Doublet Group distance statistics: 54897

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.007, 0.014, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.003, 0.016, 0.030, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.002, 0.017, 0.031, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.003, 0.020, 0.036, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.020 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.017 std_dev=0.018
N9	A	0, -0.001, 0.018, 0.037, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.018 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.002, 0.021, 0.040, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.021 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.002, 0.023, 0.045, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.023 std_dev=0.022
C8	A	0, -0.001, 0.027, 0.055, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.027 std_dev=0.028
C2'	A	0, 0.040, 0.126, 0.211, 0.307 max_d=0.307 avg_d=0.126 std_dev=0.086
O4'	A	0, 0.053, 0.154, 0.255, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.154 std_dev=0.101
O2'	A	0, 0.063, 0.192, 0.321, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.192 std_dev=0.129
C2	B	0, 0.061, 0.286, 0.511, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.286 std_dev=0.225
C3'	A	0, 0.027, 0.270, 0.513, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.270 std_dev=0.243
C4'	A	0, 0.023, 0.286, 0.548, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.286 std_dev=0.262
N3	B	0, 0.043, 0.344, 0.644, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.344 std_dev=0.300
N1	B	0, -0.024, 0.318, 0.660, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.318 std_dev=0.342
C5'	A	0, 0.067, 0.423, 0.779, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.423 std_dev=0.356
C3'	B	0, -0.052, 0.339, 0.729, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.339 std_dev=0.390
O3'	A	0, 0.019, 0.410, 0.801, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.410 std_dev=0.391
O2	B	0, -0.044, 0.358, 0.760, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.358 std_dev=0.402
O3'	B	0, -0.051, 0.374, 0.799, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.374 std_dev=0.425
C1'	B	0, -0.041, 0.414, 0.869, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.414 std_dev=0.455
P	A	0, -0.107, 0.429, 0.965, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.429 std_dev=0.536
C6	B	0, -0.076, 0.465, 1.006, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.465 std_dev=0.541
C4	B	0, -0.056, 0.495, 1.047, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.495 std_dev=0.551
C4'	B	0, -0.087, 0.491, 1.069, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.491 std_dev=0.578
O5'	A	0, -0.128, 0.457, 1.043, 1.883 max_d=1.883 avg_d=0.457 std_dev=0.586
C2'	B	0, -0.100, 0.505, 1.109, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.505 std_dev=0.605
O4'	B	0, -0.118, 0.509, 1.136, 1.938 max_d=1.938 avg_d=0.509 std_dev=0.627
C5	B	0, -0.101, 0.573, 1.246, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.573 std_dev=0.674
O5'	B	0, -0.112, 0.667, 1.445, 2.366 max_d=2.366 avg_d=0.667 std_dev=0.778
N4	B	0, -0.174, 0.619, 1.413, 2.648 max_d=2.648 avg_d=0.619 std_dev=0.793
OP2	A	0, -0.233, 0.606, 1.445, 2.816 max_d=2.816 avg_d=0.606 std_dev=0.839
OP1	A	0, -0.297, 0.575, 1.447, 2.914 max_d=2.914 avg_d=0.575 std_dev=0.872
C5'	B	0, -0.235, 0.658, 1.551, 2.903 max_d=2.903 avg_d=0.658 std_dev=0.893
P	B	0, -0.308, 0.868, 2.044, 3.884 max_d=3.884 avg_d=0.868 std_dev=1.176
O2'	B	0, -0.485, 0.769, 2.022, 4.152 max_d=4.152 avg_d=0.769 std_dev=1.254
OP1	B	0, -0.478, 1.143, 2.763, 5.180 max_d=5.180 avg_d=1.143 std_dev=1.621
OP2	B	0, -0.661, 1.287, 3.234, 6.357 max_d=6.357 avg_d=1.287 std_dev=1.948

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.15	0.28	0.19
C2	0.03	0.00	0.11	0.18	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.22	0.05	0.08	0.10	0.33	0.13
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.08	0.03	0.10	0.10	0.08	0.03	0.03	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.34	0.15
C3'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.15	0.00	0.18	0.03	0.20	0.12	0.20	0.15	0.22	0.16	0.10	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.33	0.10
C4	0.02	0.00	0.07	0.15	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.16	0.03	0.09	0.12	0.29	0.14
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.13	0.15	0.10	0.04	0.16	0.17	0.08	0.04	0.03	0.00	0.02	0.04	0.26	0.05
C5	0.01	0.00	0.06	0.18	0.00	0.13	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.20	0.02	0.12	0.13	0.43	0.18
C5'	0.02	0.11	0.02	0.03	0.12	0.01	0.20	0.00	0.21	0.21	0.17	0.07	0.26	0.25	0.11	0.03	0.05	0.02	0.01	0.04	0.22	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.20	0.00	0.13	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.25	0.03	0.14	0.13	0.51	0.19
C8	0.02	0.00	0.03	0.12	0.00	0.15	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.05	0.14	0.18	0.32	0.20
N1	0.03	0.00	0.10	0.20	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.25	0.04	0.12	0.11	0.45	0.16
N3	0.04	0.00	0.10	0.15	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.17	0.05	0.07	0.11	0.25	0.13
N6	0.01	0.01	0.08	0.22	0.01	0.16	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.27	0.03	0.18	0.15	0.63	0.24
N7	0.01	0.00	0.03	0.16	0.00	0.17	0.00	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.04	0.14	0.16	0.46	0.20
N9	0.00	0.01	0.03	0.10	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.12	0.15	0.26	0.17
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.07	0.04	0.05	0.03	0.08	0.03	0.12	0.13	0.07	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.04	0.09	0.32	0.09
O3'	0.01	0.22	0.01	0.01	0.16	0.03	0.20	0.05	0.25	0.13	0.25	0.17	0.27	0.18	0.09	0.02	0.00	0.02	0.19	0.26	0.33	0.06
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.22	0.20	0.27	0.18
O5'	0.15	0.08	0.04	0.08	0.09	0.02	0.12	0.01	0.14	0.14	0.12	0.07	0.18	0.14	0.12	0.04	0.19	0.22	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.10	0.03	0.09	0.12	0.04	0.13	0.04	0.13	0.18	0.11	0.11	0.15	0.16	0.15	0.09	0.26	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.33	0.34	0.33	0.29	0.26	0.43	0.22	0.51	0.32	0.45	0.25	0.63	0.46	0.26	0.32	0.33	0.27	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.13	0.15	0.10	0.14	0.05	0.18	0.01	0.19	0.20	0.16	0.13	0.24	0.20	0.17	0.09	0.06	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.16	0.45	0.08	0.19	0.45	0.11	0.46	0.10	0.10	0.23	0.25	0.20	0.71	0.21	0.57	0.58	0.45	0.50	0.58
C2	0.23	0.07	0.40	0.14	0.17	0.43	0.11	0.42	0.11	0.11	0.18	0.25	0.06	0.45	0.29	0.59	0.40	0.53	0.59	0.48
C2'	0.24	0.18	0.36	0.07	0.29	0.42	0.19	0.38	0.11	0.12	0.30	0.38	0.18	0.48	0.21	0.55	0.46	0.29	0.36	0.43
C3'	0.19	0.32	0.39	0.07	0.46	0.34	0.34	0.27	0.21	0.19	0.46	0.57	0.29	0.45	0.12	0.44	0.34	0.23	0.22	0.29
C4	0.23	0.10	0.42	0.12	0.17	0.44	0.09	0.43	0.09	0.09	0.20	0.24	0.12	0.54	0.30	0.60	0.46	0.47	0.56	0.51
C4'	0.11	0.34	0.53	0.14	0.41	0.28	0.31	0.28	0.21	0.21	0.43	0.48	0.35	0.77	0.09	0.36	0.42	0.32	0.27	0.36
C5	0.24	0.09	0.40	0.16	0.17	0.40	0.10	0.37	0.09	0.10	0.20	0.24	0.10	0.45	0.32	0.58	0.37	0.48	0.61	0.45
C5'	0.15	0.44	0.58	0.22	0.50	0.18	0.40	0.19	0.31	0.31	0.52	0.56	0.44	0.82	0.24	0.22	0.31	0.34	0.21	0.24
C6	0.24	0.08	0.38	0.18	0.18	0.37	0.12	0.34	0.12	0.13	0.18	0.25	0.05	0.36	0.31	0.55	0.29	0.54	0.67	0.39
C8	0.23	0.17	0.44	0.13	0.20	0.44	0.11	0.42	0.10	0.10	0.24	0.25	0.21	0.61	0.32	0.59	0.48	0.41	0.54	0.51
N1	0.23	0.08	0.38	0.17	0.18	0.39	0.13	0.37	0.13	0.13	0.17	0.25	0.06	0.38	0.30	0.56	0.32	0.56	0.65	0.42
N3	0.22	0.09	0.42	0.11	0.17	0.45	0.10	0.45	0.10	0.10	0.19	0.24	0.10	0.53	0.28	0.61	0.47	0.50	0.55	0.53
N6	0.25	0.11	0.34	0.22	0.19	0.32	0.15	0.28	0.15	0.16	0.18	0.25	0.11	0.28	0.32	0.49	0.18	0.59	0.75	0.31
N7	0.25	0.14	0.42	0.17	0.19	0.39	0.10	0.36	0.08	0.09	0.23	0.24	0.18	0.47	0.34	0.57	0.37	0.43	0.60	0.44
N9	0.22	0.14	0.43	0.10	0.19	0.46	0.10	0.45	0.09	0.10	0.22	0.24	0.18	0.62	0.28	0.60	0.53	0.45	0.53	0.55
O2'	0.20	0.17	0.42	0.07	0.26	0.37	0.17	0.34	0.11	0.11	0.26	0.34	0.17	0.59	0.12	0.51	0.48	0.31	0.35	0.45
O3'	0.20	0.37	0.38	0.11	0.57	0.28	0.45	0.19	0.29	0.24	0.53	0.69	0.31	0.38	0.08	0.39	0.26	0.32	0.17	0.21
O4'	0.13	0.21	0.51	0.08	0.20	0.42	0.12	0.46	0.10	0.11	0.25	0.25	0.26	0.87	0.12	0.50	0.61	0.47	0.52	0.59
O5'	0.18	0.27	0.30	0.04	0.40	0.40	0.28	0.32	0.15	0.13	0.39	0.48	0.24	0.39	0.03	0.45	0.32	0.18	0.19	0.23
OP1	0.35	0.09	0.16	0.29	0.20	0.49	0.11	0.41	0.09	0.12	0.19	0.29	0.09	0.07	0.02	0.48	0.47	0.29	0.45	0.32
OP2	0.25	0.79	0.37	0.28	1.08	0.17	0.98	0.35	0.77	0.65	1.00	1.20	0.64	0.09	0.02	0.19	0.39	0.74	0.68	0.55
P	0.12	0.29	0.13	0.01	0.47	0.21	0.38	0.10	0.23	0.17	0.43	0.55	0.22	0.09	0.00	0.23	0.11	0.31	0.13	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.22	0.01	0.16	0.44	0.46	0.08
C2	0.01	0.00	0.18	0.24	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.06	0.13	0.11	0.55	0.93	0.21
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.03	0.01	0.13	0.16	0.18	0.02	0.13	0.04	0.32	0.00	0.02	0.01	0.53	0.56	0.29	0.45
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.27	0.00	0.21	0.02	0.15	0.16	0.28	0.29	0.22	0.01	0.01	0.01	0.31	0.15	0.06	0.20
C4	0.01	0.00	0.03	0.27	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.25	0.12	0.02	0.28	0.77	1.10	0.17
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.13	0.06	0.07	0.10	0.09	0.18	0.03	0.00	0.01	0.09	0.16	0.04
C5	0.01	0.00	0.13	0.21	0.00	0.13	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.33	0.10	0.09	0.43	0.90	0.97	0.25
C5'	0.05	0.08	0.16	0.02	0.10	0.01	0.14	0.00	0.13	0.04	0.09	0.11	0.13	0.03	0.09	0.01	0.00	0.18	0.21	0.00
C6	0.01	0.01	0.18	0.15	0.00	0.13	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.31	0.04	0.13	0.44	0.82	0.74	0.24
N1	0.01	0.01	0.02	0.16	0.01	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.05	0.01	0.20	0.60	0.73	0.05
N3	0.01	0.00	0.13	0.28	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.09	0.10	0.16	0.64	1.09	0.22
N4	0.01	0.01	0.04	0.29	0.00	0.10	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.27	0.16	0.03	0.29	0.79	1.20	0.21
O2	0.02	0.00	0.32	0.22	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.23	0.11	0.22	0.16	0.45	0.91	0.32
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.25	0.18	0.33	0.03	0.31	0.15	0.17	0.27	0.23	0.00	0.05	0.13	0.50	0.53	0.27	0.45
O3'	0.22	0.06	0.02	0.01	0.12	0.03	0.10	0.09	0.04	0.05	0.09	0.16	0.11	0.05	0.00	0.17	0.17	0.25	0.06	0.12
O4'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.10	0.03	0.22	0.13	0.17	0.00	0.15	0.22	0.43	0.16
O5'	0.16	0.11	0.53	0.31	0.28	0.01	0.43	0.00	0.44	0.20	0.16	0.29	0.16	0.50	0.17	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.44	0.55	0.56	0.15	0.77	0.09	0.90	0.18	0.82	0.60	0.64	0.79	0.45	0.53	0.25	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.46	0.93	0.29	0.06	1.10	0.16	0.97	0.21	0.74	0.73	1.09	1.20	0.91	0.27	0.06	0.43	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.21	0.45	0.20	0.17	0.04	0.25	0.00	0.24	0.05	0.22	0.21	0.32	0.45	0.12	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00