Doublet Group distance statistics: 54928

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 6, 5, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, -0.001, 0.008, 0.018, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.008 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.016 std_dev=0.010
O6	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.022 std_dev=0.020
C3'	A	0, 0.100, 0.180, 0.260, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.180 std_dev=0.080
O3'	A	0, 0.096, 0.197, 0.298, 0.396 max_d=0.396 avg_d=0.197 std_dev=0.101
O4'	A	0, 0.068, 0.175, 0.281, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.175 std_dev=0.106
C2'	A	0, 0.079, 0.206, 0.333, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.206 std_dev=0.127
C2	B	0, 0.108, 0.271, 0.434, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.271 std_dev=0.163
C4'	A	0, 0.076, 0.242, 0.409, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.242 std_dev=0.167
N1	B	0, 0.046, 0.217, 0.388, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.217 std_dev=0.171
N3	B	0, 0.149, 0.328, 0.508, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.328 std_dev=0.179
C6	B	0, 0.072, 0.260, 0.447, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.260 std_dev=0.187
N6	B	0, 0.134, 0.322, 0.509, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.322 std_dev=0.188
O2'	A	0, 0.118, 0.308, 0.499, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.308 std_dev=0.190
C4	B	0, 0.133, 0.333, 0.533, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.333 std_dev=0.200
C5	B	0, 0.109, 0.318, 0.528, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.318 std_dev=0.210
N9	B	0, 0.190, 0.417, 0.644, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.417 std_dev=0.227
N7	B	0, 0.188, 0.421, 0.655, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.421 std_dev=0.233
O2'	B	0, 0.317, 0.554, 0.792, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.554 std_dev=0.238
C1'	B	0, 0.248, 0.488, 0.729, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.488 std_dev=0.240
C2'	B	0, 0.231, 0.474, 0.716, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.474 std_dev=0.243
C8	B	0, 0.213, 0.457, 0.702, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.457 std_dev=0.245
P	A	0, 0.107, 0.397, 0.687, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.397 std_dev=0.290
O4'	B	0, 0.296, 0.587, 0.879, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.587 std_dev=0.291
C3'	B	0, 0.253, 0.547, 0.840, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.547 std_dev=0.293
O3'	B	0, 0.290, 0.606, 0.922, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.606 std_dev=0.316
C4'	B	0, 0.283, 0.614, 0.944, 1.657 max_d=1.657 avg_d=0.614 std_dev=0.331
OP2	A	0, 0.143, 0.479, 0.815, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.479 std_dev=0.336
O5'	B	0, 0.291, 0.643, 0.994, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.643 std_dev=0.351
OP1	A	0, 0.127, 0.482, 0.836, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.482 std_dev=0.355
C5'	B	0, 0.284, 0.670, 1.057, 1.922 max_d=1.922 avg_d=0.670 std_dev=0.387
C5'	A	0, 0.144, 0.539, 0.934, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.539 std_dev=0.395
P	B	0, 0.252, 0.663, 1.073, 2.124 max_d=2.124 avg_d=0.663 std_dev=0.410
OP2	B	0, 0.222, 0.660, 1.098, 2.006 max_d=2.006 avg_d=0.660 std_dev=0.438
O5'	A	0, 0.031, 0.475, 0.918, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.475 std_dev=0.443
OP1	B	0, 0.372, 0.878, 1.384, 2.412 max_d=2.412 avg_d=0.878 std_dev=0.506

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.33	0.01	0.23	0.28	0.13
C2	0.02	0.00	0.07	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.03	0.04	0.37	0.01	0.18	0.27	0.15
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.08	0.03	0.05	0.05	0.09	0.07	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.43	0.03	0.38	0.30	0.26
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.02	0.30	0.25	0.12
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.02	0.42	0.01	0.22	0.29	0.19
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.07	0.02	0.05	0.03	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.21	0.33	0.08
C5	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.48	0.01	0.25	0.30	0.24
C5'	0.06	0.06	0.08	0.02	0.09	0.00	0.13	0.00	0.12	0.18	0.09	0.05	0.05	0.18	0.11	0.08	0.03	0.01	0.01	0.14	0.25	0.34	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.02	0.48	0.00	0.23	0.30	0.24
C8	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.09	0.03	0.05	0.52	0.01	0.28	0.33	0.28
N1	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.03	0.03	0.42	0.01	0.20	0.28	0.19
N2	0.03	0.01	0.09	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.03	0.05	0.32	0.01	0.16	0.27	0.12
N3	0.02	0.01	0.07	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.03	0.04	0.35	0.01	0.19	0.27	0.14
N7	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.03	0.03	0.53	0.01	0.28	0.33	0.29
N9	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.44	0.01	0.24	0.29	0.20
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.08	0.05	0.09	0.07	0.13	0.10	0.08	0.04	0.00	0.06	0.02	0.42	0.05	0.40	0.33	0.27
O3'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.06	0.00	0.04	0.08	0.03	0.24	0.27	0.06
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.20	0.02	0.16	0.32	0.05
O5'	0.33	0.37	0.43	0.21	0.42	0.01	0.48	0.01	0.48	0.52	0.42	0.32	0.35	0.53	0.44	0.42	0.08	0.20	0.00	0.50	0.02	0.03	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.02	0.50	0.00	0.25	0.31	0.26
OP1	0.23	0.18	0.38	0.30	0.22	0.21	0.25	0.25	0.23	0.28	0.20	0.16	0.19	0.28	0.24	0.40	0.24	0.16	0.02	0.25	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.27	0.30	0.25	0.29	0.33	0.30	0.34	0.30	0.33	0.28	0.27	0.27	0.33	0.29	0.33	0.27	0.32	0.03	0.31	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.15	0.26	0.12	0.19	0.08	0.24	0.01	0.24	0.28	0.19	0.12	0.14	0.29	0.20	0.27	0.06	0.05	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.08	0.07	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.07	0.08	0.07	0.07	0.11	0.09	0.06	0.10	0.06	0.06	0.06	0.09	0.19	0.06
C2	0.05	0.05	0.06	0.06	0.04	0.04	0.07	0.04	0.09	0.06	0.07	0.05	0.14	0.07	0.04	0.10	0.07	0.05	0.06	0.11	0.13	0.08
C2'	0.13	0.16	0.16	0.16	0.14	0.14	0.15	0.15	0.16	0.15	0.17	0.15	0.17	0.16	0.14	0.15	0.18	0.13	0.16	0.21	0.28	0.16
C3'	0.08	0.13	0.10	0.10	0.09	0.09	0.10	0.08	0.11	0.10	0.13	0.11	0.13	0.11	0.09	0.12	0.11	0.08	0.10	0.13	0.26	0.09
C4	0.06	0.05	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.08	0.06	0.05	0.05	0.13	0.08	0.05	0.10	0.06	0.06	0.06	0.10	0.15	0.07
C4'	0.17	0.12	0.14	0.13	0.14	0.16	0.14	0.17	0.12	0.17	0.10	0.13	0.14	0.16	0.15	0.17	0.12	0.19	0.16	0.14	0.23	0.16
C5	0.07	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.04	0.08	0.07	0.06	0.06	0.13	0.08	0.05	0.11	0.07	0.07	0.06	0.11	0.14	0.07
C5'	0.20	0.13	0.15	0.14	0.15	0.20	0.14	0.20	0.11	0.18	0.10	0.15	0.12	0.17	0.18	0.19	0.12	0.23	0.18	0.16	0.23	0.18
C6	0.07	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.09	0.06	0.08	0.06	0.13	0.07	0.05	0.11	0.08	0.07	0.07	0.12	0.12	0.08
C8	0.07	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.08	0.07	0.05	0.06	0.12	0.08	0.06	0.11	0.06	0.07	0.06	0.10	0.16	0.07
N1	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.07	0.05	0.09	0.06	0.09	0.06	0.14	0.07	0.05	0.10	0.08	0.06	0.07	0.12	0.12	0.08
N2	0.04	0.05	0.06	0.06	0.04	0.04	0.06	0.04	0.09	0.05	0.08	0.05	0.15	0.07	0.04	0.09	0.07	0.04	0.07	0.11	0.13	0.08
N3	0.05	0.05	0.06	0.05	0.04	0.04	0.06	0.04	0.08	0.06	0.05	0.05	0.13	0.08	0.05	0.10	0.06	0.05	0.06	0.10	0.14	0.07
N7	0.07	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.05	0.08	0.07	0.06	0.06	0.12	0.08	0.06	0.11	0.07	0.08	0.06	0.10	0.14	0.07
N9	0.06	0.06	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.07	0.07	0.05	0.05	0.12	0.08	0.05	0.10	0.06	0.07	0.06	0.09	0.17	0.07
O2'	0.24	0.25	0.26	0.27	0.25	0.27	0.26	0.27	0.25	0.26	0.25	0.25	0.25	0.27	0.26	0.25	0.28	0.25	0.28	0.34	0.36	0.28
O3'	0.10	0.15	0.11	0.10	0.11	0.10	0.11	0.09	0.12	0.11	0.14	0.13	0.13	0.12	0.10	0.13	0.10	0.10	0.10	0.11	0.25	0.08
O4'	0.15	0.11	0.12	0.11	0.13	0.14	0.13	0.15	0.12	0.15	0.10	0.12	0.15	0.15	0.14	0.16	0.10	0.16	0.14	0.13	0.21	0.14
O5'	0.19	0.19	0.20	0.18	0.17	0.17	0.17	0.15	0.17	0.17	0.17	0.19	0.18	0.17	0.17	0.24	0.19	0.17	0.13	0.11	0.22	0.12
O6	0.07	0.08	0.07	0.07	0.06	0.06	0.07	0.06	0.09	0.06	0.09	0.07	0.13	0.07	0.06	0.11	0.09	0.07	0.07	0.13	0.12	0.08
OP1	0.16	0.13	0.15	0.16	0.15	0.16	0.17	0.17	0.17	0.17	0.14	0.14	0.20	0.18	0.16	0.17	0.15	0.17	0.17	0.18	0.27	0.20
OP2	0.26	0.26	0.27	0.26	0.27	0.26	0.30	0.26	0.31	0.30	0.29	0.25	0.34	0.32	0.28	0.29	0.27	0.26	0.27	0.28	0.34	0.25
P	0.10	0.08	0.11	0.08	0.09	0.09	0.11	0.09	0.11	0.11	0.09	0.08	0.14	0.12	0.09	0.15	0.09	0.10	0.08	0.08	0.21	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.04	0.03
C2	0.04	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.06	0.02	0.05	0.08	0.12	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.09	0.03
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.04	0.05	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.14	0.04
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.03	0.01	0.06	0.07	0.11	0.07
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.09	0.11	0.17	0.10
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.07	0.03	0.02	0.08	0.07	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.02	0.09	0.12	0.19	0.11
C8	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.07	0.03	0.09	0.10	0.14	0.10
N1	0.03	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.01	0.07	0.10	0.16	0.09
N3	0.03	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.05	0.06	0.09	0.05
N6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.06	0.07	0.04	0.12	0.17	0.24	0.14
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.08	0.03	0.11	0.13	0.20	0.12
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.05	0.06	0.09	0.06
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.02	0.10	0.10	0.06	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.08	0.10	0.03
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.05	0.07	0.05	0.06	0.07	0.08	0.03	0.03	0.00	0.01	0.08	0.16	0.20	0.05
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.06	0.05	0.04
O5'	0.03	0.05	0.03	0.06	0.06	0.01	0.09	0.01	0.09	0.09	0.07	0.05	0.12	0.11	0.05	0.04	0.08	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.04	0.08	0.08	0.11	0.07	0.05	0.11	0.05	0.12	0.10	0.10	0.06	0.17	0.13	0.06	0.08	0.16	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.12	0.09	0.14	0.11	0.09	0.17	0.09	0.19	0.14	0.16	0.09	0.24	0.20	0.09	0.10	0.20	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.07	0.03	0.04	0.07	0.01	0.10	0.01	0.11	0.10	0.09	0.05	0.14	0.12	0.06	0.03	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00