Doublet Group distance statistics: 54905

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.014, 0.024, 0.034, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.024 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.014, 0.026, 0.037, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.017, 0.030, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.030 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.012, 0.026, 0.039, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.023, 0.041, 0.059, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.041 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.027, 0.046, 0.065, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.046 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.017, 0.039, 0.061, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.039 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.033, 0.058, 0.082, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.058 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.042, 0.074, 0.106, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.074 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.062, 0.206, 0.350, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.206 std_dev=0.144
C2'	A	0, 0.080, 0.243, 0.407, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.243 std_dev=0.163
C4'	A	0, 0.146, 0.356, 0.567, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.356 std_dev=0.210
N3	B	0, 0.119, 0.333, 0.548, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.333 std_dev=0.215
C3'	A	0, 0.092, 0.341, 0.589, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.341 std_dev=0.248
O2'	A	0, 0.166, 0.438, 0.711, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.438 std_dev=0.273
C4	B	0, 0.131, 0.418, 0.704, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.418 std_dev=0.287
O3'	A	0, 0.204, 0.510, 0.816, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.510 std_dev=0.306
C5'	A	0, 0.205, 0.611, 1.017, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.611 std_dev=0.406
C2	B	0, 0.125, 0.557, 0.988, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.557 std_dev=0.432
C5	B	0, 0.405, 0.883, 1.361, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.883 std_dev=0.478
N1	B	0, 0.218, 0.729, 1.240, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.729 std_dev=0.511
C2'	B	0, 0.576, 1.113, 1.651, 1.668 max_d=1.668 avg_d=1.113 std_dev=0.538
O5'	B	0, 0.328, 0.868, 1.408, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.868 std_dev=0.540
C1'	B	0, 0.189, 0.735, 1.280, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.735 std_dev=0.545
C6	B	0, 0.370, 0.949, 1.528, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.949 std_dev=0.579
O4'	B	0, 0.339, 0.922, 1.505, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.922 std_dev=0.583
C3'	B	0, 0.384, 0.973, 1.562, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.973 std_dev=0.589
N9	B	0, -0.058, 0.540, 1.137, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.540 std_dev=0.598
C4'	B	0, 0.416, 1.021, 1.626, 1.571 max_d=1.571 avg_d=1.021 std_dev=0.605
C5'	B	0, 0.470, 1.108, 1.747, 1.680 max_d=1.680 avg_d=1.108 std_dev=0.639
N7	B	0, 0.511, 1.286, 2.061, 2.324 max_d=2.324 avg_d=1.286 std_dev=0.775
O6	B	0, 0.566, 1.345, 2.125, 2.375 max_d=2.375 avg_d=1.345 std_dev=0.780
N2	B	0, 0.049, 0.873, 1.697, 2.181 max_d=2.181 avg_d=0.873 std_dev=0.824
O3'	B	0, 0.927, 1.770, 2.614, 2.688 max_d=2.688 avg_d=1.770 std_dev=0.843
C8	B	0, 0.182, 1.052, 1.923, 2.397 max_d=2.397 avg_d=1.052 std_dev=0.871
O2'	B	0, 1.207, 2.093, 2.979, 2.798 max_d=2.798 avg_d=2.093 std_dev=0.886
P	B	0, 0.640, 1.841, 3.042, 3.345 max_d=3.345 avg_d=1.841 std_dev=1.201
O5'	A	0, 0.085, 1.425, 2.764, 3.505 max_d=3.505 avg_d=1.425 std_dev=1.340
OP2	B	0, 0.816, 2.165, 3.513, 3.855 max_d=3.855 avg_d=2.165 std_dev=1.348
OP1	B	0, 1.019, 2.482, 3.946, 4.210 max_d=4.210 avg_d=2.482 std_dev=1.463
OP1	A	0, 0.198, 1.871, 3.543, 4.464 max_d=4.464 avg_d=1.871 std_dev=1.673
P	A	0, -0.298, 1.649, 3.595, 4.715 max_d=4.715 avg_d=1.649 std_dev=1.946
OP2	A	0, 0.516, 2.575, 4.635, 5.631 max_d=5.631 avg_d=2.575 std_dev=2.060

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.27	0.27	0.79	0.07
C2	0.02	0.00	0.17	0.16	0.00	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.22	0.03	0.65	0.43	0.60	0.32
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.02	0.05	0.02	0.08	0.08	0.13	0.18	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.37	0.30	0.36	0.16
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.02	0.06	0.17	0.11	0.16	0.05	0.13	0.05	0.03	0.01	0.01	0.44	0.31	0.13	0.28
C4	0.01	0.00	0.09	0.07	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.09	0.03	0.61	0.42	0.68	0.28
C4'	0.00	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.09	0.04	0.06	0.05	0.08	0.03	0.10	0.01	0.00	0.02	0.19	0.48	0.10
C5	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.06	0.03	0.71	0.49	0.64	0.42
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.08	0.01	0.08	0.00	0.09	0.08	0.10	0.10	0.10	0.08	0.05	0.09	0.02	0.02	0.01	0.21	0.28	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.08	0.03	0.76	0.51	0.59	0.47
C8	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.09	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.17	0.02	0.60	0.45	0.76	0.31
N1	0.02	0.00	0.13	0.11	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.15	0.04	0.72	0.47	0.58	0.41
N3	0.02	0.00	0.18	0.16	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.21	0.03	0.57	0.39	0.65	0.23
N6	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.07	0.03	0.80	0.55	0.56	0.56
N7	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.08	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.14	0.03	0.70	0.51	0.67	0.45
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.52	0.38	0.75	0.19
O2'	0.02	0.25	0.00	0.03	0.14	0.10	0.11	0.09	0.16	0.05	0.22	0.24	0.14	0.06	0.04	0.00	0.01	0.09	0.11	0.21	0.47	0.08
O3'	0.01	0.22	0.01	0.01	0.09	0.01	0.06	0.02	0.08	0.17	0.15	0.21	0.07	0.14	0.04	0.01	0.00	0.02	0.30	0.27	0.25	0.28
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.09	0.02	0.00	0.06	0.18	0.98	0.28
O5'	0.27	0.65	0.37	0.44	0.61	0.02	0.71	0.01	0.76	0.60	0.72	0.57	0.80	0.70	0.52	0.11	0.30	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.27	0.43	0.30	0.31	0.42	0.19	0.49	0.21	0.51	0.45	0.47	0.39	0.55	0.51	0.38	0.21	0.27	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.79	0.60	0.36	0.13	0.68	0.48	0.64	0.28	0.59	0.76	0.58	0.65	0.56	0.67	0.75	0.47	0.25	0.98	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.32	0.16	0.28	0.28	0.10	0.42	0.01	0.47	0.31	0.41	0.23	0.56	0.45	0.19	0.08	0.28	0.28	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.27	0.18	0.51	0.11	0.12	0.15	0.30	0.17	0.21	0.23	0.40	0.20	0.20	0.12	0.33	1.12	0.30	0.28	0.19	0.47	0.36	0.48
C2	0.13	0.18	0.16	0.32	0.12	0.10	0.16	0.19	0.21	0.12	0.22	0.20	0.11	0.14	0.11	0.30	0.98	0.24	0.18	0.24	0.29	0.23	0.36
C2'	0.16	0.25	0.12	0.33	0.18	0.20	0.20	0.48	0.23	0.22	0.25	0.30	0.20	0.22	0.18	0.38	0.92	0.39	0.40	0.24	0.64	0.43	0.56
C3'	0.23	0.13	0.14	0.24	0.17	0.38	0.21	0.68	0.19	0.30	0.15	0.16	0.11	0.28	0.23	0.37	0.78	0.53	0.56	0.21	0.78	0.56	0.70
C4	0.12	0.24	0.17	0.39	0.12	0.10	0.15	0.22	0.19	0.16	0.23	0.33	0.16	0.16	0.12	0.33	1.05	0.27	0.21	0.20	0.34	0.26	0.39
C4'	0.09	0.18	0.21	0.48	0.11	0.16	0.17	0.52	0.16	0.27	0.15	0.29	0.14	0.27	0.15	0.28	1.01	0.40	0.46	0.20	0.70	0.53	0.65
C5	0.15	0.24	0.20	0.32	0.11	0.09	0.14	0.18	0.18	0.17	0.23	0.33	0.16	0.16	0.13	0.34	0.94	0.25	0.18	0.19	0.26	0.22	0.33
C5'	0.06	0.15	0.31	0.54	0.06	0.16	0.15	0.60	0.13	0.27	0.09	0.27	0.13	0.27	0.12	0.30	1.02	0.38	0.53	0.18	0.80	0.59	0.72
C6	0.16	0.20	0.21	0.24	0.11	0.08	0.15	0.14	0.20	0.12	0.22	0.24	0.12	0.13	0.12	0.31	0.83	0.20	0.15	0.22	0.20	0.19	0.29
C8	0.13	0.27	0.22	0.46	0.09	0.12	0.13	0.25	0.14	0.24	0.21	0.41	0.21	0.22	0.13	0.37	1.06	0.30	0.23	0.15	0.36	0.28	0.39
N1	0.15	0.17	0.19	0.25	0.12	0.08	0.16	0.16	0.21	0.11	0.22	0.17	0.11	0.14	0.11	0.30	0.87	0.21	0.16	0.25	0.23	0.20	0.31
N3	0.12	0.21	0.15	0.39	0.12	0.10	0.16	0.22	0.20	0.14	0.23	0.28	0.14	0.15	0.11	0.32	1.05	0.27	0.21	0.23	0.36	0.27	0.40
N6	0.18	0.18	0.24	0.17	0.10	0.07	0.13	0.09	0.19	0.10	0.22	0.20	0.11	0.11	0.12	0.30	0.68	0.14	0.14	0.22	0.11	0.18	0.24
N7	0.17	0.27	0.24	0.36	0.09	0.10	0.12	0.19	0.14	0.23	0.21	0.39	0.20	0.19	0.15	0.39	0.93	0.27	0.18	0.15	0.26	0.22	0.33
N9	0.11	0.26	0.18	0.46	0.11	0.11	0.14	0.26	0.17	0.20	0.23	0.38	0.20	0.19	0.12	0.34	1.10	0.29	0.24	0.18	0.40	0.31	0.43
O2'	0.13	0.31	0.12	0.36	0.18	0.18	0.20	0.46	0.25	0.19	0.31	0.40	0.24	0.19	0.15	0.38	0.91	0.37	0.39	0.26	0.59	0.43	0.56
O3'	0.28	0.07	0.20	0.13	0.18	0.49	0.22	0.79	0.17	0.33	0.11	0.10	0.09	0.30	0.26	0.41	0.58	0.59	0.66	0.19	0.87	0.63	0.77
O4'	0.10	0.26	0.28	0.61	0.09	0.16	0.17	0.30	0.17	0.28	0.20	0.41	0.20	0.28	0.13	0.31	1.19	0.30	0.31	0.21	0.52	0.44	0.53
O5'	0.85	0.90	1.21	1.34	0.75	0.53	0.60	0.26	0.62	0.48	0.76	1.01	0.92	0.45	0.69	1.24	1.92	0.33	0.19	0.54	0.86	0.46	0.61
OP1	0.82	0.71	1.27	1.42	0.58	0.72	0.38	0.36	0.38	0.31	0.54	0.83	0.76	0.22	0.57	1.25	1.67	0.43	0.30	0.26	0.98	0.62	0.75
OP2	0.25	0.42	0.98	1.03	0.36	0.17	0.42	0.80	0.48	0.31	0.47	0.42	0.37	0.41	0.28	1.26	1.66	0.60	0.63	0.53	1.05	0.70	0.97
P	0.94	0.73	1.52	1.67	0.68	0.67	0.52	0.20	0.49	0.50	0.59	0.80	0.80	0.41	0.70	1.61	2.25	0.34	0.13	0.39	0.89	0.47	0.63

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.24	0.00	0.21	0.01	0.41	0.30	0.19
C2	0.03	0.00	0.16	0.05	0.01	0.27	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.29	0.32	0.31	0.27	0.01	0.29	0.27	0.14
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.08	0.02	0.05	0.16	0.08	0.10	0.13	0.19	0.15	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.33	0.06	0.81	0.62	0.52
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.14	0.00	0.25	0.01	0.23	0.36	0.14	0.06	0.04	0.36	0.18	0.02	0.01	0.01	0.08	0.28	0.64	0.29	0.28
C4	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.19	0.15	0.15	0.18	0.01	0.22	0.28	0.18
C4'	0.01	0.27	0.02	0.00	0.09	0.00	0.06	0.01	0.05	0.28	0.17	0.38	0.27	0.22	0.07	0.25	0.02	0.00	0.01	0.05	0.30	0.13	0.09
C5	0.01	0.01	0.05	0.25	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.06	0.05	0.24	0.00	0.22	0.41	0.35
C5'	0.07	0.31	0.16	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.07	0.41	0.18	0.45	0.30	0.35	0.12	0.09	0.19	0.01	0.00	0.12	0.07	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.23	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.06	0.12	0.20	0.00	0.21	0.42	0.34
C8	0.01	0.01	0.10	0.36	0.01	0.28	0.00	0.41	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.41	0.22	0.18	0.49	0.01	0.31	0.45	0.49
N1	0.02	0.00	0.13	0.14	0.00	0.17	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.25	0.19	0.23	0.19	0.01	0.18	0.32	0.19
N2	0.03	0.00	0.19	0.06	0.01	0.38	0.01	0.45	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.38	0.44	0.38	0.37	0.01	0.39	0.27	0.19
N3	0.03	0.01	0.15	0.04	0.00	0.27	0.01	0.30	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.34	0.31	0.28	0.01	0.35	0.27	0.16
N7	0.01	0.01	0.05	0.36	0.01	0.22	0.00	0.35	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.38	0.22	0.11	0.44	0.01	0.37	0.56	0.55
N9	0.00	0.00	0.01	0.18	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.06	0.01	0.23	0.01	0.23	0.27	0.22
O2'	0.01	0.29	0.00	0.02	0.19	0.25	0.26	0.09	0.25	0.41	0.25	0.38	0.27	0.38	0.20	0.00	0.05	0.16	0.21	0.29	0.79	0.69	0.47
O3'	0.24	0.32	0.02	0.01	0.15	0.02	0.06	0.19	0.06	0.22	0.19	0.44	0.34	0.22	0.06	0.05	0.00	0.16	0.32	0.09	0.59	0.37	0.32
O4'	0.00	0.31	0.02	0.01	0.15	0.00	0.05	0.01	0.12	0.18	0.23	0.38	0.31	0.11	0.01	0.16	0.16	0.00	0.11	0.08	0.19	0.13	0.03
O5'	0.21	0.27	0.33	0.08	0.18	0.01	0.24	0.00	0.20	0.49	0.19	0.37	0.28	0.44	0.23	0.21	0.32	0.11	0.00	0.24	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.06	0.28	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.29	0.09	0.08	0.24	0.00	0.31	0.53	0.45
OP1	0.41	0.29	0.81	0.64	0.22	0.30	0.22	0.07	0.21	0.31	0.18	0.39	0.35	0.37	0.23	0.79	0.59	0.19	0.01	0.31	0.00	0.01	0.01
OP2	0.30	0.27	0.62	0.29	0.28	0.13	0.41	0.03	0.42	0.45	0.32	0.27	0.27	0.56	0.27	0.69	0.37	0.13	0.02	0.53	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.14	0.52	0.28	0.18	0.09	0.35	0.01	0.34	0.49	0.19	0.19	0.16	0.55	0.22	0.47	0.32	0.03	0.01	0.45	0.01	0.01	0.00