Doublet Group distance statistics: 54919

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N2	A	0, 0.000, 0.042, 0.084, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.042 std_dev=0.042
O4'	A	0, 0.000, 0.099, 0.199, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.099 std_dev=0.099
C2'	A	0, 0.000, 0.126, 0.251, 0.251 max_d=0.251 avg_d=0.126 std_dev=0.126
OP2	A	0, 0.000, 0.152, 0.303, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.152 std_dev=0.152
C4'	A	0, 0.000, 0.162, 0.325, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.162 std_dev=0.162
C3'	A	0, 0.000, 0.163, 0.325, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.163 std_dev=0.163
P	A	0, 0.000, 0.172, 0.344, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.172 std_dev=0.172
O2'	A	0, 0.000, 0.213, 0.425, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.213 std_dev=0.213
N2	B	0, 0.000, 0.257, 0.514, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.257 std_dev=0.257
O3'	A	0, 0.000, 0.261, 0.523, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.261 std_dev=0.261
C5'	A	0, 0.000, 0.282, 0.564, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.282 std_dev=0.282
C2	B	0, 0.000, 0.341, 0.682, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.341 std_dev=0.341
N3	B	0, 0.000, 0.377, 0.754, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.377 std_dev=0.377
N1	B	0, 0.000, 0.401, 0.801, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.401 std_dev=0.401
C4	B	0, 0.000, 0.481, 0.962, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.481 std_dev=0.481
C6	B	0, 0.000, 0.501, 1.003, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.501 std_dev=0.501
O5'	B	0, 0.000, 0.535, 1.070, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.535 std_dev=0.535
C5	B	0, 0.000, 0.544, 1.088, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.544 std_dev=0.544
O6	B	0, 0.000, 0.556, 1.112, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.556 std_dev=0.556
N9	B	0, 0.000, 0.563, 1.126, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.563 std_dev=0.563
C4'	B	0, 0.000, 0.563, 1.126, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.563 std_dev=0.563
C3'	B	0, 0.000, 0.568, 1.135, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.568 std_dev=0.568
C5'	B	0, 0.000, 0.568, 1.137, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.568 std_dev=0.568
O4'	B	0, 0.000, 0.569, 1.139, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.569 std_dev=0.569
C1'	B	0, 0.000, 0.616, 1.231, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.616 std_dev=0.616
O5'	A	0, 0.000, 0.638, 1.277, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.638 std_dev=0.638
N7	B	0, 0.000, 0.652, 1.305, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.652 std_dev=0.652
C8	B	0, 0.000, 0.665, 1.330, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.665 std_dev=0.665
OP1	A	0, 0.000, 0.722, 1.444, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.722 std_dev=0.722
P	B	0, 0.000, 0.733, 1.466, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.733 std_dev=0.733
OP2	B	0, 0.000, 0.758, 1.516, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.758 std_dev=0.758
C2'	B	0, 0.000, 0.823, 1.646, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.823 std_dev=0.823
OP1	B	0, 0.000, 0.915, 1.830, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.915 std_dev=0.915
O3'	B	0, 0.000, 1.067, 2.135, 2.135 max_d=2.135 avg_d=1.067 std_dev=1.067
O2'	B	0, 0.000, 1.552, 3.104, 3.104 max_d=3.104 avg_d=1.552 std_dev=1.552

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.03	0.39	0.02	0.07
C2	0.02	0.00	0.09	0.07	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.10	0.02	0.01	0.01	0.30	0.04	0.00
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.08	0.11	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.51	0.06	0.11
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.07	0.10	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.11	0.05	0.54	0.10	0.15
C4	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.05	0.02	0.29	0.02	0.02
C4'	0.00	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.06	0.04	0.01	0.01	0.08	0.02	0.00	0.00	0.05	0.36	0.02	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02	0.08	0.02	0.20	0.05	0.01
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.04	0.09	0.09	0.07	0.05	0.04	0.06	0.02	0.01	0.00	0.10	0.19	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.04	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.07	0.02	0.05	0.01	0.17	0.07	0.03
C8	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.02	0.22	0.00	0.02
N1	0.02	0.00	0.08	0.07	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.11	0.09	0.02	0.01	0.01	0.23	0.06	0.02
N2	0.03	0.00	0.11	0.10	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.14	0.03	0.04	0.02	0.32	0.04	0.00
N3	0.02	0.00	0.08	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.01	0.00	0.01	0.34	0.02	0.02
N7	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.02	0.14	0.04	0.01
N9	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.03	0.31	0.00	0.04
O2'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.06	0.08	0.05	0.06	0.08	0.01	0.11	0.16	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.08	0.56	0.09	0.15
O3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.02	0.07	0.02	0.09	0.14	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.17	0.07	0.61	0.12	0.18
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.13	0.03	0.30	0.00	0.04
O5'	0.08	0.01	0.05	0.11	0.05	0.00	0.08	0.00	0.05	0.19	0.01	0.04	0.00	0.15	0.10	0.01	0.17	0.13	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01
O6	0.03	0.01	0.07	0.05	0.02	0.05	0.02	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.08	0.07	0.03	0.05	0.00	0.09	0.10	0.06
OP1	0.39	0.30	0.51	0.54	0.29	0.36	0.20	0.19	0.17	0.22	0.23	0.32	0.34	0.14	0.31	0.56	0.61	0.30	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00
OP2	0.02	0.04	0.06	0.10	0.02	0.02	0.05	0.04	0.07	0.00	0.06	0.04	0.02	0.04	0.00	0.09	0.12	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.00	0.11	0.15	0.02	0.06	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.15	0.18	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.03	0.30	0.06	0.02	0.09	0.03	0.12	0.04	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03	0.00	0.69	0.44	0.11	0.02	0.05	0.01	0.13	0.03
C2	0.25	0.12	0.49	0.12	0.16	0.08	0.14	0.04	0.12	0.19	0.10	0.09	0.14	0.16	0.19	0.99	0.14	0.08	0.10	0.11	0.18	0.03	0.12
C2'	0.06	0.02	0.29	0.06	0.01	0.09	0.02	0.13	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.69	0.42	0.10	0.02	0.04	0.03	0.11	0.01
C3'	0.06	0.02	0.28	0.04	0.01	0.09	0.02	0.12	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.63	0.43	0.09	0.01	0.04	0.04	0.09	0.00
C4	0.15	0.06	0.38	0.01	0.07	0.03	0.06	0.07	0.05	0.09	0.05	0.05	0.07	0.07	0.10	0.83	0.33	0.03	0.03	0.05	0.08	0.06	0.03
C4'	0.01	0.09	0.23	0.09	0.08	0.14	0.10	0.17	0.12	0.08	0.11	0.10	0.08	0.10	0.06	0.55	0.49	0.16	0.04	0.13	0.04	0.17	0.07
C5	0.16	0.09	0.37	0.01	0.10	0.03	0.09	0.08	0.08	0.11	0.08	0.08	0.09	0.09	0.11	0.82	0.33	0.03	0.03	0.08	0.07	0.06	0.03
C5'	0.07	0.16	0.15	0.14	0.15	0.20	0.17	0.23	0.18	0.14	0.18	0.16	0.14	0.16	0.12	0.42	0.54	0.22	0.09	0.18	0.11	0.22	0.13
C6	0.24	0.14	0.44	0.09	0.17	0.04	0.16	0.02	0.14	0.19	0.13	0.12	0.16	0.17	0.19	0.92	0.20	0.06	0.08	0.14	0.14	0.00	0.09
C8	0.03	0.01	0.26	0.08	0.01	0.12	0.02	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.61	0.47	0.13	0.03	0.01	0.01	0.14	0.04
N1	0.28	0.14	0.49	0.14	0.18	0.10	0.17	0.04	0.15	0.22	0.13	0.12	0.17	0.19	0.22	1.00	0.11	0.11	0.11	0.14	0.19	0.04	0.13
N2	0.29	0.13	0.53	0.17	0.18	0.14	0.17	0.09	0.13	0.22	0.12	0.10	0.16	0.19	0.22	1.04	0.05	0.13	0.14	0.12	0.24	0.07	0.17
N3	0.19	0.08	0.43	0.06	0.10	0.03	0.09	0.01	0.07	0.13	0.06	0.06	0.09	0.10	0.13	0.91	0.24	0.02	0.06	0.06	0.13	0.02	0.07
N7	0.07	0.04	0.28	0.06	0.03	0.11	0.03	0.14	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03	0.04	0.66	0.44	0.11	0.01	0.04	0.01	0.12	0.03
N9	0.07	0.01	0.32	0.04	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.72	0.42	0.09	0.01	0.01	0.02	0.11	0.02
O2'	0.06	0.01	0.31	0.06	0.00	0.09	0.02	0.13	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.71	0.42	0.10	0.02	0.03	0.02	0.11	0.02
O3'	0.06	0.02	0.27	0.05	0.01	0.09	0.03	0.13	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.62	0.43	0.10	0.01	0.04	0.04	0.09	0.00
O4'	0.00	0.08	0.26	0.08	0.07	0.13	0.09	0.15	0.10	0.06	0.10	0.08	0.07	0.08	0.05	0.59	0.48	0.15	0.04	0.11	0.03	0.17	0.07
O5'	0.19	0.09	0.40	0.11	0.12	0.03	0.09	0.03	0.07	0.13	0.07	0.08	0.12	0.10	0.14	0.69	0.27	0.01	0.14	0.05	0.10	0.00	0.08
O6	0.28	0.16	0.44	0.11	0.20	0.06	0.19	0.01	0.17	0.22	0.16	0.13	0.18	0.20	0.22	0.91	0.16	0.09	0.10	0.17	0.15	0.02	0.10
OP1	0.17	0.33	0.02	0.20	0.34	0.23	0.43	0.28	0.49	0.37	0.45	0.25	0.27	0.44	0.30	0.22	0.53	0.27	0.16	0.56	0.21	0.36	0.23
OP2	0.11	0.17	0.02	0.19	0.17	0.24	0.18	0.28	0.16	0.17	0.16	0.16	0.17	0.18	0.16	0.26	0.55	0.25	0.11	0.15	0.12	0.22	0.14
P	0.12	0.21	0.03	0.18	0.20	0.23	0.23	0.27	0.24	0.21	0.23	0.19	0.19	0.23	0.19	0.27	0.56	0.25	0.11	0.24	0.14	0.25	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.06	0.05	0.00	0.00	0.02	0.27	0.01	0.03	0.02	0.03	0.20	0.06
C2	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.23	0.35	0.05	0.11	0.01	0.05	0.05	0.05
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.14	0.00	0.14	0.07	0.18	0.13	0.12	0.04	0.01	0.06	0.03	0.26	0.03	0.36	0.54	0.39
C3'	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.09	0.03	0.01	0.00	0.09	0.04	0.00	0.01	0.00	0.05	0.05	0.03	0.18	0.09
C4	0.03	0.00	0.04	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.28	0.02	0.14	0.00	0.04	0.08	0.04
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.08	0.01	0.05	0.04	0.07	0.03	0.16	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.13	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.23	0.01	0.20	0.00	0.07	0.00	0.09
C5'	0.02	0.05	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.08	0.02	0.07	0.06	0.07	0.01	0.00	0.17	0.01	0.01	0.03	0.10	0.09	0.01
C6	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.27	0.00	0.19	0.00	0.09	0.03	0.11
C8	0.01	0.01	0.14	0.09	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.38	0.11	0.07	0.21	0.01	0.04	0.07	0.06
N1	0.04	0.00	0.07	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.32	0.03	0.16	0.00	0.08	0.00	0.08
N2	0.06	0.00	0.18	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.36	0.38	0.07	0.09	0.01	0.05	0.06	0.04
N3	0.05	0.00	0.13	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.35	0.06	0.09	0.00	0.03	0.09	0.02
N7	0.00	0.01	0.12	0.09	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.35	0.14	0.05	0.23	0.01	0.08	0.02	0.11
N9	0.00	0.02	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.14	0.22	0.01	0.13	0.00	0.01	0.13	0.00
O2'	0.02	0.23	0.01	0.00	0.00	0.16	0.16	0.00	0.10	0.38	0.08	0.36	0.24	0.35	0.14	0.00	0.04	0.10	0.26	0.17	0.41	0.64	0.41
O3'	0.27	0.35	0.06	0.01	0.28	0.01	0.23	0.17	0.27	0.11	0.32	0.38	0.35	0.14	0.22	0.04	0.00	0.16	0.09	0.25	0.21	0.11	0.06
O4'	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.03	0.07	0.06	0.05	0.01	0.10	0.16	0.00	0.12	0.01	0.11	0.07	0.06
O5'	0.03	0.11	0.26	0.05	0.14	0.00	0.20	0.01	0.19	0.21	0.16	0.09	0.09	0.23	0.13	0.26	0.09	0.12	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.17	0.25	0.01	0.22	0.00	0.10	0.07	0.13
OP1	0.03	0.05	0.36	0.03	0.04	0.06	0.07	0.10	0.09	0.04	0.08	0.05	0.03	0.08	0.01	0.41	0.21	0.11	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00
OP2	0.20	0.05	0.54	0.18	0.08	0.13	0.00	0.09	0.03	0.07	0.00	0.06	0.09	0.02	0.13	0.64	0.11	0.07	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.05	0.39	0.09	0.04	0.02	0.09	0.01	0.11	0.06	0.08	0.04	0.02	0.11	0.00	0.41	0.06	0.06	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00