Doublet Group distance statistics: 54930

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.007, 0.025, 0.044, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.010, 0.031, 0.052, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.021
O6	A	0, 0.015, 0.037, 0.058, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.037 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.010, 0.033, 0.055, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.014, 0.037, 0.060, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.037 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.010, 0.037, 0.063, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.037 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.019, 0.051, 0.084, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.051 std_dev=0.033
N2	A	0, 0.019, 0.062, 0.105, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.062 std_dev=0.043
O4'	A	0, -0.053, 0.144, 0.341, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.144 std_dev=0.197
C2	B	0, 0.084, 0.350, 0.616, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.350 std_dev=0.266
C2'	A	0, -0.066, 0.208, 0.482, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.208 std_dev=0.274
N3	B	0, 0.076, 0.359, 0.642, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.359 std_dev=0.283
C4'	A	0, -0.031, 0.270, 0.571, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.270 std_dev=0.301
N1	B	0, 0.032, 0.354, 0.677, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.354 std_dev=0.322
O2'	A	0, -0.065, 0.296, 0.658, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.296 std_dev=0.361
C3'	A	0, -0.084, 0.297, 0.679, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.297 std_dev=0.382
C4	B	0, -0.013, 0.419, 0.851, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.419 std_dev=0.432
C5'	A	0, -0.059, 0.454, 0.968, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.454 std_dev=0.514
O5'	A	0, -0.026, 0.503, 1.031, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.503 std_dev=0.528
C6	B	0, -0.068, 0.472, 1.012, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.472 std_dev=0.540
O3'	A	0, -0.141, 0.443, 1.027, 1.674 max_d=1.674 avg_d=0.443 std_dev=0.584
C5	B	0, -0.122, 0.526, 1.174, 1.921 max_d=1.921 avg_d=0.526 std_dev=0.648
OP2	A	0, 0.060, 0.836, 1.613, 2.448 max_d=2.448 avg_d=0.836 std_dev=0.776
N9	B	0, -0.153, 0.631, 1.416, 2.306 max_d=2.306 avg_d=0.631 std_dev=0.784
N6	B	0, -0.152, 0.724, 1.599, 2.483 max_d=2.483 avg_d=0.724 std_dev=0.876
P	A	0, -0.079, 0.807, 1.693, 2.710 max_d=2.710 avg_d=0.807 std_dev=0.886
C1'	B	0, -0.129, 0.757, 1.643, 2.551 max_d=2.551 avg_d=0.757 std_dev=0.886
O4'	B	0, -0.176, 0.915, 2.005, 3.052 max_d=3.052 avg_d=0.915 std_dev=1.091
N7	B	0, -0.285, 0.811, 1.907, 3.113 max_d=3.113 avg_d=0.811 std_dev=1.096
C8	B	0, -0.309, 0.825, 1.959, 3.245 max_d=3.245 avg_d=0.825 std_dev=1.134
C2'	B	0, -0.136, 1.045, 2.225, 2.769 max_d=2.769 avg_d=1.045 std_dev=1.181
OP1	A	0, -0.125, 1.080, 2.284, 3.643 max_d=3.643 avg_d=1.080 std_dev=1.204
C4'	B	0, -0.230, 1.030, 2.290, 3.545 max_d=3.545 avg_d=1.030 std_dev=1.260
C3'	B	0, -0.201, 1.171, 2.542, 3.412 max_d=3.412 avg_d=1.171 std_dev=1.372
O2'	B	0, -0.194, 1.299, 2.792, 3.801 max_d=3.801 avg_d=1.299 std_dev=1.493
C5'	B	0, -0.318, 1.497, 3.313, 4.232 max_d=4.232 avg_d=1.497 std_dev=1.815
O3'	B	0, -0.288, 1.567, 3.422, 4.266 max_d=4.266 avg_d=1.567 std_dev=1.855
O5'	B	0, -0.561, 1.721, 4.004, 6.050 max_d=6.050 avg_d=1.721 std_dev=2.283
P	B	0, -1.024, 2.231, 5.486, 8.932 max_d=8.932 avg_d=2.231 std_dev=3.255
OP2	B	0, -0.908, 2.463, 5.834, 8.754 max_d=8.754 avg_d=2.463 std_dev=3.371
OP1	B	0, -1.459, 2.401, 6.262, 10.780 max_d=10.780 avg_d=2.401 std_dev=3.860

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.02	0.09	0.10	0.06
C2	0.03	0.00	0.19	0.18	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.19	0.25	0.02	0.05	0.01	0.07	0.12	0.12
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.01	0.09	0.08	0.14	0.23	0.19	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.07	0.05	0.11	0.05
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.09	0.00	0.05	0.01	0.07	0.12	0.14	0.23	0.18	0.10	0.03	0.01	0.01	0.02	0.05	0.06	0.06	0.09	0.05
C4	0.02	0.01	0.10	0.09	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.12	0.01	0.08	0.01	0.10	0.11	0.14
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.08	0.05	0.10	0.07	0.07	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.09	0.08	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.06	0.01	0.13	0.01	0.14	0.16	0.20
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.08	0.13	0.05	0.06	0.04	0.13	0.06	0.03	0.03	0.01	0.01	0.10	0.11	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.10	0.10	0.02	0.12	0.00	0.14	0.18	0.21
C8	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.18	0.02	0.18	0.15	0.20
N1	0.03	0.01	0.14	0.14	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.15	0.19	0.03	0.08	0.01	0.10	0.15	0.17
N2	0.03	0.01	0.23	0.23	0.01	0.10	0.02	0.06	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.24	0.33	0.02	0.06	0.04	0.07	0.10	0.09
N3	0.03	0.00	0.19	0.18	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.24	0.03	0.05	0.01	0.07	0.10	0.10
N7	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.11	0.02	0.19	0.02	0.20	0.20	0.24
N9	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.10	0.02	0.11	0.11	0.12
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.10	0.02	0.06	0.03	0.10	0.04	0.15	0.24	0.18	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.08	0.08	0.09	0.02
O3'	0.03	0.25	0.02	0.01	0.12	0.02	0.06	0.03	0.10	0.13	0.19	0.33	0.24	0.11	0.03	0.03	0.00	0.03	0.10	0.08	0.08	0.09	0.07
O4'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00	0.07	0.02	0.10	0.13	0.04
O5'	0.05	0.05	0.03	0.05	0.08	0.01	0.13	0.01	0.12	0.18	0.08	0.06	0.05	0.19	0.10	0.01	0.10	0.07	0.00	0.15	0.01	0.03	0.00
O6	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.08	0.08	0.02	0.15	0.00	0.18	0.22	0.24
OP1	0.09	0.07	0.05	0.06	0.10	0.09	0.14	0.11	0.14	0.18	0.10	0.07	0.07	0.20	0.11	0.08	0.08	0.10	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.12	0.11	0.09	0.11	0.08	0.16	0.04	0.18	0.15	0.15	0.10	0.10	0.20	0.11	0.09	0.09	0.13	0.03	0.22	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.12	0.05	0.05	0.14	0.02	0.20	0.01	0.21	0.20	0.17	0.09	0.10	0.24	0.12	0.02	0.07	0.04	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.40	0.19	0.74	0.84	0.31	0.43	0.52	0.37	0.34	0.77	0.09	0.04	0.57	0.83	0.49	0.60	1.03	0.26	0.50	1.12	0.73	0.63
C2	0.17	0.12	0.48	0.77	0.24	0.47	0.50	0.79	0.55	0.52	0.18	0.08	0.87	0.65	0.30	0.30	0.93	0.14	0.39	0.24	0.80	0.48
C2'	0.13	0.41	0.50	0.62	0.05	0.26	0.19	0.24	0.08	0.42	0.35	0.24	0.22	0.47	0.19	0.38	0.79	0.04	0.40	1.12	0.78	0.58
C3'	0.10	0.44	0.44	0.57	0.06	0.25	0.14	0.23	0.10	0.37	0.38	0.28	0.16	0.40	0.15	0.32	0.74	0.05	0.44	1.16	0.79	0.64
C4	0.26	0.14	0.59	0.81	0.29	0.41	0.54	0.60	0.50	0.66	0.09	0.04	0.82	0.78	0.40	0.40	0.99	0.07	0.17	0.39	0.54	0.12
C4'	0.33	0.30	0.65	0.75	0.18	0.41	0.34	0.35	0.13	0.64	0.24	0.11	0.27	0.66	0.39	0.54	0.93	0.26	0.69	1.42	0.97	0.92
C5	0.20	0.12	0.51	0.80	0.26	0.46	0.53	0.75	0.52	0.61	0.15	0.07	0.85	0.74	0.35	0.31	0.99	0.09	0.35	0.12	0.70	0.41
C5'	0.35	0.26	0.65	0.76	0.21	0.44	0.36	0.40	0.16	0.67	0.19	0.08	0.30	0.68	0.41	0.54	0.95	0.30	0.70	1.40	0.94	0.93
C6	0.13	0.10	0.41	0.80	0.22	0.54	0.49	0.95	0.55	0.51	0.22	0.10	0.87	0.66	0.27	0.20	0.98	0.21	0.62	0.43	1.02	0.80
C8	0.30	0.14	0.62	0.82	0.30	0.40	0.55	0.53	0.46	0.71	0.07	0.04	0.75	0.82	0.43	0.44	1.02	0.11	0.21	0.53	0.47	0.17
N1	0.12	0.10	0.38	0.78	0.20	0.56	0.47	0.98	0.55	0.46	0.25	0.11	0.86	0.61	0.24	0.20	0.95	0.24	0.65	0.49	1.08	0.84
N2	0.15	0.12	0.44	0.74	0.23	0.49	0.47	0.85	0.56	0.44	0.23	0.09	0.81	0.57	0.26	0.28	0.89	0.19	0.48	0.35	0.91	0.60
N3	0.26	0.14	0.59	0.79	0.29	0.40	0.54	0.58	0.50	0.64	0.08	0.04	0.85	0.75	0.39	0.42	0.96	0.07	0.13	0.44	0.57	0.07
N7	0.23	0.12	0.55	0.82	0.27	0.44	0.54	0.69	0.51	0.65	0.13	0.06	0.82	0.78	0.38	0.34	1.02	0.06	0.28	0.16	0.60	0.31
N9	0.33	0.16	0.66	0.82	0.31	0.40	0.54	0.47	0.44	0.73	0.04	0.03	0.73	0.82	0.45	0.49	1.02	0.15	0.25	0.70	0.51	0.25
O2'	0.18	0.45	0.56	0.62	0.09	0.26	0.15	0.15	0.15	0.42	0.45	0.26	0.13	0.43	0.21	0.48	0.80	0.06	0.62	1.47	1.05	0.90
O3'	0.10	0.58	0.29	0.40	0.23	0.13	0.15	0.11	0.31	0.17	0.56	0.43	0.27	0.17	0.09	0.21	0.57	0.14	0.52	1.34	0.94	0.77
O4'	0.51	0.15	0.82	0.92	0.39	0.54	0.58	0.47	0.37	0.88	0.07	0.07	0.56	0.92	0.59	0.69	1.11	0.40	0.70	1.33	0.85	0.87
O5'	0.33	0.22	0.61	0.75	0.23	0.42	0.41	0.41	0.25	0.67	0.11	0.07	0.43	0.71	0.41	0.47	0.93	0.25	0.53	1.08	0.68	0.67
O6	0.11	0.09	0.34	0.81	0.19	0.62	0.47	1.10	0.55	0.46	0.26	0.12	0.87	0.62	0.22	0.15	0.99	0.29	0.81	0.73	1.27	1.07
OP1	0.40	0.21	0.60	0.76	0.27	0.50	0.43	0.51	0.25	0.72	0.12	0.09	0.40	0.73	0.46	0.47	0.93	0.37	0.69	1.22	0.76	0.86
OP2	0.33	0.18	0.63	0.84	0.28	0.49	0.48	0.59	0.37	0.69	0.10	0.10	0.58	0.75	0.43	0.44	1.03	0.24	0.38	0.65	0.30	0.39
P	0.45	0.11	0.70	0.86	0.35	0.53	0.53	0.54	0.37	0.79	0.03	0.07	0.55	0.83	0.53	0.56	1.04	0.37	0.59	1.05	0.58	0.69

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.17	0.28	0.26	0.18
C2	0.01	0.00	0.47	0.82	0.01	0.63	0.00	0.97	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.35	0.91	0.39	0.67	0.69	1.10	0.79
C2'	0.00	0.47	0.00	0.00	0.25	0.00	0.15	0.02	0.25	0.19	0.39	0.45	0.18	0.06	0.03	0.00	0.00	0.01	0.26	0.40	0.07	0.24
C3'	0.01	0.82	0.00	0.00	0.35	0.00	0.13	0.02	0.31	0.42	0.62	0.79	0.18	0.26	0.04	0.01	0.00	0.01	0.32	0.44	0.11	0.27
C4	0.01	0.01	0.25	0.35	0.00	0.27	0.00	0.39	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.37	0.20	0.32	0.65	0.66	0.39
C4'	0.01	0.63	0.00	0.00	0.27	0.00	0.10	0.01	0.23	0.33	0.47	0.62	0.14	0.22	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.16	0.09	0.02
C5	0.01	0.00	0.15	0.13	0.00	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.13	0.17	0.10	0.52	1.10	0.85	0.66
C5'	0.03	0.97	0.02	0.02	0.39	0.01	0.20	0.00	0.39	0.49	0.74	0.90	0.29	0.37	0.10	0.03	0.01	0.02	0.01	0.24	0.06	0.02
C6	0.01	0.01	0.25	0.31	0.00	0.23	0.00	0.39	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.37	0.19	0.46	1.10	0.94	0.62
C8	0.01	0.00	0.19	0.42	0.00	0.33	0.01	0.49	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.11	0.41	0.20	0.91	1.31	0.99	1.04
N1	0.01	0.00	0.39	0.62	0.02	0.47	0.01	0.74	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.30	0.71	0.32	0.50	0.84	1.01	0.62
N3	0.01	0.01	0.45	0.79	0.00	0.62	0.00	0.90	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.32	0.82	0.39	0.61	0.53	0.93	0.67
N6	0.02	0.00	0.18	0.18	0.01	0.14	0.02	0.29	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.17	0.25	0.14	0.58	1.39	1.08	0.80
N7	0.00	0.00	0.06	0.26	0.00	0.22	0.01	0.37	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.26	0.11	0.88	1.50	1.09	1.08
N9	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.03	0.01	0.42	0.71	0.55	0.47
O2'	0.02	0.35	0.00	0.01	0.18	0.04	0.13	0.03	0.20	0.11	0.30	0.32	0.17	0.06	0.03	0.00	0.02	0.06	0.11	0.14	0.09	0.08
O3'	0.01	0.91	0.00	0.00	0.37	0.02	0.17	0.01	0.37	0.41	0.71	0.82	0.25	0.26	0.03	0.02	0.00	0.02	0.25	0.34	0.32	0.19
O4'	0.00	0.39	0.01	0.01	0.20	0.00	0.10	0.02	0.19	0.20	0.32	0.39	0.14	0.11	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.21	0.25	0.02
O5'	0.17	0.67	0.26	0.32	0.32	0.01	0.52	0.01	0.46	0.91	0.50	0.61	0.58	0.88	0.42	0.11	0.25	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.28	0.69	0.40	0.44	0.65	0.16	1.10	0.24	1.10	1.31	0.84	0.53	1.39	1.50	0.71	0.14	0.34	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.26	1.10	0.07	0.11	0.66	0.09	0.85	0.06	0.94	0.99	1.01	0.93	1.08	1.09	0.55	0.09	0.32	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.79	0.24	0.27	0.39	0.02	0.66	0.02	0.62	1.04	0.62	0.67	0.80	1.08	0.47	0.08	0.19	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00