B	0, 0.391, 0.930, 1.468, 3.364 max_d=3.364 avg_d=0.930 std_dev=0.539
P	B	0, 0.336, 0.912, 1.488, 3.422 max_d=3.422 avg_d=0.912 std_dev=0.576
O2'	A	0, 0.242, 0.868, 1.494, 2.332 max_d=2.332 avg_d=0.868 std_dev=0.626
C3'	A	0, 0.226, 0.934, 1.643, 2.369 max_d=2.369 avg_d=0.934 std_dev=0.709
OP1	B	0, 0.258, 0.997, 1.736, 4.065 max_d=4.065 avg_d=0.997 std_dev=0.739
C5'	A	0, -0.322, 0.674, 1.670, 3.983 max_d=3.983 avg_d=0.674 std_dev=0.996
O3'	A	0, 0.399, 1.703, 3.006, 3.486 max_d=3.486 avg_d=1.703 std_dev=1.304
O5'	A	0, 0.368, 1.925, 3.481, 6.270 max_d=6.270 avg_d=1.925 std_dev=1.557
OP2	A	0, 0.579, 2.761, 4.943, 9.246 max_d=9.246 avg_d=2.761 std_dev=2.182
P	A	0, 0.563, 2.867, 5.171, 8.950 max_d=8.950 avg_d=2.867 std_dev=2.304
OP1	A	0, 0.909, 4.445, 7.981, 10.410 max_d=10.410 avg_d=4.445 std_dev=3.536

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.36	0.01	0.44	0.57	0.39	0.45
C2	0.03	0.00	0.22	0.10	0.01	0.18	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.38	0.60	0.26	0.49	0.63	0.81	0.56
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.11	0.01	0.05	0.24	0.10	0.13	0.17	0.22	0.07	0.08	0.02	0.00	0.03	0.02	0.80	1.05	0.46	0.79
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.12	0.01	0.23	0.02	0.19	0.37	0.11	0.10	0.25	0.35	0.18	0.02	0.01	0.04	0.41	0.52	0.33	0.35
C4	0.02	0.01	0.11	0.12	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.25	0.34	0.14	0.56	0.86	0.86	0.70
C4'	0.01	0.18	0.01	0.01	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.15	0.13	0.17	0.06	0.12	0.04	0.33	0.02	0.01	0.02	0.14	0.26	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.23	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.31	0.16	0.06	0.69	1.26	1.13	0.95
C5'	0.11	0.23	0.24	0.02	0.15	0.01	0.15	0.00	0.15	0.24	0.19	0.21	0.16	0.21	0.14	0.11	0.25	0.02	0.01	0.22	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.19	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.33	0.25	0.11	0.63	1.15	1.17	0.89
C8	0.02	0.01	0.13	0.37	0.01	0.15	0.01	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.39	0.21	0.16	0.93	1.68	1.13	1.19
N1	0.03	0.00	0.17	0.11	0.01	0.13	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.34	0.44	0.20	0.53	0.81	1.01	0.69
N3	0.04	0.00	0.22	0.10	0.00	0.17	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.36	0.60	0.26	0.46	0.57	0.70	0.51
N6	0.02	0.01	0.07	0.25	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.36	0.15	0.07	0.70	1.39	1.34	1.03
N7	0.01	0.01	0.08	0.35	0.01	0.12	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.39	0.17	0.09	0.90	1.76	1.30	1.24
N9	0.00	0.01	0.02	0.18	0.00	0.04	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.17	0.01	0.65	1.03	0.80	0.78
O2'	0.02	0.38	0.00	0.02	0.25	0.33	0.31	0.11	0.33	0.39	0.34	0.36	0.36	0.39	0.20	0.00	0.05	0.20	0.46	0.73	0.43	0.45
O3'	0.36	0.60	0.03	0.01	0.34	0.02	0.16	0.25	0.25	0.21	0.44	0.60	0.15	0.17	0.17	0.05	0.00	0.25	0.14	0.22	0.88	0.28
O4'	0.01	0.26	0.02	0.04	0.14	0.01	0.06	0.02	0.11	0.16	0.20	0.26	0.07	0.09	0.01	0.20	0.25	0.00	0.15	0.15	0.25	0.14
O5'	0.44	0.49	0.80	0.41	0.56	0.02	0.69	0.01	0.63	0.93	0.53	0.46	0.70	0.90	0.65	0.46	0.14	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.57	0.63	1.05	0.52	0.86	0.14	1.26	0.22	1.15	1.68	0.81	0.57	1.39	1.76	1.03	0.73	0.22	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.81	0.46	0.33	0.86	0.26	1.13	0.21	1.17	1.13	1.01	0.70	1.34	1.30	0.80	0.43	0.88	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.45	0.56	0.79	0.35	0.70	0.06	0.95	0.02	0.89	1.19	0.69	0.51	1.03	1.24	0.78	0.45	0.28	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.12	0.11	0.11	0.11	0.15	0.11	0.16	0.12	0.11	0.12	0.13	0.11	0.13	0.12	0.16	0.15	0.19	0.16	0.16
C2	0.16	0.11	0.11	0.11	0.13	0.16	0.14	0.18	0.15	0.13	0.12	0.10	0.10	0.11	0.14	0.21	0.18	0.20	0.16	0.17
C2'	0.20	0.18	0.22	0.22	0.18	0.22	0.19	0.22	0.20	0.19	0.18	0.18	0.22	0.24	0.18	0.22	0.22	0.27	0.21	0.22
C3'	0.57	0.47	0.60	0.62	0.50	0.66	0.55	0.67	0.58	0.54	0.46	0.42	0.60	0.61	0.48	0.62	0.67	0.72	0.66	0.68
C4	0.13	0.11	0.10	0.10	0.12	0.13	0.11	0.14	0.12	0.12	0.12	0.12	0.09	0.11	0.12	0.16	0.14	0.17	0.13	0.13
C4'	0.25	0.18	0.27	0.31	0.20	0.33	0.24	0.35	0.26	0.22	0.18	0.17	0.27	0.34	0.19	0.30	0.34	0.39	0.35	0.35
C5	0.12	0.12	0.09	0.09	0.12	0.11	0.11	0.11	0.12	0.11	0.13	0.12	0.09	0.12	0.13	0.14	0.12	0.14	0.12	0.11
C5'	0.17	0.17	0.21	0.26	0.18	0.22	0.19	0.25	0.19	0.17	0.18	0.20	0.19	0.35	0.18	0.22	0.24	0.30	0.27	0.26
C6	0.14	0.11	0.10	0.10	0.13	0.12	0.13	0.13	0.13	0.12	0.12	0.11	0.11	0.12	0.14	0.17	0.14	0.15	0.14	0.13
C8	0.11	0.13	0.10	0.09	0.12	0.11	0.11	0.11	0.11	0.11	0.14	0.15	0.09	0.13	0.13	0.12	0.11	0.15	0.11	0.11
N1	0.15	0.11	0.11	0.11	0.13	0.15	0.14	0.16	0.15	0.13	0.12	0.10	0.11	0.12	0.15	0.20	0.17	0.18	0.16	0.16
N3	0.15	0.11	0.11	0.11	0.12	0.16	0.13	0.17	0.14	0.13	0.12	0.11	0.10	0.11	0.13	0.19	0.17	0.19	0.16	0.16
N6	0.15	0.12	0.12	0.12	0.13	0.13	0.14	0.14	0.14	0.14	0.13	0.11	0.14	0.14	0.14	0.17	0.15	0.15	0.15	0.14
N7	0.11	0.13	0.09	0.09	0.12	0.10	0.11	0.10	0.10	0.11	0.14	0.15	0.08	0.13	0.13	0.12	0.10	0.13	0.10	0.10
N9	0.12	0.12	0.10	0.10	0.12	0.13	0.11	0.13	0.12	0.11	0.13	0.14	0.10	0.12	0.12	0.15	0.13	0.17	0.13	0.13
O2'	0.42	0.50	0.51	0.51	0.52	0.39	0.49	0.38	0.46	0.46	0.52	0.51	0.47	0.57	0.54	0.36	0.42	0.42	0.46	0.41
O3'	0.52	0.34	0.62	0.75	0.39	0.77	0.50	0.84	0.54	0.47	0.33	0.27	0.61	0.84	0.36	0.63	0.81	0.97	0.81	0.85
O4'	0.21	0.14	0.24	0.30	0.15	0.31	0.19	0.33	0.21	0.18	0.14	0.15	0.24	0.35	0.14	0.27	0.32	0.36	0.33	0.33
O5'	0.78	0.84	0.94	0.95	0.80	0.76	0.76	0.70	0.75	0.79	0.83	0.87	0.96	1.10	0.81	0.69	0.73	0.69	0.75	0.67
OP1	2.13	2.05	2.47	2.68	2.09	2.37	2.13	2.33	2.14	2.12	2.05	1.98	2.42	2.99	2.08	2.06	2.37	2.37	2.39	2.30
OP2	1.71	1.66	1.69	1.77	1.71	1.80	1.74	1.81	1.74	1.71	1.67	1.60	1.62	1.77	1.71	1.77	1.80	1.78	1.81	1.80
P	1.38	1.37	1.56	1.64	1.37	1.47	1.36	1.43	1.36	1.37	1.37	1.35	1.54	1.82	1.37	1.32	1.44	1.42	1.45	1.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.09	0.05
C2	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.01	0.02	0.09	0.10	0.14	0.09
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.07	0.07	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.07	0.07	0.02	0.01	0.09	0.01	0.05	0.09	0.08	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.02	0.13	0.15	0.20	0.14
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.01	0.03	0.13	0.14	0.19	0.14
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.08	0.04	0.07	0.04	0.04	0.02	0.10	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.01	0.03	0.11	0.11	0.14	0.10
N1	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.08	0.08	0.12	0.08
N3	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.01	0.11	0.13	0.17	0.12
O2	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.09	0.08	0.02	0.04	0.08	0.09	0.12	0.08
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.05	0.09	0.00	0.04	0.04	0.03	0.04	0.09	0.07	0.04
O3'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.11	0.02	0.11	0.02	0.09	0.04	0.09	0.08	0.04	0.00	0.12	0.02	0.07	0.13	0.13	0.08
O4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.00	0.03	0.14	0.17	0.23	0.16
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03	0.00	0.05	0.05	0.10	0.06
O5'	0.04	0.09	0.04	0.05	0.13	0.01	0.13	0.01	0.11	0.08	0.11	0.08	0.04	0.07	0.14	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.05	0.10	0.07	0.09	0.15	0.05	0.14	0.05	0.11	0.08	0.13	0.09	0.09	0.13	0.17	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.14	0.07	0.08	0.20	0.05	0.19	0.05	0.14	0.12	0.17	0.12	0.07	0.13	0.23	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.09	0.04	0.05	0.14	0.02	0.14	0.01	0.10	0.08	0.12	0.08	0.04	0.08	0.16	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00