Doublet Group distance statistics: 54924

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 6, 12, 3, 3, 8, 7, 15, 2, 0, 2, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.002, 0.014, 0.025, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.014 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.004, 0.017, 0.031, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.001, 0.015, 0.030, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.004, 0.021, 0.038, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.021 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.014, 0.037, 0.060, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.037 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.007, 0.036, 0.066, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.036 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.003, 0.037, 0.070, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.037 std_dev=0.033
O4'	A	0, -0.011, 0.124, 0.259, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.124 std_dev=0.135
C6	B	0, 0.145, 0.284, 0.422, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.284 std_dev=0.139
C2'	A	0, 0.002, 0.164, 0.327, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.164 std_dev=0.162
N6	B	0, 0.074, 0.256, 0.437, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.256 std_dev=0.182
C5	B	0, 0.183, 0.402, 0.621, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.402 std_dev=0.219
N1	B	0, 0.087, 0.307, 0.527, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.307 std_dev=0.220
O2'	A	0, 0.096, 0.336, 0.575, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.336 std_dev=0.239
C3'	A	0, 0.017, 0.258, 0.499, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.258 std_dev=0.241
N7	B	0, 0.231, 0.522, 0.812, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.522 std_dev=0.291
C4	B	0, 0.220, 0.511, 0.803, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.511 std_dev=0.292
C4'	A	0, 0.153, 0.463, 0.772, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.463 std_dev=0.310
C2	B	0, 0.086, 0.418, 0.751, 1.518 max_d=1.518 avg_d=0.418 std_dev=0.333
N3	B	0, 0.171, 0.530, 0.888, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.530 std_dev=0.359
N9	B	0, 0.265, 0.627, 0.988, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.627 std_dev=0.361
C8	B	0, 0.277, 0.644, 1.010, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.644 std_dev=0.367
O3'	A	0, -0.003, 0.371, 0.746, 2.401 max_d=2.401 avg_d=0.371 std_dev=0.375
O5'	A	0, 0.171, 0.599, 1.026, 2.369 max_d=2.369 avg_d=0.599 std_dev=0.427
C1'	B	0, 0.308, 0.740, 1.172, 2.030 max_d=2.030 avg_d=0.740 std_dev=0.432
P	A	0, 0.184, 0.736, 1.288, 3.103 max_d=3.103 avg_d=0.736 std_dev=0.552
OP2	A	0, 0.156, 0.719, 1.282, 3.847 max_d=3.847 avg_d=0.719 std_dev=0.563
C5'	A	0, 0.290, 1.043, 1.796, 2.323 max_d=2.323 avg_d=1.043 std_dev=0.753
OP1	A	0, 0.250, 1.012, 1.774, 4.203 max_d=4.203 avg_d=1.012 std_dev=0.762
O4'	B	0, 0.464, 1.257, 2.049, 2.214 max_d=2.214 avg_d=1.257 std_dev=0.792
C2'	B	0, 0.407, 1.421, 2.436, 3.529 max_d=3.529 avg_d=1.421 std_dev=1.015
O2'	B	0, 0.449, 1.590, 2.732, 4.789 max_d=4.789 avg_d=1.590 std_dev=1.142
C4'	B	0, 0.504, 1.652, 2.800, 2.990 max_d=2.990 avg_d=1.652 std_dev=1.148
C3'	B	0, 0.448, 1.677, 2.907, 3.905 max_d=3.905 avg_d=1.677 std_dev=1.229
O3'	B	0, 0.536, 1.926, 3.316, 4.501 max_d=4.501 avg_d=1.926 std_dev=1.390
C5'	B	0, 0.574, 2.108, 3.642, 5.253 max_d=5.253 avg_d=2.108 std_dev=1.534
O5'	B	0, 0.556, 2.456, 4.356, 6.037 max_d=6.037 avg_d=2.456 std_dev=1.900
P	B	0, 0.680, 2.996, 5.311, 8.891 max_d=8.891 avg_d=2.996 std_dev=2.316
OP1	B	0, 0.840, 3.270, 5.700, 8.967 max_d=8.967 avg_d=3.270 std_dev=2.430
OP2	B	0, 0.722, 3.213, 5.703, 10.320 max_d=10.320 avg_d=3.213 std_dev=2.491

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.31	0.02	0.32	0.10	0.20
C2	0.03	0.00	0.10	0.12	0.01	0.11	0.01	0.51	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.13	0.04	0.28	0.01	0.21	0.29	0.18
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.03	0.04	0.10	0.05	0.08	0.07	0.13	0.11	0.06	0.02	0.00	0.02	0.03	0.21	0.05	0.30	0.09	0.15
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.09	0.11	0.11	0.14	0.11	0.10	0.06	0.02	0.01	0.02	0.14	0.10	0.30	0.15	0.13
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.14	0.00	0.55	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.06	0.02	0.30	0.01	0.22	0.27	0.19
C4'	0.01	0.11	0.03	0.01	0.14	0.00	0.20	0.01	0.20	0.24	0.16	0.08	0.08	0.25	0.15	0.08	0.03	0.00	0.01	0.23	0.20	0.21	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.20	0.00	0.67	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.06	0.02	0.30	0.01	0.25	0.35	0.23
C5'	0.23	0.51	0.10	0.02	0.55	0.01	0.67	0.00	0.69	0.70	0.62	0.46	0.45	0.74	0.52	0.04	0.18	0.07	0.02	0.74	0.38	0.42	0.03
C6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.20	0.01	0.69	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.29	0.00	0.27	0.39	0.25
C8	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.24	0.00	0.70	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.04	0.32	0.02	0.25	0.28	0.22
N1	0.03	0.00	0.07	0.11	0.01	0.16	0.01	0.62	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.09	0.03	0.29	0.01	0.23	0.35	0.22
N2	0.04	0.00	0.13	0.14	0.01	0.08	0.01	0.46	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.17	0.06	0.27	0.01	0.21	0.28	0.18
N3	0.03	0.01	0.11	0.11	0.00	0.08	0.00	0.45	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.12	0.04	0.28	0.01	0.22	0.24	0.17
N7	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.25	0.00	0.74	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.03	0.30	0.02	0.28	0.38	0.27
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.15	0.00	0.52	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.31	0.02	0.24	0.21	0.18
O2'	0.03	0.15	0.00	0.02	0.09	0.08	0.07	0.04	0.10	0.04	0.13	0.18	0.14	0.05	0.03	0.00	0.05	0.13	0.13	0.09	0.30	0.09	0.14
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.06	0.03	0.06	0.18	0.06	0.12	0.09	0.17	0.12	0.11	0.05	0.05	0.00	0.05	0.16	0.07	0.32	0.23	0.18
O4'	0.01	0.04	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.07	0.02	0.04	0.03	0.06	0.04	0.03	0.01	0.13	0.05	0.00	0.37	0.03	0.41	0.15	0.29
O5'	0.31	0.28	0.21	0.14	0.30	0.01	0.30	0.02	0.29	0.32	0.29	0.27	0.28	0.30	0.31	0.13	0.16	0.37	0.00	0.29	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.23	0.01	0.74	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.07	0.03	0.29	0.00	0.32	0.43	0.29
OP1	0.32	0.21	0.30	0.30	0.22	0.20	0.25	0.38	0.27	0.25	0.23	0.21	0.22	0.28	0.24	0.30	0.32	0.41	0.02	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.29	0.09	0.15	0.27	0.21	0.35	0.42	0.39	0.28	0.35	0.28	0.24	0.38	0.21	0.09	0.23	0.15	0.01	0.43	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.18	0.15	0.13	0.19	0.06	0.23	0.03	0.25	0.22	0.22	0.18	0.17	0.27	0.18	0.14	0.18	0.29	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.13	0.12	0.36	0.08	0.14	0.10	0.26	0.10	0.15	0.14	0.10	0.11	0.15	0.10	0.40	0.18	0.15	0.99	1.37	1.08	1.12
C2	0.16	0.20	0.29	0.26	0.15	0.28	0.14	0.48	0.14	0.14	0.17	0.19	0.18	0.15	0.15	0.23	0.19	0.35	0.57	0.93	0.63	0.66
C2'	0.19	0.24	0.25	0.51	0.19	0.25	0.20	0.25	0.21	0.23	0.24	0.21	0.21	0.24	0.20	0.47	0.36	0.21	1.13	1.49	1.30	1.29
C3'	0.18	0.23	0.26	0.60	0.17	0.32	0.17	0.32	0.17	0.22	0.23	0.19	0.17	0.22	0.18	0.46	0.47	0.23	1.31	1.71	1.53	1.51
C4	0.10	0.15	0.19	0.28	0.10	0.17	0.11	0.37	0.11	0.13	0.14	0.13	0.13	0.15	0.11	0.21	0.10	0.23	0.74	1.12	0.79	0.83
C4'	0.26	0.19	0.27	0.67	0.21	0.42	0.21	0.41	0.18	0.29	0.19	0.19	0.17	0.27	0.25	0.35	0.55	0.35	1.46	1.87	1.62	1.65
C5	0.11	0.16	0.20	0.26	0.11	0.21	0.12	0.43	0.11	0.14	0.14	0.14	0.13	0.15	0.11	0.20	0.12	0.28	0.66	1.06	0.72	0.75
C5'	0.18	0.17	0.22	0.61	0.10	0.35	0.11	0.39	0.12	0.25	0.21	0.10	0.14	0.22	0.17	0.40	0.49	0.27	1.43	1.90	1.65	1.65
C6	0.14	0.19	0.25	0.24	0.14	0.30	0.13	0.52	0.13	0.15	0.15	0.17	0.16	0.16	0.14	0.22	0.19	0.36	0.55	0.94	0.62	0.64
C8	0.09	0.14	0.13	0.30	0.08	0.14	0.10	0.34	0.09	0.14	0.13	0.10	0.11	0.15	0.10	0.29	0.12	0.18	0.85	1.25	0.92	0.96
N1	0.17	0.20	0.30	0.25	0.16	0.32	0.15	0.55	0.14	0.15	0.17	0.19	0.17	0.16	0.16	0.26	0.23	0.40	0.51	0.89	0.59	0.61
N2	0.20	0.23	0.34	0.27	0.18	0.33	0.16	0.53	0.16	0.16	0.18	0.22	0.19	0.16	0.18	0.29	0.25	0.41	0.53	0.87	0.59	0.63
N3	0.12	0.17	0.23	0.29	0.12	0.19	0.12	0.38	0.12	0.13	0.15	0.15	0.16	0.15	0.12	0.19	0.12	0.25	0.70	1.06	0.74	0.79
N7	0.10	0.15	0.16	0.27	0.10	0.18	0.11	0.40	0.10	0.14	0.13	0.12	0.12	0.15	0.10	0.23	0.10	0.24	0.73	1.14	0.80	0.83
N9	0.09	0.14	0.14	0.32	0.09	0.13	0.10	0.31	0.09	0.14	0.14	0.10	0.11	0.15	0.10	0.29	0.12	0.17	0.87	1.25	0.93	0.97
O2'	0.25	0.28	0.30	0.62	0.25	0.36	0.26	0.32	0.26	0.29	0.28	0.26	0.27	0.31	0.25	0.49	0.49	0.29	1.25	1.58	1.41	1.41
O3'	0.26	0.29	0.36	0.72	0.25	0.44	0.24	0.42	0.23	0.29	0.28	0.27	0.22	0.28	0.26	0.58	0.64	0.32	1.42	1.83	1.71	1.66
O4'	0.15	0.14	0.15	0.33	0.12	0.19	0.13	0.32	0.12	0.18	0.15	0.12	0.14	0.17	0.15	0.51	0.21	0.20	1.06	1.48	1.14	1.21
O5'	0.34	0.35	0.33	0.70	0.33	0.48	0.33	0.47	0.33	0.37	0.35	0.33	0.33	0.36	0.34	0.32	0.57	0.42	1.51	1.97	1.65	1.71
O6	0.16	0.19	0.26	0.23	0.15	0.34	0.14	0.58	0.13	0.16	0.16	0.18	0.16	0.17	0.15	0.24	0.23	0.40	0.49	0.90	0.58	0.59
OP1	0.55	0.39	0.52	0.93	0.47	0.74	0.47	0.76	0.41	0.60	0.38	0.42	0.40	0.56	0.54	0.36	0.82	0.67	1.82	2.36	1.99	2.07
OP2	0.19	0.24	0.19	0.43	0.17	0.25	0.17	0.36	0.18	0.24	0.25	0.19	0.18	0.22	0.19	0.44	0.27	0.25	1.17	1.69	1.32	1.37
P	0.36	0.28	0.33	0.67	0.30	0.47	0.31	0.49	0.28	0.40	0.28	0.28	0.28	0.37	0.35	0.38	0.54	0.44	1.49	1.99	1.61	1.69

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.29	0.01	0.32	0.46	0.20	0.32
C2	0.02	0.00	0.36	0.22	0.01	0.22	0.01	0.43	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.23	0.31	0.57	0.82	0.55	0.65
C2'	0.00	0.36	0.00	0.00	0.18	0.02	0.07	0.23	0.15	0.21	0.27	0.36	0.09	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.20	0.26	0.46	0.31
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.21	0.00	0.27	0.04	0.28	0.28	0.25	0.20	0.31	0.31	0.18	0.02	0.01	0.04	0.12	0.20	0.24	0.12
C4	0.01	0.01	0.18	0.21	0.00	0.09	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.14	0.17	0.58	0.80	0.45	0.60
C4'	0.01	0.22	0.02	0.00	0.09	0.00	0.05	0.01	0.08	0.17	0.16	0.21	0.06	0.13	0.04	0.31	0.03	0.00	0.04	0.23	0.27	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.27	0.00	0.05	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.07	0.07	0.76	1.02	0.66	0.80
C5'	0.10	0.43	0.23	0.04	0.24	0.01	0.19	0.00	0.25	0.20	0.36	0.40	0.22	0.18	0.13	0.10	0.20	0.02	0.01	0.44	0.40	0.01
C6	0.02	0.00	0.15	0.28	0.01	0.08	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.08	0.14	0.75	1.05	0.69	0.81
C8	0.01	0.01	0.21	0.28	0.00	0.17	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.48	0.12	0.17	0.91	1.08	0.72	0.92
N1	0.02	0.00	0.27	0.25	0.01	0.16	0.01	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.14	0.24	0.66	0.95	0.61	0.73
N3	0.02	0.00	0.36	0.20	0.00	0.21	0.00	0.40	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.32	0.27	0.31	0.50	0.71	0.45	0.56
N6	0.02	0.01	0.09	0.31	0.01	0.06	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.26	0.09	0.09	0.84	1.18	0.83	0.93
N7	0.01	0.01	0.13	0.31	0.00	0.13	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.46	0.14	0.09	0.95	1.19	0.86	0.99
N9	0.00	0.01	0.02	0.18	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.19	0.11	0.01	0.60	0.77	0.40	0.59
O2'	0.02	0.29	0.00	0.02	0.10	0.31	0.24	0.10	0.17	0.48	0.15	0.32	0.26	0.46	0.19	0.00	0.04	0.19	0.16	0.25	0.47	0.27
O3'	0.29	0.23	0.02	0.01	0.14	0.03	0.07	0.20	0.08	0.12	0.14	0.27	0.09	0.14	0.11	0.04	0.00	0.21	0.18	0.40	0.22	0.18
O4'	0.01	0.31	0.02	0.04	0.17	0.00	0.07	0.02	0.14	0.17	0.24	0.31	0.09	0.09	0.01	0.19	0.21	0.00	0.39	0.54	0.18	0.35
O5'	0.32	0.57	0.20	0.12	0.58	0.04	0.76	0.01	0.75	0.91	0.66	0.50	0.84	0.95	0.60	0.16	0.18	0.39	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.46	0.82	0.26	0.20	0.80	0.23	1.02	0.44	1.05	1.08	0.95	0.71	1.18	1.19	0.77	0.25	0.40	0.54	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.55	0.46	0.24	0.45	0.27	0.66	0.40	0.69	0.72	0.61	0.45	0.83	0.86	0.40	0.47	0.22	0.18	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.32	0.65	0.31	0.12	0.60	0.04	0.80	0.01	0.81	0.92	0.73	0.56	0.93	0.99	0.59	0.27	0.18	0.35	0.01	0.01	0.00	0.00