Doublet Group distance statistics: 54892

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 4,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.008, 0.016, 0.025, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.027, 0.042, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.027 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.011, 0.026, 0.042, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.035, 0.054, 0.074, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.054 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.338, 0.529, 0.720, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.529 std_dev=0.191
C2'	A	0, 0.347, 0.580, 0.812, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.580 std_dev=0.232
C4'	A	0, 0.524, 0.819, 1.113, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.819 std_dev=0.294
O2'	A	0, 0.326, 0.638, 0.950, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.638 std_dev=0.312
O2	B	0, 0.638, 0.952, 1.266, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.952 std_dev=0.314
C3'	A	0, 0.563, 0.903, 1.244, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.903 std_dev=0.341
O5'	A	0, 0.695, 1.039, 1.383, 1.312 max_d=1.312 avg_d=1.039 std_dev=0.344
C2	B	0, 0.643, 1.040, 1.436, 1.422 max_d=1.422 avg_d=1.040 std_dev=0.397
N3	B	0, 0.866, 1.274, 1.683, 1.523 max_d=1.523 avg_d=1.274 std_dev=0.408
C4	B	0, 0.877, 1.340, 1.802, 1.693 max_d=1.693 avg_d=1.340 std_dev=0.462
C5'	A	0, 0.905, 1.402, 1.899, 1.821 max_d=1.821 avg_d=1.402 std_dev=0.497
O3'	A	0, 0.822, 1.340, 1.857, 1.826 max_d=1.826 avg_d=1.340 std_dev=0.518
O4	B	0, 1.145, 1.694, 2.242, 2.035 max_d=2.035 avg_d=1.694 std_dev=0.549
N1	B	0, 0.603, 1.311, 2.020, 1.976 max_d=1.976 avg_d=1.311 std_dev=0.708
C5	B	0, 0.571, 1.281, 1.992, 1.958 max_d=1.958 avg_d=1.281 std_dev=0.711
C2'	B	0, 1.452, 2.211, 2.969, 2.735 max_d=2.735 avg_d=2.211 std_dev=0.758
O2'	B	0, 1.577, 2.336, 3.096, 2.844 max_d=2.844 avg_d=2.336 std_dev=0.759
C6	B	0, 0.715, 1.494, 2.274, 2.237 max_d=2.237 avg_d=1.494 std_dev=0.780
C1'	B	0, 1.061, 1.843, 2.624, 2.494 max_d=2.494 avg_d=1.843 std_dev=0.782
P	A	0, 1.918, 2.841, 3.763, 3.537 max_d=3.537 avg_d=2.841 std_dev=0.922
O4'	B	0, 1.659, 2.588, 3.517, 3.267 max_d=3.267 avg_d=2.588 std_dev=0.929
OP2	A	0, 2.152, 3.169, 4.185, 3.910 max_d=3.910 avg_d=3.169 std_dev=1.016
C3'	B	0, 2.088, 3.112, 4.136, 3.786 max_d=3.786 avg_d=3.112 std_dev=1.024
C4'	B	0, 2.158, 3.229, 4.300, 3.907 max_d=3.907 avg_d=3.229 std_dev=1.071
O3'	B	0, 2.357, 3.491, 4.625, 4.082 max_d=4.082 avg_d=3.491 std_dev=1.134
C5'	B	0, 2.655, 3.930, 5.206, 4.926 max_d=4.926 avg_d=3.930 std_dev=1.275
O5'	B	0, 2.630, 3.929, 5.228, 4.930 max_d=4.930 avg_d=3.929 std_dev=1.299
OP2	B	0, 3.221, 4.806, 6.390, 5.841 max_d=5.841 avg_d=4.806 std_dev=1.585
OP1	A	0, 2.865, 4.537, 6.209, 5.674 max_d=5.674 avg_d=4.537 std_dev=1.672
P	B	0, 3.466, 5.153, 6.841, 6.215 max_d=6.215 avg_d=5.153 std_dev=1.687
OP1	B	0, 4.272, 6.319, 8.365, 7.547 max_d=7.547 avg_d=6.319 std_dev=2.046

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.38	0.56	0.25
C2	0.04	0.00	0.13	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.17	0.13	0.02	0.24	0.50	0.70	0.23
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.07	0.05	0.10	0.13	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.56	0.35	0.22
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.02	0.04	0.14	0.05	0.08	0.06	0.13	0.07	0.02	0.00	0.01	0.15	0.59	0.18	0.16
C4	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.04	0.01	0.24	0.38	0.72	0.20
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.05	0.14	0.02	0.06	0.07	0.13	0.06	0.04	0.02	0.00	0.02	0.32	0.19	0.14
C5	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.07	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.01	0.32	0.24	0.77	0.14
C5'	0.04	0.07	0.02	0.02	0.11	0.01	0.19	0.00	0.18	0.25	0.12	0.04	0.22	0.27	0.13	0.03	0.02	0.02	0.01	0.12	0.15	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.04	0.01	0.05	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01	0.33	0.28	0.76	0.15
C8	0.01	0.02	0.05	0.14	0.01	0.14	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.15	0.04	0.30	0.10	0.75	0.11
N1	0.03	0.00	0.10	0.05	0.00	0.02	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.08	0.01	0.30	0.41	0.73	0.19
N3	0.04	0.00	0.13	0.08	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.12	0.03	0.19	0.51	0.68	0.25
N6	0.03	0.02	0.06	0.06	0.01	0.07	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.06	0.01	0.37	0.18	0.76	0.13
N7	0.01	0.02	0.02	0.13	0.01	0.13	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.03	0.36	0.08	0.78	0.09
N9	0.00	0.01	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.20	0.30	0.69	0.20
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.08	0.04	0.07	0.03	0.10	0.03	0.14	0.16	0.09	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.53	0.27	0.19
O3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.04	0.15	0.08	0.12	0.06	0.13	0.06	0.02	0.00	0.02	0.15	0.67	0.30	0.11
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.27	0.52	0.27
O5'	0.08	0.24	0.12	0.15	0.24	0.02	0.32	0.01	0.33	0.30	0.30	0.19	0.37	0.36	0.20	0.06	0.15	0.09	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.38	0.50	0.56	0.59	0.38	0.32	0.24	0.12	0.28	0.10	0.41	0.51	0.18	0.08	0.30	0.53	0.67	0.27	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.56	0.70	0.35	0.18	0.72	0.19	0.77	0.15	0.76	0.75	0.73	0.68	0.76	0.78	0.69	0.27	0.30	0.52	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.25	0.23	0.22	0.16	0.20	0.14	0.14	0.02	0.15	0.11	0.19	0.25	0.13	0.09	0.20	0.19	0.11	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.35	0.16	0.05	0.39	0.16	0.38	0.18	0.36	0.34	0.37	0.32	0.17	0.21	0.40	0.40	0.16	0.20	0.15	0.17
C2	0.05	0.17	0.16	0.27	0.24	0.14	0.20	0.13	0.14	0.12	0.23	0.16	0.32	0.52	0.29	0.17	0.10	0.15	0.11	0.11
C2'	0.29	0.35	0.14	0.06	0.37	0.12	0.35	0.12	0.33	0.33	0.37	0.34	0.17	0.22	0.39	0.38	0.12	0.18	0.11	0.13
C3'	0.25	0.29	0.13	0.08	0.30	0.10	0.28	0.13	0.27	0.28	0.30	0.30	0.18	0.20	0.31	0.32	0.09	0.18	0.10	0.12
C4	0.12	0.26	0.09	0.20	0.31	0.10	0.28	0.13	0.23	0.21	0.30	0.25	0.23	0.46	0.34	0.25	0.09	0.14	0.07	0.09
C4'	0.27	0.30	0.18	0.04	0.31	0.12	0.31	0.10	0.30	0.29	0.30	0.28	0.22	0.06	0.32	0.34	0.10	0.19	0.10	0.13
C5	0.06	0.23	0.20	0.31	0.29	0.17	0.24	0.13	0.18	0.16	0.29	0.22	0.36	0.59	0.34	0.16	0.11	0.15	0.10	0.10
C5'	0.22	0.24	0.17	0.10	0.24	0.10	0.23	0.17	0.22	0.23	0.24	0.25	0.22	0.11	0.24	0.25	0.10	0.20	0.12	0.12
C6	0.12	0.16	0.29	0.38	0.24	0.23	0.19	0.15	0.13	0.11	0.23	0.14	0.48	0.65	0.29	0.10	0.16	0.18	0.17	0.16
C8	0.22	0.37	0.09	0.17	0.41	0.09	0.38	0.13	0.34	0.32	0.40	0.33	0.19	0.45	0.43	0.33	0.10	0.15	0.09	0.10
N1	0.10	0.15	0.26	0.35	0.23	0.20	0.18	0.15	0.13	0.10	0.22	0.13	0.43	0.61	0.28	0.11	0.15	0.17	0.16	0.15
N3	0.11	0.23	0.08	0.19	0.28	0.10	0.25	0.14	0.21	0.19	0.27	0.21	0.23	0.44	0.31	0.25	0.09	0.15	0.08	0.10
N6	0.23	0.15	0.41	0.47	0.23	0.30	0.19	0.19	0.16	0.16	0.22	0.13	0.60	0.72	0.29	0.14	0.22	0.24	0.23	0.22
N7	0.08	0.31	0.19	0.32	0.36	0.18	0.30	0.12	0.24	0.22	0.36	0.29	0.35	0.61	0.39	0.17	0.10	0.15	0.07	0.09
N9	0.23	0.34	0.09	0.11	0.38	0.10	0.36	0.15	0.32	0.31	0.36	0.31	0.16	0.36	0.40	0.35	0.12	0.16	0.11	0.13
O2'	0.29	0.36	0.16	0.04	0.38	0.14	0.37	0.14	0.35	0.34	0.38	0.35	0.17	0.17	0.40	0.39	0.14	0.21	0.13	0.16
O3'	0.24	0.29	0.12	0.11	0.27	0.11	0.25	0.18	0.25	0.26	0.29	0.30	0.18	0.18	0.28	0.29	0.10	0.20	0.12	0.13
O4'	0.33	0.36	0.24	0.12	0.40	0.21	0.41	0.19	0.39	0.37	0.38	0.33	0.25	0.10	0.41	0.44	0.19	0.23	0.19	0.20
O5'	0.24	0.26	0.16	0.06	0.26	0.16	0.26	0.16	0.25	0.25	0.26	0.29	0.17	0.03	0.26	0.30	0.13	0.26	0.13	0.18
OP1	0.14	0.19	0.10	0.35	0.11	0.62	0.18	0.99	0.19	0.12	0.15	0.30	0.48	0.03	0.10	0.32	0.75	0.89	0.76	0.82
OP2	1.07	1.16	0.75	0.27	1.07	0.45	0.99	0.24	0.98	1.09	1.13	1.18	0.81	0.03	1.07	0.93	0.36	0.20	0.30	0.29
P	0.36	0.39	0.27	0.03	0.34	0.11	0.31	0.26	0.31	0.36	0.37	0.41	0.40	0.01	0.34	0.29	0.11	0.23	0.16	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.11	0.03	0.00	0.06	0.10	0.13	0.08
C2	0.03	0.00	0.10	0.07	0.01	0.04	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.20	0.01	0.05	0.10	0.11	0.10	0.08
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.08	0.15	0.00	0.09	0.05	0.02	0.07	0.21	0.10	0.11
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.11	0.02	0.03	0.16	0.03	0.02	0.05	0.01	0.12	0.28	0.13	0.18
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.11	0.01	0.30	0.01	0.02	0.01	0.01	0.16	0.10	0.00	0.04	0.19	0.14	0.10	0.12
C4'	0.02	0.04	0.02	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.13	0.06	0.07	0.07	0.04	0.02	0.12	0.00	0.02	0.10	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.14	0.00	0.32	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.01	0.03	0.21	0.15	0.11	0.13
C5'	0.05	0.17	0.03	0.01	0.30	0.01	0.32	0.00	0.27	0.17	0.24	0.10	0.02	0.05	0.32	0.02	0.00	0.11	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.13	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.07	0.01	0.03	0.16	0.13	0.10	0.10
N1	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	0.17	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.10	0.02	0.02	0.10	0.11	0.11	0.08
N3	0.03	0.01	0.08	0.03	0.01	0.07	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.17	0.01	0.05	0.14	0.12	0.09	0.09
O2	0.06	0.01	0.15	0.16	0.01	0.07	0.01	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00	0.28	0.31	0.01	0.07	0.09	0.11	0.12	0.09
O2'	0.03	0.21	0.00	0.03	0.16	0.04	0.09	0.02	0.06	0.09	0.22	0.28	0.00	0.18	0.18	0.03	0.09	0.28	0.14	0.15
O3'	0.11	0.20	0.09	0.02	0.10	0.02	0.07	0.05	0.07	0.10	0.17	0.31	0.18	0.00	0.10	0.04	0.12	0.38	0.15	0.22
O4	0.03	0.01	0.05	0.05	0.00	0.12	0.01	0.32	0.01	0.02	0.01	0.01	0.18	0.10	0.00	0.05	0.20	0.15	0.12	0.14
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.07	0.03	0.04	0.05	0.00	0.19	0.15	0.26	0.20
O5'	0.06	0.10	0.07	0.12	0.19	0.02	0.21	0.00	0.16	0.10	0.14	0.09	0.09	0.12	0.20	0.19	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.11	0.21	0.28	0.14	0.10	0.15	0.11	0.13	0.11	0.12	0.11	0.28	0.38	0.15	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.10	0.10	0.13	0.10	0.05	0.11	0.02	0.10	0.11	0.09	0.12	0.14	0.15	0.12	0.26	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.08	0.11	0.18	0.12	0.03	0.13	0.01	0.10	0.08	0.09	0.09	0.15	0.22	0.14	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00