Doublet Group distance statistics: 54929

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 4, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.015, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.015, 0.024, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.024 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.017, 0.028, 0.040, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.028 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.023, 0.036, 0.050, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.036 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.024, 0.040, 0.056, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.040 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.031, 0.051, 0.071, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.051 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.015, 0.039, 0.064, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.039 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.030, 0.055, 0.079, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.055 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.001, 0.026, 0.051, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.026 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.009, 0.036, 0.064, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.036 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.031, 0.060, 0.089, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.060 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.011, 0.051, 0.091, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.051 std_dev=0.040
O2'	A	0, 0.170, 0.320, 0.471, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.320 std_dev=0.150
C2'	A	0, 0.100, 0.265, 0.429, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.265 std_dev=0.164
C6	B	0, 0.173, 0.345, 0.517, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.345 std_dev=0.172
N6	B	0, 0.176, 0.350, 0.523, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.350 std_dev=0.174
O4'	A	0, 0.059, 0.240, 0.420, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.240 std_dev=0.181
C5	B	0, 0.184, 0.392, 0.600, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.392 std_dev=0.208
N1	B	0, 0.196, 0.406, 0.617, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.406 std_dev=0.210
N3	B	0, 0.239, 0.480, 0.721, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.480 std_dev=0.241
C4	B	0, 0.174, 0.419, 0.664, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.419 std_dev=0.245
C2	B	0, 0.225, 0.475, 0.726, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.475 std_dev=0.251
N9	B	0, 0.245, 0.517, 0.790, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.517 std_dev=0.272
C4'	A	0, 0.080, 0.368, 0.656, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.368 std_dev=0.288
C3'	A	0, 0.114, 0.403, 0.693, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.403 std_dev=0.290
N7	B	0, 0.202, 0.496, 0.789, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.496 std_dev=0.293
C1'	B	0, 0.255, 0.569, 0.883, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.569 std_dev=0.314
O5'	A	0, 0.328, 0.668, 1.008, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.668 std_dev=0.340
C8	B	0, 0.218, 0.558, 0.898, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.558 std_dev=0.340
C5'	A	0, 0.221, 0.634, 1.047, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.634 std_dev=0.413
O3'	A	0, 0.155, 0.605, 1.055, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.605 std_dev=0.450
P	A	0, 0.470, 0.923, 1.375, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.923 std_dev=0.452
O4'	B	0, 0.271, 0.767, 1.264, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.767 std_dev=0.497
OP1	A	0, 0.572, 1.071, 1.570, 1.557 max_d=1.557 avg_d=1.071 std_dev=0.499
OP2	A	0, 0.480, 1.009, 1.537, 1.777 max_d=1.777 avg_d=1.009 std_dev=0.529
C4'	B	0, 0.400, 1.134, 1.868, 2.681 max_d=2.681 avg_d=1.134 std_dev=0.734
C2'	B	0, 0.047, 0.906, 1.764, 2.706 max_d=2.706 avg_d=0.906 std_dev=0.858
C3'	B	0, 0.360, 1.250, 2.140, 3.175 max_d=3.175 avg_d=1.250 std_dev=0.890
C5'	B	0, 0.849, 1.909, 2.970, 3.614 max_d=3.614 avg_d=1.909 std_dev=1.061
O2'	B	0, 0.015, 1.238, 2.461, 3.461 max_d=3.461 avg_d=1.238 std_dev=1.223
O3'	B	0, 0.375, 1.663, 2.952, 4.631 max_d=4.631 avg_d=1.663 std_dev=1.288
O5'	B	0, 1.231, 2.619, 4.008, 5.286 max_d=5.286 avg_d=2.619 std_dev=1.389
P	B	0, 1.434, 3.269, 5.103, 6.367 max_d=6.367 avg_d=3.269 std_dev=1.834
OP2	B	0, 2.348, 4.234, 6.120, 6.800 max_d=6.800 avg_d=4.234 std_dev=1.886
OP1	B	0, 0.640, 3.414, 6.188, 8.885 max_d=8.885 avg_d=3.414 std_dev=2.774

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.06	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.03	0.08	0.05	0.04
C2	0.05	0.00	0.15	0.15	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.10	0.20	0.12	0.14	0.02	0.14	0.14	0.12
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.09	0.12	0.18	0.14	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.06	0.11	0.09	0.06
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.11	0.09	0.14	0.17	0.14	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.13	0.10	0.08
C4	0.03	0.02	0.08	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.07	0.14	0.01	0.14	0.13	0.13
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.04	0.01
C5	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.03	0.17	0.01	0.17	0.18	0.17
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.10	0.12	0.09	0.09	0.07	0.12	0.07	0.03	0.03	0.01	0.01	0.12	0.08	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.14	0.05	0.18	0.00	0.19	0.20	0.18
C8	0.01	0.02	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.05	0.15	0.02	0.15	0.13	0.15
N1	0.04	0.01	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.18	0.09	0.16	0.01	0.17	0.18	0.16
N2	0.06	0.00	0.18	0.17	0.02	0.07	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.13	0.24	0.15	0.13	0.03	0.14	0.14	0.12
N3	0.06	0.00	0.14	0.14	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.18	0.12	0.12	0.02	0.13	0.12	0.10
N7	0.01	0.02	0.05	0.06	0.01	0.05	0.01	0.12	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.03	0.18	0.03	0.18	0.18	0.19
N9	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.11	0.02	0.12	0.09	0.10
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.07	0.07	0.13	0.09	0.05	0.02	0.00	0.04	0.03	0.03	0.03	0.10	0.08	0.04
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.11	0.02	0.10	0.03	0.14	0.11	0.18	0.24	0.18	0.08	0.05	0.04	0.00	0.02	0.11	0.13	0.18	0.13	0.12
O4'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.05	0.09	0.15	0.12	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.04	0.07	0.08	0.05
O5'	0.05	0.14	0.04	0.06	0.14	0.01	0.17	0.01	0.18	0.15	0.16	0.13	0.12	0.18	0.11	0.03	0.11	0.05	0.00	0.19	0.01	0.02	0.00
O6	0.03	0.02	0.06	0.11	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.13	0.04	0.19	0.00	0.22	0.23	0.21
OP1	0.08	0.14	0.11	0.13	0.14	0.08	0.17	0.08	0.19	0.15	0.17	0.14	0.13	0.18	0.12	0.10	0.18	0.07	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01
OP2	0.05	0.14	0.09	0.10	0.13	0.04	0.18	0.02	0.20	0.13	0.18	0.14	0.12	0.18	0.09	0.08	0.13	0.08	0.02	0.23	0.02	0.00	0.01
P	0.04	0.12	0.06	0.08	0.13	0.01	0.17	0.02	0.18	0.15	0.16	0.12	0.10	0.19	0.10	0.04	0.12	0.05	0.00	0.21	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.16	0.07	0.35	0.12	0.24	0.11	0.55	0.13	0.11	0.17	0.14	0.13	0.11	0.10	0.49	0.07	0.06	1.49	2.54	1.83	1.95
C2	0.20	0.26	0.28	0.56	0.21	0.36	0.19	0.70	0.20	0.18	0.25	0.24	0.18	0.17	0.20	0.36	0.23	0.22	1.56	2.33	1.79	2.00
C2'	0.14	0.18	0.19	0.55	0.15	0.52	0.14	0.84	0.17	0.12	0.18	0.16	0.19	0.12	0.13	0.51	0.35	0.27	1.77	2.86	2.11	2.24
C3'	0.20	0.19	0.24	0.64	0.17	0.65	0.17	1.00	0.18	0.17	0.19	0.18	0.18	0.16	0.18	0.50	0.49	0.37	1.90	3.06	2.35	2.42
C4	0.14	0.21	0.13	0.48	0.16	0.32	0.15	0.67	0.18	0.13	0.21	0.18	0.17	0.13	0.14	0.45	0.13	0.14	1.63	2.56	1.92	2.11
C4'	0.06	0.15	0.09	0.41	0.09	0.38	0.07	0.70	0.11	0.08	0.16	0.12	0.12	0.06	0.07	0.46	0.22	0.15	1.60	2.74	2.08	2.09
C5	0.15	0.23	0.16	0.52	0.17	0.36	0.16	0.75	0.19	0.13	0.23	0.20	0.19	0.14	0.15	0.49	0.17	0.14	1.71	2.66	2.05	2.23
C5'	0.07	0.15	0.09	0.45	0.08	0.42	0.06	0.77	0.11	0.09	0.16	0.12	0.12	0.06	0.07	0.45	0.26	0.18	1.67	2.84	2.22	2.19
C6	0.19	0.26	0.24	0.58	0.20	0.40	0.18	0.80	0.20	0.16	0.25	0.24	0.19	0.16	0.18	0.46	0.22	0.19	1.72	2.60	2.05	2.24
C8	0.11	0.19	0.06	0.44	0.14	0.33	0.13	0.69	0.17	0.11	0.20	0.16	0.17	0.12	0.11	0.55	0.13	0.09	1.68	2.74	2.07	2.20
N1	0.21	0.28	0.29	0.59	0.22	0.39	0.20	0.78	0.21	0.18	0.25	0.26	0.19	0.17	0.21	0.41	0.25	0.22	1.65	2.44	1.93	2.13
N2	0.23	0.29	0.37	0.60	0.24	0.38	0.21	0.70	0.20	0.21	0.25	0.27	0.17	0.20	0.23	0.30	0.31	0.28	1.46	2.12	1.64	1.86
N3	0.15	0.22	0.19	0.50	0.17	0.31	0.16	0.64	0.18	0.15	0.22	0.19	0.17	0.15	0.15	0.38	0.16	0.17	1.55	2.39	1.78	1.98
N7	0.14	0.22	0.10	0.50	0.16	0.37	0.15	0.75	0.18	0.12	0.22	0.19	0.19	0.13	0.13	0.54	0.16	0.12	1.74	2.76	2.12	2.28
N9	0.11	0.18	0.05	0.43	0.13	0.30	0.13	0.64	0.16	0.11	0.19	0.15	0.16	0.11	0.11	0.49	0.10	0.09	1.61	2.63	1.95	2.10
O2'	0.09	0.16	0.16	0.42	0.12	0.40	0.13	0.68	0.18	0.08	0.18	0.14	0.21	0.10	0.09	0.50	0.26	0.20	1.56	2.62	1.87	1.96
O3'	0.35	0.28	0.38	0.79	0.30	0.84	0.29	1.20	0.27	0.31	0.26	0.30	0.25	0.30	0.32	0.54	0.70	0.56	2.03	3.24	2.53	2.56
O4'	0.15	0.21	0.16	0.30	0.16	0.19	0.15	0.49	0.16	0.17	0.21	0.19	0.15	0.16	0.15	0.50	0.09	0.08	1.41	2.51	1.82	1.88
O5'	0.07	0.15	0.12	0.55	0.08	0.53	0.08	0.91	0.13	0.06	0.17	0.11	0.14	0.05	0.06	0.48	0.36	0.24	1.84	3.01	2.38	2.40
O6	0.20	0.27	0.26	0.61	0.21	0.43	0.19	0.85	0.21	0.17	0.25	0.25	0.20	0.17	0.20	0.49	0.25	0.20	1.77	2.65	2.13	2.32
OP1	0.13	0.17	0.20	0.59	0.13	0.62	0.12	1.03	0.16	0.12	0.18	0.14	0.18	0.11	0.12	0.56	0.47	0.32	1.89	3.11	2.51	2.47
OP2	0.14	0.20	0.21	0.64	0.14	0.62	0.13	1.04	0.17	0.11	0.20	0.17	0.18	0.11	0.13	0.57	0.47	0.29	1.99	3.17	2.56	2.59
P	0.08	0.16	0.13	0.57	0.08	0.56	0.08	0.96	0.13	0.07	0.17	0.12	0.15	0.06	0.06	0.50	0.40	0.26	1.88	3.07	2.46	2.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.06	0.04	0.04	0.06	0.09	0.03	0.02	0.01	0.01	0.31	0.01	0.36	0.70	0.35	0.34
C2	0.08	0.00	0.41	0.60	0.01	0.41	0.01	0.66	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.42	0.29	1.06	1.51	1.08	1.28
C2'	0.00	0.41	0.00	0.00	0.22	0.02	0.10	0.17	0.18	0.19	0.31	0.42	0.13	0.11	0.02	0.00	0.03	0.02	0.27	0.45	0.50	0.28
C3'	0.02	0.60	0.00	0.00	0.38	0.01	0.35	0.02	0.44	0.27	0.54	0.57	0.43	0.30	0.19	0.02	0.01	0.02	0.30	0.39	0.45	0.27
C4	0.04	0.01	0.22	0.38	0.00	0.21	0.01	0.35	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.16	0.16	0.14	0.96	1.43	0.88	1.07
C4'	0.01	0.41	0.02	0.01	0.21	0.00	0.21	0.01	0.24	0.32	0.33	0.40	0.25	0.30	0.12	0.23	0.03	0.01	0.01	0.28	0.23	0.04
C5	0.02	0.01	0.10	0.35	0.01	0.21	0.00	0.38	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.28	0.06	0.05	1.20	1.82	1.19	1.37
C5'	0.06	0.66	0.17	0.02	0.35	0.01	0.38	0.00	0.46	0.49	0.57	0.59	0.49	0.50	0.20	0.05	0.18	0.01	0.01	0.26	0.31	0.02
C6	0.04	0.01	0.18	0.44	0.02	0.24	0.00	0.46	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.27	0.14	0.10	1.28	1.95	1.32	1.53
C8	0.04	0.01	0.19	0.27	0.01	0.32	0.01	0.49	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.36	0.23	0.25	1.10	1.61	1.12	1.13
N1	0.06	0.01	0.31	0.54	0.01	0.33	0.01	0.57	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.19	0.30	0.21	1.20	1.79	1.25	1.47
N3	0.09	0.00	0.42	0.57	0.01	0.40	0.01	0.59	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.15	0.40	0.30	0.90	1.28	0.86	1.05
N6	0.03	0.02	0.13	0.43	0.02	0.25	0.01	0.49	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.33	0.11	0.06	1.39	2.19	1.52	1.71
N7	0.02	0.01	0.11	0.30	0.01	0.30	0.00	0.50	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.39	0.17	0.17	1.28	1.96	1.35	1.42
N9	0.01	0.01	0.02	0.19	0.00	0.12	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.19	0.13	0.03	0.81	1.22	0.72	0.82
O2'	0.01	0.16	0.00	0.02	0.16	0.23	0.28	0.05	0.27	0.36	0.19	0.15	0.33	0.39	0.19	0.00	0.05	0.18	0.15	0.36	0.51	0.18
O3'	0.31	0.42	0.03	0.01	0.16	0.03	0.06	0.18	0.14	0.23	0.30	0.40	0.11	0.17	0.13	0.05	0.00	0.19	0.25	0.38	0.44	0.23
O4'	0.01	0.29	0.02	0.02	0.14	0.01	0.05	0.01	0.10	0.25	0.21	0.30	0.06	0.17	0.03	0.18	0.19	0.00	0.30	0.61	0.31	0.30
O5'	0.36	1.06	0.27	0.30	0.96	0.01	1.20	0.01	1.28	1.10	1.20	0.90	1.39	1.28	0.81	0.15	0.25	0.30	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.70	1.51	0.45	0.39	1.43	0.28	1.82	0.26	1.95	1.61	1.79	1.28	2.19	1.96	1.22	0.36	0.38	0.61	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	1.08	0.50	0.45	0.88	0.23	1.19	0.31	1.32	1.12	1.25	0.86	1.52	1.35	0.72	0.51	0.44	0.31	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.34	1.28	0.28	0.27	1.07	0.04	1.37	0.02	1.53	1.13	1.47	1.05	1.71	1.42	0.82	0.18	0.23	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00