Doublet Group distance statistics: 54917

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 2, 1, 1, 0, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.011, 0.026, 0.040, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.026 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.017, 0.032, 0.047, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.032 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.006, 0.023, 0.039, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.010, 0.027, 0.044, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.027 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.014, 0.032, 0.050, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.011, 0.032, 0.053, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.032 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.014, 0.039, 0.063, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.039 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.026, 0.052, 0.078, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.052 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.034, 0.064, 0.095, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.064 std_dev=0.030
N2	A	0, 0.005, 0.043, 0.081, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.043 std_dev=0.038
O6	A	0, 0.013, 0.062, 0.111, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.062 std_dev=0.049
O4'	A	0, 0.065, 0.201, 0.338, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.201 std_dev=0.136
C2'	A	0, 0.102, 0.287, 0.472, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.287 std_dev=0.185
C2	B	0, 0.199, 0.423, 0.647, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.423 std_dev=0.224
C5	B	0, 0.294, 0.548, 0.802, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.548 std_dev=0.254
N1	B	0, 0.229, 0.486, 0.744, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.486 std_dev=0.257
N2	B	0, 0.165, 0.425, 0.684, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.425 std_dev=0.259
C4	B	0, 0.235, 0.508, 0.781, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.508 std_dev=0.273
C4'	A	0, 0.064, 0.340, 0.617, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.340 std_dev=0.276
N7	B	0, 0.355, 0.640, 0.926, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.640 std_dev=0.286
N3	B	0, 0.197, 0.487, 0.776, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.487 std_dev=0.289
C6	B	0, 0.266, 0.575, 0.885, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.575 std_dev=0.310
C8	B	0, 0.329, 0.643, 0.956, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.643 std_dev=0.313
N9	B	0, 0.284, 0.613, 0.943, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.613 std_dev=0.329
O5'	B	0, 0.478, 0.820, 1.162, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.820 std_dev=0.342
O2'	A	0, 0.073, 0.423, 0.773, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.423 std_dev=0.350
C5'	A	0, 0.186, 0.582, 0.978, 1.458 max_d=1.458 avg_d=0.582 std_dev=0.396
P	B	0, 0.532, 0.931, 1.329, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.931 std_dev=0.398
C3'	A	0, 0.036, 0.448, 0.859, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.448 std_dev=0.411
C2'	B	0, 0.445, 0.865, 1.285, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.865 std_dev=0.420
C1'	B	0, 0.354, 0.774, 1.195, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.774 std_dev=0.420
O6	B	0, 0.255, 0.694, 1.132, 1.784 max_d=1.784 avg_d=0.694 std_dev=0.439
C3'	B	0, 0.498, 0.940, 1.381, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.940 std_dev=0.442
O4'	B	0, 0.380, 0.852, 1.323, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.852 std_dev=0.471
C4'	B	0, 0.465, 0.937, 1.409, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.937 std_dev=0.472
C5'	B	0, 0.483, 0.975, 1.466, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.975 std_dev=0.491
OP1	B	0, 0.627, 1.139, 1.650, 1.874 max_d=1.874 avg_d=1.139 std_dev=0.512
OP2	B	0, 0.380, 0.916, 1.452, 2.140 max_d=2.140 avg_d=0.916 std_dev=0.536
O2'	B	0, 0.448, 1.041, 1.634, 2.434 max_d=2.434 avg_d=1.041 std_dev=0.593
O3'	B	0, 0.531, 1.153, 1.774, 2.606 max_d=2.606 avg_d=1.153 std_dev=0.622
O5'	A	0, -0.011, 0.646, 1.303, 2.522 max_d=2.522 avg_d=0.646 std_dev=0.657
O3'	A	0, -0.051, 0.615, 1.282, 2.580 max_d=2.580 avg_d=0.615 std_dev=0.667
P	A	0, -0.055, 0.836, 1.728, 3.352 max_d=3.352 avg_d=0.836 std_dev=0.892
OP1	A	0, -0.109, 1.005, 2.120, 4.183 max_d=4.183 avg_d=1.005 std_dev=1.115
OP2	A	0, -0.238, 1.099, 2.436, 5.043 max_d=5.043 avg_d=1.099 std_dev=1.337

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.06	0.05	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.14	0.05	0.16	0.27	0.18
C2	0.04	0.00	0.07	0.13	0.01	0.05	0.02	0.10	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.31	0.13	0.04	0.30	0.02	0.28	0.53	0.37
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.07	0.06	0.09	0.05	0.09	0.10	0.06	0.09	0.08	0.13	0.05	0.01	0.05	0.05	0.17	0.10	0.19	0.21	0.14
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.16	0.01	0.23	0.03	0.23	0.26	0.19	0.11	0.12	0.29	0.16	0.06	0.02	0.02	0.23	0.26	0.21	0.20	0.14
C4	0.03	0.01	0.07	0.16	0.00	0.07	0.02	0.13	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.21	0.17	0.04	0.34	0.04	0.32	0.55	0.40
C4'	0.02	0.05	0.06	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.11	0.15	0.07	0.05	0.05	0.16	0.08	0.23	0.06	0.00	0.03	0.13	0.12	0.23	0.04
C5	0.03	0.02	0.09	0.23	0.02	0.11	0.00	0.20	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.18	0.26	0.07	0.44	0.03	0.46	0.76	0.54
C5'	0.02	0.10	0.05	0.03	0.13	0.00	0.20	0.00	0.20	0.24	0.15	0.07	0.08	0.26	0.13	0.22	0.08	0.03	0.01	0.23	0.17	0.31	0.02
C6	0.03	0.02	0.09	0.23	0.03	0.11	0.02	0.20	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.22	0.27	0.07	0.45	0.01	0.49	0.82	0.57
C8	0.02	0.03	0.10	0.26	0.02	0.15	0.03	0.24	0.05	0.00	0.05	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.28	0.07	0.47	0.07	0.48	0.72	0.54
N1	0.03	0.02	0.06	0.19	0.03	0.07	0.03	0.15	0.01	0.05	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.26	0.20	0.05	0.39	0.02	0.39	0.70	0.48
N2	0.06	0.01	0.09	0.11	0.02	0.05	0.02	0.07	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.36	0.11	0.06	0.25	0.03	0.21	0.46	0.30
N3	0.05	0.01	0.08	0.12	0.01	0.05	0.02	0.08	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.30	0.11	0.04	0.26	0.03	0.23	0.44	0.31
N7	0.03	0.02	0.13	0.29	0.01	0.16	0.01	0.26	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.13	0.34	0.07	0.52	0.08	0.56	0.87	0.63
N9	0.01	0.02	0.05	0.16	0.01	0.08	0.03	0.13	0.04	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.10	0.16	0.03	0.32	0.06	0.31	0.49	0.37
O2'	0.02	0.31	0.01	0.06	0.21	0.23	0.18	0.22	0.22	0.06	0.26	0.36	0.30	0.13	0.10	0.00	0.09	0.15	0.26	0.22	0.31	0.28	0.25
O3'	0.03	0.13	0.05	0.02	0.17	0.06	0.26	0.08	0.27	0.28	0.20	0.11	0.11	0.34	0.16	0.09	0.00	0.05	0.21	0.32	0.22	0.26	0.14
O4'	0.01	0.04	0.05	0.02	0.04	0.00	0.07	0.03	0.07	0.07	0.05	0.06	0.04	0.07	0.03	0.15	0.05	0.00	0.18	0.11	0.21	0.32	0.20
O5'	0.14	0.30	0.17	0.23	0.34	0.03	0.44	0.01	0.45	0.47	0.39	0.25	0.26	0.52	0.32	0.26	0.21	0.18	0.00	0.50	0.04	0.01	0.01
O6	0.05	0.02	0.10	0.26	0.04	0.13	0.03	0.23	0.01	0.07	0.02	0.03	0.03	0.08	0.06	0.22	0.32	0.11	0.50	0.00	0.57	0.94	0.65
OP1	0.16	0.28	0.19	0.21	0.32	0.12	0.46	0.17	0.49	0.48	0.39	0.21	0.23	0.56	0.31	0.31	0.22	0.21	0.04	0.57	0.00	0.03	0.01
OP2	0.27	0.53	0.21	0.20	0.55	0.23	0.76	0.31	0.82	0.72	0.70	0.46	0.44	0.87	0.49	0.28	0.26	0.32	0.01	0.94	0.03	0.00	0.01
P	0.18	0.37	0.14	0.14	0.40	0.04	0.54	0.02	0.57	0.54	0.48	0.30	0.31	0.63	0.37	0.25	0.14	0.20	0.01	0.65	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.15	0.35	0.34	0.18	0.30	0.13	0.31	0.11	0.19	0.12	0.15	0.20	0.15	0.22	0.45	0.38	0.30	0.29	0.13	0.31	0.36	0.33
C2	0.27	0.12	0.34	0.37	0.14	0.30	0.10	0.31	0.11	0.18	0.13	0.16	0.13	0.14	0.19	0.44	0.45	0.30	0.28	0.11	0.33	0.35	0.30
C2'	0.40	0.24	0.44	0.44	0.28	0.41	0.22	0.41	0.18	0.29	0.19	0.25	0.30	0.24	0.32	0.55	0.47	0.41	0.38	0.19	0.41	0.44	0.44
C3'	0.53	0.46	0.57	0.55	0.47	0.54	0.44	0.54	0.41	0.47	0.42	0.47	0.49	0.44	0.49	0.67	0.58	0.54	0.50	0.39	0.54	0.60	0.59
C4	0.27	0.10	0.33	0.34	0.14	0.28	0.09	0.29	0.08	0.17	0.10	0.11	0.15	0.12	0.19	0.44	0.38	0.28	0.27	0.09	0.29	0.34	0.30
C4'	0.40	0.33	0.44	0.42	0.35	0.40	0.32	0.41	0.30	0.34	0.31	0.34	0.36	0.32	0.36	0.52	0.43	0.41	0.38	0.31	0.41	0.48	0.46
C5	0.28	0.11	0.34	0.33	0.16	0.29	0.10	0.30	0.09	0.18	0.11	0.12	0.17	0.14	0.21	0.44	0.37	0.30	0.28	0.10	0.30	0.35	0.32
C5'	0.50	0.47	0.52	0.50	0.48	0.50	0.47	0.50	0.46	0.48	0.46	0.48	0.49	0.47	0.49	0.61	0.50	0.51	0.48	0.46	0.51	0.59	0.57
C6	0.29	0.12	0.35	0.35	0.14	0.30	0.10	0.31	0.11	0.18	0.14	0.18	0.14	0.14	0.20	0.46	0.40	0.31	0.29	0.12	0.32	0.35	0.32
C8	0.28	0.17	0.33	0.31	0.20	0.28	0.15	0.29	0.14	0.20	0.15	0.18	0.22	0.17	0.23	0.41	0.32	0.28	0.28	0.14	0.30	0.36	0.33
N1	0.29	0.14	0.35	0.38	0.15	0.31	0.12	0.32	0.13	0.19	0.15	0.20	0.14	0.15	0.20	0.46	0.45	0.32	0.29	0.14	0.34	0.35	0.31
N2	0.27	0.14	0.33	0.38	0.15	0.30	0.12	0.30	0.13	0.19	0.15	0.18	0.14	0.15	0.20	0.42	0.48	0.30	0.28	0.13	0.34	0.36	0.29
N3	0.27	0.09	0.34	0.35	0.13	0.29	0.09	0.30	0.08	0.17	0.10	0.11	0.14	0.12	0.19	0.44	0.42	0.29	0.27	0.09	0.31	0.35	0.30
N7	0.27	0.13	0.32	0.29	0.17	0.27	0.12	0.28	0.10	0.18	0.12	0.14	0.20	0.14	0.21	0.41	0.31	0.27	0.27	0.10	0.28	0.34	0.31
N9	0.28	0.14	0.34	0.33	0.18	0.29	0.12	0.30	0.11	0.18	0.12	0.14	0.19	0.15	0.21	0.43	0.36	0.29	0.28	0.11	0.30	0.35	0.32
O2'	0.41	0.20	0.42	0.42	0.26	0.40	0.18	0.42	0.14	0.27	0.15	0.19	0.28	0.21	0.31	0.50	0.43	0.44	0.40	0.16	0.43	0.41	0.42
O3'	0.63	0.54	0.64	0.63	0.57	0.64	0.54	0.64	0.51	0.58	0.51	0.55	0.58	0.55	0.59	0.74	0.64	0.65	0.61	0.49	0.66	0.71	0.71
O4'	0.26	0.16	0.32	0.32	0.18	0.28	0.14	0.28	0.14	0.17	0.14	0.17	0.20	0.15	0.20	0.42	0.35	0.27	0.26	0.14	0.27	0.33	0.31
O5'	0.80	0.77	0.77	0.73	0.78	0.78	0.77	0.78	0.75	0.78	0.75	0.76	0.78	0.77	0.79	0.85	0.70	0.81	0.75	0.74	0.78	0.85	0.85
O6	0.29	0.16	0.35	0.34	0.14	0.30	0.11	0.31	0.15	0.18	0.18	0.25	0.13	0.14	0.20	0.47	0.38	0.31	0.28	0.16	0.32	0.34	0.32
OP1	0.90	0.90	0.82	0.78	0.94	0.87	0.97	0.89	0.99	0.97	0.95	0.86	0.90	0.99	0.94	0.87	0.72	0.94	0.88	1.01	0.92	1.00	1.00
OP2	1.36	1.36	1.32	1.30	1.40	1.35	1.43	1.35	1.43	1.43	1.41	1.30	1.35	1.45	1.40	1.36	1.27	1.38	1.35	1.43	1.40	1.46	1.45
P	0.96	0.95	0.92	0.88	0.98	0.94	1.00	0.94	1.00	1.00	0.98	0.92	0.95	1.01	0.98	0.98	0.84	0.98	0.92	1.00	0.95	1.02	1.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.05	0.09	0.09	0.22	0.12
C2	0.03	0.00	0.05	0.07	0.02	0.04	0.02	0.09	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.11	0.09	0.04	0.14	0.03	0.14	0.23	0.16
C2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04	0.06	0.05	0.03	0.02	0.02	0.05	0.05	0.10	0.08	0.12	0.21	0.03
C3'	0.03	0.07	0.02	0.00	0.07	0.02	0.09	0.02	0.09	0.10	0.08	0.06	0.06	0.11	0.06	0.05	0.02	0.08	0.17	0.11	0.18	0.24	0.10
C4	0.02	0.02	0.04	0.07	0.00	0.06	0.02	0.11	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.08	0.08	0.04	0.14	0.06	0.13	0.21	0.15
C4'	0.02	0.04	0.04	0.02	0.06	0.00	0.08	0.02	0.06	0.12	0.07	0.03	0.04	0.13	0.07	0.13	0.06	0.01	0.02	0.07	0.12	0.19	0.06
C5	0.03	0.02	0.04	0.09	0.02	0.08	0.00	0.15	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.09	0.10	0.05	0.20	0.07	0.18	0.23	0.19
C5'	0.02	0.09	0.03	0.02	0.11	0.02	0.15	0.00	0.13	0.19	0.13	0.07	0.06	0.22	0.11	0.11	0.06	0.03	0.01	0.11	0.12	0.18	0.04
C6	0.05	0.03	0.05	0.09	0.04	0.06	0.02	0.13	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.11	0.11	0.06	0.19	0.01	0.18	0.24	0.19
C8	0.02	0.02	0.03	0.10	0.01	0.12	0.01	0.19	0.04	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.10	0.07	0.20	0.12	0.16	0.20	0.17
N1	0.03	0.02	0.04	0.08	0.02	0.07	0.02	0.13	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.10	0.09	0.05	0.18	0.04	0.18	0.24	0.19
N2	0.04	0.02	0.06	0.06	0.02	0.03	0.02	0.07	0.04	0.03	0.04	0.00	0.02	0.03	0.03	0.14	0.10	0.04	0.12	0.07	0.13	0.23	0.16
N3	0.03	0.02	0.05	0.06	0.01	0.04	0.03	0.06	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.09	0.03	0.11	0.03	0.11	0.21	0.14
N7	0.01	0.02	0.03	0.11	0.02	0.13	0.02	0.22	0.04	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.12	0.06	0.25	0.14	0.22	0.24	0.23
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.00	0.07	0.02	0.11	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.06	0.06	0.04	0.13	0.09	0.11	0.20	0.13
O2'	0.07	0.11	0.02	0.05	0.08	0.13	0.09	0.11	0.11	0.05	0.10	0.14	0.11	0.03	0.06	0.00	0.07	0.09	0.11	0.12	0.17	0.21	0.09
O3'	0.06	0.09	0.05	0.02	0.08	0.06	0.10	0.06	0.11	0.10	0.09	0.10	0.09	0.12	0.06	0.07	0.00	0.09	0.20	0.13	0.29	0.30	0.18
O4'	0.01	0.04	0.05	0.08	0.04	0.01	0.05	0.03	0.06	0.07	0.05	0.04	0.03	0.06	0.04	0.09	0.09	0.00	0.14	0.11	0.15	0.28	0.19
O5'	0.05	0.14	0.10	0.17	0.14	0.02	0.20	0.01	0.19	0.20	0.18	0.12	0.11	0.25	0.13	0.11	0.20	0.14	0.00	0.19	0.03	0.03	0.02
O6	0.09	0.03	0.08	0.11	0.06	0.07	0.07	0.11	0.01	0.12	0.04	0.07	0.03	0.14	0.09	0.12	0.13	0.11	0.19	0.00	0.17	0.23	0.16
OP1	0.09	0.14	0.12	0.18	0.13	0.12	0.18	0.12	0.18	0.16	0.18	0.13	0.11	0.22	0.11	0.17	0.29	0.15	0.03	0.17	0.00	0.03	0.01
OP2	0.22	0.23	0.21	0.24	0.21	0.19	0.23	0.18	0.24	0.20	0.24	0.23	0.21	0.24	0.20	0.21	0.30	0.28	0.03	0.23	0.03	0.00	0.01
P	0.12	0.16	0.03	0.10	0.15	0.06	0.19	0.04	0.19	0.17	0.19	0.16	0.14	0.23	0.13	0.09	0.18	0.19	0.02	0.16	0.01	0.01	0.00