Doublet Group distance statistics: 54906

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.003, 0.005, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.002
C1'	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.016
N6	A	0, -0.001, 0.017, 0.035, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.018
O4'	A	0, -0.020, 0.075, 0.170, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.075 std_dev=0.095
C2'	A	0, -0.007, 0.090, 0.187, 0.224 max_d=0.224 avg_d=0.090 std_dev=0.097
O2'	A	0, 0.004, 0.129, 0.254, 0.298 max_d=0.298 avg_d=0.129 std_dev=0.125
C4'	A	0, 0.002, 0.131, 0.261, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.131 std_dev=0.130
C3'	A	0, -0.005, 0.134, 0.273, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.134 std_dev=0.139
P	A	0, 0.022, 0.177, 0.333, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.177 std_dev=0.156
O3'	A	0, 0.014, 0.185, 0.355, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.185 std_dev=0.171
C2'	B	0, 0.071, 0.263, 0.455, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.263 std_dev=0.192
C3'	B	0, 0.070, 0.267, 0.465, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.267 std_dev=0.198
C5'	A	0, 0.026, 0.254, 0.481, 0.552 max_d=0.552 avg_d=0.254 std_dev=0.228
O2'	B	0, 0.088, 0.320, 0.552, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.320 std_dev=0.232
C1'	B	0, 0.097, 0.390, 0.683, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.390 std_dev=0.293
C4	B	0, 0.123, 0.443, 0.763, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.443 std_dev=0.320
N9	B	0, 0.126, 0.453, 0.779, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.453 std_dev=0.326
C5	B	0, 0.168, 0.598, 1.029, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.598 std_dev=0.431
C6	B	0, 0.182, 0.631, 1.079, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.631 std_dev=0.449
OP1	A	0, 0.057, 0.513, 0.968, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.513 std_dev=0.455
C4'	B	0, 0.067, 0.548, 1.030, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.548 std_dev=0.482
N1	B	0, 0.155, 0.649, 1.144, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.649 std_dev=0.494
O5'	A	0, -0.022, 0.486, 0.994, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.486 std_dev=0.508
OP2	A	0, 0.012, 0.537, 1.061, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.537 std_dev=0.525
O3'	B	0, 0.052, 0.589, 1.125, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.589 std_dev=0.536
O4'	B	0, 0.058, 0.606, 1.154, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.606 std_dev=0.548
N3	B	0, 0.032, 0.592, 1.152, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.592 std_dev=0.560
O6	B	0, 0.229, 0.827, 1.425, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.827 std_dev=0.598
C8	B	0, 0.159, 0.760, 1.360, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.760 std_dev=0.600
C2	B	0, 0.051, 0.720, 1.390, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.720 std_dev=0.670
N7	B	0, 0.182, 0.862, 1.541, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.862 std_dev=0.680
O5'	B	0, 0.061, 0.877, 1.694, 1.966 max_d=1.966 avg_d=0.877 std_dev=0.816
C5'	B	0, 0.020, 0.840, 1.661, 1.954 max_d=1.954 avg_d=0.840 std_dev=0.821
N2	B	0, -0.062, 1.007, 2.075, 2.486 max_d=2.486 avg_d=1.007 std_dev=1.068
P	B	0, -0.044, 1.219, 2.482, 2.959 max_d=2.959 avg_d=1.219 std_dev=1.263
OP1	B	0, -0.054, 1.270, 2.593, 3.095 max_d=3.095 avg_d=1.270 std_dev=1.323
OP2	B	0, -0.043, 1.364, 2.770, 3.300 max_d=3.300 avg_d=1.364 std_dev=1.407

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.48	0.05
C2	0.00	0.00	0.04	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.10	0.04	0.50	0.05
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.22	0.56	0.14
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.08	0.09	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.13	0.32	0.49	0.17
C4	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.06	0.06	0.50	0.04
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.04	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.08	0.31	0.06
C5	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.07	0.11	0.46	0.07
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.06	0.09	0.08	0.09	0.08	0.04	0.06	0.04	0.00	0.01	0.03	0.09	0.01
C6	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01	0.09	0.10	0.45	0.07
C8	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.10	0.15	0.45	0.05
N1	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.10	0.07	0.47	0.06
N3	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.08	0.04	0.51	0.04
N6	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.08	0.12	0.41	0.08
N7	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.07	0.17	0.43	0.08
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.06	0.50	0.04
O2'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.04	0.05	0.05	0.06	0.06	0.02	0.06	0.03	0.06	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.08	0.17	0.50	0.10
O3'	0.02	0.09	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.04	0.06	0.01	0.08	0.08	0.06	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.22	0.44	0.40	0.17
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.10	0.11	0.34	0.01
O5'	0.04	0.10	0.06	0.13	0.06	0.02	0.07	0.01	0.09	0.10	0.10	0.08	0.08	0.07	0.06	0.08	0.22	0.10	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.02	0.04	0.22	0.32	0.06	0.08	0.11	0.03	0.10	0.15	0.07	0.04	0.12	0.17	0.06	0.17	0.44	0.11	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.48	0.50	0.56	0.49	0.50	0.31	0.46	0.09	0.45	0.45	0.47	0.51	0.41	0.43	0.50	0.50	0.40	0.34	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.05	0.14	0.17	0.04	0.06	0.07	0.01	0.07	0.05	0.06	0.04	0.08	0.08	0.04	0.10	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.07	0.15	0.03	0.18	0.46	0.25	0.59	0.23	0.34	0.15	0.03	0.08	0.34	0.25	0.14	0.48	0.49	0.52	0.27	0.53	0.56	0.61
C2	0.22	0.09	0.07	0.09	0.18	0.36	0.26	0.46	0.25	0.31	0.16	0.14	0.08	0.33	0.22	0.06	0.64	0.46	0.38	0.31	0.39	0.44	0.48
C2'	0.31	0.18	0.23	0.08	0.24	0.49	0.28	0.58	0.26	0.34	0.22	0.12	0.19	0.33	0.29	0.25	0.36	0.53	0.51	0.28	0.49	0.50	0.56
C3'	0.31	0.20	0.25	0.10	0.24	0.49	0.25	0.54	0.23	0.30	0.21	0.18	0.22	0.28	0.28	0.28	0.24	0.50	0.48	0.24	0.43	0.43	0.50
C4	0.24	0.08	0.09	0.07	0.19	0.40	0.26	0.49	0.24	0.32	0.16	0.06	0.08	0.33	0.24	0.01	0.62	0.49	0.42	0.29	0.41	0.47	0.51
C4'	0.25	0.13	0.19	0.07	0.20	0.46	0.23	0.57	0.21	0.30	0.17	0.09	0.14	0.29	0.25	0.21	0.26	0.46	0.51	0.22	0.50	0.50	0.56
C5	0.22	0.09	0.06	0.10	0.19	0.33	0.25	0.40	0.24	0.29	0.17	0.04	0.09	0.30	0.23	0.08	0.66	0.44	0.34	0.27	0.32	0.38	0.41
C5'	0.22	0.14	0.17	0.08	0.18	0.43	0.20	0.53	0.18	0.26	0.15	0.11	0.14	0.24	0.22	0.18	0.13	0.40	0.49	0.18	0.46	0.45	0.51
C6	0.20	0.09	0.07	0.12	0.18	0.29	0.25	0.35	0.24	0.27	0.17	0.08	0.09	0.29	0.21	0.15	0.65	0.40	0.29	0.28	0.27	0.33	0.36
C8	0.25	0.11	0.12	0.05	0.20	0.41	0.25	0.48	0.23	0.32	0.17	0.03	0.11	0.32	0.26	0.07	0.62	0.49	0.43	0.26	0.39	0.46	0.48
N1	0.20	0.10	0.07	0.12	0.17	0.31	0.25	0.39	0.25	0.28	0.17	0.14	0.09	0.31	0.21	0.12	0.65	0.41	0.32	0.30	0.31	0.37	0.40
N3	0.24	0.08	0.08	0.07	0.19	0.40	0.27	0.51	0.26	0.33	0.16	0.10	0.07	0.35	0.24	0.01	0.61	0.49	0.44	0.31	0.45	0.49	0.54
N6	0.17	0.12	0.10	0.14	0.19	0.23	0.24	0.26	0.25	0.24	0.20	0.05	0.11	0.26	0.19	0.21	0.62	0.33	0.21	0.28	0.19	0.25	0.27
N7	0.24	0.12	0.07	0.10	0.20	0.32	0.25	0.37	0.23	0.29	0.18	0.04	0.12	0.29	0.24	0.05	0.67	0.44	0.33	0.25	0.29	0.37	0.38
N9	0.25	0.08	0.12	0.04	0.19	0.44	0.26	0.54	0.23	0.33	0.15	0.03	0.08	0.33	0.25	0.09	0.57	0.50	0.47	0.27	0.46	0.51	0.55
O2'	0.28	0.17	0.20	0.05	0.23	0.45	0.28	0.56	0.27	0.34	0.22	0.12	0.17	0.34	0.28	0.24	0.36	0.49	0.50	0.30	0.49	0.51	0.57
O3'	0.30	0.23	0.24	0.09	0.23	0.46	0.22	0.50	0.21	0.26	0.22	0.23	0.24	0.24	0.26	0.28	0.15	0.47	0.43	0.20	0.37	0.36	0.44
O4'	0.22	0.07	0.14	0.03	0.17	0.45	0.24	0.61	0.22	0.33	0.14	0.02	0.07	0.33	0.24	0.15	0.42	0.46	0.55	0.25	0.57	0.59	0.64
O5'	0.42	0.26	0.30	0.25	0.33	0.68	0.34	0.71	0.31	0.42	0.27	0.22	0.28	0.39	0.39	0.22	0.05	0.64	0.65	0.30	0.57	0.57	0.65
OP1	0.18	0.08	0.06	0.29	0.10	0.33	0.17	0.45	0.13	0.28	0.04	0.17	0.06	0.27	0.18	0.18	0.04	0.28	0.35	0.18	0.51	0.40	0.43
OP2	0.35	0.58	0.25	0.07	0.37	0.17	0.24	0.08	0.29	0.08	0.45	0.72	0.58	0.08	0.27	0.51	0.04	0.30	0.09	0.21	0.41	0.28	0.24
P	0.13	0.22	0.14	0.04	0.13	0.13	0.08	0.06	0.10	0.04	0.16	0.27	0.21	0.03	0.10	0.24	0.01	0.15	0.08	0.06	0.07	0.00	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.08	0.06	0.01	0.00	0.00	0.25	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01
C2	0.06	0.00	0.10	0.08	0.01	0.07	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.25	0.05	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.10	0.05	0.15	0.04	0.16	0.11	0.14	0.05	0.00	0.11	0.03	0.11	0.09	0.16	0.13	0.13
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.06	0.10	0.08	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.12	0.02	0.04	0.12	0.09
C4	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.22	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.00
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.09	0.07	0.03	0.01	0.09	0.02	0.00	0.00	0.02	0.05	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.08	0.03	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.18	0.00	0.08	0.01	0.05	0.03	0.04
C5'	0.01	0.04	0.10	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.01	0.06	0.05	0.05	0.00	0.02	0.16	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.20	0.01	0.09	0.00	0.07	0.04	0.06
C8	0.02	0.01	0.15	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.11	0.01	0.08	0.03	0.04	0.04	0.02
N1	0.04	0.00	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.23	0.03	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03
N2	0.08	0.00	0.16	0.10	0.01	0.09	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.14	0.27	0.06	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03
N3	0.06	0.01	0.11	0.08	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.26	0.04	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03
N7	0.01	0.00	0.14	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.12	0.01	0.10	0.03	0.07	0.04	0.06
N9	0.00	0.02	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.12	0.18	0.00	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01
O2'	0.00	0.07	0.00	0.04	0.10	0.09	0.18	0.02	0.16	0.21	0.09	0.14	0.07	0.23	0.12	0.00	0.21	0.06	0.08	0.21	0.14	0.17	0.12
O3'	0.25	0.25	0.11	0.03	0.22	0.02	0.18	0.16	0.20	0.11	0.23	0.27	0.26	0.12	0.18	0.21	0.00	0.16	0.25	0.19	0.33	0.28	0.28
O4'	0.00	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.04	0.01	0.00	0.06	0.16	0.00	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02
O5'	0.02	0.02	0.11	0.12	0.04	0.00	0.08	0.01	0.09	0.08	0.05	0.02	0.02	0.10	0.03	0.08	0.25	0.03	0.00	0.13	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.00	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.21	0.19	0.01	0.13	0.00	0.11	0.09	0.11
OP1	0.04	0.02	0.16	0.04	0.02	0.05	0.05	0.07	0.07	0.04	0.04	0.03	0.02	0.07	0.02	0.14	0.33	0.03	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01
OP2	0.04	0.04	0.13	0.12	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.04	0.02	0.05	0.06	0.04	0.06	0.17	0.28	0.06	0.02	0.09	0.00	0.00	0.01
P	0.01	0.01	0.13	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.03	0.03	0.03	0.06	0.01	0.12	0.28	0.02	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00